MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus suis SS12 chromosome

Total Repeats: 42496

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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3502	NC_017619	GATTTG	2	12	171522	171533	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	386581221
3503	NC_017619	TGG	2	6	171535	171540	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386581221
3504	NC_017619	TGG	2	6	171802	171807	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386581221
3505	NC_017619	AAG	2	6	172016	172021	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386581221
3506	NC_017619	AGA	2	6	172031	172036	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386581221
3507	NC_017619	GCA	2	6	172044	172049	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386581221
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3509	NC_017619	AGG	2	6	172165	172170	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386581221
3510	NC_017619	ATT	2	6	172216	172221	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386581221
3511	NC_017619	AGA	2	6	172250	172255	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386581221
3512	NC_017619	TGGA	2	8	172256	172263	25 %	25 %	50 %	0 %	386581221
3513	NC_017619	AATC	2	8	172322	172329	50 %	25 %	0 %	25 %	386581221
3514	NC_017619	GAA	2	6	172353	172358	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386581221
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3516	NC_017619	GAA	2	6	172458	172463	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386581221
3517	NC_017619	TGA	2	6	172535	172540	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386581221
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3521	NC_017619	TAGA	2	8	172712	172719	50 %	25 %	25 %	0 %	386581221
3522	NC_017619	CATTG	2	10	172743	172752	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
3523	NC_017619	ATT	2	6	172778	172783	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3524	NC_017619	A	6	6	172898	172903	100 %	0 %	0 %	0 %	386581222
3525	NC_017619	CAGT	2	8	172904	172911	25 %	25 %	25 %	25 %	386581222
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3530	NC_017619	TGA	2	6	173085	173090	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386581222
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3532	NC_017619	AAC	2	6	173201	173206	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386581222
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3537	NC_017619	TGG	2	6	173519	173524	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3538	NC_017619	T	6	6	173534	173539	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3539	NC_017619	AGT	2	6	173546	173551	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3540	NC_017619	ATTTTT	2	12	173564	173575	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3541	NC_017619	AGG	2	6	173639	173644	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3542	NC_017619	AAAG	2	8	173701	173708	75 %	0 %	25 %	0 %	386581223
3543	NC_017619	AGC	2	6	173747	173752	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386581223
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3545	NC_017619	TTG	2	6	173782	173787	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386581223
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3547	NC_017619	ATACA	2	10	173809	173818	60 %	20 %	0 %	20 %	386581223
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3549	NC_017619	ATCT	2	8	173896	173903	25 %	50 %	0 %	25 %	386581223
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3553	NC_017619	ATT	2	6	173985	173990	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386581223
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3558	NC_017619	GAA	2	6	174220	174225	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386581223
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3562	NC_017619	GA	3	6	174280	174285	50 %	0 %	50 %	0 %	386581223
3563	NC_017619	T	6	6	174303	174308	0 %	100 %	0 %	0 %	386581223
3564	NC_017619	TTTA	2	8	174315	174322	25 %	75 %	0 %	0 %	386581223
3565	NC_017619	AGGG	2	8	174371	174378	25 %	0 %	75 %	0 %	386581223
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3572	NC_017619	TGG	2	6	174804	174809	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386581223
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3593	NC_017619	TAT	2	6	175912	175917	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386581224
3594	NC_017619	ATGA	2	8	175922	175929	50 %	25 %	25 %	0 %	386581224
3595	NC_017619	GGTTT	2	10	175967	175976	0 %	60 %	40 %	0 %	386581224
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3603	NC_017619	AT	3	6	176379	176384	50 %	50 %	0 %	0 %	386581225
3604	NC_017619	CA	3	6	176401	176406	50 %	0 %	0 %	50 %	386581225
3605	NC_017619	TA	3	6	176408	176413	50 %	50 %	0 %	0 %	386581225
3606	NC_017619	TGGG	2	8	176477	176484	0 %	25 %	75 %	0 %	386581225
3607	NC_017619	GTG	2	6	176603	176608	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386581225
3608	NC_017619	TAG	2	6	176609	176614	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386581225
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3611	NC_017619	GTG	2	6	176777	176782	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386581225
3612	NC_017619	GCA	2	6	176827	176832	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386581225
3613	NC_017619	TTATC	2	10	176843	176852	20 %	60 %	0 %	20 %	386581225
3614	NC_017619	GTT	2	6	176947	176952	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386581225
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3619	NC_017619	GCTA	2	8	177273	177280	25 %	25 %	25 %	25 %	386581225
3620	NC_017619	A	6	6	177355	177360	100 %	0 %	0 %	0 %	386581225
3621	NC_017619	AGAA	2	8	177365	177372	75 %	0 %	25 %	0 %	386581225
3622	NC_017619	ATA	2	6	177375	177380	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386581225
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3996	NC_017619	GTCAAG	2	12	195306	195317	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	386581239
3997	NC_017619	AAG	2	6	195336	195341	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386581239
3998	NC_017619	ATT	2	6	195372	195377	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386581239
3999	NC_017619	AGCAG	2	10	195391	195400	40 %	0 %	40 %	20 %	386581239
4000	NC_017619	GTA	2	6	195439	195444	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386581239

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