MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus suis D12 chromosome

Total Repeats: 44212

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13501	NC_017621	TAA	2	6	664095	664100	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13502	NC_017621	GTTA	2	8	664150	664157	25 %	50 %	25 %	0 %	386585818
13503	NC_017621	GGT	2	6	664202	664207	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386585818
13504	NC_017621	GTC	2	6	664269	664274	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386585818
13505	NC_017621	CTT	2	6	664323	664328	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386585818
13506	NC_017621	TTA	2	6	664337	664342	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386585818
13507	NC_017621	GCA	2	6	664412	664417	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386585818
13508	NC_017621	GGT	2	6	664418	664423	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386585818
13509	NC_017621	T	7	7	664425	664431	0 %	100 %	0 %	0 %	386585818
13510	NC_017621	GCATTT	2	12	664456	664467	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	386585818
13511	NC_017621	GGT	2	6	664496	664501	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386585818
13512	NC_017621	A	6	6	664513	664518	100 %	0 %	0 %	0 %	386585818
13513	NC_017621	CTT	2	6	664540	664545	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386585818
13514	NC_017621	CGGT	2	8	664581	664588	0 %	25 %	50 %	25 %	386585818
13515	NC_017621	CAG	2	6	664623	664628	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386585818
13516	NC_017621	GCA	2	6	664778	664783	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386585818
13517	NC_017621	GTC	2	6	664865	664870	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386585818
13518	NC_017621	AGA	2	6	664873	664878	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386585818
13519	NC_017621	TAT	2	6	664945	664950	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386585818
13520	NC_017621	ATG	2	6	664952	664957	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386585818
13521	NC_017621	TGT	2	6	664994	664999	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13522	NC_017621	T	6	6	665007	665012	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13523	NC_017621	TAT	2	6	665087	665092	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386585819
13524	NC_017621	TGG	2	6	665099	665104	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386585819
13525	NC_017621	CG	3	6	665131	665136	0 %	0 %	50 %	50 %	386585819
13526	NC_017621	TAT	2	6	665181	665186	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386585819
13527	NC_017621	ATT	2	6	665229	665234	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386585819
13528	NC_017621	AAC	2	6	665314	665319	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386585819
13529	NC_017621	GAA	2	6	665358	665363	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386585819
13530	NC_017621	TGA	2	6	665372	665377	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386585819
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13533	NC_017621	ATG	2	6	665611	665616	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386585819
13534	NC_017621	A	6	6	665630	665635	100 %	0 %	0 %	0 %	386585819
13535	NC_017621	GTG	2	6	665653	665658	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386585819
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13539	NC_017621	CTT	2	6	666106	666111	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386585820
13540	NC_017621	AAT	2	6	666131	666136	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386585820
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13542	NC_017621	TTC	2	6	666159	666164	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386585820
13543	NC_017621	TACC	2	8	666268	666275	25 %	25 %	0 %	50 %	386585820
13544	NC_017621	ACT	2	6	666378	666383	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386585820
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13547	NC_017621	CTC	2	6	666500	666505	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386585820
13548	NC_017621	AGCAG	2	10	666564	666573	40 %	0 %	40 %	20 %	386585821
13549	NC_017621	CTG	2	6	666598	666603	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386585821
13550	NC_017621	GGCA	2	8	666644	666651	25 %	0 %	50 %	25 %	386585821
13551	NC_017621	GAG	2	6	666706	666711	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386585821
13552	NC_017621	ATG	2	6	666742	666747	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386585821
13553	NC_017621	GGC	2	6	666799	666804	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386585821
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13556	NC_017621	TACC	2	8	666901	666908	25 %	25 %	0 %	50 %	386585821
13557	NC_017621	GAA	2	6	667009	667014	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386585821
13558	NC_017621	AGT	2	6	667022	667027	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386585821
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13560	NC_017621	CTTTG	2	10	667093	667102	0 %	60 %	20 %	20 %	386585822
13561	NC_017621	TGG	2	6	667160	667165	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386585822
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13564	NC_017621	A	6	6	667206	667211	100 %	0 %	0 %	0 %	386585822
13565	NC_017621	A	7	7	667222	667228	100 %	0 %	0 %	0 %	386585822
13566	NC_017621	TGG	2	6	667257	667262	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386585823
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13571	NC_017621	CTT	2	6	667552	667557	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386585823
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13573	NC_017621	CCTT	2	8	667620	667627	0 %	50 %	0 %	50 %	386585823
13574	NC_017621	CAG	2	6	667676	667681	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386585823
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13582	NC_017621	TGAC	2	8	668069	668076	25 %	25 %	25 %	25 %	386585823
13583	NC_017621	GCTAT	2	10	668096	668105	20 %	40 %	20 %	20 %	386585823
13584	NC_017621	GCAA	2	8	668110	668117	50 %	0 %	25 %	25 %	386585823
13585	NC_017621	TGGA	2	8	668133	668140	25 %	25 %	50 %	0 %	386585823
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13590	NC_017621	TCTT	2	8	668305	668312	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
13591	NC_017621	GTG	2	6	668393	668398	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386585824
13592	NC_017621	TGC	2	6	668409	668414	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386585824
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13598	NC_017621	GTT	2	6	668857	668862	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386585824
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13600	NC_017621	TGG	2	6	668921	668926	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386585824
13601	NC_017621	CAAG	2	8	668931	668938	50 %	0 %	25 %	25 %	386585824
13602	NC_017621	TAC	2	6	668947	668952	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386585824
13603	NC_017621	GCA	2	6	668968	668973	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386585824
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13605	NC_017621	TCAAC	2	10	669080	669089	40 %	20 %	0 %	40 %	386585824
13606	NC_017621	AAG	2	6	669140	669145	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386585824
13607	NC_017621	AAGAA	2	10	669167	669176	80 %	0 %	20 %	0 %	386585824
13608	NC_017621	AAAG	2	8	669202	669209	75 %	0 %	25 %	0 %	386585825
13609	NC_017621	GTT	2	6	669223	669228	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386585825
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13615	NC_017621	ATG	2	6	669422	669427	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386585825
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13618	NC_017621	CAG	2	6	669498	669503	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386585825
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