MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus suis SS12 chromosome

Total Repeats: 42496

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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25002	NC_017619	TGA	2	6	1215534	1215539	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386582218
25003	NC_017619	TGA	2	6	1215546	1215551	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386582218
25004	NC_017619	AAGG	2	8	1215623	1215630	50 %	0 %	50 %	0 %	386582218
25005	NC_017619	TCG	2	6	1215643	1215648	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386582218
25006	NC_017619	TGG	2	6	1215658	1215663	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386582218
25007	NC_017619	GA	3	6	1215747	1215752	50 %	0 %	50 %	0 %	386582218
25008	NC_017619	AGC	2	6	1215801	1215806	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386582218
25009	NC_017619	CAAC	2	8	1215815	1215822	50 %	0 %	0 %	50 %	386582218
25010	NC_017619	CAA	2	6	1215842	1215847	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386582218
25011	NC_017619	TAAG	2	8	1215901	1215908	50 %	25 %	25 %	0 %	386582218
25012	NC_017619	GAT	2	6	1215938	1215943	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386582218
25013	NC_017619	TA	3	6	1215947	1215952	50 %	50 %	0 %	0 %	386582218
25014	NC_017619	CCA	2	6	1215988	1215993	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386582218
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25016	NC_017619	T	7	7	1216022	1216028	0 %	100 %	0 %	0 %	386582218
25017	NC_017619	T	7	7	1216039	1216045	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
25018	NC_017619	T	6	6	1216047	1216052	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
25019	NC_017619	GT	3	6	1216053	1216058	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
25020	NC_017619	AGCAA	2	10	1216147	1216156	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
25021	NC_017619	AC	3	6	1216180	1216185	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
25022	NC_017619	TCGCT	2	10	1216194	1216203	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
25023	NC_017619	T	6	6	1216207	1216212	0 %	100 %	0 %	0 %	386582219
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25092	NC_017619	ATG	2	6	1219376	1219381	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386582223
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25102	NC_017619	GTAG	2	8	1219679	1219686	25 %	25 %	50 %	0 %	386582223
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25117	NC_017619	CAT	2	6	1220339	1220344	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386582224
25118	NC_017619	ATT	2	6	1220352	1220357	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386582224
25119	NC_017619	CTTTT	2	10	1220391	1220400	0 %	80 %	0 %	20 %	386582224
25120	NC_017619	C	6	6	1220431	1220436	0 %	0 %	0 %	100 %	386582224
25121	NC_017619	CTGA	2	8	1220552	1220559	25 %	25 %	25 %	25 %	386582224
25122	NC_017619	A	7	7	1220617	1220623	100 %	0 %	0 %	0 %	386582224
25123	NC_017619	GTA	2	6	1220831	1220836	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386582225
25124	NC_017619	TTTGT	2	10	1220885	1220894	0 %	80 %	20 %	0 %	386582225
25125	NC_017619	CTT	2	6	1220907	1220912	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386582225
25126	NC_017619	AATC	2	8	1220931	1220938	50 %	25 %	0 %	25 %	386582225
25127	NC_017619	TCT	2	6	1220961	1220966	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386582225
25128	NC_017619	CACC	2	8	1221021	1221028	25 %	0 %	0 %	75 %	386582225
25129	NC_017619	ATTTCA	2	12	1221128	1221139	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	386582225
25130	NC_017619	TTGA	2	8	1221199	1221206	25 %	50 %	25 %	0 %	386582225
25131	NC_017619	GAA	2	6	1221269	1221274	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386582225
25132	NC_017619	A	6	6	1221302	1221307	100 %	0 %	0 %	0 %	386582225
25133	NC_017619	AAT	2	6	1221341	1221346	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386582225
25134	NC_017619	TGC	2	6	1221349	1221354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386582225
25135	NC_017619	TGC	2	6	1221505	1221510	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386582226
25136	NC_017619	AG	4	8	1221523	1221530	50 %	0 %	50 %	0 %	386582226
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25138	NC_017619	T	6	6	1221584	1221589	0 %	100 %	0 %	0 %	386582226
25139	NC_017619	CTT	2	6	1221837	1221842	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386582226
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25142	NC_017619	GT	3	6	1222108	1222113	0 %	50 %	50 %	0 %	386582226
25143	NC_017619	TCT	2	6	1222209	1222214	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386582226
25144	NC_017619	TGA	2	6	1222259	1222264	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386582226
