MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus suis JS14 chromosome

Total Repeats: 43189

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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4002	NC_017618	AAG	2	6	194763	194768	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386579172
4003	NC_017618	ATT	2	6	194799	194804	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386579172
4004	NC_017618	AGCAG	2	10	194818	194827	40 %	0 %	40 %	20 %	386579172
4005	NC_017618	GTA	2	6	194866	194871	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386579172
4006	NC_017618	TAG	2	6	194930	194935	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386579173
4007	NC_017618	TGG	2	6	194992	194997	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386579173
4008	NC_017618	ATG	2	6	194999	195004	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386579173
4009	NC_017618	AAC	2	6	195048	195053	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386579173
4010	NC_017618	ATTC	2	8	195103	195110	25 %	50 %	0 %	25 %	386579173
4011	NC_017618	GGA	2	6	195129	195134	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386579173
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4014	NC_017618	CAG	2	6	195254	195259	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386579173
4015	NC_017618	GCT	2	6	195273	195278	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386579173
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4017	NC_017618	ATT	2	6	195407	195412	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386579173
4018	NC_017618	TGAT	2	8	195485	195492	25 %	50 %	25 %	0 %	386579173
4019	NC_017618	TGA	2	6	195531	195536	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386579173
4020	NC_017618	TGA	2	6	195545	195550	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386579173
4021	NC_017618	AAAATC	2	12	195568	195579	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	386579174
4022	NC_017618	GTT	2	6	195584	195589	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386579174
4023	NC_017618	TGA	2	6	195599	195604	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386579174
4024	NC_017618	TTGATT	2	12	195638	195649	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	386579174
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4026	NC_017618	AAACG	2	10	195779	195788	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
4027	NC_017618	GTTG	2	8	195817	195824	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4028	NC_017618	T	7	7	195828	195834	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4029	NC_017618	TGC	2	6	195886	195891	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386579175
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4033	NC_017618	CAA	2	6	195975	195980	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386579175
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4037	NC_017618	T	8	8	196038	196045	0 %	100 %	0 %	0 %	386579175
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4049	NC_017618	GAACA	2	10	196385	196394	60 %	0 %	20 %	20 %	386579175
4050	NC_017618	AATA	2	8	196411	196418	75 %	25 %	0 %	0 %	386579175
4051	NC_017618	AAAT	2	8	196535	196542	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4052	NC_017618	ATT	2	6	196552	196557	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4053	NC_017618	ATA	2	6	196562	196567	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4054	NC_017618	ATT	2	6	196667	196672	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4055	NC_017618	ATTT	2	8	196675	196682	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4056	NC_017618	TAA	2	6	196815	196820	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4057	NC_017618	GTC	2	6	196821	196826	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4058	NC_017618	TAC	2	6	196827	196832	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4060	NC_017618	T	6	6	196963	196968	0 %	100 %	0 %	0 %	386579176
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4062	NC_017618	AT	3	6	196990	196995	50 %	50 %	0 %	0 %	386579176
4063	NC_017618	TCT	2	6	197019	197024	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386579176
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4065	NC_017618	T	6	6	197086	197091	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4069	NC_017618	TAAA	2	8	197153	197160	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4070	NC_017618	AAAAT	2	10	197201	197210	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4101	NC_017618	TATT	2	8	198489	198496	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4107	NC_017618	ACTG	2	8	198878	198885	25 %	25 %	25 %	25 %	386579178
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4113	NC_017618	CAT	2	6	199169	199174	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386579178
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4115	NC_017618	ACTA	2	8	199318	199325	50 %	25 %	0 %	25 %	386579178
4116	NC_017618	TG	3	6	199362	199367	0 %	50 %	50 %	0 %	386579178
4117	NC_017618	AAGGA	2	10	199388	199397	60 %	0 %	40 %	0 %	386579178
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4285	NC_017618	A	6	6	206809	206814	100 %	0 %	0 %	0 %	386579182
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4365	NC_017618	TAG	2	6	211134	211139	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4367	NC_017618	CTGG	2	8	211187	211194	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4368	NC_017618	AAG	2	6	211203	211208	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4370	NC_017618	GTT	2	6	211221	211226	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4371	NC_017618	ACT	2	6	211234	211239	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4373	NC_017618	T	6	6	211311	211316	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4374	NC_017618	AGG	2	6	211435	211440	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4375	NC_017618	GGA	2	6	211520	211525	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4376	NC_017618	TGGA	2	8	211558	211565	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4377	NC_017618	AGGA	2	8	211674	211681	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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