MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus suis JS14 chromosome

Total Repeats: 43189

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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38101	NC_017618	TA	3	6	1878517	1878522	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38102	NC_017618	T	6	6	1878596	1878601	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
38103	NC_017618	AGA	3	9	1878615	1878623	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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38122	NC_017618	GCA	2	6	1879646	1879651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386580816
38123	NC_017618	A	6	6	1879666	1879671	100 %	0 %	0 %	0 %	386580816
38124	NC_017618	ATC	2	6	1879697	1879702	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386580816
38125	NC_017618	GGT	2	6	1879748	1879753	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386580816
38126	NC_017618	GGGGCA	2	12	1879794	1879805	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	386580816
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38129	NC_017618	T	6	6	1879835	1879840	0 %	100 %	0 %	0 %	386580817
38130	NC_017618	TCTG	2	8	1879880	1879887	0 %	50 %	25 %	25 %	386580817
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38132	NC_017618	CTA	2	6	1880044	1880049	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38133	NC_017618	CAA	2	6	1880240	1880245	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38134	NC_017618	TTG	2	6	1880260	1880265	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38135	NC_017618	TTCT	2	8	1880291	1880298	0 %	75 %	0 %	25 %	386580818
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38137	NC_017618	GTT	2	6	1880315	1880320	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386580818
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38141	NC_017618	AGCC	2	8	1880644	1880651	25 %	0 %	25 %	50 %	386580818
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38143	NC_017618	CTA	2	6	1880671	1880676	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386580818
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38148	NC_017618	AAG	2	6	1880977	1880982	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386580818
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38156	NC_017618	CCG	2	6	1881211	1881216	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386580818
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38161	NC_017618	TC	3	6	1881545	1881550	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
38162	NC_017618	GA	3	6	1881588	1881593	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
38163	NC_017618	TTGA	2	8	1881633	1881640	25 %	50 %	25 %	0 %	386580819
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38180	NC_017618	GATC	2	8	1882279	1882286	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
38181	NC_017618	AAT	2	6	1882289	1882294	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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38228	NC_017618	T	6	6	1885684	1885689	0 %	100 %	0 %	0 %	386580823
38229	NC_017618	AAAT	2	8	1885788	1885795	75 %	25 %	0 %	0 %	386580823
38230	NC_017618	CGGA	2	8	1885892	1885899	25 %	0 %	50 %	25 %	386580823
38231	NC_017618	GAA	2	6	1885933	1885938	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386580823
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38233	NC_017618	CAT	3	9	1885963	1885971	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386580823
38234	NC_017618	GCT	2	6	1885989	1885994	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386580823
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38236	NC_017618	CT	3	6	1886083	1886088	0 %	50 %	0 %	50 %	386580823
38237	NC_017618	T	7	7	1886194	1886200	0 %	100 %	0 %	0 %	386580823
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38477	NC_017618	TGC	2	6	1899159	1899164	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386580833
38478	NC_017618	CG	3	6	1899175	1899180	0 %	0 %	50 %	50 %	386580833
38479	NC_017618	A	6	6	1899305	1899310	100 %	0 %	0 %	0 %	386580834
38480	NC_017618	ATC	2	6	1899324	1899329	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386580834
38481	NC_017618	AGA	2	6	1899383	1899388	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386580834
38482	NC_017618	CTG	2	6	1899442	1899447	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386580834
38483	NC_017618	CCT	2	6	1899452	1899457	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386580834
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38487	NC_017618	CT	3	6	1899574	1899579	0 %	50 %	0 %	50 %	386580834
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38490	NC_017618	CT	3	6	1899729	1899734	0 %	50 %	0 %	50 %	386580835
38491	NC_017618	GGCT	2	8	1899756	1899763	0 %	25 %	50 %	25 %	386580835
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38497	NC_017618	ATTC	2	8	1900451	1900458	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
38498	NC_017618	TA	3	6	1900462	1900467	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38499	NC_017618	A	6	6	1900467	1900472	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
38500	NC_017618	CAA	2	6	1900507	1900512	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

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