MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus suis JS14 chromosome

Total Repeats: 43189

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017618	AAC	2	6	11	16	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386578981
2	NC_017618	T	6	6	17	22	0 %	100 %	0 %	0 %	386578981
3	NC_017618	A	6	6	148	153	100 %	0 %	0 %	0 %	386578981
4	NC_017618	A	7	7	164	170	100 %	0 %	0 %	0 %	386578981
5	NC_017618	TAC	2	6	267	272	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386578981
6	NC_017618	AAG	2	6	279	284	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386578981
7	NC_017618	CTC	2	6	323	328	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386578981
8	NC_017618	AAT	2	6	400	405	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386578981
9	NC_017618	ATT	2	6	465	470	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386578981
10	NC_017618	TGG	2	6	477	482	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386578981
11	NC_017618	TCA	2	6	581	586	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386578981
12	NC_017618	A	7	7	631	637	100 %	0 %	0 %	0 %	386578981
13	NC_017618	ACTT	2	8	653	660	25 %	50 %	0 %	25 %	386578981
14	NC_017618	TGA	2	6	666	671	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386578981
15	NC_017618	TC	3	6	679	684	0 %	50 %	0 %	50 %	386578981
16	NC_017618	TAA	2	6	687	692	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386578981
17	NC_017618	CAA	2	6	695	700	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386578981
18	NC_017618	GAA	2	6	706	711	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386578981
19	NC_017618	A	7	7	740	746	100 %	0 %	0 %	0 %	386578981
20	NC_017618	GAA	2	6	799	804	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386578981
21	NC_017618	CTATC	2	10	928	937	20 %	40 %	0 %	40 %	386578981
22	NC_017618	ACGT	2	8	959	966	25 %	25 %	25 %	25 %	386578981
23	NC_017618	TGC	2	6	1041	1046	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386578981
24	NC_017618	ACAA	2	8	1068	1075	75 %	0 %	0 %	25 %	386578981
25	NC_017618	CG	3	6	1188	1193	0 %	0 %	50 %	50 %	386578981
26	NC_017618	GACA	2	8	1224	1231	50 %	0 %	25 %	25 %	386578981
27	NC_017618	ATGC	2	8	1285	1292	25 %	25 %	25 %	25 %	386578981
28	NC_017618	AATAA	2	10	1297	1306	80 %	20 %	0 %	0 %	386578981
29	NC_017618	CTC	2	6	1312	1317	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386578981
30	NC_017618	GAT	2	6	1321	1326	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386578981
31	NC_017618	A	6	6	1356	1361	100 %	0 %	0 %	0 %	386578981
32	NC_017618	T	6	6	1387	1392	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017618	A	6	6	1393	1398	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017618	T	6	6	1404	1409	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017618	TCA	2	6	1454	1459	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_017618	ACT	2	6	1482	1487	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_017618	ATA	2	6	1507	1512	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017618	TAA	2	6	1545	1550	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386578982
39	NC_017618	AT	3	6	1553	1558	50 %	50 %	0 %	0 %	386578982
40	NC_017618	A	6	6	1599	1604	100 %	0 %	0 %	0 %	386578982
41	NC_017618	TTA	2	6	1772	1777	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386578982
42	NC_017618	AAG	2	6	1880	1885	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386578982
43	NC_017618	ACAA	2	8	1956	1963	75 %	0 %	0 %	25 %	386578982
44	NC_017618	GTC	2	6	2000	2005	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386578982
45	NC_017618	TGA	2	6	2115	2120	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386578982
46	NC_017618	TGT	2	6	2127	2132	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386578982
47	NC_017618	TC	3	6	2146	2151	0 %	50 %	0 %	50 %	386578982
48	NC_017618	GAT	2	6	2176	2181	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386578982
49	NC_017618	TCT	2	6	2198	2203	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386578982
50	NC_017618	AAT	2	6	2209	2214	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386578982
51	NC_017618	TTA	2	6	2257	2262	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386578982
52	NC_017618	TACC	2	8	2268	2275	25 %	25 %	0 %	50 %	386578982
53	NC_017618	ACCG	2	8	2281	2288	25 %	0 %	25 %	50 %	386578982
54	NC_017618	AAC	2	6	2310	2315	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386578982
55	NC_017618	TCT	2	6	2364	2369	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386578982
56	NC_017618	TAA	2	6	2412	2417	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386578982
57	NC_017618	TGT	2	6	2418	2423	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386578982
58	NC_017618	ACTT	2	8	2521	2528	25 %	50 %	0 %	25 %	386578982
59	NC_017618	TCT	2	6	2581	2586	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386578982
60	NC_017618	GTCC	2	8	2587	2594	0 %	25 %	25 %	50 %	386578982
61	NC_017618	AAT	2	6	2611	2616	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386578982
62	NC_017618	ATA	2	6	2665	2670	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017618	A	6	6	2708	2713	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017618	TA	3	6	2732	2737	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017618	TA	4	8	2763	2770	50 %	50 %	0 %	0 %	386578983
66	NC_017618	CTG	2	6	2799	2804	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386578983
67	NC_017618	CATAT	2	10	2807	2816	40 %	40 %	0 %	20 %	386578983
68	NC_017618	AAAG	2	8	2825	2832	75 %	0 %	25 %	0 %	386578983
69	NC_017618	A	6	6	2883	2888	100 %	0 %	0 %	0 %	386578983
70	NC_017618	AGT	2	6	2921	2926	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386578983
