MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus suis D9 chromosome

Total Repeats: 43891

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_017620	ACC	2	6	650617	650622	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386583734
13002	NC_017620	GCT	2	6	650624	650629	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386583734
13003	NC_017620	A	6	6	650639	650644	100 %	0 %	0 %	0 %	386583734
13004	NC_017620	CAAA	2	8	650676	650683	75 %	0 %	0 %	25 %	386583734
13005	NC_017620	A	7	7	650874	650880	100 %	0 %	0 %	0 %	386583735
13006	NC_017620	TGC	2	6	650894	650899	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386583735
13007	NC_017620	A	6	6	650905	650910	100 %	0 %	0 %	0 %	386583735
13008	NC_017620	AGA	2	6	650936	650941	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386583735
13009	NC_017620	AACT	2	8	650963	650970	50 %	25 %	0 %	25 %	386583735
13010	NC_017620	ACGT	2	8	651019	651026	25 %	25 %	25 %	25 %	386583735
13011	NC_017620	CAA	2	6	651036	651041	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386583735
13012	NC_017620	GTG	2	6	651046	651051	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386583735
13013	NC_017620	GTG	2	6	651106	651111	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386583735
13014	NC_017620	AGA	2	6	651119	651124	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386583735
13015	NC_017620	GCT	2	6	651132	651137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386583735
13016	NC_017620	TTG	2	6	651148	651153	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386583735
13017	NC_017620	GGT	2	6	651183	651188	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386583735
13018	NC_017620	GTT	2	6	651204	651209	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386583735
13019	NC_017620	ATG	2	6	651225	651230	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386583735
13020	NC_017620	TGT	2	6	651233	651238	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386583735
13021	NC_017620	GGT	2	6	651339	651344	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386583735
13022	NC_017620	GCTAAA	2	12	651456	651467	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	386583735
13023	NC_017620	CAGCTA	2	12	651469	651480	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	386583735
13024	NC_017620	ACA	3	9	651510	651518	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386583735
13025	NC_017620	T	8	8	651586	651593	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13026	NC_017620	AGAA	2	8	651675	651682	75 %	0 %	25 %	0 %	386583736
13027	NC_017620	A	6	6	651750	651755	100 %	0 %	0 %	0 %	386583736
13028	NC_017620	AGG	2	6	651783	651788	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386583736
13029	NC_017620	TA	3	6	651797	651802	50 %	50 %	0 %	0 %	386583736
13030	NC_017620	CAG	2	6	652034	652039	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386583737
13031	NC_017620	GA	3	6	652070	652075	50 %	0 %	50 %	0 %	386583737
13032	NC_017620	TAT	2	6	652125	652130	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386583737
13033	NC_017620	GGA	2	6	652134	652139	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386583737
13034	NC_017620	TCA	2	6	652184	652189	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386583737
13035	NC_017620	TTG	2	6	652223	652228	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386583737
13036	NC_017620	ATT	2	6	652265	652270	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386583737
13037	NC_017620	TGG	2	6	652419	652424	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386583737
13038	NC_017620	TTC	2	6	652438	652443	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386583737
13039	NC_017620	AT	3	6	652542	652547	50 %	50 %	0 %	0 %	386583737
13040	NC_017620	CAG	2	6	652631	652636	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386583737
13041	NC_017620	TAAT	2	8	652743	652750	50 %	50 %	0 %	0 %	386583737
13042	NC_017620	T	6	6	652774	652779	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13043	NC_017620	TAA	2	6	652849	652854	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13044	NC_017620	CAA	2	6	652929	652934	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386583738
13045	NC_017620	TGATTT	2	12	652939	652950	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	386583738
13046	NC_017620	GCA	2	6	653024	653029	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386583738
13047	NC_017620	GGCTT	2	10	653058	653067	0 %	40 %	40 %	20 %	386583738
13048	NC_017620	CTG	2	6	653074	653079	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386583738
13049	NC_017620	CTT	2	6	653198	653203	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386583738
13050	NC_017620	AGA	2	6	653273	653278	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386583738
13051	NC_017620	TTC	2	6	653304	653309	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386583738
13052	NC_017620	TAGTC	2	10	653417	653426	20 %	40 %	20 %	20 %	386583738
13053	NC_017620	CT	3	6	653431	653436	0 %	50 %	0 %	50 %	386583738
13054	NC_017620	T	6	6	653468	653473	0 %	100 %	0 %	0 %	386583738
13055	NC_017620	CAGC	2	8	653507	653514	25 %	0 %	25 %	50 %	386583738
13056	NC_017620	AGC	2	6	653521	653526	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386583738
