MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus suis A7 chromosome

Total Repeats: 41287

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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23002	NC_017622	GCA	2	6	1124012	1124017	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386588353
23003	NC_017622	T	7	7	1124043	1124049	0 %	100 %	0 %	0 %	386588353
23004	NC_017622	GTTT	2	8	1124051	1124058	0 %	75 %	25 %	0 %	386588353
23005	NC_017622	CT	3	6	1124068	1124073	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
23006	NC_017622	T	6	6	1124076	1124081	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
23007	NC_017622	TAT	2	6	1124094	1124099	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23008	NC_017622	CTT	2	6	1124118	1124123	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386588354
23009	NC_017622	TCC	2	6	1124308	1124313	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386588354
23010	NC_017622	ACC	2	6	1124341	1124346	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386588354
23011	NC_017622	AT	3	6	1124384	1124389	50 %	50 %	0 %	0 %	386588354
23012	NC_017622	AAAAT	2	10	1124411	1124420	80 %	20 %	0 %	0 %	386588354
23013	NC_017622	GAA	2	6	1124445	1124450	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386588354
23014	NC_017622	CTG	2	6	1124482	1124487	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386588354
23015	NC_017622	TTC	2	6	1124533	1124538	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386588354
23016	NC_017622	TCG	2	6	1124550	1124555	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386588354
23017	NC_017622	TGA	2	6	1124705	1124710	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386588354
23018	NC_017622	TTC	2	6	1124779	1124784	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386588354
23019	NC_017622	TTC	2	6	1124873	1124878	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23020	NC_017622	AGGT	2	8	1124893	1124900	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
23021	NC_017622	TCA	2	6	1125052	1125057	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386588355
23022	NC_017622	CTG	2	6	1125156	1125161	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386588355
23023	NC_017622	A	6	6	1125171	1125176	100 %	0 %	0 %	0 %	386588355
23024	NC_017622	CA	3	6	1125213	1125218	50 %	0 %	0 %	50 %	386588355
23025	NC_017622	ATC	2	6	1125300	1125305	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386588355
23026	NC_017622	ACT	2	6	1125370	1125375	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386588355
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23029	NC_017622	TTA	2	6	1125477	1125482	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386588356
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23032	NC_017622	C	6	6	1125589	1125594	0 %	0 %	0 %	100 %	386588356
23033	NC_017622	TCT	2	6	1125673	1125678	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386588356
23034	NC_017622	AT	4	8	1125767	1125774	50 %	50 %	0 %	0 %	386588356
23035	NC_017622	ACA	2	6	1125811	1125816	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386588356
23036	NC_017622	CTTG	2	8	1125833	1125840	0 %	50 %	25 %	25 %	386588356
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23039	NC_017622	CAT	2	6	1125990	1125995	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386588357
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23050	NC_017622	AAT	2	6	1126725	1126730	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386588357
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23069	NC_017622	GTC	2	6	1127843	1127848	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23070	NC_017622	C	11	11	1127868	1127878	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
23071	NC_017622	AGT	2	6	1127882	1127887	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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23087	NC_017622	CTA	2	6	1128887	1128892	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386588358
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23089	NC_017622	A	7	7	1128923	1128929	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
23090	NC_017622	T	6	6	1128956	1128961	0 %	100 %	0 %	0 %	386588359
23091	NC_017622	CTGA	2	8	1129047	1129054	25 %	25 %	25 %	25 %	386588359
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23102	NC_017622	TTG	2	6	1129663	1129668	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386588359
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23118	NC_017622	CTGG	2	8	1130381	1130388	0 %	25 %	50 %	25 %	386588359
23119	NC_017622	GAAG	2	8	1130447	1130454	50 %	0 %	50 %	0 %	386588359
23120	NC_017622	TTC	2	6	1130460	1130465	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386588359
23121	NC_017622	ACC	2	6	1130502	1130507	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386588359
23122	NC_017622	ACCA	2	8	1130585	1130592	50 %	0 %	0 %	50 %	386588359
23123	NC_017622	GTC	2	6	1130613	1130618	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386588359
23124	NC_017622	GCC	2	6	1130644	1130649	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386588359
23125	NC_017622	ATC	2	6	1130667	1130672	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386588359
23126	NC_017622	C	17	17	1130738	1130754	0 %	0 %	0 %	100 %	386588359
23127	NC_017622	CTT	2	6	1130792	1130797	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386588359
23128	NC_017622	TCT	2	6	1130813	1130818	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386588359
23129	NC_017622	TCA	2	6	1130827	1130832	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386588359
23130	NC_017622	A	6	6	1130846	1130851	100 %	0 %	0 %	0 %	386588359
23131	NC_017622	ATA	2	6	1130940	1130945	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386588359
23132	NC_017622	T	7	7	1130983	1130989	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
23133	NC_017622	ACA	2	6	1131026	1131031	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23134	NC_017622	CTAT	2	8	1131090	1131097	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
