MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. B182 chromosome

Total Repeats: 100404

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017623	AGA	2	6	107	112	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017623	TTTA	2	8	117	124	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017623	TTA	2	6	148	153	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017623	TAA	2	6	188	193	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017623	AAC	2	6	295	300	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_017623	CCA	2	6	339	344	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7	NC_017623	CGC	2	6	522	527	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386589257
8	NC_017623	TAA	2	6	700	705	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386589257
9	NC_017623	GCC	2	6	781	786	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386589257
10	NC_017623	TGC	2	6	792	797	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386589257
11	NC_017623	TCGC	2	8	826	833	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
12	NC_017623	A	6	6	901	906	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017623	TCA	2	6	976	981	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386589258
14	NC_017623	TTG	2	6	994	999	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386589258
15	NC_017623	GATT	2	8	1023	1030	25 %	50 %	25 %	0 %	386589258
16	NC_017623	GGT	2	6	1065	1070	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386589258
17	NC_017623	GAT	2	6	1146	1151	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386589258
18	NC_017623	AGC	2	6	1160	1165	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386589258
19	NC_017623	GTT	2	6	1181	1186	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386589258
20	NC_017623	ATT	2	6	1413	1418	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017623	ATT	2	6	1458	1463	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017623	TTG	2	6	1480	1485	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017623	A	7	7	1515	1521	100 %	0 %	0 %	0 %	386589259
24	NC_017623	AAC	2	6	1543	1548	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386589259
25	NC_017623	TC	3	6	1576	1581	0 %	50 %	0 %	50 %	386589259
26	NC_017623	GGA	2	6	1589	1594	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386589259
27	NC_017623	GTG	2	6	1725	1730	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386589259
28	NC_017623	CT	3	6	1836	1841	0 %	50 %	0 %	50 %	386589259
29	NC_017623	TGT	2	6	2038	2043	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386589259
30	NC_017623	CG	3	6	2079	2084	0 %	0 %	50 %	50 %	386589259
31	NC_017623	TGG	2	6	2113	2118	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386589259
32	NC_017623	ATG	2	6	2152	2157	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386589259
33	NC_017623	CG	3	6	2160	2165	0 %	0 %	50 %	50 %	386589259
34	NC_017623	ATG	2	6	2173	2178	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386589259
35	NC_017623	TGA	2	6	2327	2332	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386589259
36	NC_017623	GCT	2	6	2363	2368	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386589259
37	NC_017623	GCG	2	6	2371	2376	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386589259
38	NC_017623	CGG	3	9	2393	2401	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386589259
39	NC_017623	TGC	3	9	2428	2436	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386589259
40	NC_017623	GCG	2	6	2464	2469	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386589259
41	NC_017623	GCC	2	6	2523	2528	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386589260
42	NC_017623	CAG	2	6	2536	2541	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386589260
43	NC_017623	ATG	2	6	2591	2596	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386589260
44	NC_017623	CAC	2	6	2674	2679	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386589260
45	NC_017623	ACC	2	6	2717	2722	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386589260
46	NC_017623	AAT	2	6	2761	2766	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386589260
47	NC_017623	GCC	2	6	2794	2799	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386589260
48	NC_017623	ATA	2	6	2888	2893	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386589260
49	NC_017623	AGC	2	6	2895	2900	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386589260
50	NC_017623	TCC	2	6	2968	2973	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386589260
51	NC_017623	CG	3	6	3012	3017	0 %	0 %	50 %	50 %	386589260
52	NC_017623	GCT	2	6	3018	3023	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386589260
53	NC_017623	TAC	2	6	3040	3045	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386589260
54	NC_017623	CACGC	2	10	3066	3075	20 %	0 %	20 %	60 %	386589260
55	NC_017623	GAG	2	6	3097	3102	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386589260
56	NC_017623	CGG	2	6	3119	3124	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386589260
57	NC_017623	GGC	2	6	3170	3175	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386589260
58	NC_017623	ATC	2	6	3190	3195	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386589260
59	NC_017623	T	6	6	3277	3282	0 %	100 %	0 %	0 %	386589260
60	NC_017623	GTT	2	6	3315	3320	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386589260
61	NC_017623	GCG	2	6	3347	3352	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386589260
62	NC_017623	CAC	2	6	3387	3392	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386589260
