MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptomyces hygroscopicus subsp. jinggangensis 5008 plasmid pSHJG1

Total Repeats: 4299

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_017766	GTT	2	6	134213	134218	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3502	NC_017766	GCA	2	6	134232	134237	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386835982
3503	NC_017766	GTAC	2	8	134311	134318	25 %	25 %	25 %	25 %	386835982
3504	NC_017766	CAG	3	9	134332	134340	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386835982
3505	NC_017766	CGG	2	6	134343	134348	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386835982
3506	NC_017766	CCGT	2	8	134570	134577	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3507	NC_017766	GCG	2	6	134639	134644	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386835983
3508	NC_017766	CTG	2	6	134651	134656	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386835983
3509	NC_017766	TGC	2	6	134661	134666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386835983
3510	NC_017766	TGG	2	6	134693	134698	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386835983
3511	NC_017766	GC	3	6	134798	134803	0 %	0 %	50 %	50 %	386835983
3512	NC_017766	CAG	2	6	134804	134809	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386835983
3513	NC_017766	CG	3	6	134869	134874	0 %	0 %	50 %	50 %	386835983
3514	NC_017766	CAC	2	6	134893	134898	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386835983
3515	NC_017766	ACG	2	6	134904	134909	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386835983
3516	NC_017766	CGAAGC	2	12	134916	134927	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386835983
3517	NC_017766	GAC	2	6	135005	135010	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386835983
3518	NC_017766	CCG	2	6	135028	135033	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386835983
3519	NC_017766	GTC	2	6	135101	135106	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386835983
3520	NC_017766	AGG	2	6	135108	135113	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386835983
3521	NC_017766	GAC	2	6	135119	135124	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386835983
3522	NC_017766	C	6	6	135148	135153	0 %	0 %	0 %	100 %	386835983
3523	NC_017766	GAC	2	6	135155	135160	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386835983
3524	NC_017766	TCG	2	6	135228	135233	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386835983
3525	NC_017766	CG	3	6	135237	135242	0 %	0 %	50 %	50 %	386835983
3526	NC_017766	CGA	2	6	135247	135252	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386835983
3527	NC_017766	GCTTCT	2	12	135285	135296	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	386835983
3528	NC_017766	GGA	2	6	135379	135384	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386835983
3529	NC_017766	CTC	2	6	135444	135449	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386835983
3530	NC_017766	CG	3	6	135470	135475	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3531	NC_017766	CGGGC	2	10	135483	135492	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
3532	NC_017766	CGC	2	6	135541	135546	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3533	NC_017766	CCA	2	6	135554	135559	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3534	NC_017766	GC	3	6	135567	135572	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3535	NC_017766	GGA	2	6	135631	135636	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3536	NC_017766	GAG	2	6	135662	135667	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3537	NC_017766	AGGCC	2	10	135698	135707	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
3538	NC_017766	CAC	2	6	135735	135740	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3539	NC_017766	AGGG	2	8	135743	135750	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
3540	NC_017766	CGC	2	6	135858	135863	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3541	NC_017766	CCAG	2	8	135874	135881	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3542	NC_017766	CAGCG	2	10	135903	135912	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
3543	NC_017766	GCC	2	6	135916	135921	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3544	NC_017766	CAG	2	6	135934	135939	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3545	NC_017766	GAG	2	6	135952	135957	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386835984
3546	NC_017766	GAC	2	6	135972	135977	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386835984
3547	NC_017766	CGC	2	6	136023	136028	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386835984
3548	NC_017766	CGC	3	9	136051	136059	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386835984
3549	NC_017766	CCGA	2	8	136071	136078	25 %	0 %	25 %	50 %	386835984
3550	NC_017766	AGC	2	6	136085	136090	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386835984
3551	NC_017766	CAG	3	9	136117	136125	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386835984
3552	NC_017766	CAC	2	6	136126	136131	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386835984
3553	NC_017766	GCA	2	6	136246	136251	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3554	NC_017766	ACG	2	6	136260	136265	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3555	NC_017766	GCC	2	6	136329	136334	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3556	NC_017766	CGA	2	6	136396	136401	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3557	NC_017766	GCG	2	6	136441	136446	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3558	NC_017766	CGT	2	6	136453	136458	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3559	NC_017766	GGTGC	2	10	136533	136542	0 %	20 %	60 %	20 %	386835985
3560	NC_017766	CTGCA	2	10	136555	136564	20 %	20 %	20 %	40 %	386835985
3561	NC_017766	GGA	2	6	136614	136619	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386835985
3562	NC_017766	CAG	2	6	136623	136628	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386835985
3563	NC_017766	GCAA	2	8	136636	136643	50 %	0 %	25 %	25 %	386835985
3564	NC_017766	GCC	2	6	136661	136666	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386835985
