MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Sinorhizobium fredii HH103 plasmid pSfHH103d

Total Repeats: 5679

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018294	TGC	3	9	51	59	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_018294	CCG	2	6	194	199	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3	NC_018294	TTC	2	6	210	215	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_018294	GC	3	6	224	229	0 %	0 %	50 %	50 %	399995010
5	NC_018294	TCG	2	6	231	236	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995010
6	NC_018294	CCA	2	6	239	244	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	399995010
7	NC_018294	CG	3	6	262	267	0 %	0 %	50 %	50 %	399995010
8	NC_018294	GCG	2	6	294	299	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995010
9	NC_018294	GCGG	2	8	351	358	0 %	0 %	75 %	25 %	399995010
10	NC_018294	GTC	2	6	404	409	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995010
11	NC_018294	GCC	2	6	462	467	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995010
12	NC_018294	GAC	2	6	472	477	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995010
13	NC_018294	CGA	2	6	507	512	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995010
14	NC_018294	GCC	2	6	556	561	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995010
15	NC_018294	CG	3	6	594	599	0 %	0 %	50 %	50 %	399995010
16	NC_018294	GCA	2	6	609	614	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995010
17	NC_018294	GCC	2	6	673	678	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995010
18	NC_018294	CCG	2	6	706	711	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995010
19	NC_018294	ATC	2	6	769	774	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	399995010
20	NC_018294	CAA	2	6	778	783	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	399995010
21	NC_018294	TGC	2	6	814	819	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_018294	GC	3	6	908	913	0 %	0 %	50 %	50 %	399995011
23	NC_018294	GGC	2	6	931	936	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995011
24	NC_018294	CGGC	2	8	969	976	0 %	0 %	50 %	50 %	399995011
25	NC_018294	GGC	2	6	1072	1077	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995011
26	NC_018294	AAC	2	6	1079	1084	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	399995011
27	NC_018294	CTT	2	6	1135	1140	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	399995011
28	NC_018294	TCG	2	6	1190	1195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995011
29	NC_018294	CGG	2	6	1219	1224	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995011
30	NC_018294	CGA	2	6	1260	1265	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995011
31	NC_018294	GCG	2	6	1333	1338	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995011
32	NC_018294	GCC	2	6	1367	1372	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995011
33	NC_018294	CGT	2	6	1393	1398	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995011
34	NC_018294	CGG	2	6	1405	1410	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995011
35	NC_018294	CCA	2	6	1428	1433	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	399995011
36	NC_018294	GCG	2	6	1458	1463	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995011
37	NC_018294	CAG	2	6	1603	1608	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995011
38	NC_018294	GAT	2	6	1609	1614	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	399995011
39	NC_018294	GC	3	6	1619	1624	0 %	0 %	50 %	50 %	399995011
40	NC_018294	GCG	2	6	1638	1643	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995011
41	NC_018294	TGA	2	6	1656	1661	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	399995011
42	NC_018294	TCGG	2	8	1682	1689	0 %	25 %	50 %	25 %	399995011
43	NC_018294	CTG	2	6	1820	1825	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_018294	AACC	2	8	1884	1891	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
45	NC_018294	CGAT	2	8	1906	1913	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
46	NC_018294	CCCAAT	2	12	1923	1934	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
47	NC_018294	TCA	2	6	2039	2044	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	399995012
48	NC_018294	TG	3	6	2063	2068	0 %	50 %	50 %	0 %	399995012
49	NC_018294	GC	3	6	2081	2086	0 %	0 %	50 %	50 %	399995012
50	NC_018294	CG	3	6	2129	2134	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
51	NC_018294	GCC	3	9	2173	2181	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
52	NC_018294	CGC	3	9	2214	2222	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
53	NC_018294	GGC	2	6	2235	2240	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_018294	CCG	2	6	2321	2326	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995013
55	NC_018294	CAT	2	6	2385	2390	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	399995013
56	NC_018294	GA	3	6	2446	2451	50 %	0 %	50 %	0 %	399995013
57	NC_018294	GGC	2	6	2454	2459	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995013
58	NC_018294	GC	3	6	2546	2551	0 %	0 %	50 %	50 %	399995013
59	NC_018294	ATC	2	6	2605	2610	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	399995013
60	NC_018294	TCC	2	6	2710	2715	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	399995013
61	NC_018294	TCA	2	6	2726	2731	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	399995013
62	NC_018294	GCG	2	6	2760	2765	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995013
63	NC_018294	GCA	2	6	2819	2824	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995013
64	NC_018294	TCG	2	6	2884	2889	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995013
65	NC_018294	TTG	2	6	2902	2907	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	399995013
66	NC_018294	TTC	2	6	2920	2925	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	399995013
67	NC_018294	TGA	2	6	2948	2953	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	399995013
68	NC_018294	TGC	2	6	2969	2974	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995013