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25146	NC_017619	TATT	2	8	1222373	1222380	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
25147	NC_017619	CAATT	2	10	1222399	1222408	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
25148	NC_017619	ATC	2	6	1222511	1222516	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386582227
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25155	NC_017619	CTT	2	6	1222918	1222923	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386582227
25156	NC_017619	TTG	2	6	1222939	1222944	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386582227
25157	NC_017619	TC	4	8	1222970	1222977	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
25158	NC_017619	AAT	2	6	1222986	1222991	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25159	NC_017619	T	6	6	1223020	1223025	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
25160	NC_017619	AT	3	6	1223040	1223045	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25161	NC_017619	CA	3	6	1223074	1223079	50 %	0 %	0 %	50 %	386582228
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25219	NC_017619	GA	3	6	1225745	1225750	50 %	0 %	50 %	0 %	386582230
25220	NC_017619	AAG	2	6	1225849	1225854	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386582230
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25224	NC_017619	ACTG	2	8	1226099	1226106	25 %	25 %	25 %	25 %	386582230
25225	NC_017619	TCC	2	6	1226168	1226173	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386582230
25226	NC_017619	TTTC	2	8	1226178	1226185	0 %	75 %	0 %	25 %	386582230
25227	NC_017619	GTA	2	6	1226295	1226300	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386582230
25228	NC_017619	TCT	2	6	1226318	1226323	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386582230
25229	NC_017619	TTC	2	6	1226350	1226355	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386582230
25230	NC_017619	CTT	2	6	1226409	1226414	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386582230
25231	NC_017619	T	6	6	1226413	1226418	0 %	100 %	0 %	0 %	386582230
25232	NC_017619	TCA	2	6	1226438	1226443	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386582230
25233	NC_017619	AAT	2	6	1226456	1226461	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386582230
25234	NC_017619	T	6	6	1226489	1226494	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
25235	NC_017619	TAT	2	6	1226555	1226560	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25236	NC_017619	GAA	2	6	1226624	1226629	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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25355	NC_017619	ATT	2	6	1232154	1232159	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386582233
25356	NC_017619	TCA	2	6	1232197	1232202	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386582233
25357	NC_017619	A	6	6	1232202	1232207	100 %	0 %	0 %	0 %	386582233
25358	NC_017619	T	7	7	1232254	1232260	0 %	100 %	0 %	0 %	386582233
25359	NC_017619	GCT	2	6	1232276	1232281	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386582233
25360	NC_017619	A	6	6	1232314	1232319	100 %	0 %	0 %	0 %	386582233
25361	NC_017619	ACC	2	6	1232355	1232360	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386582233
25362	NC_017619	GCT	2	6	1232509	1232514	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386582234
25363	NC_017619	TCT	2	6	1232581	1232586	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386582234
25364	NC_017619	TGGCA	2	10	1232650	1232659	20 %	20 %	40 %	20 %	386582234
25365	NC_017619	GAG	3	9	1232701	1232709	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386582234
25366	NC_017619	TCT	2	6	1232742	1232747	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386582234
25367	NC_017619	CG	3	6	1232807	1232812	0 %	0 %	50 %	50 %	386582234
25368	NC_017619	ATGGT	2	10	1232877	1232886	20 %	40 %	40 %	0 %	386582234
25369	NC_017619	GACCT	2	10	1232927	1232936	20 %	20 %	20 %	40 %	386582234
25370	NC_017619	AATG	2	8	1232962	1232969	50 %	25 %	25 %	0 %	386582234
25371	NC_017619	TCTG	2	8	1233051	1233058	0 %	50 %	25 %	25 %	386582234
25372	NC_017619	CTC	2	6	1233059	1233064	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386582234
25373	NC_017619	TAA	2	6	1233133	1233138	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386582234
25374	NC_017619	TGAT	2	8	1233222	1233229	25 %	50 %	25 %	0 %	386582234
25375	NC_017619	TA	4	8	1233336	1233343	50 %	50 %	0 %	0 %	386582235
25376	NC_017619	CGACC	2	10	1233355	1233364	20 %	0 %	20 %	60 %	386582235
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25378	NC_017619	CCT	2	6	1233488	1233493	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386582235
25379	NC_017619	CTC	2	6	1233540	1233545	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386582235
