MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus suis D12 chromosome

Total Repeats: 44212

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
43501	NC_017621	TCA	2	6	2148514	2148519	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43502	NC_017621	CGA	2	6	2148625	2148630	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386587244
43503	NC_017621	CT	3	6	2148636	2148641	0 %	50 %	0 %	50 %	386587244
43504	NC_017621	CAA	2	6	2148783	2148788	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386587244
43505	NC_017621	CAT	2	6	2148815	2148820	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386587244
43506	NC_017621	TCA	2	6	2148842	2148847	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386587244
43507	NC_017621	AGA	2	6	2148936	2148941	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386587244
43508	NC_017621	CCAA	2	8	2148987	2148994	50 %	0 %	0 %	50 %	386587244
43509	NC_017621	ACA	2	6	2148995	2149000	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386587244
43510	NC_017621	GA	3	6	2149114	2149119	50 %	0 %	50 %	0 %	386587244
43511	NC_017621	GAT	2	6	2149265	2149270	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386587244
43512	NC_017621	ATC	2	6	2149296	2149301	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386587244
43513	NC_017621	GCA	2	6	2149312	2149317	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386587244
43514	NC_017621	GAT	2	6	2149372	2149377	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386587244
43515	NC_017621	CAT	2	6	2149406	2149411	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386587244
43516	NC_017621	AAT	2	6	2149437	2149442	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386587244
43517	NC_017621	TCT	2	6	2149465	2149470	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386587244
43518	NC_017621	GTCT	2	8	2149552	2149559	0 %	50 %	25 %	25 %	386587244
43519	NC_017621	TCAT	2	8	2149603	2149610	25 %	50 %	0 %	25 %	386587244
43520	NC_017621	ACA	2	6	2149678	2149683	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386587244
43521	NC_017621	AAC	2	6	2149779	2149784	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386587244
43522	NC_017621	CTT	2	6	2149839	2149844	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386587244
43523	NC_017621	AACT	2	8	2149848	2149855	50 %	25 %	0 %	25 %	386587244
43524	NC_017621	TTC	2	6	2149859	2149864	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386587244
43525	NC_017621	ATC	2	6	2149899	2149904	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386587245
43526	NC_017621	CAATC	2	10	2149951	2149960	40 %	20 %	0 %	40 %	386587245
43527	NC_017621	TA	3	6	2149999	2150004	50 %	50 %	0 %	0 %	386587245
43528	NC_017621	ATT	2	6	2150018	2150023	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386587245
43529	NC_017621	TGAA	2	8	2150048	2150055	50 %	25 %	25 %	0 %	386587245
43530	NC_017621	T	6	6	2150064	2150069	0 %	100 %	0 %	0 %	386587245
43531	NC_017621	TTC	3	9	2150081	2150089	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386587245
43532	NC_017621	AGT	2	6	2150115	2150120	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386587245
43533	NC_017621	A	6	6	2150194	2150199	100 %	0 %	0 %	0 %	386587245
43534	NC_017621	CTTT	2	8	2150232	2150239	0 %	75 %	0 %	25 %	386587245
43535	NC_017621	ATAA	2	8	2150253	2150260	75 %	25 %	0 %	0 %	386587245
43536	NC_017621	TAG	2	6	2150282	2150287	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386587245
43537	NC_017621	ACC	2	6	2150331	2150336	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386587245
43538	NC_017621	TGCCT	2	10	2150367	2150376	0 %	40 %	20 %	40 %	386587245
43539	NC_017621	T	6	6	2150389	2150394	0 %	100 %	0 %	0 %	386587245
43540	NC_017621	TGA	2	6	2150418	2150423	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386587245
43541	NC_017621	AT	3	6	2150515	2150520	50 %	50 %	0 %	0 %	386587245
43542	NC_017621	CTG	2	6	2150569	2150574	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386587245
43543	NC_017621	AG	3	6	2150619	2150624	50 %	0 %	50 %	0 %	386587245
43544	NC_017621	A	6	6	2150635	2150640	100 %	0 %	0 %	0 %	386587245
43545	NC_017621	TCT	2	6	2150676	2150681	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386587245
43546	NC_017621	CTGA	2	8	2150686	2150693	25 %	25 %	25 %	25 %	386587245
43547	NC_017621	T	6	6	2150713	2150718	0 %	100 %	0 %	0 %	386587245
43548	NC_017621	A	6	6	2150784	2150789	100 %	0 %	0 %	0 %	386587245
43549	NC_017621	TCT	2	6	2150927	2150932	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386587245
43550	NC_017621	AC	3	6	2150992	2150997	50 %	0 %	0 %	50 %	386587245
43551	NC_017621	CTCA	2	8	2151014	2151021	25 %	25 %	0 %	50 %	386587245
43552	NC_017621	TCT	2	6	2151109	2151114	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386587245
43553	NC_017621	A	7	7	2151225	2151231	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
43554	NC_017621	A	7	7	2151286	2151292	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
43555	NC_017621	AAT	2	6	2151322	2151327	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43556	NC_017621	CAG	2	6	2151333	2151338	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43557	NC_017621	T	7	7	2151368	2151374	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
43558	NC_017621	TAT	2	6	2151390	2151395	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43559	NC_017621	GCG	2	6	2151467	2151472	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
43560	NC_017621	A	6	6	2151491	2151496	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
