MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Sinorhizobium fredii USDA 257 plasmid pUSDA257

Total Repeats: 4533

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_018191	TCGA	2	8	46683	46690	25 %	25 %	25 %	25 %	398356152
1002	NC_018191	AC	3	6	46742	46747	50 %	0 %	0 %	50 %	398356152
1003	NC_018191	CA	3	6	46767	46772	50 %	0 %	0 %	50 %	398356152
1004	NC_018191	CGT	2	6	46791	46796	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398356152
1005	NC_018191	AG	3	6	46798	46803	50 %	0 %	50 %	0 %	398356152
1006	NC_018191	CGT	2	6	46814	46819	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398356152
1007	NC_018191	CAGC	2	8	46820	46827	25 %	0 %	25 %	50 %	398356152
1008	NC_018191	CGAC	2	8	46837	46844	25 %	0 %	25 %	50 %	398356152
1009	NC_018191	GCT	2	6	46890	46895	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398356152
1010	NC_018191	GC	3	6	46944	46949	0 %	0 %	50 %	50 %	398356152
1011	NC_018191	GTC	2	6	46986	46991	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398356152
1012	NC_018191	CGA	2	6	47009	47014	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398356152
1013	NC_018191	CGA	2	6	47021	47026	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398356152
1014	NC_018191	CGT	2	6	47027	47032	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398356152
1015	NC_018191	AGG	2	6	47066	47071	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	398356152
1016	NC_018191	CG	3	6	47081	47086	0 %	0 %	50 %	50 %	398356152
1017	NC_018191	ATG	2	6	47131	47136	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	398356152
1018	NC_018191	CTG	2	6	47169	47174	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398356153
1019	NC_018191	CTT	2	6	47207	47212	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	398356153
1020	NC_018191	CGAG	2	8	47221	47228	25 %	0 %	50 %	25 %	398356153
1021	NC_018191	TCG	2	6	47251	47256	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398356153
1022	NC_018191	ACG	2	6	47257	47262	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398356153
1023	NC_018191	GGC	2	6	47275	47280	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398356153
1024	NC_018191	CGAA	2	8	47339	47346	50 %	0 %	25 %	25 %	398356154
1025	NC_018191	CGC	2	6	47362	47367	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398356154
1026	NC_018191	TTC	2	6	47380	47385	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	398356154
1027	NC_018191	CCAG	2	8	47422	47429	25 %	0 %	25 %	50 %	398356154
1028	NC_018191	GC	3	6	47443	47448	0 %	0 %	50 %	50 %	398356154
1029	NC_018191	CGG	2	6	47467	47472	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398356154
1030	NC_018191	CA	3	6	47473	47478	50 %	0 %	0 %	50 %	398356154
1031	NC_018191	CGA	2	6	47501	47506	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1032	NC_018191	TAC	2	6	47522	47527	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1033	NC_018191	GAG	2	6	47560	47565	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1034	NC_018191	ATG	2	6	47566	47571	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	398356155
1035	NC_018191	GAAC	2	8	47604	47611	50 %	0 %	25 %	25 %	398356155
1036	NC_018191	TGC	2	6	47634	47639	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398356155
1037	NC_018191	CGC	2	6	47712	47717	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398356155
1038	NC_018191	GGA	2	6	47760	47765	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	398356155
1039	NC_018191	GC	3	6	47843	47848	0 %	0 %	50 %	50 %	398356156
1040	NC_018191	GTG	2	6	47898	47903	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	398356156
1041	NC_018191	CGG	3	9	47928	47936	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398356156
1042	NC_018191	CGGCA	2	10	48023	48032	20 %	0 %	40 %	40 %	398356156
1043	NC_018191	AACGC	2	10	48048	48057	40 %	0 %	20 %	40 %	398356156
1044	NC_018191	TCGACG	2	12	48078	48089	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	398356156
1045	NC_018191	CGG	2	6	48094	48099	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398356156
1046	NC_018191	TGG	2	6	48147	48152	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	398356156
1047	NC_018191	CGC	2	6	48157	48162	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398356156
1048	NC_018191	CCG	2	6	48183	48188	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398356156
1049	NC_018191	ATC	2	6	48195	48200	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	398356156
1050	NC_018191	CG	3	6	48246	48251	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1051	NC_018191	GCA	2	6	48329	48334	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398356157
1052	NC_018191	CGCA	2	8	48414	48421	25 %	0 %	25 %	50 %	398356157
1053	NC_018191	ATG	2	6	48455	48460	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	398356157
1054	NC_018191	TCCA	2	8	48464	48471	25 %	25 %	0 %	50 %	398356157
1055	NC_018191	TGAG	2	8	48592	48599	25 %	25 %	50 %	0 %	398356158
1056	NC_018191	TCA	3	9	48640	48648	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	398356158
1057	NC_018191	CGA	2	6	48710	48715	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398356158
1058	NC_018191	ATG	2	6	48717	48722	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	398356158
1059	NC_018191	GAC	2	6	48747	48752	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398356158
1060	NC_018191	CGA	2	6	48854	48859	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398356158
1061	NC_018191	GCT	2	6	48885	48890	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398356158
1062	NC_018191	GGA	2	6	48950	48955	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	398356158
1063	NC_018191	TCG	2	6	49176	49181	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398356159
1064	NC_018191	CGG	2	6	49197	49202	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398356159
1065	NC_018191	AAG	2	6	49203	49208	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	398356159
1066	NC_018191	TGA	2	6	49231	49236	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	398356159
1067	NC_018191	CG	3	6	49263	49268	0 %	0 %	50 %	50 %	398356159
1068	NC_018191	GCC	2	6	49339	49344	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398356159