23135	NC_017622	TCA	2	6	1131177	1131182	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386588360
23136	NC_017622	ACGGT	2	10	1131199	1131208	20 %	20 %	40 %	20 %	386588360
23137	NC_017622	GACA	2	8	1131358	1131365	50 %	0 %	25 %	25 %	386588360
23138	NC_017622	TGGC	2	8	1131459	1131466	0 %	25 %	50 %	25 %	386588360
23139	NC_017622	CTA	2	6	1131548	1131553	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386588360
23140	NC_017622	TGA	2	6	1131631	1131636	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386588360
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23142	NC_017622	T	6	6	1131824	1131829	0 %	100 %	0 %	0 %	386588361
23143	NC_017622	TCT	2	6	1131842	1131847	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386588361
23144	NC_017622	TC	3	6	1131853	1131858	0 %	50 %	0 %	50 %	386588361
23145	NC_017622	GTAA	2	8	1131907	1131914	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
23146	NC_017622	TA	4	8	1131932	1131939	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23147	NC_017622	AAT	2	6	1132003	1132008	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23148	NC_017622	A	6	6	1132068	1132073	100 %	0 %	0 %	0 %	386588362
23149	NC_017622	ATCA	2	8	1132079	1132086	50 %	25 %	0 %	25 %	386588362
23150	NC_017622	A	6	6	1132127	1132132	100 %	0 %	0 %	0 %	386588362
23151	NC_017622	TCT	2	6	1132183	1132188	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386588362
23152	NC_017622	TTC	2	6	1132207	1132212	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386588362
23153	NC_017622	AAG	2	6	1132263	1132268	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386588362
23154	NC_017622	ACCA	2	8	1132353	1132360	50 %	0 %	0 %	50 %	386588362
23155	NC_017622	TGC	2	6	1132369	1132374	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386588362
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23157	NC_017622	ACT	2	6	1132445	1132450	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386588362
23158	NC_017622	TGA	2	6	1132489	1132494	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386588362
23159	NC_017622	CAG	2	6	1132538	1132543	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386588362
23160	NC_017622	TGC	2	6	1132633	1132638	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386588362
23161	NC_017622	AGA	2	6	1132641	1132646	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386588362
23162	NC_017622	TCCT	2	8	1132652	1132659	0 %	50 %	0 %	50 %	386588362
23163	NC_017622	CAA	2	6	1132663	1132668	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386588362
23164	NC_017622	TTC	2	6	1132710	1132715	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386588362
23165	NC_017622	TACC	2	8	1132742	1132749	25 %	25 %	0 %	50 %	386588362
23166	NC_017622	TAC	2	6	1132757	1132762	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386588362
23167	NC_017622	TCA	3	9	1132818	1132826	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386588362
23168	NC_017622	ACCA	2	8	1132832	1132839	50 %	0 %	0 %	50 %	386588362
23169	NC_017622	ATT	2	6	1132857	1132862	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386588362
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23171	NC_017622	A	6	6	1133028	1133033	100 %	0 %	0 %	0 %	386588362
23172	NC_017622	ACA	2	6	1133058	1133063	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386588362
23173	NC_017622	TAAAG	2	10	1133116	1133125	60 %	20 %	20 %	0 %	386588363
23174	NC_017622	A	6	6	1133161	1133166	100 %	0 %	0 %	0 %	386588363
23175	NC_017622	GAA	2	6	1133177	1133182	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386588363
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23178	NC_017622	CT	3	6	1133282	1133287	0 %	50 %	0 %	50 %	386588363
23179	NC_017622	TCA	2	6	1133383	1133388	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386588363
23180	NC_017622	CTG	2	6	1133481	1133486	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386588363
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23184	NC_017622	TTTA	2	8	1133687	1133694	25 %	75 %	0 %	0 %	386588363
23185	NC_017622	GTG	2	6	1133748	1133753	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386588363
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23188	NC_017622	A	6	6	1133884	1133889	100 %	0 %	0 %	0 %	386588363
23189	NC_017622	CGTC	2	8	1133911	1133918	0 %	25 %	25 %	50 %	386588363
23190	NC_017622	TCA	2	6	1133925	1133930	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386588363
23191	NC_017622	A	6	6	1134060	1134065	100 %	0 %	0 %	0 %	386588363
23192	NC_017622	TCA	2	6	1134088	1134093	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386588363
23193	NC_017622	T	6	6	1134116	1134121	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
23194	NC_017622	ATAA	2	8	1134127	1134134	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
23195	NC_017622	TGC	2	6	1134175	1134180	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386588364
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23199	NC_017622	CTGA	2	8	1134389	1134396	25 %	25 %	25 %	25 %	386588364
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23202	NC_017622	TTC	2	6	1134479	1134484	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386588364
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23204	NC_017622	GGT	4	12	1134542	1134553	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386588364
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23206	NC_017622	TGA	2	6	1134700	1134705	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386588364
23207	NC_017622	TAC	2	6	1134714	1134719	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386588364
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23210	NC_017622	AGC	2	6	1134928	1134933	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386588364
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23212	NC_017622	GACT	2	8	1134970	1134977	25 %	25 %	25 %	25 %	386588364
23213	NC_017622	AG	3	6	1135017	1135022	50 %	0 %	50 %	0 %	386588364
23214	NC_017622	TGA	2	6	1135029	1135034	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386588365