71	NC_017618	TTA	2	6	3007	3012	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386578983
72	NC_017618	TA	3	6	3063	3068	50 %	50 %	0 %	0 %	386578983
73	NC_017618	AG	3	6	3088	3093	50 %	0 %	50 %	0 %	386578983
74	NC_017618	AT	3	6	3107	3112	50 %	50 %	0 %	0 %	386578983
75	NC_017618	A	7	7	3203	3209	100 %	0 %	0 %	0 %	386578983
76	NC_017618	ATT	2	6	3265	3270	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386578983
77	NC_017618	TGA	2	6	3304	3309	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386578983
78	NC_017618	T	6	6	3335	3340	0 %	100 %	0 %	0 %	386578983
79	NC_017618	TGG	2	6	3367	3372	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386578983
80	NC_017618	GAAG	2	8	3409	3416	50 %	0 %	50 %	0 %	386578983
81	NC_017618	TTA	2	6	3476	3481	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386578983
82	NC_017618	TCT	2	6	3497	3502	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386578983
83	NC_017618	ATT	3	9	3556	3564	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386578983
84	NC_017618	GA	3	6	3576	3581	50 %	0 %	50 %	0 %	386578983
85	NC_017618	GTAT	2	8	3624	3631	25 %	50 %	25 %	0 %	386578983
86	NC_017618	AGG	2	6	3637	3642	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386578983
87	NC_017618	TCA	2	6	3696	3701	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386578984
88	NC_017618	TAA	2	6	3721	3726	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386578984
89	NC_017618	ATG	2	6	3791	3796	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386578984
90	NC_017618	ACT	2	6	3864	3869	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_017618	A	6	6	3933	3938	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017618	GAG	2	6	3939	3944	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017618	TGG	2	6	4171	4176	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386578985
94	NC_017618	AAC	2	6	4177	4182	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386578985
95	NC_017618	AATG	2	8	4190	4197	50 %	25 %	25 %	0 %	386578985
96	NC_017618	GAA	2	6	4215	4220	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386578985
97	NC_017618	TGT	2	6	4247	4252	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386578985
98	NC_017618	ATT	2	6	4289	4294	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386578985
99	NC_017618	ATT	2	6	4303	4308	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386578985
100	NC_017618	A	8	8	4390	4397	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017618	CAG	2	6	4409	4414	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386578986
102	NC_017618	TCG	2	6	4418	4423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386578986
103	NC_017618	TCA	2	6	4568	4573	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386578986
104	NC_017618	AAAT	2	8	4659	4666	75 %	25 %	0 %	0 %	386578986
105	NC_017618	AG	3	6	4821	4826	50 %	0 %	50 %	0 %	386578986
106	NC_017618	CAA	2	6	4830	4835	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386578986
107	NC_017618	A	6	6	4853	4858	100 %	0 %	0 %	0 %	386578986
108	NC_017618	A	6	6	4910	4915	100 %	0 %	0 %	0 %	386578986
109	NC_017618	AGA	2	6	4929	4934	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386578986
110	NC_017618	GAA	2	6	4969	4974	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386578986
111	NC_017618	A	6	6	4976	4981	100 %	0 %	0 %	0 %	386578986
112	NC_017618	TGA	2	6	5037	5042	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386578986
113	NC_017618	GCA	2	6	5098	5103	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386578986
114	NC_017618	GTG	3	9	5119	5127	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386578986
115	NC_017618	GAA	3	9	5143	5151	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386578986
116	NC_017618	CGA	2	6	5163	5168	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386578986
117	NC_017618	CTTG	2	8	5247	5254	0 %	50 %	25 %	25 %	386578986
118	NC_017618	CAG	2	6	5273	5278	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386578986
119	NC_017618	AGG	2	6	5285	5290	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386578986
120	NC_017618	CTC	2	6	5324	5329	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386578986
121	NC_017618	GAT	2	6	5395	5400	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386578986
122	NC_017618	AAG	2	6	5432	5437	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386578986
123	NC_017618	GAA	2	6	5452	5457	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386578986
124	NC_017618	CAT	2	6	5487	5492	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386578986
125	NC_017618	TTC	2	6	5532	5537	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_017618	GTT	2	6	5538	5543	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017618	GAT	2	6	5617	5622	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017618	TTGG	2	8	5626	5633	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017618	A	6	6	5667	5672	100 %	0 %	0 %	0 %	386578987
130	NC_017618	GATT	2	8	5679	5686	25 %	50 %	25 %	0 %	386578987
131	NC_017618	AAACA	2	10	5721	5730	80 %	0 %	0 %	20 %	386578987
132	NC_017618	TGC	2	6	5745	5750	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386578987
133	NC_017618	A	6	6	5838	5843	100 %	0 %	0 %	0 %	386578987
134	NC_017618	ATGA	2	8	5870	5877	50 %	25 %	25 %	0 %	386578987
135	NC_017618	TTA	2	6	5908	5913	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386578987
136	NC_017618	TAG	2	6	5937	5942	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386578987
137	NC_017618	GAC	2	6	5948	5953	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386578987
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139	NC_017618	TGTCT	2	10	6112	6121	0 %	60 %	20 %	20 %	386578987
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