1069	NC_018191	TCC	2	6	49404	49409	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	398356159
1070	NC_018191	CGA	3	9	49420	49428	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398356159
1071	NC_018191	CGA	2	6	49504	49509	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398356159
1072	NC_018191	AGG	2	6	49519	49524	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	398356159
1073	NC_018191	CG	3	6	49551	49556	0 %	0 %	50 %	50 %	398356159
1074	NC_018191	GAT	2	6	49622	49627	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	398356159
1075	NC_018191	GCCT	2	8	49667	49674	0 %	25 %	25 %	50 %	398356160
1076	NC_018191	AAT	2	6	49730	49735	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	398356160
1077	NC_018191	CGG	2	6	49744	49749	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	398356160
1078	NC_018191	CCTG	2	8	49791	49798	0 %	25 %	25 %	50 %	398356160
1079	NC_018191	CGTG	2	8	49899	49906	0 %	25 %	50 %	25 %	398356160
1080	NC_018191	CCGCT	2	10	49970	49979	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
1081	NC_018191	TG	3	6	49987	49992	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1082	NC_018191	GAA	2	6	50017	50022	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1083	NC_018191	CG	3	6	50029	50034	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1084	NC_018191	TC	3	6	50144	50149	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1085	NC_018191	CCG	2	6	50165	50170	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1086	NC_018191	TGAC	2	8	50187	50194	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1087	NC_018191	GGA	2	6	50199	50204	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1088	NC_018191	ATG	2	6	50263	50268	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1089	NC_018191	CGC	2	6	50269	50274	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1090	NC_018191	TCCGGC	2	12	50323	50334	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
1091	NC_018191	TTC	2	6	50350	50355	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1092	NC_018191	CCG	2	6	50393	50398	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1093	NC_018191	TTC	2	6	50417	50422	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1094	NC_018191	CAC	2	6	50436	50441	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1095	NC_018191	CGC	2	6	50488	50493	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1096	NC_018191	GCT	2	6	50506	50511	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1097	NC_018191	CCGA	2	8	50527	50534	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1098	NC_018191	GC	3	6	50620	50625	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1099	NC_018191	TGAGA	2	10	50627	50636	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
1100	NC_018191	CGC	2	6	50637	50642	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1101	NC_018191	AAG	2	6	50727	50732	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1102	NC_018191	GGGC	2	8	50776	50783	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1103	NC_018191	GCA	2	6	50788	50793	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1104	NC_018191	TGC	2	6	50910	50915	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1105	NC_018191	GCCA	2	8	50944	50951	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1106	NC_018191	AGAT	2	8	51019	51026	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1107	NC_018191	TCT	2	6	51034	51039	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1108	NC_018191	CTG	2	6	51078	51083	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1109	NC_018191	GAT	2	6	51090	51095	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1110	NC_018191	T	6	6	51113	51118	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1111	NC_018191	AGC	2	6	51199	51204	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1112	NC_018191	ACG	2	6	51229	51234	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1113	NC_018191	GCT	2	6	51262	51267	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1114	NC_018191	CTC	2	6	51306	51311	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1115	NC_018191	GCC	2	6	51481	51486	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1116	NC_018191	AGAA	2	8	51496	51503	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1117	NC_018191	GC	3	6	51543	51548	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1118	NC_018191	CG	3	6	51624	51629	0 %	0 %	50 %	50 %	398356161
1119	NC_018191	CGA	2	6	51813	51818	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398356162
1120	NC_018191	CGC	3	9	51913	51921	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398356162
1121	NC_018191	GCT	2	6	51938	51943	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398356162
1122	NC_018191	CTG	2	6	51949	51954	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	398356162
1123	NC_018191	GAC	2	6	52006	52011	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	398356162
1124	NC_018191	GTCA	2	8	52012	52019	25 %	25 %	25 %	25 %	398356162
1125	NC_018191	TTC	3	9	52081	52089	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	398356162
1126	NC_018191	CTT	2	6	52122	52127	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	398356162
1127	NC_018191	GCC	3	9	52130	52138	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398356162
1128	NC_018191	GCC	2	6	52147	52152	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398356162
1129	NC_018191	GGC	2	6	52246	52251	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1130	NC_018191	CAT	2	6	52266	52271	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1253	NC_018191	CAC	2	6	58050	58055	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1254	NC_018191	CCG	2	6	58118	58123	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	398356171
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1495	NC_018191	CCTCGA	2	12	69323	69334	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	398356176
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1499	NC_018191	TG	3	6	69598	69603	0 %	50 %	50 %	0 %	398356176
1500	NC_018191	ACCT	2	8	69618	69625	25 %	25 %	0 %	50 %	398356176

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