MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Sinorhizobium fredii HH103 plasmid pSfHH103d

Total Repeats: 5679

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_018294	TCG	2	6	122444	122449	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995146
2502	NC_018294	GCC	2	6	122461	122466	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995146
2503	NC_018294	GCA	2	6	122467	122472	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995146
2504	NC_018294	CGC	2	6	122497	122502	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995146
2505	NC_018294	GCGG	2	8	122590	122597	0 %	0 %	75 %	25 %	399995146
2506	NC_018294	GC	3	6	122619	122624	0 %	0 %	50 %	50 %	399995146
2507	NC_018294	GCT	2	6	122657	122662	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995146
2508	NC_018294	GCGCT	2	10	122701	122710	0 %	20 %	40 %	40 %	399995146
2509	NC_018294	CGC	3	9	122795	122803	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995146
2510	NC_018294	TGC	2	6	122822	122827	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995146
2511	NC_018294	GGT	2	6	122979	122984	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	399995146
2512	NC_018294	CCG	2	6	123056	123061	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2513	NC_018294	GC	3	6	123083	123088	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2514	NC_018294	CAT	2	6	123144	123149	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2515	NC_018294	CG	3	6	123249	123254	0 %	0 %	50 %	50 %	399995147
2516	NC_018294	CGG	2	6	123361	123366	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995147
2517	NC_018294	CGA	3	9	123373	123381	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995147
2518	NC_018294	GCC	2	6	123419	123424	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995147
2519	NC_018294	TCC	2	6	123437	123442	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	399995147
2520	NC_018294	CTG	2	6	123452	123457	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995147
2521	NC_018294	GGC	2	6	123476	123481	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995147
2522	NC_018294	TGCC	2	8	123486	123493	0 %	25 %	25 %	50 %	399995147
2523	NC_018294	GGC	2	6	123524	123529	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995147
2524	NC_018294	CCG	2	6	123532	123537	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995147
2525	NC_018294	CAGCG	2	10	123623	123632	20 %	0 %	40 %	40 %	399995147
2526	NC_018294	AGG	2	6	123691	123696	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	399995147
2527	NC_018294	GCT	2	6	123701	123706	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995147
2528	NC_018294	TGC	2	6	123723	123728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995147
2529	NC_018294	AGC	2	6	123828	123833	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995147
2530	NC_018294	CTG	2	6	123863	123868	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995147
2531	NC_018294	TCG	2	6	123898	123903	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995147
2532	NC_018294	GGC	2	6	124013	124018	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995147
2533	NC_018294	GAA	2	6	124088	124093	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	399995147
2534	NC_018294	GCA	2	6	124096	124101	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995147
2535	NC_018294	ATCCA	2	10	124184	124193	40 %	20 %	0 %	40 %	399995147
2536	NC_018294	CTC	2	6	124219	124224	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2537	NC_018294	TGC	2	6	124228	124233	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2538	NC_018294	CAT	2	6	124248	124253	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2539	NC_018294	CCG	2	6	124262	124267	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2540	NC_018294	CAT	2	6	124283	124288	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2541	NC_018294	TCG	2	6	124334	124339	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2542	NC_018294	CG	3	6	124344	124349	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2543	NC_018294	CGT	2	6	124366	124371	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995148
2544	NC_018294	TGC	2	6	124505	124510	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995148
2545	NC_018294	CAAC	2	8	124516	124523	50 %	0 %	0 %	50 %	399995148
2546	NC_018294	CA	3	6	124532	124537	50 %	0 %	0 %	50 %	399995148
2547	NC_018294	CAC	2	6	124638	124643	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	399995149
2548	NC_018294	CGT	2	6	124704	124709	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995149
2549	NC_018294	CCG	2	6	124713	124718	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995149
2550	NC_018294	GCG	2	6	124725	124730	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995149
2551	NC_018294	TTC	2	6	124747	124752	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	399995149
2552	NC_018294	TCG	2	6	124772	124777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995149
2553	NC_018294	CAC	2	6	124801	124806	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	399995149
2554	NC_018294	TCAG	2	8	124820	124827	25 %	25 %	25 %	25 %	399995149
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2557	NC_018294	CGCC	2	8	124964	124971	0 %	0 %	25 %	75 %	399995149
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2559	NC_018294	CAT	2	6	125070	125075	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	399995149
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2561	NC_018294	GAT	2	6	125128	125133	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	399995149
2562	NC_018294	CGG	2	6	125150	125155	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995149
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2564	NC_018294	CAT	2	6	125295	125300	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	399995149
2565	NC_018294	CGC	2	6	125301	125306	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995149
2566	NC_018294	CGA	2	6	125318	125323	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995149
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2569	NC_018294	AGC	2	6	125398	125403	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995149
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2571	NC_018294	GCT	2	6	125457	125462	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995149
2572	NC_018294	TCG	2	6	125465	125470	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995149
2573	NC_018294	CATC	2	8	125477	125484	25 %	25 %	0 %	50 %	399995149
2574	NC_018294	AAGC	2	8	125488	125495	50 %	0 %	25 %	25 %	399995149
2575	NC_018294	CGC	2	6	125559	125564	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995149
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2578	NC_018294	CAA	2	6	125660	125665	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2579	NC_018294	CGG	2	6	125756	125761	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995150
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2581	NC_018294	CAAG	2	8	125818	125825	50 %	0 %	25 %	25 %	399995150
2582	NC_018294	AGC	3	9	125831	125839	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995150
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2592	NC_018294	GTTG	2	8	126345	126352	0 %	50 %	50 %	0 %	399995150
2593	NC_018294	GTT	2	6	126370	126375	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	399995150
2594	NC_018294	CG	3	6	126377	126382	0 %	0 %	50 %	50 %	399995150
2595	NC_018294	CAA	2	6	126405	126410	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	399995150
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2598	NC_018294	ACA	2	6	126512	126517	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	399995150
2599	NC_018294	GA	3	6	126566	126571	50 %	0 %	50 %	0 %	399995150
2600	NC_018294	GCA	2	6	126590	126595	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995150
2601	NC_018294	TGA	2	6	126600	126605	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	399995150
2602	NC_018294	AGG	2	6	126736	126741	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2603	NC_018294	CG	3	6	126745	126750	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2604	NC_018294	CAC	2	6	126759	126764	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2605	NC_018294	TCA	2	6	126769	126774	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2606	NC_018294	CG	3	6	126795	126800	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2607	NC_018294	GATC	2	8	126839	126846	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
2608	NC_018294	CCG	2	6	126892	126897	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995151
2609	NC_018294	AGG	2	6	126904	126909	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	399995151
2610	NC_018294	GCG	2	6	127019	127024	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995151
2611	NC_018294	AC	3	6	127025	127030	50 %	0 %	0 %	50 %	399995151
2612	NC_018294	GGC	2	6	127054	127059	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995151
2613	NC_018294	ATGG	2	8	127131	127138	25 %	25 %	50 %	0 %	399995151
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2619	NC_018294	CGG	2	6	127384	127389	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995151
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2621	NC_018294	CCA	2	6	127466	127471	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	399995151
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2623	NC_018294	TCG	2	6	127477	127482	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995151
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2999	NC_018294	CCTT	2	8	146514	146521	0 %	50 %	0 %	50 %	399995170
3000	NC_018294	GCC	2	6	146543	146548	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995170

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