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25382	NC_017619	CCG	2	6	1233644	1233649	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386582235
25383	NC_017619	GCTT	2	8	1233701	1233708	0 %	50 %	25 %	25 %	386582235
25384	NC_017619	GCT	2	6	1233743	1233748	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386582235
25385	NC_017619	TAG	2	6	1233763	1233768	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386582235
25386	NC_017619	GTCA	2	8	1233864	1233871	25 %	25 %	25 %	25 %	386582235
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25389	NC_017619	CAT	2	6	1234138	1234143	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386582236
25390	NC_017619	CATGA	2	10	1234183	1234192	40 %	20 %	20 %	20 %	386582236
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25393	NC_017619	AG	3	6	1234242	1234247	50 %	0 %	50 %	0 %	386582236
25394	NC_017619	ACC	2	6	1234295	1234300	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386582236
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25404	NC_017619	TTG	2	6	1234943	1234948	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386582236
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25431	NC_017619	TAT	2	6	1236106	1236111	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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25439	NC_017619	A	6	6	1236341	1236346	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
25440	NC_017619	CTT	2	6	1236387	1236392	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25441	NC_017619	ATA	2	6	1236413	1236418	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386582239
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25445	NC_017619	CAT	2	6	1236628	1236633	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386582239
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25460	NC_017619	AG	3	6	1237401	1237406	50 %	0 %	50 %	0 %	386582239
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25462	NC_017619	CTG	2	6	1237467	1237472	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386582239
25463	NC_017619	T	6	6	1237564	1237569	0 %	100 %	0 %	0 %	386582239
25464	NC_017619	T	6	6	1237658	1237663	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
25465	NC_017619	TCA	2	6	1237741	1237746	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25466	NC_017619	AG	3	6	1237757	1237762	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
25467	NC_017619	AC	3	6	1237763	1237768	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
25468	NC_017619	CTT	2	6	1237804	1237809	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386582240
25469	NC_017619	ATG	2	6	1237877	1237882	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386582240
25470	NC_017619	A	6	6	1237922	1237927	100 %	0 %	0 %	0 %	386582240
25471	NC_017619	TTG	2	6	1237928	1237933	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386582240
25472	NC_017619	ATG	2	6	1238069	1238074	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386582240
25473	NC_017619	A	6	6	1238133	1238138	100 %	0 %	0 %	0 %	386582240
25474	NC_017619	CAAA	2	8	1238196	1238203	75 %	0 %	0 %	25 %	386582240
25475	NC_017619	TGA	2	6	1238286	1238291	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386582240
25476	NC_017619	TGG	2	6	1238349	1238354	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386582240
25477	NC_017619	TGA	2	6	1238370	1238375	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386582240
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25479	NC_017619	TTG	2	6	1238465	1238470	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386582240
25480	NC_017619	AAT	2	6	1238476	1238481	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386582240
25481	NC_017619	CGAT	2	8	1238616	1238623	25 %	25 %	25 %	25 %	386582240
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25483	NC_017619	GAT	2	6	1238737	1238742	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386582240
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25491	NC_017619	AAAG	2	8	1239139	1239146	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
25492	NC_017619	TGC	2	6	1239166	1239171	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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25494	NC_017619	TGTT	2	8	1239489	1239496	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
25495	NC_017619	TA	3	6	1239567	1239572	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25496	NC_017619	ACT	2	6	1239588	1239593	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386582241
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25499	NC_017619	AATC	2	8	1239738	1239745	50 %	25 %	0 %	25 %	386582241
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