MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus mutans GS-5 chromosome

Total Repeats: 44780

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018089	TTTTGT	2	12	1	12	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_018089	ATC	2	6	70	75	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_018089	T	6	6	122	127	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_018089	TTA	2	6	167	172	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_018089	T	6	6	213	218	0 %	100 %	0 %	0 %	397648809
6	NC_018089	AAGC	2	8	254	261	50 %	0 %	25 %	25 %	397648809
7	NC_018089	T	6	6	271	276	0 %	100 %	0 %	0 %	397648809
8	NC_018089	ATT	2	6	292	297	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	397648809
9	NC_018089	CTT	2	6	326	331	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	397648809
10	NC_018089	GAT	2	6	332	337	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	397648809
11	NC_018089	A	6	6	341	346	100 %	0 %	0 %	0 %	397648809
12	NC_018089	A	7	7	357	363	100 %	0 %	0 %	0 %	397648809
13	NC_018089	TGT	2	6	373	378	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	397648809
14	NC_018089	GAA	2	6	434	439	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	397648809
15	NC_018089	TGA	2	6	565	570	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	397648809
16	NC_018089	AAC	2	6	619	624	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	397648809
17	NC_018089	CT	3	6	633	638	0 %	50 %	0 %	50 %	397648809
18	NC_018089	TTAT	2	8	639	646	25 %	75 %	0 %	0 %	397648809
19	NC_018089	GGA	2	6	647	652	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	397648809
20	NC_018089	AGCA	2	8	703	710	50 %	0 %	25 %	25 %	397648809
21	NC_018089	AT	3	6	730	735	50 %	50 %	0 %	0 %	397648809
22	NC_018089	TTA	2	6	750	755	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	397648809
23	NC_018089	TGT	2	6	763	768	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	397648809
24	NC_018089	AGA	2	6	801	806	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	397648809
25	NC_018089	TGA	2	6	835	840	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	397648809
26	NC_018089	AAG	2	6	879	884	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	397648809
27	NC_018089	ATA	3	9	915	923	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	397648809
28	NC_018089	CCT	2	6	1025	1030	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	397648809
29	NC_018089	TC	3	6	1090	1095	0 %	50 %	0 %	50 %	397648809
30	NC_018089	A	6	6	1187	1192	100 %	0 %	0 %	0 %	397648809
31	NC_018089	TTA	2	6	1200	1205	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	397648809
32	NC_018089	GCA	2	6	1217	1222	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397648809
33	NC_018089	GAT	2	6	1261	1266	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	397648809
34	NC_018089	AAATC	2	10	1329	1338	60 %	20 %	0 %	20 %	397648809
35	NC_018089	TAA	2	6	1474	1479	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	397648809
36	NC_018089	ATAAA	2	10	1544	1553	80 %	20 %	0 %	0 %	397648809
37	NC_018089	TAT	2	6	1579	1584	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_018089	TGA	2	6	1616	1621	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_018089	CTA	2	6	1662	1667	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_018089	ACT	2	6	1670	1675	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_018089	TTA	2	6	1679	1684	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_018089	TAA	2	6	1725	1730	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	397648810
43	NC_018089	T	7	7	1733	1739	0 %	100 %	0 %	0 %	397648810
44	NC_018089	CTATTC	2	12	1787	1798	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	397648810
45	NC_018089	GAA	3	9	1888	1896	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	397648810
46	NC_018089	CTT	2	6	1916	1921	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	397648810
47	NC_018089	TTA	2	6	1952	1957	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	397648810
48	NC_018089	GAA	2	6	1996	2001	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	397648810
49	NC_018089	AAC	2	6	2006	2011	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	397648810
50	NC_018089	GTT	2	6	2017	2022	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	397648810
51	NC_018089	AAT	2	6	2101	2106	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	397648810
52	NC_018089	ATT	2	6	2140	2145	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	397648810
53	NC_018089	TGC	2	6	2160	2165	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397648810
54	NC_018089	TCAT	2	8	2286	2293	25 %	50 %	0 %	25 %	397648810
55	NC_018089	GAT	2	6	2296	2301	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	397648810
56	NC_018089	GTC	2	6	2308	2313	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397648810
57	NC_018089	GAT	2	6	2356	2361	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	397648810
58	NC_018089	AT	3	6	2415	2420	50 %	50 %	0 %	0 %	397648810
59	NC_018089	TTG	2	6	2470	2475	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	397648810
60	NC_018089	CAA	2	6	2592	2597	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	397648810
61	NC_018089	GAA	2	6	2644	2649	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	397648810
62	NC_018089	ACTT	2	8	2701	2708	25 %	50 %	0 %	25 %	397648810
63	NC_018089	TTCA	2	8	2809	2816	25 %	50 %	0 %	25 %	397648810
64	NC_018089	TAT	2	6	2854	2859	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_018089	GTT	2	6	2864	2869	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_018089	T	6	6	2868	2873	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_018089	A	7	7	2945	2951	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_018089	ATTA	2	8	2956	2963	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_018089	GCT	2	6	3076	3081	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_018089	TGAAA	2	10	3140	3149	60 %	20 %	20 %	0 %	397648811
71	NC_018089	GAC	2	6	3173	3178	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397648811
72	NC_018089	A	6	6	3183	3188	100 %	0 %	0 %	0 %	397648811
73	NC_018089	TTG	2	6	3194	3199	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	397648811
74	NC_018089	CGTA	2	8	3206	3213	25 %	25 %	25 %	25 %	397648811
