MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus suis JS14 chromosome

Total Repeats: 43189

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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43002	NC_017618	AGC	2	6	2129679	2129684	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386581041
43003	NC_017618	AGA	2	6	2129715	2129720	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386581041
43004	NC_017618	A	6	6	2129720	2129725	100 %	0 %	0 %	0 %	386581041
43005	NC_017618	TCTAAG	2	12	2129770	2129781	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	386581041
43006	NC_017618	GAA	2	6	2129824	2129829	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386581041
43007	NC_017618	GTT	2	6	2129920	2129925	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386581041
43008	NC_017618	AAC	2	6	2130012	2130017	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386581041
43009	NC_017618	ACT	2	6	2130079	2130084	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386581041
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43011	NC_017618	CTT	2	6	2130189	2130194	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386581041
43012	NC_017618	TGA	2	6	2130228	2130233	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386581041
43013	NC_017618	TGT	2	6	2130284	2130289	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386581041
43014	NC_017618	CTC	2	6	2130301	2130306	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386581041
43015	NC_017618	GAT	2	6	2130328	2130333	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386581041
43016	NC_017618	CCAA	2	8	2130334	2130341	50 %	0 %	0 %	50 %	386581041
43017	NC_017618	ACTTGG	2	12	2130344	2130355	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	386581041
43018	NC_017618	CAT	2	6	2130402	2130407	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386581041
43019	NC_017618	GCCA	2	8	2130412	2130419	25 %	0 %	25 %	50 %	386581041
43020	NC_017618	ATC	2	6	2130454	2130459	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386581041
43021	NC_017618	CGA	2	6	2130492	2130497	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386581041
43022	NC_017618	ATG	2	6	2130503	2130508	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386581041
43023	NC_017618	ATA	2	6	2130561	2130566	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386581041
43024	NC_017618	CT	3	6	2130593	2130598	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
43025	NC_017618	GGGA	2	8	2130754	2130761	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
43026	NC_017618	TTG	2	6	2130810	2130815	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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43028	NC_017618	CTTTT	2	10	2130855	2130864	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
43029	NC_017618	A	7	7	2130874	2130880	100 %	0 %	0 %	0 %	386581042
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43032	NC_017618	TGG	2	6	2130967	2130972	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386581042
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43051	NC_017618	ACA	2	6	2131723	2131728	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386581042
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43083	NC_017618	TAT	2	6	2133424	2133429	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386581042
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43086	NC_017618	A	6	6	2133479	2133484	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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43088	NC_017618	GAA	2	6	2133590	2133595	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43089	NC_017618	CCG	2	6	2133626	2133631	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
43090	NC_017618	TTTG	2	8	2133704	2133711	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
43091	NC_017618	T	6	6	2133720	2133725	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
43092	NC_017618	T	6	6	2133728	2133733	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
43093	NC_017618	TAAAA	2	10	2133763	2133772	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
43094	NC_017618	CTG	2	6	2133842	2133847	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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43098	NC_017618	AT	3	6	2133903	2133908	50 %	50 %	0 %	0 %	386581043
43099	NC_017618	TTC	2	6	2133941	2133946	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386581043
43100	NC_017618	ATG	2	6	2133972	2133977	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386581043
43101	NC_017618	AGC	2	6	2134073	2134078	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386581043
43102	NC_017618	TCA	3	9	2134096	2134104	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386581043
43103	NC_017618	GA	3	6	2134206	2134211	50 %	0 %	50 %	0 %	386581043
43104	NC_017618	TAGT	2	8	2134216	2134223	25 %	50 %	25 %	0 %	386581043
43105	NC_017618	CAT	2	6	2134238	2134243	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386581043
43106	NC_017618	ACT	2	6	2134247	2134252	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386581043
43107	NC_017618	TGTT	2	8	2134271	2134278	0 %	75 %	25 %	0 %	386581043
43108	NC_017618	CTT	2	6	2134290	2134295	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386581043
43109	NC_017618	A	6	6	2134307	2134312	100 %	0 %	0 %	0 %	386581043
43110	NC_017618	A	6	6	2134325	2134330	100 %	0 %	0 %	0 %	386581043
43111	NC_017618	A	6	6	2134380	2134385	100 %	0 %	0 %	0 %	386581043
43112	NC_017618	ACC	2	6	2134430	2134435	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386581043
43113	NC_017618	ACT	2	6	2134558	2134563	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386581044
43114	NC_017618	CTG	2	6	2134580	2134585	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386581044
43115	NC_017618	TCA	2	6	2134663	2134668	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386581044
43116	NC_017618	T	7	7	2134681	2134687	0 %	100 %	0 %	0 %	386581044
43117	NC_017618	ACC	2	6	2134712	2134717	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386581044
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43119	NC_017618	TTC	2	6	2134778	2134783	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386581044
43120	NC_017618	CTT	2	6	2134861	2134866	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386581044
43121	NC_017618	T	7	7	2134865	2134871	0 %	100 %	0 %	0 %	386581044
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43123	NC_017618	CTT	2	6	2134984	2134989	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386581044
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43189	NC_017618	T	6	6	2137387	2137392	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.