69	NC_018294	GTT	2	6	2979	2984	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	399995013
70	NC_018294	CCA	2	6	2988	2993	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	399995013
71	NC_018294	CGAG	2	8	3042	3049	25 %	0 %	50 %	25 %	399995013
72	NC_018294	TCG	2	6	3128	3133	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995013
73	NC_018294	ACG	3	9	3241	3249	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995013
74	NC_018294	GCG	2	6	3265	3270	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995013
75	NC_018294	CCT	2	6	3281	3286	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	399995013
76	NC_018294	GA	3	6	3337	3342	50 %	0 %	50 %	0 %	399995013
77	NC_018294	CCG	2	6	3353	3358	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995013
78	NC_018294	CGGCC	2	10	3366	3375	0 %	0 %	40 %	60 %	399995013
79	NC_018294	CGC	2	6	3452	3457	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995013
80	NC_018294	CGG	2	6	3494	3499	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995013
81	NC_018294	A	6	6	3508	3513	100 %	0 %	0 %	0 %	399995013
82	NC_018294	CGA	2	6	3514	3519	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995013
83	NC_018294	GCC	2	6	3588	3593	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995013
84	NC_018294	CAG	2	6	3597	3602	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995013
85	NC_018294	GTG	2	6	3622	3627	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	399995013
86	NC_018294	CGG	2	6	3629	3634	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995013
87	NC_018294	ATC	2	6	3643	3648	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	399995013
88	NC_018294	GCC	2	6	3694	3699	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995013
89	NC_018294	CAG	2	6	3711	3716	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995013
90	NC_018294	GGT	2	6	3771	3776	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	399995013
91	NC_018294	ACC	2	6	3832	3837	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	399995013
92	NC_018294	TTG	2	6	3856	3861	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	399995013
93	NC_018294	CAG	2	6	3870	3875	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995013
94	NC_018294	CCGG	2	8	3917	3924	0 %	0 %	50 %	50 %	399995013
95	NC_018294	TC	3	6	3950	3955	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
96	NC_018294	A	7	7	3957	3963	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_018294	CTT	2	6	4012	4017	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_018294	CAG	2	6	4158	4163	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_018294	CGC	3	9	4183	4191	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
100	NC_018294	GGC	2	6	4195	4200	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_018294	TG	3	6	4240	4245	0 %	50 %	50 %	0 %	399995014
102	NC_018294	CGT	2	6	4254	4259	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995014
103	NC_018294	CGT	2	6	4295	4300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995014
104	NC_018294	CGC	2	6	4338	4343	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995014
105	NC_018294	AGG	2	6	4358	4363	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	399995014
106	NC_018294	GC	3	6	4440	4445	0 %	0 %	50 %	50 %	399995014
107	NC_018294	GTC	2	6	4575	4580	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995015
108	NC_018294	CTG	2	6	4607	4612	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995015
109	NC_018294	TCA	2	6	4615	4620	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	399995015
110	NC_018294	CTG	2	6	4629	4634	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995015
111	NC_018294	TGC	2	6	4670	4675	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995015
112	NC_018294	TCG	2	6	4711	4716	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995015
113	NC_018294	GC	3	6	4728	4733	0 %	0 %	50 %	50 %	399995015
114	NC_018294	TTCG	2	8	4743	4750	0 %	50 %	25 %	25 %	399995015
115	NC_018294	GCAG	2	8	4791	4798	25 %	0 %	50 %	25 %	399995015
116	NC_018294	CGC	2	6	4826	4831	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995015
117	NC_018294	TGA	2	6	4840	4845	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	399995015
118	NC_018294	CTG	2	6	4848	4853	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995015
119	NC_018294	GGC	2	6	4865	4870	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995015
120	NC_018294	GGCT	2	8	4884	4891	0 %	25 %	50 %	25 %	399995015
121	NC_018294	GAC	2	6	4892	4897	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995015
122	NC_018294	CAA	2	6	4916	4921	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	399995015
123	NC_018294	TGA	2	6	4960	4965	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	399995015
124	NC_018294	CGG	3	9	4987	4995	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995015
125	NC_018294	AAG	2	6	5052	5057	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	399995015
126	NC_018294	CTG	2	6	5084	5089	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995016
127	NC_018294	TCG	2	6	5091	5096	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995016
128	NC_018294	TTG	2	6	5121	5126	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	399995016
129	NC_018294	GGC	2	6	5151	5156	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995016
130	NC_018294	GGC	2	6	5188	5193	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995016
131	NC_018294	CGG	2	6	5197	5202	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995016
132	NC_018294	TCT	2	6	5260	5265	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	399995016
133	NC_018294	GCA	3	9	5278	5286	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995016
134	NC_018294	CCGC	2	8	5313	5320	0 %	0 %	25 %	75 %	399995016
135	NC_018294	CGA	2	6	5329	5334	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995016
136	NC_018294	CCA	2	6	5386	5391	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	399995016