63	NC_017623	GGC	2	6	3423	3428	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386589260
64	NC_017623	CTT	2	6	3519	3524	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386589260
65	NC_017623	GTG	2	6	3545	3550	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386589260
66	NC_017623	A	7	7	3584	3590	100 %	0 %	0 %	0 %	386589260
67	NC_017623	GT	3	6	3593	3598	0 %	50 %	50 %	0 %	386589260
68	NC_017623	AG	3	6	3718	3723	50 %	0 %	50 %	0 %	386589260
69	NC_017623	CGG	2	6	3766	3771	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386589260
70	NC_017623	CGG	2	6	3825	3830	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386589260
71	NC_017623	T	6	6	3839	3844	0 %	100 %	0 %	0 %	386589260
72	NC_017623	ATC	2	6	3902	3907	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386589260
73	NC_017623	TTG	2	6	3969	3974	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386589260
74	NC_017623	TGC	2	6	4057	4062	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386589261
75	NC_017623	TGC	2	6	4078	4083	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386589261
76	NC_017623	GCT	2	6	4112	4117	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386589261
77	NC_017623	CAC	2	6	4194	4199	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386589261
78	NC_017623	CGC	2	6	4274	4279	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386589261
79	NC_017623	GC	3	6	4301	4306	0 %	0 %	50 %	50 %	386589261
80	NC_017623	CGG	2	6	4395	4400	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386589261
81	NC_017623	CTT	2	6	4436	4441	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386589261
82	NC_017623	TGC	2	6	4477	4482	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386589261
83	NC_017623	CCG	2	6	4507	4512	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386589261
84	NC_017623	CTG	3	9	4530	4538	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386589261
85	NC_017623	TCA	2	6	4553	4558	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386589261
86	NC_017623	CGCGT	2	10	4647	4656	0 %	20 %	40 %	40 %	386589261
87	NC_017623	AAG	2	6	4663	4668	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386589261
88	NC_017623	TTC	2	6	4696	4701	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386589261
89	NC_017623	TTC	2	6	4827	4832	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386589261
90	NC_017623	CTG	2	6	4878	4883	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386589261
91	NC_017623	GCC	2	6	5002	5007	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386589261
92	NC_017623	CAG	2	6	5010	5015	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386589261
93	NC_017623	T	6	6	5027	5032	0 %	100 %	0 %	0 %	386589261
94	NC_017623	CGTT	2	8	5059	5066	0 %	50 %	25 %	25 %	386589261
95	NC_017623	AG	3	6	5199	5204	50 %	0 %	50 %	0 %	386589261
96	NC_017623	TCA	2	6	5240	5245	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386589261
97	NC_017623	GC	3	6	5263	5268	0 %	0 %	50 %	50 %	386589261
98	NC_017623	GGC	2	6	5285	5290	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386589261
99	NC_017623	CGGG	2	8	5315	5322	0 %	0 %	75 %	25 %	386589261
100	NC_017623	CAA	2	6	5325	5330	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386589261
101	NC_017623	CGC	2	6	5352	5357	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386589261
102	NC_017623	GCT	2	6	5412	5417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386589261
103	NC_017623	TAA	2	6	5439	5444	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386589261
104	NC_017623	ATA	2	6	5458	5463	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386589261
105	NC_017623	CAC	2	6	5516	5521	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
106	NC_017623	T	6	6	5625	5630	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017623	CA	3	6	5649	5654	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
108	NC_017623	TCAT	2	8	5671	5678	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
109	NC_017623	GGC	2	6	5693	5698	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_017623	AGG	2	6	5762	5767	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017623	ATA	2	6	5817	5822	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386589262
112	NC_017623	TCT	2	6	5973	5978	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386589262
113	NC_017623	GC	3	6	6025	6030	0 %	0 %	50 %	50 %	386589262
114	NC_017623	GC	3	6	6092	6097	0 %	0 %	50 %	50 %	386589262
115	NC_017623	GTTA	2	8	6109	6116	25 %	50 %	25 %	0 %	386589262
116	NC_017623	GGC	2	6	6131	6136	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386589262
117	NC_017623	GTG	2	6	6155	6160	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386589262
118	NC_017623	CGC	2	6	6213	6218	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386589262
119	NC_017623	ATT	2	6	6248	6253	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386589262
120	NC_017623	TGT	2	6	6264	6269	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386589262
121	NC_017623	TAT	2	6	6367	6372	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386589262
122	NC_017623	T	6	6	6421	6426	0 %	100 %	0 %	0 %	386589262
123	NC_017623	GGT	2	6	6466	6471	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386589262
124	NC_017623	CGT	2	6	6564	6569	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386589262
125	NC_017623	ACT	2	6	6579	6584	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386589262
126	NC_017623	CTT	2	6	6634	6639	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386589262
127	NC_017623	GCT	2	6	6670	6675	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386589262