3565	NC_017766	CGT	2	6	136698	136703	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386835985
3566	NC_017766	ACG	2	6	136722	136727	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386835985
3567	NC_017766	GGC	2	6	136732	136737	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386835985
3568	NC_017766	ACG	2	6	136756	136761	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386835985
3569	NC_017766	GAC	2	6	136786	136791	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386835985
3570	NC_017766	CGGA	2	8	136834	136841	25 %	0 %	50 %	25 %	386835985
3571	NC_017766	CGG	3	9	136902	136910	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386835985
3572	NC_017766	GCC	2	6	136924	136929	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386835985
3573	NC_017766	CCA	2	6	136946	136951	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386835985
3574	NC_017766	GCA	2	6	136959	136964	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386835985
3575	NC_017766	CCG	2	6	136970	136975	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386835985
3576	NC_017766	GGC	2	6	137028	137033	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386835985
3577	NC_017766	ACGA	2	8	137044	137051	50 %	0 %	25 %	25 %	386835985
3578	NC_017766	ATG	2	6	137077	137082	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386835985
3579	NC_017766	CCG	2	6	137092	137097	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3580	NC_017766	ACG	2	6	137195	137200	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3581	NC_017766	CG	3	6	137236	137241	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3582	NC_017766	C	6	6	137288	137293	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3583	NC_017766	GAT	2	6	137309	137314	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386835986
3584	NC_017766	AGC	2	6	137344	137349	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386835986
3585	NC_017766	AGC	2	6	137362	137367	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386835986
3586	NC_017766	CG	3	6	137388	137393	0 %	0 %	50 %	50 %	386835986
3587	NC_017766	GCC	3	9	137414	137422	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386835986
3588	NC_017766	CCGCTC	2	12	137432	137443	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	386835986
3589	NC_017766	CGG	2	6	137456	137461	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386835986
3590	NC_017766	GCC	2	6	137491	137496	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386835986
3591	NC_017766	CGG	2	6	137547	137552	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3592	NC_017766	ACTCC	2	10	137612	137621	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
3593	NC_017766	CGGTG	2	10	137629	137638	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
3594	NC_017766	GGTGC	2	10	137673	137682	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
3595	NC_017766	CG	3	6	137699	137704	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3596	NC_017766	CGA	2	6	137706	137711	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386835987
3597	NC_017766	CACCG	2	10	137729	137738	20 %	0 %	20 %	60 %	386835987
3598	NC_017766	GC	3	6	137739	137744	0 %	0 %	50 %	50 %	386835987
3599	NC_017766	GCC	2	6	137766	137771	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386835987
3600	NC_017766	GCC	2	6	137866	137871	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3601	NC_017766	GC	3	6	137873	137878	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3602	NC_017766	GCGG	2	8	137884	137891	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
3603	NC_017766	TCCCG	2	10	137892	137901	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
3604	NC_017766	GGTGG	2	10	137956	137965	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
3605	NC_017766	TGAT	2	8	138047	138054	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3606	NC_017766	GGCTG	2	10	138186	138195	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
3607	NC_017766	TCT	2	6	138259	138264	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3608	NC_017766	TCCG	2	8	138265	138272	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3609	NC_017766	CCG	2	6	138281	138286	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3610	NC_017766	GGT	2	6	138306	138311	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386835988
3611	NC_017766	GCC	2	6	138337	138342	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386835988
3612	NC_017766	ACC	3	9	138344	138352	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386835988
3613	NC_017766	CCA	2	6	138357	138362	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386835988
3614	NC_017766	GGT	2	6	138372	138377	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386835988
3615	NC_017766	GAC	2	6	138415	138420	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386835988
3616	NC_017766	GTGG	2	8	138447	138454	0 %	25 %	75 %	0 %	386835988
3617	NC_017766	CCGT	2	8	138563	138570	0 %	25 %	25 %	50 %	386835988
3618	NC_017766	CGGA	2	8	138598	138605	25 %	0 %	50 %	25 %	386835988
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3621	NC_017766	TCG	2	6	138683	138688	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386835988
3622	NC_017766	CCA	2	6	138705	138710	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386835988
3623	NC_017766	ACC	2	6	138716	138721	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386835988
3624	NC_017766	GCG	2	6	138722	138727	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386835988
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3995	NC_017766	TCC	2	6	153111	153116	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386836010
3996	NC_017766	GAG	2	6	153122	153127	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386836010
3997	NC_017766	CGA	2	6	153130	153135	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386836010
3998	NC_017766	CTC	2	6	153137	153142	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386836010
3999	NC_017766	GTGG	2	8	153166	153173	0 %	25 %	75 %	0 %	386836010
4000	NC_017766	TGG	2	6	153231	153236	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386836010

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