MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. ST4/74 plasmid TY474p2

Total Repeats: 1755

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017675	ATTTT	2	10	35	44	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017675	T	7	7	41	47	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017675	TTA	2	6	67	72	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017675	GAG	2	6	84	89	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017675	GAAGA	2	10	96	105	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017675	TTA	2	6	156	161	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017675	GCG	2	6	194	199	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_017675	GA	3	6	236	241	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017675	AGA	2	6	264	269	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017675	TCTT	2	8	311	318	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
11	NC_017675	ACG	2	6	333	338	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_017675	GAA	2	6	466	471	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386730447
13	NC_017675	CGT	3	9	596	604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_017675	CCA	2	6	615	620	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15	NC_017675	GTCG	2	8	791	798	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
16	NC_017675	TCCG	2	8	810	817	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
17	NC_017675	CCT	2	6	829	834	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18	NC_017675	CA	3	6	877	882	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
19	NC_017675	CAG	3	9	1139	1147	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_017675	GTGAAA	2	12	1158	1169	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017675	CAG	2	6	1175	1180	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_017675	CGT	2	6	1280	1285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_017675	AGC	3	9	1291	1299	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_017675	GC	3	6	1306	1311	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
25	NC_017675	GAA	2	6	1321	1326	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017675	CTGC	2	8	1328	1335	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
27	NC_017675	CAG	2	6	1340	1345	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_017675	GCTG	2	8	1462	1469	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
29	NC_017675	ATC	2	6	1511	1516	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_017675	TCA	2	6	1625	1630	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_017675	GTT	2	6	1643	1648	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017675	CAAA	2	8	1670	1677	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
33	NC_017675	AAG	2	6	1685	1690	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017675	ATT	2	6	1734	1739	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017675	CGC	2	6	1758	1763	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
36	NC_017675	GCCGC	2	10	1832	1841	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
37	NC_017675	CG	3	6	1871	1876	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
38	NC_017675	CAA	2	6	1905	1910	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_017675	CA	3	6	1934	1939	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
40	NC_017675	GCA	2	6	1943	1948	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_017675	GCC	2	6	1980	1985	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
42	NC_017675	AAC	2	6	2003	2008	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_017675	TGT	2	6	2027	2032	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017675	ATC	2	6	2042	2047	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_017675	TCT	2	6	2056	2061	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_017675	TCG	2	6	2144	2149	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_017675	CT	3	6	2175	2180	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
48	NC_017675	ATCA	2	8	2236	2243	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
49	NC_017675	CGG	2	6	2265	2270	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_017675	GCC	2	6	2303	2308	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
51	NC_017675	TA	3	6	2356	2361	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017675	TA	3	6	2367	2372	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017675	GTA	2	6	2374	2379	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017675	CTGAA	2	10	2429	2438	40 %	20 %	20 %	20 %	386730448
55	NC_017675	GCA	2	6	2523	2528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386730448
56	NC_017675	CTG	2	6	2615	2620	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386730448
57	NC_017675	ATG	2	6	2661	2666	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386730448
58	NC_017675	GCCA	2	8	2688	2695	25 %	0 %	25 %	50 %	386730449
59	NC_017675	CAGC	2	8	2776	2783	25 %	0 %	25 %	50 %	386730449
60	NC_017675	AAGGA	2	10	2960	2969	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017675	AAT	2	6	2985	2990	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386730450
62	NC_017675	CCA	2	6	3001	3006	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386730450
63	NC_017675	TGG	2	6	3122	3127	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386730450
64	NC_017675	ACA	2	6	3194	3199	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386730450
65	NC_017675	GCTG	2	8	3200	3207	0 %	25 %	50 %	25 %	386730450
66	NC_017675	GGCA	2	8	3262	3269	25 %	0 %	50 %	25 %	386730450
67	NC_017675	ATA	2	6	3325	3330	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386730450
68	NC_017675	GGT	2	6	3374	3379	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386730450
