MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus suis ST1 chromosome

Total Repeats: 41086

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11001	NC_017950	TGA	2	6	543958	543963	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11002	NC_017950	GAA	2	6	544001	544006	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11003	NC_017950	GAA	2	6	544040	544045	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11004	NC_017950	CAT	2	6	544084	544089	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11005	NC_017950	AGA	2	6	544134	544139	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11006	NC_017950	AAGAT	2	10	544203	544212	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
11007	NC_017950	TGG	2	6	544287	544292	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11008	NC_017950	TGG	2	6	544305	544310	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11009	NC_017950	TCG	2	6	544324	544329	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11010	NC_017950	CGT	2	6	544526	544531	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11011	NC_017950	ATG	2	6	544562	544567	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11012	NC_017950	TGT	2	6	544628	544633	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11013	NC_017950	ACA	2	6	544638	544643	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11014	NC_017950	TGG	2	6	544669	544674	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11015	NC_017950	CTGAGC	2	12	544693	544704	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11016	NC_017950	A	6	6	544778	544783	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11017	NC_017950	CAT	2	6	544802	544807	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11018	NC_017950	ATC	2	6	544857	544862	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11019	NC_017950	ATG	2	6	544933	544938	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11020	NC_017950	TCA	2	6	544965	544970	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11021	NC_017950	ATA	2	6	545038	545043	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11022	NC_017950	CAG	2	6	545078	545083	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11023	NC_017950	GAA	2	6	545101	545106	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11024	NC_017950	A	6	6	545113	545118	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11025	NC_017950	CTT	2	6	545123	545128	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11026	NC_017950	GAA	2	6	545159	545164	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11027	NC_017950	AGA	2	6	545229	545234	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389856214
11028	NC_017950	TGAA	2	8	545247	545254	50 %	25 %	25 %	0 %	389856214
11029	NC_017950	A	6	6	545257	545262	100 %	0 %	0 %	0 %	389856214
11030	NC_017950	ATG	2	6	545298	545303	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389856214
11031	NC_017950	AGA	2	6	545332	545337	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389856214
11032	NC_017950	GTTG	2	8	545356	545363	0 %	50 %	50 %	0 %	389856214
11033	NC_017950	ATCC	2	8	545456	545463	25 %	25 %	0 %	50 %	389856214
11034	NC_017950	GGT	2	6	545471	545476	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	389856214
11035	NC_017950	TGA	2	6	545575	545580	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389856214
11036	NC_017950	GCTT	2	8	545631	545638	0 %	50 %	25 %	25 %	389856214
11037	NC_017950	CGT	2	6	545696	545701	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389856214
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11041	NC_017950	CAA	2	6	545824	545829	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	389856214
11042	NC_017950	GAA	2	6	545965	545970	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389856214
11043	NC_017950	ACTC	2	8	545985	545992	25 %	25 %	0 %	50 %	389856214
11044	NC_017950	AAGA	2	8	546002	546009	75 %	0 %	25 %	0 %	389856214
11045	NC_017950	ACC	2	6	546069	546074	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	389856214
11046	NC_017950	AAGTG	2	10	546181	546190	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
11047	NC_017950	GTAA	2	8	546194	546201	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
11048	NC_017950	TCA	2	6	546217	546222	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11049	NC_017950	T	6	6	546229	546234	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11050	NC_017950	ACTG	2	8	546243	546250	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
11051	NC_017950	A	6	6	546258	546263	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11052	NC_017950	AAAG	2	8	546277	546284	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
11053	NC_017950	AAT	2	6	546313	546318	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	389856215
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11055	NC_017950	AG	3	6	546525	546530	50 %	0 %	50 %	0 %	389856215
11056	NC_017950	CGT	2	6	546545	546550	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389856215
11057	NC_017950	TGGT	2	8	546684	546691	0 %	50 %	50 %	0 %	389856215
11058	NC_017950	GGT	2	6	546731	546736	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	389856215
11059	NC_017950	TATTGC	2	12	546748	546759	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	389856215
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11061	NC_017950	ATTG	2	8	546787	546794	25 %	50 %	25 %	0 %	389856215
11062	NC_017950	TGA	2	6	546796	546801	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389856215
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11064	NC_017950	GTA	2	6	546956	546961	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389856215
11065	NC_017950	TGA	2	6	546964	546969	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389856215
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11067	NC_017950	TTGG	2	8	547098	547105	0 %	50 %	50 %	0 %	389856216
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11095	NC_017950	CAT	2	6	549338	549343	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	389856217
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11097	NC_017950	AGGG	2	8	549420	549427	25 %	0 %	75 %	0 %	389856217
11098	NC_017950	GTCG	2	8	549449	549456	0 %	25 %	50 %	25 %	389856217
11099	NC_017950	TTGA	2	8	549534	549541	25 %	50 %	25 %	0 %	389856217
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11101	NC_017950	TGA	2	6	549688	549693	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389856217
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11378	NC_017950	CTG	2	6	562645	562650	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389856228
11379	NC_017950	CTA	2	6	562675	562680	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	389856228
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11475	NC_017950	CA	3	6	567326	567331	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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11477	NC_017950	A	6	6	567414	567419	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11478	NC_017950	TCG	2	6	567531	567536	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389856233
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11493	NC_017950	GACAG	2	10	568227	568236	40 %	0 %	40 %	20 %	389856233
11494	NC_017950	CAGA	2	8	568252	568259	50 %	0 %	25 %	25 %	389856233
11495	NC_017950	GGT	2	6	568279	568284	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	389856233
11496	NC_017950	T	6	6	568381	568386	0 %	100 %	0 %	0 %	389856234
11497	NC_017950	GATGCG	2	12	568412	568423	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	389856234
11498	NC_017950	GAT	2	6	568502	568507	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389856234
11499	NC_017950	ATC	2	6	568592	568597	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	389856234
11500	NC_017950	TTG	2	6	568607	568612	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	389856234

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