MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus suis A7 chromosome

Total Repeats: 41287

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
18001	NC_017622	GAA	2	6	879525	879530	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18002	NC_017622	T	6	6	879534	879539	0 %	100 %	0 %	0 %	386588108
18003	NC_017622	CGA	2	6	879623	879628	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386588108
18004	NC_017622	TCA	2	6	879736	879741	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386588108
18005	NC_017622	T	6	6	879796	879801	0 %	100 %	0 %	0 %	386588108
18006	NC_017622	GACA	2	8	879815	879822	50 %	0 %	25 %	25 %	386588108
18007	NC_017622	TTC	2	6	879940	879945	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386588108
18008	NC_017622	TTC	2	6	879975	879980	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386588108
18009	NC_017622	T	6	6	879987	879992	0 %	100 %	0 %	0 %	386588108
18010	NC_017622	TC	4	8	880019	880026	0 %	50 %	0 %	50 %	386588108
18011	NC_017622	CTG	2	6	880037	880042	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386588108
18012	NC_017622	ATC	2	6	880063	880068	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386588108
18013	NC_017622	TTTTCT	2	12	880069	880080	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	386588108
18014	NC_017622	TCT	2	6	880105	880110	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18015	NC_017622	TCTT	2	8	880148	880155	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
18016	NC_017622	TTA	2	6	880186	880191	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18017	NC_017622	AGA	2	6	880315	880320	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386588109
18018	NC_017622	TGG	2	6	880339	880344	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386588109
18019	NC_017622	GATT	2	8	880512	880519	25 %	50 %	25 %	0 %	386588109
18020	NC_017622	CTTTA	2	10	880558	880567	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
18021	NC_017622	T	6	6	880568	880573	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18022	NC_017622	TA	3	6	880580	880585	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18023	NC_017622	AG	3	6	880610	880615	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
18024	NC_017622	AAAC	2	8	880628	880635	75 %	0 %	0 %	25 %	386588110
18025	NC_017622	AGT	2	6	880705	880710	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386588110
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18027	NC_017622	GAT	2	6	880784	880789	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386588110
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18033	NC_017622	TCAG	2	8	880983	880990	25 %	25 %	25 %	25 %	386588110
18034	NC_017622	TCT	3	9	880999	881007	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386588110
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18037	NC_017622	CAT	2	6	881086	881091	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386588110
18038	NC_017622	CTA	2	6	881119	881124	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386588110
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18040	NC_017622	CA	3	6	881228	881233	50 %	0 %	0 %	50 %	386588111
18041	NC_017622	ATTC	2	8	881280	881287	25 %	50 %	0 %	25 %	386588111
18042	NC_017622	CATTGC	2	12	881441	881452	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	386588111
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18044	NC_017622	GGT	2	6	881487	881492	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386588111
18045	NC_017622	TTG	2	6	881509	881514	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386588111
18046	NC_017622	A	7	7	881565	881571	100 %	0 %	0 %	0 %	386588111
18047	NC_017622	CCTCTA	2	12	881588	881599	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	386588111
18048	NC_017622	TGGT	2	8	881613	881620	0 %	50 %	50 %	0 %	386588111
18049	NC_017622	GCCA	2	8	881633	881640	25 %	0 %	25 %	50 %	386588111
18050	NC_017622	TTC	2	6	881641	881646	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386588111
18051	NC_017622	A	6	6	881647	881652	100 %	0 %	0 %	0 %	386588111
18052	NC_017622	GCTG	2	8	881678	881685	0 %	25 %	50 %	25 %	386588111
18053	NC_017622	CTA	2	6	881766	881771	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386588111
18054	NC_017622	TGA	2	6	881863	881868	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386588112
18055	NC_017622	TCA	2	6	882094	882099	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386588112
18056	NC_017622	TCT	2	6	882123	882128	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386588112
18057	NC_017622	TCA	2	6	882222	882227	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386588112
18058	NC_017622	ATG	2	6	882246	882251	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386588112
18059	NC_017622	CAAT	2	8	882331	882338	50 %	25 %	0 %	25 %	386588112
18060	NC_017622	ACC	2	6	882351	882356	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386588112
18061	NC_017622	AAAC	2	8	882460	882467	75 %	0 %	0 %	25 %	386588112
18062	NC_017622	TGCT	2	8	882499	882506	0 %	50 %	25 %	25 %	386588112
18063	NC_017622	CAA	2	6	882686	882691	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386588112
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18105	NC_017622	T	6	6	884955	884960	0 %	100 %	0 %	0 %	386588115
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18111	NC_017622	AT	3	6	885276	885281	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18112	NC_017622	TC	3	6	885302	885307	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
18113	NC_017622	AGTAT	2	10	885331	885340	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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18115	NC_017622	TA	3	6	885353	885358	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18116	NC_017622	T	6	6	885359	885364	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18117	NC_017622	CT	3	6	885405	885410	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
18118	NC_017622	ATTT	2	8	885417	885424	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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18120	NC_017622	A	11	11	885470	885480	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18121	NC_017622	TTA	2	6	885524	885529	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18122	NC_017622	TAT	2	6	885536	885541	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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18243	NC_017622	CAT	2	6	891547	891552	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386588119
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18354	NC_017622	CA	3	6	896548	896553	50 %	0 %	0 %	50 %	386588124
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18491	NC_017622	ATC	2	6	903948	903953	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386588128
18492	NC_017622	ATA	2	6	903972	903977	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386588128
18493	NC_017622	T	6	6	904107	904112	0 %	100 %	0 %	0 %	386588129
18494	NC_017622	GAA	2	6	904125	904130	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386588129
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18499	NC_017622	TGC	2	6	904276	904281	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386588129
18500	NC_017622	AT	3	6	904465	904470	50 %	50 %	0 %	0 %	386588129

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