MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus suis ST1 chromosome

Total Repeats: 41086

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_017950	TGT	2	6	648317	648322	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13002	NC_017950	TGAT	2	8	648410	648417	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
13003	NC_017950	AAG	2	6	648443	648448	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13004	NC_017950	AAT	2	6	648585	648590	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	389856304
13005	NC_017950	CTTG	2	8	648591	648598	0 %	50 %	25 %	25 %	389856304
13006	NC_017950	TTC	2	6	648624	648629	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	389856304
13007	NC_017950	ATC	2	6	648630	648635	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	389856304
13008	NC_017950	TCA	2	6	648727	648732	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	389856304
13009	NC_017950	GAA	2	6	648744	648749	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389856304
13010	NC_017950	ATT	2	6	648891	648896	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	389856304
13011	NC_017950	CAA	2	6	648902	648907	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	389856304
13012	NC_017950	AGC	2	6	648921	648926	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389856304
13013	NC_017950	AAT	2	6	648979	648984	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	389856304
13014	NC_017950	TCA	2	6	648997	649002	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	389856304
13015	NC_017950	CCA	2	6	649018	649023	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	389856304
13016	NC_017950	TCA	2	6	649081	649086	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	389856304
13017	NC_017950	T	6	6	649234	649239	0 %	100 %	0 %	0 %	389856304
13018	NC_017950	CAT	2	6	649298	649303	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	389856304
13019	NC_017950	CAA	2	6	649439	649444	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	389856304
13020	NC_017950	T	6	6	649445	649450	0 %	100 %	0 %	0 %	389856304
13021	NC_017950	TCA	2	6	649489	649494	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	389856304
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13023	NC_017950	TG	3	6	649603	649608	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
13024	NC_017950	TC	3	6	649609	649614	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13025	NC_017950	TGA	2	6	649626	649631	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13026	NC_017950	A	6	6	649709	649714	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13027	NC_017950	A	6	6	649803	649808	100 %	0 %	0 %	0 %	389856305
13028	NC_017950	TAT	2	6	649820	649825	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	389856305
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13032	NC_017950	TTG	2	6	650104	650109	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	389856305
13033	NC_017950	TTA	2	6	650125	650130	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	389856305
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13043	NC_017950	CTTG	2	8	650636	650643	0 %	50 %	25 %	25 %	389856305
13044	NC_017950	ATG	2	6	650652	650657	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389856305
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13052	NC_017950	T	6	6	651026	651031	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13053	NC_017950	ATA	2	6	651041	651046	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13054	NC_017950	TA	3	6	651093	651098	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13055	NC_017950	AAC	2	6	651162	651167	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	389856306
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13061	NC_017950	GTC	2	6	651554	651559	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389856306
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13087	NC_017950	TAT	2	6	653011	653016	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	389856308
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13101	NC_017950	CCT	2	6	653636	653641	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	389856309
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13103	NC_017950	GGA	2	6	653687	653692	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	389856309
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13105	NC_017950	TGA	2	6	653822	653827	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389856309
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13107	NC_017950	CAGG	2	8	654042	654049	25 %	0 %	50 %	25 %	389856309
13108	NC_017950	CGC	2	6	654177	654182	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	389856309
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13110	NC_017950	TGA	2	6	654281	654286	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389856309
13111	NC_017950	CTGA	2	8	654351	654358	25 %	25 %	25 %	25 %	389856309
13112	NC_017950	GGTT	2	8	654362	654369	0 %	50 %	50 %	0 %	389856309
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13117	NC_017950	TCATG	2	10	654602	654611	20 %	40 %	20 %	20 %	389856309
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13120	NC_017950	TGAC	2	8	654923	654930	25 %	25 %	25 %	25 %	389856310
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13223	NC_017950	TAG	3	9	660259	660267	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389856313
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13230	NC_017950	A	7	7	660577	660583	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13231	NC_017950	GA	3	6	660589	660594	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13232	NC_017950	TA	4	8	660618	660625	50 %	50 %	0 %	0 %	389856314
13233	NC_017950	ATT	2	6	660652	660657	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	389856314
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13235	NC_017950	ATTG	2	8	660717	660724	25 %	50 %	25 %	0 %	389856314
13236	NC_017950	T	6	6	660734	660739	0 %	100 %	0 %	0 %	389856314
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13239	NC_017950	CTATT	2	10	660838	660847	20 %	60 %	0 %	20 %	389856314
13240	NC_017950	AAGC	2	8	660898	660905	50 %	0 %	25 %	25 %	389856314
13241	NC_017950	TGAG	2	8	660998	661005	25 %	25 %	50 %	0 %	389856314
13242	NC_017950	CTA	2	6	661078	661083	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	389856314
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13246	NC_017950	TATG	2	8	661209	661216	25 %	50 %	25 %	0 %	389856314
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13354	NC_017950	AAG	2	6	667287	667292	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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13362	NC_017950	AG	4	8	667598	667605	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13363	NC_017950	CAA	2	6	667632	667637	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	389856319
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13491	NC_017950	CTT	2	6	674343	674348	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	389856328
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