MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus suis D9 chromosome

Total Repeats: 43891

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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5002	NC_017620	GGA	2	6	245139	245144	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386583372
5003	NC_017620	AAG	2	6	245183	245188	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386583372
5004	NC_017620	GTC	2	6	245261	245266	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386583372
5005	NC_017620	ATG	2	6	245279	245284	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386583372
5006	NC_017620	T	6	6	245296	245301	0 %	100 %	0 %	0 %	386583372
5007	NC_017620	AAG	2	6	245321	245326	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386583372
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5009	NC_017620	AGA	2	6	245418	245423	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386583372
5010	NC_017620	AGG	2	6	245440	245445	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386583372
5011	NC_017620	CGG	2	6	245513	245518	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386583373
5012	NC_017620	TTG	2	6	245558	245563	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386583373
5013	NC_017620	AGAC	2	8	245595	245602	50 %	0 %	25 %	25 %	386583373
5014	NC_017620	AGA	2	6	245607	245612	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386583373
5015	NC_017620	GTAC	2	8	245681	245688	25 %	25 %	25 %	25 %	386583373
5016	NC_017620	GAA	2	6	245696	245701	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386583373
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5019	NC_017620	GCAA	2	8	245969	245976	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5020	NC_017620	TTGTTT	2	12	245979	245990	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
5021	NC_017620	ATA	2	6	246012	246017	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5022	NC_017620	GGT	2	6	246082	246087	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5023	NC_017620	CCT	2	6	246096	246101	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5024	NC_017620	A	6	6	246127	246132	100 %	0 %	0 %	0 %	386583374
5025	NC_017620	TTAT	2	8	246141	246148	25 %	75 %	0 %	0 %	386583374
5026	NC_017620	GTCT	2	8	246160	246167	0 %	50 %	25 %	25 %	386583374
5027	NC_017620	GAA	2	6	246250	246255	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386583374
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5029	NC_017620	AACAGA	2	12	246330	246341	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	386583374
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5040	NC_017620	TGGA	2	8	246725	246732	25 %	25 %	50 %	0 %	386583374
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5043	NC_017620	TTA	2	6	246967	246972	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386583374
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5048	NC_017620	TGA	2	6	247128	247133	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386583374
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5050	NC_017620	TAATG	2	10	247197	247206	40 %	40 %	20 %	0 %	386583374
5051	NC_017620	CAT	2	6	247251	247256	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386583374
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5055	NC_017620	ATG	2	6	247412	247417	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386583374
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5057	NC_017620	TTA	2	6	247503	247508	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386583374
5058	NC_017620	TTG	2	6	247586	247591	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386583374
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5062	NC_017620	TCT	2	6	247848	247853	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386583374
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5101	NC_017620	TATTT	2	10	249655	249664	20 %	80 %	0 %	0 %	386583375
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5120	NC_017620	TGA	2	6	250853	250858	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5121	NC_017620	T	6	6	250983	250988	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5122	NC_017620	TAAAA	2	10	251002	251011	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5124	NC_017620	GA	3	6	251082	251087	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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5499	NC_017620	GTT	2	6	269510	269515	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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