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23217	NC_017622	A	6	6	1135297	1135302	100 %	0 %	0 %	0 %	386588365
23218	NC_017622	CGG	2	6	1135336	1135341	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386588365
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23221	NC_017622	GCCA	2	8	1135503	1135510	25 %	0 %	25 %	50 %	386588365
23222	NC_017622	ATTG	2	8	1135561	1135568	25 %	50 %	25 %	0 %	386588365
23223	NC_017622	GAT	2	6	1135604	1135609	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386588365
23224	NC_017622	TAT	2	6	1135678	1135683	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386588365
23225	NC_017622	GTT	2	6	1135712	1135717	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386588365
23226	NC_017622	A	6	6	1135868	1135873	100 %	0 %	0 %	0 %	386588365
23227	NC_017622	TG	3	6	1135914	1135919	0 %	50 %	50 %	0 %	386588365
23228	NC_017622	AC	3	6	1135940	1135945	50 %	0 %	0 %	50 %	386588365
23229	NC_017622	A	7	7	1135991	1135997	100 %	0 %	0 %	0 %	386588365
23230	NC_017622	CCAT	2	8	1136049	1136056	25 %	25 %	0 %	50 %	386588365
23231	NC_017622	GAA	2	6	1136069	1136074	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386588365
23232	NC_017622	TAA	2	6	1136125	1136130	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23233	NC_017622	GCAGAT	2	12	1136175	1136186	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
23234	NC_017622	TCA	2	6	1136198	1136203	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23235	NC_017622	CAA	2	6	1136212	1136217	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23236	NC_017622	TGATTT	2	12	1136222	1136233	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
23237	NC_017622	A	6	6	1136260	1136265	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
23238	NC_017622	ACT	2	6	1136267	1136272	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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23352	NC_017622	AAAG	2	8	1142510	1142517	75 %	0 %	25 %	0 %	386588372
23353	NC_017622	CCTGC	2	10	1142557	1142566	0 %	20 %	20 %	60 %	386588372
23354	NC_017622	CAAGA	2	10	1142649	1142658	60 %	0 %	20 %	20 %	386588372
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23360	NC_017622	AT	3	6	1142958	1142963	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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23455	NC_017622	A	7	7	1147662	1147668	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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23457	NC_017622	AAG	2	6	1147768	1147773	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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23462	NC_017622	TC	3	6	1147935	1147940	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
23463	NC_017622	TA	3	6	1147945	1147950	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23464	NC_017622	TCT	2	6	1147964	1147969	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23465	NC_017622	TAGCG	2	10	1147971	1147980	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
23466	NC_017622	TAT	2	6	1147992	1147997	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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23471	NC_017622	A	7	7	1148203	1148209	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
23472	NC_017622	A	6	6	1148218	1148223	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
23473	NC_017622	AT	3	6	1148445	1148450	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23474	NC_017622	ACT	2	6	1148480	1148485	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23475	NC_017622	TATC	2	8	1148511	1148518	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
23476	NC_017622	ACA	2	6	1148535	1148540	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23477	NC_017622	CT	3	6	1148700	1148705	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
23478	NC_017622	TCAA	2	8	1148714	1148721	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
23479	NC_017622	CAA	2	6	1148758	1148763	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23480	NC_017622	AT	3	6	1148772	1148777	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23481	NC_017622	TC	4	8	1148778	1148785	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
23482	NC_017622	GGA	2	6	1148791	1148796	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
23483	NC_017622	CTG	2	6	1148804	1148809	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23484	NC_017622	AAC	2	6	1148845	1148850	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23485	NC_017622	CTT	2	6	1148877	1148882	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23486	NC_017622	CTG	2	6	1148909	1148914	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23487	NC_017622	ATTC	2	8	1148918	1148925	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
23488	NC_017622	GAT	2	6	1149085	1149090	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23489	NC_017622	CAT	2	6	1149189	1149194	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23490	NC_017622	ATG	2	6	1149298	1149303	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23491	NC_017622	AT	3	6	1149315	1149320	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23492	NC_017622	TTG	2	6	1149323	1149328	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23493	NC_017622	TGG	2	6	1149366	1149371	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
23494	NC_017622	C	14	14	1149465	1149478	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
23495	NC_017622	CTG	2	6	1149501	1149506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23496	NC_017622	TAT	2	6	1149551	1149556	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23497	NC_017622	AGAA	2	8	1149600	1149607	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
23498	NC_017622	AAG	2	6	1149621	1149626	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23499	NC_017622	GCA	2	6	1149632	1149637	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23500	NC_017622	TTC	2	6	1149683	1149688	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

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