128	NC_017623	GCT	2	6	6838	6843	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386589262
129	NC_017623	GTT	2	6	6860	6865	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386589262
130	NC_017623	GGC	3	9	6895	6903	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386589262
131	NC_017623	TTCT	2	8	6945	6952	0 %	75 %	0 %	25 %	386589262
132	NC_017623	TTG	2	6	7061	7066	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386589262
133	NC_017623	CGG	2	6	7069	7074	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386589262
134	NC_017623	ACC	2	6	7118	7123	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386589262
135	NC_017623	AGCG	2	8	7130	7137	25 %	0 %	50 %	25 %	386589262
136	NC_017623	CGT	2	6	7151	7156	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386589262
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242	NC_017623	GCA	2	6	11855	11860	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386589267
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261	NC_017623	GC	3	6	12692	12697	0 %	0 %	50 %	50 %	386589267
262	NC_017623	TTCCG	2	10	12702	12711	0 %	40 %	20 %	40 %	386589267
263	NC_017623	CAG	2	6	12742	12747	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386589267
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399	NC_017623	G	6	6	19748	19753	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
400	NC_017623	GT	4	8	19806	19813	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
401	NC_017623	GAC	2	6	19850	19855	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
402	NC_017623	CAA	2	6	19876	19881	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
403	NC_017623	GGT	2	6	19948	19953	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
404	NC_017623	GA	3	6	19978	19983	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
405	NC_017623	AGTC	2	8	20074	20081	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
406	NC_017623	GCTG	2	8	20092	20099	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
407	NC_017623	TTA	2	6	20107	20112	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
408	NC_017623	CGG	2	6	20231	20236	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
409	NC_017623	ATG	2	6	20307	20312	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
410	NC_017623	ACC	2	6	20502	20507	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
411	NC_017623	TGG	2	6	20562	20567	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
412	NC_017623	TCC	2	6	20588	20593	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
413	NC_017623	GGA	2	6	20605	20610	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
414	NC_017623	AGG	2	6	20643	20648	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
415	NC_017623	GGT	2	6	20725	20730	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
416	NC_017623	CGG	2	6	20812	20817	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
417	NC_017623	TCA	2	6	20840	20845	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
418	NC_017623	CGT	2	6	20920	20925	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
419	NC_017623	G	6	6	20969	20974	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
420	NC_017623	GAC	3	9	21151	21159	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
421	NC_017623	GT	3	6	21173	21178	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
422	NC_017623	GA	3	6	21260	21265	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
423	NC_017623	GGC	2	6	21330	21335	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
424	NC_017623	GGT	2	6	21344	21349	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
425	NC_017623	CCTG	2	8	21524	21531	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
426	NC_017623	CCGT	2	8	21559	21566	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
427	NC_017623	TC	3	6	21641	21646	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
428	NC_017623	AAT	2	6	21660	21665	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
429	NC_017623	T	9	9	21685	21693	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
430	NC_017623	CTT	2	6	21737	21742	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
431	NC_017623	TCA	2	6	21750	21755	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
432	NC_017623	GCT	2	6	21941	21946	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386589271
433	NC_017623	GTT	2	6	21970	21975	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386589271
434	NC_017623	CTG	2	6	21992	21997	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386589271
435	NC_017623	GCT	2	6	22080	22085	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386589271
436	NC_017623	AAGTG	2	10	22100	22109	40 %	20 %	40 %	0 %	386589271
437	NC_017623	CTG	2	6	22123	22128	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386589271
438	NC_017623	GTA	2	6	22153	22158	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386589271
439	NC_017623	GAG	2	6	22161	22166	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386589271
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444	NC_017623	ATT	2	6	22611	22616	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
445	NC_017623	TGTTT	2	10	22634	22643	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
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487	NC_017623	GGA	2	6	24776	24781	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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500	NC_017623	GGC	2	6	25342	25347	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386589275

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