MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus suis A7 chromosome

Total Repeats: 41287

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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35003	NC_017622	T	6	6	1717959	1717964	0 %	100 %	0 %	0 %	386588956
35004	NC_017622	CGA	2	6	1717979	1717984	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386588956
35005	NC_017622	ATG	2	6	1717985	1717990	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386588956
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35009	NC_017622	CGC	2	6	1718173	1718178	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386588956
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35011	NC_017622	AAT	2	6	1718263	1718268	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386588956
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35037	NC_017622	CATA	2	8	1719586	1719593	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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35104	NC_017622	T	7	7	1722976	1722982	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
35105	NC_017622	A	8	8	1722988	1722995	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
35106	NC_017622	ATCA	2	8	1723085	1723092	50 %	25 %	0 %	25 %	386588960
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35110	NC_017622	T	6	6	1723273	1723278	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
35111	NC_017622	T	6	6	1723334	1723339	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
35112	NC_017622	CAT	2	6	1723342	1723347	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386588961
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35114	NC_017622	GGAA	2	8	1723408	1723415	50 %	0 %	50 %	0 %	386588961
35115	NC_017622	CCT	2	6	1723429	1723434	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386588961
35116	NC_017622	ATT	2	6	1723443	1723448	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386588961
35117	NC_017622	TTGG	2	8	1723464	1723471	0 %	50 %	50 %	0 %	386588961
35118	NC_017622	CGAAT	2	10	1723531	1723540	40 %	20 %	20 %	20 %	386588961
35119	NC_017622	GTT	2	6	1723568	1723573	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386588961
35120	NC_017622	GCTTCT	2	12	1723609	1723620	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	386588961
35121	NC_017622	GCT	2	6	1723621	1723626	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386588961
35122	NC_017622	TCAT	2	8	1723699	1723706	25 %	50 %	0 %	25 %	386588961
35123	NC_017622	ATAAC	2	10	1723759	1723768	60 %	20 %	0 %	20 %	386588961
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35125	NC_017622	ATT	2	6	1723941	1723946	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386588961
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35127	NC_017622	T	6	6	1724108	1724113	0 %	100 %	0 %	0 %	386588961
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35130	NC_017622	AATCAA	2	12	1724178	1724189	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	386588961
35131	NC_017622	CCT	2	6	1724252	1724257	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386588962
35132	NC_017622	AT	3	6	1724410	1724415	50 %	50 %	0 %	0 %	386588962
35133	NC_017622	ATC	2	6	1724430	1724435	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386588962
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35149	NC_017622	TGC	2	6	1725105	1725110	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386588962
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35152	NC_017622	TCA	2	6	1725310	1725315	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386588962
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35158	NC_017622	TTTC	2	8	1725518	1725525	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
35159	NC_017622	TATT	2	8	1725528	1725535	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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35162	NC_017622	T	7	7	1725609	1725615	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
35163	NC_017622	ATGA	2	8	1725625	1725632	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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35166	NC_017622	TCC	2	6	1725765	1725770	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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35189	NC_017622	TTA	2	6	1726936	1726941	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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35216	NC_017622	ATCAAT	2	12	1728195	1728206	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	386588965
35217	NC_017622	GTT	2	6	1728235	1728240	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386588965
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35221	NC_017622	ACC	3	9	1728465	1728473	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386588965
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35223	NC_017622	AAC	2	6	1728633	1728638	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386588965
35224	NC_017622	TGT	2	6	1728654	1728659	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386588965
35225	NC_017622	TGA	2	6	1728680	1728685	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386588965
35226	NC_017622	TGA	2	6	1728912	1728917	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386588965
35227	NC_017622	GATA	2	8	1728992	1728999	50 %	25 %	25 %	0 %	386588965
35228	NC_017622	CAT	2	6	1729001	1729006	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386588965
35229	NC_017622	CCA	2	6	1729024	1729029	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386588965
35230	NC_017622	TGGT	2	8	1729098	1729105	0 %	50 %	50 %	0 %	386588965
35231	NC_017622	TCC	2	6	1729131	1729136	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
35232	NC_017622	CTA	2	6	1729155	1729160	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35233	NC_017622	GCTT	2	8	1729287	1729294	0 %	50 %	25 %	25 %	386588966
35234	NC_017622	TAG	2	6	1729311	1729316	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386588966
35235	NC_017622	A	7	7	1729324	1729330	100 %	0 %	0 %	0 %	386588966
35236	NC_017622	TAT	2	6	1729352	1729357	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386588967
35237	NC_017622	CCAG	2	8	1729375	1729382	25 %	0 %	25 %	50 %	386588967
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35239	NC_017622	GAT	2	6	1729448	1729453	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386588967
35240	NC_017622	GTA	2	6	1729455	1729460	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386588967
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35342	NC_017622	AAC	2	6	1735041	1735046	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35343	NC_017622	AAG	2	6	1735068	1735073	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35344	NC_017622	ATCA	2	8	1735166	1735173	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
35345	NC_017622	A	6	6	1735208	1735213	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
35346	NC_017622	AT	3	6	1735241	1735246	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35347	NC_017622	GCTT	2	8	1735274	1735281	0 %	50 %	25 %	25 %	386588975
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35352	NC_017622	CGT	2	6	1735462	1735467	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386588975
35353	NC_017622	TGGT	2	8	1735496	1735503	0 %	50 %	50 %	0 %	386588975
35354	NC_017622	T	6	6	1735550	1735555	0 %	100 %	0 %	0 %	386588975
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35475	NC_017622	T	7	7	1741783	1741789	0 %	100 %	0 %	0 %	386588983
35476	NC_017622	AGT	2	6	1741791	1741796	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386588983
35477	NC_017622	CCT	2	6	1741810	1741815	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
35478	NC_017622	CCAT	2	8	1741845	1741852	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
35479	NC_017622	AGA	2	6	1741853	1741858	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35480	NC_017622	TAA	2	6	1741997	1742002	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35481	NC_017622	A	6	6	1742034	1742039	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
35482	NC_017622	CTTG	2	8	1742104	1742111	0 %	50 %	25 %	25 %	386588984
35483	NC_017622	TCA	3	9	1742114	1742122	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386588984
35484	NC_017622	TTG	2	6	1742135	1742140	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386588984
35485	NC_017622	CTAC	2	8	1742216	1742223	25 %	25 %	0 %	50 %	386588984
35486	NC_017622	TAGAG	2	10	1742226	1742235	40 %	20 %	40 %	0 %	386588984
35487	NC_017622	TCT	2	6	1742330	1742335	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386588984
35488	NC_017622	TTC	2	6	1742377	1742382	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386588984
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35491	NC_017622	CAA	2	6	1742496	1742501	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386588984
35492	NC_017622	CTG	2	6	1742574	1742579	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386588984
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35495	NC_017622	ACGA	2	8	1742767	1742774	50 %	0 %	25 %	25 %	386588984
35496	NC_017622	AGC	2	6	1742863	1742868	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386588984
35497	NC_017622	TTC	2	6	1742869	1742874	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386588984
35498	NC_017622	T	6	6	1742881	1742886	0 %	100 %	0 %	0 %	386588984
35499	NC_017622	TGT	2	6	1742931	1742936	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386588984
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