MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus suis D9 chromosome

Total Repeats: 43891

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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11502	NC_017620	GATT	2	8	569394	569401	25 %	50 %	25 %	0 %	386583668
11503	NC_017620	T	6	6	569430	569435	0 %	100 %	0 %	0 %	386583668
11504	NC_017620	GTC	2	6	569488	569493	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386583669
11505	NC_017620	A	6	6	569536	569541	100 %	0 %	0 %	0 %	386583669
11506	NC_017620	CAT	2	6	569546	569551	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386583669
11507	NC_017620	AAC	2	6	569567	569572	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386583669
11508	NC_017620	AGA	3	9	569603	569611	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386583669
11509	NC_017620	AC	3	6	569629	569634	50 %	0 %	0 %	50 %	386583669
11510	NC_017620	TGG	2	6	569674	569679	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386583669
11511	NC_017620	TGA	2	6	569756	569761	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386583669
11512	NC_017620	GTT	2	6	569808	569813	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386583669
11513	NC_017620	TGA	2	6	569858	569863	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386583669
11514	NC_017620	ACC	2	6	570001	570006	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386583669
11515	NC_017620	GAT	2	6	570029	570034	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386583669
11516	NC_017620	TGA	2	6	570110	570115	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386583669
11517	NC_017620	CAT	3	9	570176	570184	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386583669
11518	NC_017620	TCG	2	6	570227	570232	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386583669
11519	NC_017620	GTCAAG	2	12	570279	570290	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	386583669
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11521	NC_017620	GAAAG	2	10	570562	570571	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
11522	NC_017620	A	6	6	570611	570616	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11523	NC_017620	ATAG	2	8	570730	570737	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
11524	NC_017620	GAAAG	2	10	570791	570800	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
11525	NC_017620	CCT	2	6	570833	570838	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11526	NC_017620	ATAG	2	8	570959	570966	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
11527	NC_017620	TG	3	6	570974	570979	0 %	50 %	50 %	0 %	386583670
11528	NC_017620	CA	3	6	570985	570990	50 %	0 %	0 %	50 %	386583670
11529	NC_017620	TCG	2	6	571070	571075	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386583670
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11531	NC_017620	CGT	2	6	571203	571208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386583670
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11533	NC_017620	TGCC	2	8	571297	571304	0 %	25 %	25 %	50 %	386583670
11534	NC_017620	AACA	2	8	571305	571312	75 %	0 %	0 %	25 %	386583670
11535	NC_017620	T	6	6	571323	571328	0 %	100 %	0 %	0 %	386583670
11536	NC_017620	CTG	2	6	571389	571394	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386583670
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11539	NC_017620	TGG	2	6	571537	571542	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386583670
11540	NC_017620	CAG	2	6	571621	571626	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386583670
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11542	NC_017620	ATGG	2	8	571725	571732	25 %	25 %	50 %	0 %	386583670
11543	NC_017620	ATT	2	6	571744	571749	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386583670
11544	NC_017620	CAGA	2	8	571791	571798	50 %	0 %	25 %	25 %	386583670
11545	NC_017620	T	6	6	571920	571925	0 %	100 %	0 %	0 %	386583671
11546	NC_017620	GATGCG	2	12	571951	571962	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	386583671
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11550	NC_017620	GGA	2	6	572178	572183	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386583671
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11553	NC_017620	CTTT	2	8	572344	572351	0 %	75 %	0 %	25 %	386583671
11554	NC_017620	GGT	2	6	572376	572381	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386583671
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11556	NC_017620	GGA	2	6	572436	572441	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386583671
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11559	NC_017620	TTGG	2	8	572494	572501	0 %	50 %	50 %	0 %	386583672
11560	NC_017620	GCA	2	6	572630	572635	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386583672
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11606	NC_017620	CGGAA	2	10	575048	575057	40 %	0 %	40 %	20 %	386583674
11607	NC_017620	TTG	2	6	575107	575112	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386583674
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