43561	NC_017621	GCG	2	6	2151528	2151533	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
43562	NC_017621	TTG	2	6	2151534	2151539	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43563	NC_017621	ACCC	2	8	2151552	2151559	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
43564	NC_017621	AGT	2	6	2151678	2151683	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386587246
43565	NC_017621	TCTGC	2	10	2151714	2151723	0 %	40 %	20 %	40 %	386587246
43566	NC_017621	AT	3	6	2151744	2151749	50 %	50 %	0 %	0 %	386587246
43567	NC_017621	CTT	2	6	2151819	2151824	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386587246
43568	NC_017621	AT	3	6	2151847	2151852	50 %	50 %	0 %	0 %	386587246
43569	NC_017621	GTT	2	6	2151984	2151989	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386587246
43570	NC_017621	ACT	2	6	2152031	2152036	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43571	NC_017621	AGT	2	6	2152042	2152047	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43572	NC_017621	TCT	2	6	2152205	2152210	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43573	NC_017621	TC	3	6	2152290	2152295	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
43574	NC_017621	TCT	2	6	2152687	2152692	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386587247
43575	NC_017621	C	6	6	2152724	2152729	0 %	0 %	0 %	100 %	386587247
43576	NC_017621	TTC	2	6	2152734	2152739	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386587247
43577	NC_017621	GTACT	2	10	2152742	2152751	20 %	40 %	20 %	20 %	386587247
43578	NC_017621	CAGTA	2	10	2152941	2152950	40 %	20 %	20 %	20 %	386587247
43579	NC_017621	GTT	2	6	2153030	2153035	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386587248
43580	NC_017621	CCCCTG	2	12	2153088	2153099	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	386587248
43581	NC_017621	ATA	2	6	2153171	2153176	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386587248
43582	NC_017621	T	7	7	2153305	2153311	0 %	100 %	0 %	0 %	386587248
43583	NC_017621	CTT	2	6	2153312	2153317	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386587248
43584	NC_017621	TGT	2	6	2153320	2153325	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386587248
43585	NC_017621	TCTAAC	2	12	2153350	2153361	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386587248
43586	NC_017621	TAGC	2	8	2153449	2153456	25 %	25 %	25 %	25 %	386587248
43587	NC_017621	TCA	2	6	2153515	2153520	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386587248
43588	NC_017621	TCT	2	6	2153572	2153577	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386587248
43589	NC_017621	TTC	2	6	2153601	2153606	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386587248
43590	NC_017621	A	6	6	2153742	2153747	100 %	0 %	0 %	0 %	386587248
43591	NC_017621	T	6	6	2153748	2153753	0 %	100 %	0 %	0 %	386587248
43592	NC_017621	AT	3	6	2153772	2153777	50 %	50 %	0 %	0 %	386587248
43593	NC_017621	TCAC	2	8	2153819	2153826	25 %	25 %	0 %	50 %	386587249
43594	NC_017621	GGT	2	6	2153858	2153863	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386587249
43595	NC_017621	TTC	2	6	2153882	2153887	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386587249
43596	NC_017621	GCTC	2	8	2153922	2153929	0 %	25 %	25 %	50 %	386587249
43597	NC_017621	TCC	2	6	2154073	2154078	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386587250
43598	NC_017621	AAG	2	6	2154098	2154103	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386587250
43599	NC_017621	TAG	2	6	2154189	2154194	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386587250
43600	NC_017621	CAA	2	6	2154241	2154246	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386587250
43601	NC_017621	ATTCC	2	10	2154325	2154334	20 %	40 %	0 %	40 %	386587250
43602	NC_017621	GTA	2	6	2154340	2154345	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386587250
43603	NC_017621	GTG	2	6	2154367	2154372	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386587250
43604	NC_017621	TCT	2	6	2154473	2154478	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386587251
43605	NC_017621	TG	3	6	2154484	2154489	0 %	50 %	50 %	0 %	386587251
43606	NC_017621	CCT	2	6	2154545	2154550	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386587252
43607	NC_017621	TA	3	6	2154576	2154581	50 %	50 %	0 %	0 %	386587252
43608	NC_017621	ATAG	2	8	2154683	2154690	50 %	25 %	25 %	0 %	386587252
43609	NC_017621	T	6	6	2154752	2154757	0 %	100 %	0 %	0 %	386587252
43610	NC_017621	CCT	2	6	2154760	2154765	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386587253
43611	NC_017621	TTCTA	2	10	2154786	2154795	20 %	60 %	0 %	20 %	386587253
43612	NC_017621	TGA	2	6	2154956	2154961	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386587253
43613	NC_017621	TG	3	6	2155103	2155108	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
43614	NC_017621	GCCC	2	8	2155195	2155202	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
43615	NC_017621	ATA	2	6	2155247	2155252	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43616	NC_017621	TG	4	8	2155260	2155267	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
43617	NC_017621	GGT	2	6	2155278	2155283	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
43618	NC_017621	GCT	2	6	2155288	2155293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43619	NC_017621	TAA	2	6	2155432	2155437	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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