MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Sinorhizobium fredii HH103 plasmid pSfHH103d

Total Repeats: 5311

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_018299	GTG	2	6	162329	162334	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	399995484
3502	NC_018299	CTT	2	6	162370	162375	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	399995484
3503	NC_018299	GTCCTC	2	12	162391	162402	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	399995484
3504	NC_018299	CG	3	6	162466	162471	0 %	0 %	50 %	50 %	399995484
3505	NC_018299	CGA	2	6	162522	162527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995484
3506	NC_018299	CTC	2	6	162541	162546	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	399995484
3507	NC_018299	TTC	2	6	162556	162561	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	399995484
3508	NC_018299	CGC	2	6	162570	162575	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995484
3509	NC_018299	TCG	3	9	162584	162592	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995484
3510	NC_018299	CGG	3	9	162612	162620	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995484
3511	NC_018299	CTT	2	6	162642	162647	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	399995484
3512	NC_018299	CGT	2	6	162696	162701	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995484
3513	NC_018299	CGA	2	6	162747	162752	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995484
3514	NC_018299	ACATG	2	10	162840	162849	40 %	20 %	20 %	20 %	399995484
3515	NC_018299	TCGACG	2	12	162863	162874	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	399995484
3516	NC_018299	CTC	2	6	162910	162915	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	399995484
3517	NC_018299	TCT	2	6	162924	162929	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	399995484
3518	NC_018299	CGG	2	6	162963	162968	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995484
3519	NC_018299	CGA	2	6	163005	163010	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995484
3520	NC_018299	CAG	2	6	163033	163038	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995484
3521	NC_018299	GCCG	2	8	163071	163078	0 %	0 %	50 %	50 %	399995484
3522	NC_018299	TGG	2	6	163079	163084	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	399995484
3523	NC_018299	AGGC	2	8	163103	163110	25 %	0 %	50 %	25 %	399995484
3524	NC_018299	CGG	2	6	163113	163118	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995484
3525	NC_018299	TCC	2	6	163178	163183	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	399995484
3526	NC_018299	CAT	2	6	163401	163406	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	399995484
3527	NC_018299	GTCGAG	2	12	163408	163419	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	399995484
3528	NC_018299	GC	3	6	163452	163457	0 %	0 %	50 %	50 %	399995484
3529	NC_018299	TCG	2	6	163508	163513	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995484
3530	NC_018299	GA	3	6	163568	163573	50 %	0 %	50 %	0 %	399995484
3531	NC_018299	CGG	2	6	163583	163588	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995484
3532	NC_018299	CTG	2	6	163590	163595	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995484
3533	NC_018299	CCGC	2	8	163599	163606	0 %	0 %	25 %	75 %	399995484
3534	NC_018299	CGCT	2	8	163646	163653	0 %	25 %	25 %	50 %	399995484
3535	NC_018299	TCG	2	6	163673	163678	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995484
3536	NC_018299	CGT	2	6	163695	163700	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995484
3537	NC_018299	ATG	2	6	163754	163759	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	399995484
3538	NC_018299	TCA	2	6	163784	163789	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	399995484
3539	NC_018299	CCGA	2	8	163790	163797	25 %	0 %	25 %	50 %	399995484
3540	NC_018299	GAG	2	6	163820	163825	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	399995484
3541	NC_018299	GC	3	6	163886	163891	0 %	0 %	50 %	50 %	399995484
3542	NC_018299	GC	3	6	163915	163920	0 %	0 %	50 %	50 %	399995484
3543	NC_018299	CGA	2	6	163921	163926	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995484
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3545	NC_018299	TCG	2	6	163997	164002	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995484
3546	NC_018299	GC	3	6	164068	164073	0 %	0 %	50 %	50 %	399995484
3547	NC_018299	CGA	2	6	164080	164085	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995484
3548	NC_018299	CGGTT	2	10	164134	164143	0 %	40 %	40 %	20 %	399995484
3549	NC_018299	TGC	2	6	164165	164170	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995484
3550	NC_018299	GTC	2	6	164176	164181	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995484
3551	NC_018299	CCA	2	6	164209	164214	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	399995484
3552	NC_018299	TCG	2	6	164355	164360	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995484
3553	NC_018299	TCG	2	6	164369	164374	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995484
3554	NC_018299	TTC	2	6	164383	164388	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	399995484
