MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus suis SS12 chromosome

Total Repeats: 42496

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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31002	NC_017619	TCA	2	6	1517701	1517706	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31003	NC_017619	CCT	2	6	1517750	1517755	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
31004	NC_017619	GTTT	2	8	1517756	1517763	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
31005	NC_017619	T	6	6	1517792	1517797	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31006	NC_017619	ATT	2	6	1517831	1517836	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386582547
31007	NC_017619	TA	3	6	1517843	1517848	50 %	50 %	0 %	0 %	386582547
31008	NC_017619	ATG	2	6	1517884	1517889	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386582547
31009	NC_017619	CCTA	2	8	1517922	1517929	25 %	25 %	0 %	50 %	386582547
31010	NC_017619	AGC	2	6	1517931	1517936	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386582547
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31012	NC_017619	CAAC	2	8	1518035	1518042	50 %	0 %	0 %	50 %	386582547
31013	NC_017619	ATA	2	6	1518043	1518048	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386582547
31014	NC_017619	T	6	6	1518204	1518209	0 %	100 %	0 %	0 %	386582547
31015	NC_017619	CTA	2	6	1518230	1518235	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386582547
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31017	NC_017619	AGA	2	6	1518290	1518295	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386582547
31018	NC_017619	CA	3	6	1518300	1518305	50 %	0 %	0 %	50 %	386582547
31019	NC_017619	CTG	2	6	1518389	1518394	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386582548
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31023	NC_017619	T	6	6	1518587	1518592	0 %	100 %	0 %	0 %	386582548
31024	NC_017619	CTG	2	6	1518623	1518628	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386582548
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31028	NC_017619	A	6	6	1518771	1518776	100 %	0 %	0 %	0 %	386582548
31029	NC_017619	CAA	2	6	1518895	1518900	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386582548
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31031	NC_017619	CATA	2	8	1518925	1518932	50 %	25 %	0 %	25 %	386582548
31032	NC_017619	TGCC	2	8	1518979	1518986	0 %	25 %	25 %	50 %	386582548
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31041	NC_017619	AAC	2	6	1519208	1519213	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31042	NC_017619	ATT	2	6	1519221	1519226	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31043	NC_017619	T	6	6	1519356	1519361	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31044	NC_017619	TTG	2	6	1519387	1519392	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31045	NC_017619	TCA	2	6	1519468	1519473	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386582549
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31049	NC_017619	CTGCT	2	10	1519686	1519695	0 %	40 %	20 %	40 %	386582549
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31056	NC_017619	TAAA	2	8	1520103	1520110	75 %	25 %	0 %	0 %	386582550
31057	NC_017619	GAT	2	6	1520141	1520146	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386582550
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31059	NC_017619	TAC	2	6	1520219	1520224	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386582550
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31062	NC_017619	AT	3	6	1520317	1520322	50 %	50 %	0 %	0 %	386582550
31063	NC_017619	CAA	2	6	1520405	1520410	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386582550
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31108	NC_017619	TAT	2	6	1522399	1522404	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31109	NC_017619	TAT	2	6	1522436	1522441	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31110	NC_017619	TAAA	2	8	1522454	1522461	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
31111	NC_017619	A	6	6	1522459	1522464	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31112	NC_017619	AAAC	2	8	1522509	1522516	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
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31117	NC_017619	TTC	2	6	1522732	1522737	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386582553
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31240	NC_017619	AGA	2	6	1528325	1528330	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386582561
31241	NC_017619	ATG	2	6	1528333	1528338	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386582561
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31243	NC_017619	TCA	2	6	1528472	1528477	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386582561
31244	NC_017619	TAC	2	6	1528550	1528555	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386582561
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31246	NC_017619	TGA	2	6	1528659	1528664	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386582562
31247	NC_017619	GCT	2	6	1528688	1528693	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386582562
31248	NC_017619	T	6	6	1528740	1528745	0 %	100 %	0 %	0 %	386582562
31249	NC_017619	AGA	2	6	1528757	1528762	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386582562
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31251	NC_017619	TGA	2	6	1528827	1528832	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386582562
31252	NC_017619	GCT	3	9	1528854	1528862	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386582562
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31259	NC_017619	CTTTT	2	10	1529321	1529330	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
31260	NC_017619	A	6	6	1529411	1529416	100 %	0 %	0 %	0 %	386582563
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31341	NC_017619	AAT	2	6	1533614	1533619	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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31344	NC_017619	CTGC	2	8	1533689	1533696	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
31345	NC_017619	T	6	6	1533702	1533707	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31346	NC_017619	T	6	6	1533738	1533743	0 %	100 %	0 %	0 %	386582567
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31354	NC_017619	TGG	2	6	1534231	1534236	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386582567
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