MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. SL1344 plasmid pSLT_SL1344

Total Repeats: 2039

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_017720	TCC	2	6	70135	70140	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386730731
1502	NC_017720	CAG	2	6	70147	70152	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386730731
1503	NC_017720	GCC	2	6	70226	70231	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386730731
1504	NC_017720	AGC	2	6	70232	70237	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386730731
1505	NC_017720	CTGC	2	8	70244	70251	0 %	25 %	25 %	50 %	386730731
1506	NC_017720	CGG	2	6	70252	70257	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386730731
1507	NC_017720	ACC	2	6	70269	70274	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386730731
1508	NC_017720	ATG	2	6	70364	70369	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386730731
1509	NC_017720	CTGC	2	8	70388	70395	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1510	NC_017720	GGC	2	6	70398	70403	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1511	NC_017720	CCG	2	6	70420	70425	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1512	NC_017720	CGGG	2	8	70428	70435	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1513	NC_017720	CAG	2	6	70437	70442	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1514	NC_017720	TCAC	2	8	70474	70481	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1515	NC_017720	CCCG	2	8	70485	70492	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1516	NC_017720	CGG	2	6	70510	70515	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1517	NC_017720	CGGG	2	8	70524	70531	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1518	NC_017720	CAC	2	6	70551	70556	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1519	NC_017720	GTC	3	9	70608	70616	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1520	NC_017720	CGG	2	6	70657	70662	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1521	NC_017720	CCA	2	6	70725	70730	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1522	NC_017720	ACAGGG	2	12	70745	70756	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
1523	NC_017720	CTGC	2	8	70806	70813	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1524	NC_017720	AAC	2	6	70831	70836	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1525	NC_017720	GGCT	2	8	70885	70892	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1526	NC_017720	T	6	6	70892	70897	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1527	NC_017720	C	6	6	70966	70971	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1528	NC_017720	GC	3	6	70983	70988	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1529	NC_017720	GC	3	6	71058	71063	0 %	0 %	50 %	50 %	386730732
1530	NC_017720	ATC	2	6	71065	71070	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386730732
1531	NC_017720	GTC	2	6	71115	71120	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386730732
1532	NC_017720	C	6	6	71136	71141	0 %	0 %	0 %	100 %	386730732
1533	NC_017720	GGC	2	6	71142	71147	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386730732
1534	NC_017720	CCG	2	6	71162	71167	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386730732
1535	NC_017720	CAG	2	6	71253	71258	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386730732
1536	NC_017720	CGGA	2	8	71262	71269	25 %	0 %	50 %	25 %	386730732
1537	NC_017720	GCG	2	6	71273	71278	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386730732
1538	NC_017720	CAGGCT	2	12	71286	71297	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	386730732
1539	NC_017720	TCA	3	9	71309	71317	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386730732
1540	NC_017720	CGGC	2	8	71323	71330	0 %	0 %	50 %	50 %	386730732
1541	NC_017720	TCG	2	6	71365	71370	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386730732
1542	NC_017720	GCA	2	6	71381	71386	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386730732
1543	NC_017720	CCG	2	6	71392	71397	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386730732
1544	NC_017720	CAG	2	6	71439	71444	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386730732
1545	NC_017720	CAGC	2	8	71460	71467	25 %	0 %	25 %	50 %	386730732
1546	NC_017720	CAC	2	6	71487	71492	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386730732
1547	NC_017720	CCT	2	6	71497	71502	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386730732
1548	NC_017720	CCT	2	6	71601	71606	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386730733
1549	NC_017720	GCA	2	6	71734	71739	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386730733
1550	NC_017720	ACGTC	2	10	71818	71827	20 %	20 %	20 %	40 %	386730733
1551	NC_017720	CGGT	2	8	71877	71884	0 %	25 %	50 %	25 %	386730733
1552	NC_017720	GC	3	6	71897	71902	0 %	0 %	50 %	50 %	386730733
1553	NC_017720	ACG	2	6	71930	71935	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386730733
1554	NC_017720	CCA	2	6	71959	71964	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386730733
1555	NC_017720	GCTG	2	8	72019	72026	0 %	25 %	50 %	25 %	386730733
1556	NC_017720	GCC	2	6	72054	72059	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386730733
1557	NC_017720	CCGC	2	8	72064	72071	0 %	0 %	25 %	75 %	386730733
1558	NC_017720	GGT	2	6	72105	72110	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386730733
1559	NC_017720	CAG	2	6	72182	72187	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386730733
1560	NC_017720	CAG	2	6	72242	72247	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386730733
1561	NC_017720	GTC	2	6	72260	72265	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386730733
1562	NC_017720	TGC	2	6	72267	72272	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386730733
1563	NC_017720	GCC	2	6	72297	72302	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386730733
