MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus suis D12 chromosome

Total Repeats: 44212

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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13002	NC_017621	GAT	2	6	639455	639460	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386585794
13003	NC_017621	AAAGAA	2	12	639494	639505	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	386585794
13004	NC_017621	TTG	2	6	639506	639511	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386585794
13005	NC_017621	ATC	2	6	639549	639554	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13006	NC_017621	GTG	2	6	639575	639580	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13007	NC_017621	G	6	6	639600	639605	0 %	0 %	100 %	0 %	386585795
13008	NC_017621	AGAA	2	8	639637	639644	75 %	0 %	25 %	0 %	386585795
13009	NC_017621	ATGA	2	8	639652	639659	50 %	25 %	25 %	0 %	386585795
13010	NC_017621	TTA	2	6	639661	639666	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386585795
13011	NC_017621	AT	3	6	639672	639677	50 %	50 %	0 %	0 %	386585795
13012	NC_017621	TGAC	2	8	639689	639696	25 %	25 %	25 %	25 %	386585795
13013	NC_017621	TTGG	2	8	639863	639870	0 %	50 %	50 %	0 %	386585795
13014	NC_017621	CAAG	2	8	639930	639937	50 %	0 %	25 %	25 %	386585795
13015	NC_017621	GTT	2	6	639940	639945	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386585795
13016	NC_017621	A	6	6	639985	639990	100 %	0 %	0 %	0 %	386585795
13017	NC_017621	AAG	2	6	640024	640029	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386585795
13018	NC_017621	AAG	2	6	640058	640063	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386585795
13019	NC_017621	GCGA	2	8	640116	640123	25 %	0 %	50 %	25 %	386585795
13020	NC_017621	AATG	2	8	640140	640147	50 %	25 %	25 %	0 %	386585795
13021	NC_017621	ACA	3	9	640169	640177	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386585795
13022	NC_017621	ATCC	2	8	640189	640196	25 %	25 %	0 %	50 %	386585795
13023	NC_017621	TC	3	6	640285	640290	0 %	50 %	0 %	50 %	386585795
13024	NC_017621	ATG	2	6	640319	640324	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386585795
13025	NC_017621	GAT	2	6	640329	640334	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386585795
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13027	NC_017621	TGG	2	6	640446	640451	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386585795
13028	NC_017621	TGA	2	6	640454	640459	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386585795
13029	NC_017621	TA	3	6	640523	640528	50 %	50 %	0 %	0 %	386585796
13030	NC_017621	GAA	2	6	640612	640617	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386585796
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13032	NC_017621	ACCG	2	8	640695	640702	25 %	0 %	25 %	50 %	386585796
13033	NC_017621	GA	3	6	640710	640715	50 %	0 %	50 %	0 %	386585796
13034	NC_017621	CGA	2	6	640835	640840	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386585796
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13039	NC_017621	TGT	2	6	641040	641045	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386585796
13040	NC_017621	TGA	2	6	641081	641086	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386585796
13041	NC_017621	ATT	2	6	641124	641129	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386585796
13042	NC_017621	GAA	2	6	641215	641220	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386585796
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13049	NC_017621	TAT	2	6	641590	641595	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386585797
13050	NC_017621	TGC	2	6	641604	641609	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386585797
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13053	NC_017621	TGC	2	6	641739	641744	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386585797
13054	NC_017621	ATTG	2	8	641826	641833	25 %	50 %	25 %	0 %	386585797
13055	NC_017621	TA	3	6	641866	641871	50 %	50 %	0 %	0 %	386585797
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13057	NC_017621	GAA	2	6	641911	641916	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386585798
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13069	NC_017621	TGA	2	6	642464	642469	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386585799
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13078	NC_017621	GATT	2	8	643067	643074	25 %	50 %	25 %	0 %	386585799
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13083	NC_017621	AT	3	6	643273	643278	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13084	NC_017621	TGA	2	6	643310	643315	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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13086	NC_017621	GATTCG	2	12	643618	643629	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
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13089	NC_017621	TAA	2	6	643719	643724	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13090	NC_017621	TA	3	6	643735	643740	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13091	NC_017621	A	7	7	643740	643746	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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13093	NC_017621	TGT	2	6	643758	643763	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13094	NC_017621	TGAT	2	8	643851	643858	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
13095	NC_017621	AAG	2	6	643884	643889	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13096	NC_017621	AAT	2	6	644026	644031	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386585800
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13117	NC_017621	TC	3	6	645050	645055	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13118	NC_017621	TTTC	2	8	645056	645063	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
13119	NC_017621	TGA	2	6	645071	645076	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13120	NC_017621	A	6	6	645154	645159	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13121	NC_017621	A	6	6	645248	645253	100 %	0 %	0 %	0 %	386585801
13122	NC_017621	GCA	2	6	645344	645349	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386585801
13123	NC_017621	TCA	2	6	645399	645404	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386585801
13124	NC_017621	TTG	2	6	645549	645554	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386585801
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13232	NC_017621	ATCA	2	8	651117	651124	50 %	25 %	0 %	25 %	386585807
13233	NC_017621	AAC	2	6	651173	651178	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386585807
13234	NC_017621	CACC	2	8	651212	651219	25 %	0 %	0 %	75 %	386585807
13235	NC_017621	T	6	6	651251	651256	0 %	100 %	0 %	0 %	386585807
13236	NC_017621	GATATT	2	12	651294	651305	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	386585807
13237	NC_017621	CATT	2	8	651377	651384	25 %	50 %	0 %	25 %	386585807
13238	NC_017621	AGGTC	2	10	651410	651419	20 %	20 %	40 %	20 %	386585807
13239	NC_017621	ACCAT	2	10	651460	651469	40 %	20 %	0 %	40 %	386585807
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13241	NC_017621	TCC	2	6	651638	651643	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386585807
13242	NC_017621	TCGC	2	8	651766	651773	0 %	25 %	25 %	50 %	386585807
13243	NC_017621	TGG	2	6	651985	651990	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386585808
13244	NC_017621	GAT	2	6	652022	652027	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386585808
13245	NC_017621	T	6	6	652027	652032	0 %	100 %	0 %	0 %	386585808
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