137	NC_018294	TCG	2	6	5517	5522	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995016
138	NC_018294	CG	3	6	5532	5537	0 %	0 %	50 %	50 %	399995016
139	NC_018294	CGCT	2	8	5540	5547	0 %	25 %	25 %	50 %	399995016
140	NC_018294	CGT	2	6	5578	5583	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995016
141	NC_018294	CTG	2	6	5732	5737	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995016
142	NC_018294	GCC	2	6	5741	5746	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995016
143	NC_018294	CGTGG	2	10	5781	5790	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
144	NC_018294	ATC	2	6	5794	5799	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
145	NC_018294	GCT	2	6	5808	5813	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
146	NC_018294	TG	3	6	5814	5819	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
147	NC_018294	ACG	3	9	5879	5887	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
148	NC_018294	CGGAG	2	10	5919	5928	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
149	NC_018294	CG	3	6	6027	6032	0 %	0 %	50 %	50 %	399995017
150	NC_018294	GC	3	6	6043	6048	0 %	0 %	50 %	50 %	399995017
151	NC_018294	GATG	2	8	6093	6100	25 %	25 %	50 %	0 %	399995017
152	NC_018294	CG	3	6	6111	6116	0 %	0 %	50 %	50 %	399995017
153	NC_018294	GCC	2	6	6151	6156	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995017
154	NC_018294	GACA	2	8	6172	6179	50 %	0 %	25 %	25 %	399995017
155	NC_018294	GC	3	6	6190	6195	0 %	0 %	50 %	50 %	399995017
156	NC_018294	TGC	2	6	6201	6206	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995017
157	NC_018294	ATC	2	6	6306	6311	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
158	NC_018294	GGC	2	6	6495	6500	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
159	NC_018294	GC	3	6	6544	6549	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
160	NC_018294	GAC	2	6	6578	6583	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995018
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162	NC_018294	TCA	2	6	6619	6624	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	399995018
163	NC_018294	CTT	2	6	6697	6702	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	399995018
164	NC_018294	ACCT	2	8	6728	6735	25 %	25 %	0 %	50 %	399995018
165	NC_018294	ACGGAT	2	12	6834	6845	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	399995018
166	NC_018294	AAT	2	6	6852	6857	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	399995018
167	NC_018294	T	6	6	6884	6889	0 %	100 %	0 %	0 %	399995018
168	NC_018294	CTT	2	6	6899	6904	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	399995018
169	NC_018294	T	6	6	6919	6924	0 %	100 %	0 %	0 %	399995018
170	NC_018294	ATCA	2	8	7040	7047	50 %	25 %	0 %	25 %	399995018
171	NC_018294	ACCTT	2	10	7051	7060	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
172	NC_018294	AGC	2	6	7099	7104	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
173	NC_018294	CT	3	6	7116	7121	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
174	NC_018294	TCCC	2	8	7140	7147	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
175	NC_018294	G	6	6	7153	7158	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
176	NC_018294	TGCT	2	8	7437	7444	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
177	NC_018294	CGTC	2	8	7489	7496	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
178	NC_018294	CTG	2	6	7577	7582	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
179	NC_018294	GAG	2	6	7594	7599	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
180	NC_018294	GCC	2	6	7622	7627	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
181	NC_018294	CAAG	2	8	7636	7643	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
182	NC_018294	GATC	2	8	7690	7697	25 %	25 %	25 %	25 %	399995020
183	NC_018294	ATG	2	6	7707	7712	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	399995020
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185	NC_018294	TCGCG	2	10	7881	7890	0 %	20 %	40 %	40 %	399995020
186	NC_018294	CGTC	2	8	7894	7901	0 %	25 %	25 %	50 %	399995020
187	NC_018294	GGC	2	6	7912	7917	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995020
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241	NC_018294	GAG	2	6	10843	10848	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
242	NC_018294	CGA	2	6	10935	10940	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995026
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250	NC_018294	TTC	2	6	11351	11356	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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262	NC_018294	CG	3	6	11735	11740	0 %	0 %	50 %	50 %	399995027
263	NC_018294	GCA	2	6	11750	11755	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995027
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265	NC_018294	CCG	2	6	11847	11852	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995027
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268	NC_018294	TGC	2	6	11955	11960	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
269	NC_018294	CCA	2	6	12031	12036	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
270	NC_018294	GGC	2	6	12058	12063	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
271	NC_018294	CAG	2	6	12091	12096	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
272	NC_018294	ATAA	2	8	12097	12104	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
273	NC_018294	ACC	2	6	12131	12136	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
274	NC_018294	CAC	2	6	12157	12162	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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295	NC_018294	GGC	2	6	13327	13332	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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399	NC_018294	CGG	3	9	18658	18666	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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