69	NC_017675	GCC	2	6	3423	3428	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386730450
70	NC_017675	CT	3	6	3454	3459	0 %	50 %	0 %	50 %	386730450
71	NC_017675	GCG	2	6	3460	3465	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386730450
72	NC_017675	CAT	2	6	3469	3474	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386730450
73	NC_017675	GACC	2	8	3513	3520	25 %	0 %	25 %	50 %	386730450
74	NC_017675	CTG	2	6	3568	3573	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386730450
75	NC_017675	CTGG	2	8	3596	3603	0 %	25 %	50 %	25 %	386730450
76	NC_017675	GCTG	2	8	3632	3639	0 %	25 %	50 %	25 %	386730450
77	NC_017675	CCA	2	6	3655	3660	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386730450
78	NC_017675	TGC	2	6	3689	3694	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386730450
79	NC_017675	GGCA	2	8	3721	3728	25 %	0 %	50 %	25 %	386730450
80	NC_017675	GGT	2	6	3764	3769	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386730450
81	NC_017675	TGC	2	6	3779	3784	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386730450
82	NC_017675	ATC	2	6	3787	3792	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386730450
83	NC_017675	CTG	2	6	3798	3803	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386730450
84	NC_017675	GCCTG	2	10	3833	3842	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
85	NC_017675	CCG	2	6	3878	3883	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
86	NC_017675	TTG	2	6	3885	3890	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017675	ATGT	2	8	3911	3918	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017675	GAT	2	6	3939	3944	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017675	GA	3	6	3949	3954	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017675	T	7	7	3978	3984	0 %	100 %	0 %	0 %	386730451
91	NC_017675	GGC	2	6	3986	3991	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386730451
92	NC_017675	TGC	2	6	4125	4130	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386730451
93	NC_017675	CGATCC	2	12	4156	4167	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	386730451
94	NC_017675	GTT	2	6	4238	4243	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386730451
95	NC_017675	TGG	2	6	4299	4304	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386730451
96	NC_017675	A	6	6	4305	4310	100 %	0 %	0 %	0 %	386730451
97	NC_017675	GCC	2	6	4331	4336	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386730451
98	NC_017675	A	6	6	4412	4417	100 %	0 %	0 %	0 %	386730451
99	NC_017675	TTG	2	6	4436	4441	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017675	TTC	2	6	4442	4447	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_017675	TCA	2	6	4452	4457	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_017675	ATG	2	6	4489	4494	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017675	TGAGAA	2	12	4537	4548	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017675	GTC	2	6	4557	4562	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386730452
105	NC_017675	TGC	2	6	4589	4594	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386730452
106	NC_017675	GCT	2	6	4602	4607	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386730452
107	NC_017675	GTTG	2	8	4608	4615	0 %	50 %	50 %	0 %	386730452
108	NC_017675	GGT	2	6	4616	4621	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386730452
109	NC_017675	GAT	2	6	4651	4656	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386730452
110	NC_017675	ATTT	2	8	4695	4702	25 %	75 %	0 %	0 %	386730452
111	NC_017675	GA	3	6	4744	4749	50 %	0 %	50 %	0 %	386730452
112	NC_017675	AAT	2	6	4797	4802	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017675	A	6	6	4812	4817	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017675	TC	4	8	4842	4849	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
115	NC_017675	TTA	2	6	5027	5032	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386730453
116	NC_017675	ATC	2	6	5092	5097	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386730453
117	NC_017675	ATC	3	9	5159	5167	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386730453
118	NC_017675	T	6	6	5175	5180	0 %	100 %	0 %	0 %	386730454
119	NC_017675	TTC	2	6	5203	5208	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386730454
120	NC_017675	CTG	2	6	5229	5234	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386730454
121	NC_017675	CCCG	2	8	5306	5313	0 %	0 %	25 %	75 %	386730454
122	NC_017675	AAG	2	6	5343	5348	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386730454
123	NC_017675	AAG	2	6	5419	5424	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386730454
124	NC_017675	GAAA	2	8	5449	5456	75 %	0 %	25 %	0 %	386730454
125	NC_017675	GTA	2	6	5457	5462	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386730454
126	NC_017675	ATA	2	6	5555	5560	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386730454
127	NC_017675	A	7	7	5569	5575	100 %	0 %	0 %	0 %	386730454
128	NC_017675	TA	3	6	5576	5581	50 %	50 %	0 %	0 %	386730454
129	NC_017675	TCT	2	6	5633	5638	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386730454
130	NC_017675	CA	3	6	5651	5656	50 %	0 %	0 %	50 %	386730454
131	NC_017675	T	6	6	5673	5678	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017675	CTG	2	6	5734	5739	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386730455
133	NC_017675	CGG	2	6	5885	5890	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386730455
134	NC_017675	CCA	2	6	6005	6010	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386730455
135	NC_017675	T	6	6	6045	6050	0 %	100 %	0 %	0 %	386730455
136	NC_017675	GGGA	2	8	6084	6091	25 %	0 %	75 %	0 %	386730455
137	NC_017675	TCTTT	2	10	6106	6115	0 %	80 %	0 %	20 %	386730455
138	NC_017675	TTC	3	9	6116	6124	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386730455