3555	NC_018299	CGAA	2	8	164447	164454	50 %	0 %	25 %	25 %	399995484
3556	NC_018299	GTC	2	6	164524	164529	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995484
3557	NC_018299	GCC	2	6	164585	164590	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995484
3558	NC_018299	GCG	2	6	164591	164596	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995484
3559	NC_018299	GGC	2	6	164665	164670	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995484
3560	NC_018299	GC	3	6	164669	164674	0 %	0 %	50 %	50 %	399995484
3561	NC_018299	CGA	2	6	164698	164703	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995484
3562	NC_018299	CGC	2	6	164836	164841	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995484
3563	NC_018299	CGGTCG	2	12	164877	164888	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	399995484
3564	NC_018299	CCT	2	6	164932	164937	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	399995485
3565	NC_018299	ACG	2	6	164985	164990	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995485
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3567	NC_018299	TCC	2	6	165024	165029	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	399995485
3568	NC_018299	ACG	2	6	165034	165039	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995485
3569	NC_018299	CAG	2	6	165164	165169	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995485
3570	NC_018299	CAG	2	6	165185	165190	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995485
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3572	NC_018299	GTC	2	6	165338	165343	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995485
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3576	NC_018299	CGAA	2	8	165563	165570	50 %	0 %	25 %	25 %	399995485
3577	NC_018299	TCA	2	6	165585	165590	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	399995485
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3583	NC_018299	AGC	2	6	165789	165794	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995486
3584	NC_018299	CGG	2	6	165880	165885	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995486
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3588	NC_018299	GGCG	2	8	166030	166037	0 %	0 %	75 %	25 %	399995486
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3591	NC_018299	CGC	2	6	166166	166171	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995486
3592	NC_018299	ATCG	2	8	166334	166341	25 %	25 %	25 %	25 %	399995486
3593	NC_018299	CCGTC	2	10	166363	166372	0 %	20 %	20 %	60 %	399995486
3594	NC_018299	CCA	2	6	166459	166464	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	399995486
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3597	NC_018299	GGGCG	2	10	166642	166651	0 %	0 %	80 %	20 %	399995486
3598	NC_018299	GATC	2	8	166656	166663	25 %	25 %	25 %	25 %	399995486
3599	NC_018299	GGC	2	6	166664	166669	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995486
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3602	NC_018299	CCAG	2	8	166856	166863	25 %	0 %	25 %	50 %	399995487
3603	NC_018299	GC	4	8	166868	166875	0 %	0 %	50 %	50 %	399995487
3604	NC_018299	GTGC	2	8	166922	166929	0 %	25 %	50 %	25 %	399995487
3605	NC_018299	CGA	2	6	166937	166942	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995487
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3607	NC_018299	GACC	2	8	166989	166996	25 %	0 %	25 %	50 %	399995487
3608	NC_018299	GCC	2	6	167032	167037	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995487
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3611	NC_018299	TGC	2	6	167244	167249	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995487
3612	NC_018299	AT	3	6	167332	167337	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3613	NC_018299	CTG	2	6	167363	167368	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3614	NC_018299	ACG	2	6	167381	167386	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3615	NC_018299	CTT	2	6	167421	167426	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3616	NC_018299	TGC	2	6	167444	167449	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3617	NC_018299	ATC	2	6	167499	167504	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3618	NC_018299	GCC	2	6	167668	167673	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995488
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3989	NC_018299	TGT	2	6	186592	186597	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	399995501
3990	NC_018299	CGAG	2	8	186721	186728	25 %	0 %	50 %	25 %	399995501
3991	NC_018299	ATC	2	6	186738	186743	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	399995501
3992	NC_018299	CG	3	6	186764	186769	0 %	0 %	50 %	50 %	399995501
3993	NC_018299	GGC	2	6	186896	186901	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995501
3994	NC_018299	CCA	2	6	186904	186909	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	399995501
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3997	NC_018299	CGCT	2	8	187026	187033	0 %	25 %	25 %	50 %	399995501
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