1564	NC_017720	GCA	2	6	72322	72327	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386730733
1565	NC_017720	CTGC	2	8	72337	72344	0 %	25 %	25 %	50 %	386730733
1566	NC_017720	ACAG	2	8	72347	72354	50 %	0 %	25 %	25 %	386730733
1567	NC_017720	CT	3	6	72380	72385	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1568	NC_017720	CAT	2	6	72409	72414	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386730734
1569	NC_017720	T	6	6	72416	72421	0 %	100 %	0 %	0 %	386730734
1570	NC_017720	CGC	2	6	72473	72478	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386730734
1571	NC_017720	CAG	2	6	72546	72551	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386730734
1572	NC_017720	GC	3	6	72619	72624	0 %	0 %	50 %	50 %	386730734
1573	NC_017720	GAC	2	6	72665	72670	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386730734
1574	NC_017720	CGT	2	6	72780	72785	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386730734
1575	NC_017720	CAG	2	6	72804	72809	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386730734
1576	NC_017720	GTC	2	6	72850	72855	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386730734
1577	NC_017720	GGT	2	6	72935	72940	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386730735
1578	NC_017720	CCG	2	6	72975	72980	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386730735
1579	NC_017720	ACC	2	6	73038	73043	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386730735
1580	NC_017720	GCG	2	6	73148	73153	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386730735
1581	NC_017720	CA	3	6	73166	73171	50 %	0 %	0 %	50 %	386730735
1582	NC_017720	GCC	2	6	73172	73177	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386730735
1583	NC_017720	ACT	2	6	73187	73192	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386730735
1584	NC_017720	AGC	2	6	73194	73199	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386730735
1585	NC_017720	CAG	2	6	73335	73340	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386730736
1586	NC_017720	CAG	2	6	73401	73406	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386730736
1587	NC_017720	CCG	2	6	73434	73439	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386730736
1588	NC_017720	ATG	2	6	73453	73458	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386730736
1589	NC_017720	TGT	2	6	73539	73544	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386730737
1590	NC_017720	TTC	2	6	73606	73611	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386730737
1591	NC_017720	CGG	2	6	73634	73639	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386730737
1592	NC_017720	CGT	2	6	73683	73688	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386730737
1593	NC_017720	AGC	2	6	73697	73702	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386730737
1594	NC_017720	GCTGTC	2	12	73708	73719	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386730737
1595	NC_017720	CACTGT	2	12	73720	73731	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	386730737
1596	NC_017720	GCT	2	6	73737	73742	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386730737
1597	NC_017720	T	6	6	73757	73762	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1598	NC_017720	CGC	2	6	73865	73870	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1599	NC_017720	T	6	6	74069	74074	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1600	NC_017720	GC	3	6	74141	74146	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1601	NC_017720	ACA	2	6	74171	74176	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1602	NC_017720	CAG	2	6	74188	74193	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1603	NC_017720	AGA	2	6	74249	74254	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1604	NC_017720	T	6	6	74267	74272	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1605	NC_017720	AAAATT	2	12	74340	74351	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1606	NC_017720	CGT	2	6	74407	74412	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1607	NC_017720	ATG	2	6	74575	74580	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386730738
1608	NC_017720	GCA	3	9	74661	74669	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386730738
1609	NC_017720	CT	3	6	74671	74676	0 %	50 %	0 %	50 %	386730738
1610	NC_017720	AGG	2	6	74678	74683	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386730738
1611	NC_017720	AAC	2	6	74738	74743	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386730738
1612	NC_017720	TTA	2	6	74770	74775	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386730738
1613	NC_017720	T	6	6	74815	74820	0 %	100 %	0 %	0 %	386730738
1614	NC_017720	GAT	2	6	74851	74856	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386730738
1615	NC_017720	AT	3	6	74964	74969	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1616	NC_017720	CTG	2	6	75061	75066	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1617	NC_017720	ACTG	2	8	75111	75118	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1618	NC_017720	CTGT	2	8	75129	75136	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1619	NC_017720	AAAT	2	8	75222	75229	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1620	NC_017720	GTT	2	6	75337	75342	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1621	NC_017720	AGG	2	6	75379	75384	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1622	NC_017720	CTG	2	6	75398	75403	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1623	NC_017720	ATG	2	6	75411	75416	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1624	NC_017720	GATG	2	8	75426	75433	25 %	25 %	50 %	0 %	386730739
1625	NC_017720	AACAGA	2	12	75465	75476	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	386730739
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1627	NC_017720	GAA	2	6	75592	75597	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386730739
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