MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus suis ST1 chromosome

Total Repeats: 41086

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
18501	NC_017950	A	6	6	916411	916416	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18502	NC_017950	TGTCCC	2	12	916419	916430	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
18503	NC_017950	CGGTT	2	10	916513	916522	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
18504	NC_017950	GTTT	2	8	916565	916572	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
18505	NC_017950	T	6	6	916570	916575	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18506	NC_017950	TCG	2	6	916579	916584	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18507	NC_017950	GCA	3	9	916588	916596	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18508	NC_017950	ATT	2	6	916622	916627	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18509	NC_017950	ATT	2	6	916672	916677	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18510	NC_017950	ATT	2	6	916715	916720	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18511	NC_017950	TGG	2	6	916817	916822	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18512	NC_017950	TC	3	6	916834	916839	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
18513	NC_017950	A	6	6	916864	916869	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18514	NC_017950	AAG	2	6	916873	916878	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18515	NC_017950	CTT	2	6	916920	916925	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18516	NC_017950	ACT	2	6	917077	917082	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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18518	NC_017950	CCATT	2	10	917126	917135	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
18519	NC_017950	AAG	2	6	917192	917197	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18520	NC_017950	ATT	2	6	917251	917256	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18521	NC_017950	GAA	2	6	917260	917265	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18522	NC_017950	CTG	2	6	917291	917296	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18523	NC_017950	TTG	2	6	917306	917311	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18524	NC_017950	A	7	7	917322	917328	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18525	NC_017950	GAT	2	6	917335	917340	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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18528	NC_017950	ATG	2	6	917453	917458	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18529	NC_017950	ATT	2	6	917531	917536	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18530	NC_017950	ACA	2	6	917626	917631	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18531	NC_017950	AAC	2	6	917658	917663	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18532	NC_017950	AGA	2	6	917664	917669	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18533	NC_017950	AGA	2	6	917700	917705	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18534	NC_017950	GAA	2	6	917719	917724	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18535	NC_017950	AAGGT	2	10	917738	917747	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
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18538	NC_017950	CAA	3	9	917837	917845	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18539	NC_017950	GAC	2	6	917932	917937	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18540	NC_017950	CGG	2	6	917972	917977	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18541	NC_017950	ACA	2	6	918001	918006	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18542	NC_017950	AGA	2	6	918054	918059	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18543	NC_017950	AAC	2	6	918068	918073	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18544	NC_017950	CTC	2	6	918223	918228	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18545	NC_017950	ATA	2	6	918233	918238	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18546	NC_017950	AAG	2	6	918377	918382	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18547	NC_017950	ATTTG	2	10	918405	918414	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
18548	NC_017950	AAG	2	6	918421	918426	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18549	NC_017950	CGT	2	6	918463	918468	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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18551	NC_017950	TACC	2	8	918568	918575	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
18552	NC_017950	GAA	2	6	918589	918594	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18553	NC_017950	TGA	2	6	918639	918644	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18554	NC_017950	TTGA	2	8	918742	918749	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
18555	NC_017950	TGG	2	6	918927	918932	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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18560	NC_017950	TGG	2	6	919260	919265	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18561	NC_017950	TCG	2	6	919268	919273	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18562	NC_017950	GAC	2	6	919341	919346	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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18565	NC_017950	TAA	2	6	919425	919430	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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18568	NC_017950	GCAA	2	8	919563	919570	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
18569	NC_017950	CTTAA	2	10	919618	919627	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
18570	NC_017950	ATT	2	6	919631	919636	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18571	NC_017950	ACT	2	6	919643	919648	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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18574	NC_017950	CTT	2	6	919729	919734	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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18605	NC_017950	TCT	2	6	921251	921256	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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18611	NC_017950	AAT	2	6	921630	921635	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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18623	NC_017950	TGA	2	6	922186	922191	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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18625	NC_017950	A	6	6	922284	922289	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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18629	NC_017950	AGG	2	6	922532	922537	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	389856573
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