139	NC_017675	CTGG	2	8	6125	6132	0 %	25 %	50 %	25 %	386730455
140	NC_017675	CGG	2	6	6174	6179	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386730455
141	NC_017675	ATA	2	6	6218	6223	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386730455
142	NC_017675	T	6	6	6228	6233	0 %	100 %	0 %	0 %	386730455
143	NC_017675	ACG	2	6	6259	6264	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386730455
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153	NC_017675	TC	3	6	6506	6511	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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162	NC_017675	TGA	2	6	7055	7060	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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260	NC_017675	TGA	2	6	12378	12383	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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410	NC_017675	ATC	2	6	19950	19955	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386730469
411	NC_017675	CTG	2	6	19990	19995	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386730469
412	NC_017675	CTG	2	6	19998	20003	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386730469
413	NC_017675	GCC	2	6	20052	20057	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386730469
414	NC_017675	CCG	2	6	20093	20098	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386730469
415	NC_017675	CTG	2	6	20127	20132	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386730469
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421	NC_017675	CTG	3	9	20256	20264	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
422	NC_017675	CTG	2	6	20340	20345	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
423	NC_017675	CGG	2	6	20384	20389	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
424	NC_017675	GCC	2	6	20396	20401	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
425	NC_017675	CAGT	2	8	20462	20469	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
426	NC_017675	TGGC	2	8	20532	20539	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
427	NC_017675	AGA	2	6	20609	20614	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
428	NC_017675	GCG	2	6	20631	20636	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
429	NC_017675	ACC	3	9	20640	20648	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
430	NC_017675	CGC	2	6	20676	20681	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
431	NC_017675	CTG	2	6	20714	20719	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
432	NC_017675	GAC	2	6	20730	20735	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
433	NC_017675	GTG	2	6	20748	20753	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
434	NC_017675	CGG	2	6	20788	20793	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
435	NC_017675	TGGC	2	8	20841	20848	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
436	NC_017675	TGC	2	6	20857	20862	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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438	NC_017675	GTG	2	6	20899	20904	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
439	NC_017675	GGT	2	6	20915	20920	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
440	NC_017675	GCA	2	6	20944	20949	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
441	NC_017675	ATG	2	6	20978	20983	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
442	NC_017675	CGC	2	6	21046	21051	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
443	NC_017675	GCC	2	6	21108	21113	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
444	NC_017675	CGC	2	6	21180	21185	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
445	NC_017675	CCT	2	6	21201	21206	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
446	NC_017675	GGCAC	2	10	21347	21356	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
447	NC_017675	AAC	2	6	21380	21385	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
448	NC_017675	GGA	2	6	21386	21391	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
449	NC_017675	CAT	2	6	21395	21400	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
450	NC_017675	GTCT	2	8	21445	21452	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
451	NC_017675	ATG	2	6	21522	21527	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386730470
452	NC_017675	ATG	2	6	21585	21590	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386730470
453	NC_017675	ACCGT	2	10	21637	21646	20 %	20 %	20 %	40 %	386730470
454	NC_017675	CAT	2	6	21665	21670	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386730470
455	NC_017675	GCA	2	6	21810	21815	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386730470
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457	NC_017675	GGC	2	6	21836	21841	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
458	NC_017675	GCC	2	6	21845	21850	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
459	NC_017675	TGTAC	2	10	21872	21881	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
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461	NC_017675	GTT	2	6	22066	22071	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
462	NC_017675	GTT	2	6	22078	22083	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
463	NC_017675	GAA	2	6	22096	22101	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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467	NC_017675	GAA	2	6	22234	22239	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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499	NC_017675	GAC	2	6	23760	23765	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386730474
500	NC_017675	CCGCC	2	10	23796	23805	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding

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