75	NC_018089	ATCAAA	2	12	3225	3236	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	397648811
76	NC_018089	ATG	2	6	3261	3266	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	397648811
77	NC_018089	GCC	2	6	3268	3273	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397648811
78	NC_018089	A	6	6	3293	3298	100 %	0 %	0 %	0 %	397648811
79	NC_018089	TAT	2	6	3375	3380	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_018089	CAG	2	6	3482	3487	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397648812
81	NC_018089	CAA	2	6	3665	3670	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	397648812
82	NC_018089	AAAT	2	8	3732	3739	75 %	25 %	0 %	0 %	397648812
83	NC_018089	TGT	2	6	3777	3782	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	397648812
84	NC_018089	ATG	2	6	3794	3799	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	397648812
85	NC_018089	TTG	2	6	3836	3841	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	397648812
86	NC_018089	AATT	2	8	3864	3871	50 %	50 %	0 %	0 %	397648812
87	NC_018089	AATT	2	8	3875	3882	50 %	50 %	0 %	0 %	397648812
88	NC_018089	TAA	2	6	3903	3908	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	397648812
89	NC_018089	A	6	6	3926	3931	100 %	0 %	0 %	0 %	397648812
90	NC_018089	TTC	2	6	3977	3982	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	397648812
91	NC_018089	AGA	2	6	4038	4043	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	397648812
92	NC_018089	TGA	2	6	4110	4115	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	397648812
93	NC_018089	CAA	2	6	4153	4158	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	397648812
94	NC_018089	GCA	2	6	4171	4176	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397648812
95	NC_018089	GTT	3	9	4192	4200	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	397648812
96	NC_018089	GAA	3	9	4216	4224	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	397648812
97	NC_018089	TGA	3	9	4236	4244	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	397648812
98	NC_018089	TTG	2	6	4321	4326	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	397648812
99	NC_018089	ACTT	2	8	4336	4343	25 %	50 %	0 %	25 %	397648812
100	NC_018089	GTGC	2	8	4363	4370	0 %	25 %	50 %	25 %	397648812
101	NC_018089	CAC	2	6	4397	4402	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	397648812
102	NC_018089	ATG	2	6	4466	4471	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	397648812
103	NC_018089	AAG	2	6	4505	4510	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	397648812
104	NC_018089	GAA	2	6	4525	4530	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	397648812
105	NC_018089	A	6	6	4608	4613	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_018089	CTT	2	6	4636	4641	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_018089	GGAAA	2	10	4662	4671	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
108	NC_018089	TTG	2	6	4687	4692	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	397648813
109	NC_018089	GAAAC	2	10	4722	4731	60 %	0 %	20 %	20 %	397648813
110	NC_018089	CAG	2	6	4816	4821	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397648813
111	NC_018089	TTA	2	6	4828	4833	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	397648813
112	NC_018089	A	6	6	4840	4845	100 %	0 %	0 %	0 %	397648813
113	NC_018089	TTTAT	2	10	4846	4855	20 %	80 %	0 %	0 %	397648813
114	NC_018089	TTA	2	6	4910	4915	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	397648813
115	NC_018089	TTAT	2	8	4942	4949	25 %	75 %	0 %	0 %	397648813
116	NC_018089	GAT	2	6	4950	4955	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	397648813
117	NC_018089	CTG	2	6	4999	5004	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397648813
118	NC_018089	AGA	2	6	5135	5140	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	397648813
119	NC_018089	AC	3	6	5158	5163	50 %	0 %	0 %	50 %	397648813
120	NC_018089	AACA	2	8	5215	5222	75 %	0 %	0 %	25 %	397648813
121	NC_018089	ATTT	2	8	5258	5265	25 %	75 %	0 %	0 %	397648814
122	NC_018089	A	6	6	5276	5281	100 %	0 %	0 %	0 %	397648814
123	NC_018089	TC	3	6	5301	5306	0 %	50 %	0 %	50 %	397648814
124	NC_018089	CTA	2	6	5312	5317	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	397648814
125	NC_018089	AGC	2	6	5364	5369	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397648814
126	NC_018089	AGC	2	6	5378	5383	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397648814
127	NC_018089	GAA	2	6	5467	5472	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	397648814
128	NC_018089	TGA	2	6	5490	5495	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	397648814
129	NC_018089	GCA	3	9	5500	5508	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397648814
130	NC_018089	TTG	2	6	5606	5611	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	397648814
131	NC_018089	AGC	2	6	5649	5654	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397648814
132	NC_018089	TTAAA	2	10	5660	5669	60 %	40 %	0 %	0 %	397648814
133	NC_018089	GAA	2	6	5677	5682	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	397648814
134	NC_018089	ATCA	2	8	5797	5804	50 %	25 %	0 %	25 %	397648814
135	NC_018089	T	6	6	5827	5832	0 %	100 %	0 %	0 %	397648814
136	NC_018089	TGA	2	6	5868	5873	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	397648814
137	NC_018089	TGA	2	6	5919	5924	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	397648814
138	NC_018089	ATC	2	6	5926	5931	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	397648814
139	NC_018089	TTA	2	6	5981	5986	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	397648814
140	NC_018089	TCA	2	6	6051	6056	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	397648814
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142	NC_018089	T	6	6	6136	6141	0 %	100 %	0 %	0 %	397648814
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148	NC_018089	T	6	6	6376	6381	0 %	100 %	0 %	0 %	397648814
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152	NC_018089	TGA	2	6	6594	6599	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	397648814
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165	NC_018089	TCT	2	6	7149	7154	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	397648814
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