13057	NC_017620	GCA	2	6	653550	653555	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386583738
13058	NC_017620	TTATGA	2	12	653560	653571	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	386583738
13059	NC_017620	GAT	2	6	653633	653638	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386583738
13060	NC_017620	TTA	2	6	653740	653745	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386583738
13061	NC_017620	ATT	2	6	653798	653803	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386583738
13062	NC_017620	AT	3	6	653888	653893	50 %	50 %	0 %	0 %	386583738
13063	NC_017620	GAT	3	9	653918	653926	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386583738
13064	NC_017620	AAGA	2	8	653988	653995	75 %	0 %	25 %	0 %	386583738
13065	NC_017620	GGC	2	6	654002	654007	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386583738
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13069	NC_017620	TATT	2	8	654139	654146	25 %	75 %	0 %	0 %	386583738
13070	NC_017620	AGA	2	6	654222	654227	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386583738
13071	NC_017620	TAT	2	6	654234	654239	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386583738
13072	NC_017620	TTGGG	2	10	654328	654337	0 %	40 %	60 %	0 %	386583738
13073	NC_017620	TGA	2	6	654386	654391	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386583738
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13075	NC_017620	GTTT	2	8	654644	654651	0 %	75 %	25 %	0 %	386583738
13076	NC_017620	CTA	2	6	654668	654673	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13077	NC_017620	T	6	6	654737	654742	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13078	NC_017620	A	8	8	654760	654767	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13079	NC_017620	TAG	2	6	654785	654790	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13080	NC_017620	A	6	6	654795	654800	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13081	NC_017620	GAG	2	6	654801	654806	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13082	NC_017620	AG	3	6	654805	654810	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13083	NC_017620	ATG	2	6	654811	654816	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386583739
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13086	NC_017620	CTG	3	9	654995	655003	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386583739
13087	NC_017620	CAGT	2	8	655132	655139	25 %	25 %	25 %	25 %	386583739
13088	NC_017620	TGC	2	6	655257	655262	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386583739
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13091	NC_017620	ATGA	2	8	655462	655469	50 %	25 %	25 %	0 %	386583739
13092	NC_017620	TAC	2	6	655512	655517	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386583739
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13094	NC_017620	AGA	2	6	655533	655538	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386583739
13095	NC_017620	AAAT	2	8	655540	655547	75 %	25 %	0 %	0 %	386583739
13096	NC_017620	TTA	2	6	655571	655576	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13097	NC_017620	TGCCT	2	10	655588	655597	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
13098	NC_017620	A	7	7	655655	655661	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13099	NC_017620	GAAG	2	8	655668	655675	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13100	NC_017620	ATT	2	6	655692	655697	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386583740
13101	NC_017620	TCA	2	6	655727	655732	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386583740
13102	NC_017620	TTG	2	6	655785	655790	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386583740
13103	NC_017620	TAC	2	6	655809	655814	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386583740
13104	NC_017620	A	6	6	656031	656036	100 %	0 %	0 %	0 %	386583740
13105	NC_017620	CGT	2	6	656073	656078	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386583740
13106	NC_017620	A	6	6	656097	656102	100 %	0 %	0 %	0 %	386583740
13107	NC_017620	AGA	2	6	656126	656131	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386583740
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13109	NC_017620	AAAGAA	2	12	656211	656222	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	386583740
13110	NC_017620	TTG	2	6	656223	656228	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386583740
13111	NC_017620	ATC	2	6	656266	656271	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13112	NC_017620	GTG	2	6	656292	656297	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13113	NC_017620	G	6	6	656317	656322	0 %	0 %	100 %	0 %	386583741
13114	NC_017620	AGAA	2	8	656354	656361	75 %	0 %	25 %	0 %	386583741
13115	NC_017620	ATGA	2	8	656369	656376	50 %	25 %	25 %	0 %	386583741
13116	NC_017620	TTA	2	6	656378	656383	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386583741
13117	NC_017620	TGAC	2	8	656406	656413	25 %	25 %	25 %	25 %	386583741
13118	NC_017620	GAGT	2	8	656562	656569	25 %	25 %	50 %	0 %	386583741
13119	NC_017620	TTGG	2	8	656580	656587	0 %	50 %	50 %	0 %	386583741
13120	NC_017620	CAAG	2	8	656647	656654	50 %	0 %	25 %	25 %	386583741
13121	NC_017620	GTT	2	6	656657	656662	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386583741
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