MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus suis GZ1 chromosome

Total Repeats: 41209

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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27502	NC_017617	T	7	7	1349653	1349659	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
27503	NC_017617	TCA	2	6	1349668	1349673	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27504	NC_017617	CCT	2	6	1349679	1349684	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
27505	NC_017617	TA	5	10	1349717	1349726	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27506	NC_017617	CAA	2	6	1349752	1349757	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386578287
27507	NC_017617	TGT	2	6	1349766	1349771	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386578287
27508	NC_017617	CAA	2	6	1349796	1349801	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386578287
27509	NC_017617	GATG	2	8	1349840	1349847	25 %	25 %	50 %	0 %	386578287
27510	NC_017617	ATC	2	6	1349875	1349880	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386578287
27511	NC_017617	CT	3	6	1349892	1349897	0 %	50 %	0 %	50 %	386578287
27512	NC_017617	ATA	2	6	1349926	1349931	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386578287
27513	NC_017617	GGC	2	6	1350026	1350031	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386578287
27514	NC_017617	ATA	2	6	1350058	1350063	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386578287
27515	NC_017617	GAA	2	6	1350075	1350080	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386578287
27516	NC_017617	CGT	2	6	1350153	1350158	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386578287
27517	NC_017617	AAT	2	6	1350205	1350210	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386578287
27518	NC_017617	ATG	2	6	1350290	1350295	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386578287
27519	NC_017617	ATG	2	6	1350320	1350325	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386578287
27520	NC_017617	TCT	3	9	1350351	1350359	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386578288
27521	NC_017617	T	6	6	1350377	1350382	0 %	100 %	0 %	0 %	386578288
27522	NC_017617	AGAA	2	8	1350385	1350392	75 %	0 %	25 %	0 %	386578288
27523	NC_017617	AGA	2	6	1350420	1350425	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386578288
27524	NC_017617	TAA	2	6	1350470	1350475	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386578288
27525	NC_017617	ATC	2	6	1350677	1350682	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386578288
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27527	NC_017617	TCC	2	6	1350770	1350775	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
27528	NC_017617	A	6	6	1350777	1350782	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
27529	NC_017617	GCG	2	6	1350847	1350852	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386578289
27530	NC_017617	ACC	2	6	1350963	1350968	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386578289
27531	NC_017617	TG	3	6	1350999	1351004	0 %	50 %	50 %	0 %	386578289
27532	NC_017617	AAT	2	6	1351055	1351060	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386578289
27533	NC_017617	T	6	6	1351144	1351149	0 %	100 %	0 %	0 %	386578289
27534	NC_017617	TGA	2	6	1351182	1351187	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386578289
27535	NC_017617	T	6	6	1351263	1351268	0 %	100 %	0 %	0 %	386578289
27536	NC_017617	CCAAAT	2	12	1351301	1351312	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	386578289
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27539	NC_017617	ACTTGA	2	12	1351426	1351437	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	386578289
27540	NC_017617	GCT	2	6	1351477	1351482	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386578289
27541	NC_017617	CTA	2	6	1351490	1351495	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386578289
27542	NC_017617	ATA	2	6	1351528	1351533	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386578289
27543	NC_017617	GCC	2	6	1351569	1351574	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386578289
27544	NC_017617	AGC	2	6	1351593	1351598	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386578289
27545	NC_017617	GA	3	6	1351679	1351684	50 %	0 %	50 %	0 %	386578289
27546	NC_017617	AGT	2	6	1351721	1351726	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386578289
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27550	NC_017617	TGA	2	6	1351808	1351813	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386578289
27551	NC_017617	GTA	2	6	1351824	1351829	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386578289
27552	NC_017617	GGTC	2	8	1351839	1351846	0 %	25 %	50 %	25 %	386578289
27553	NC_017617	GTC	2	6	1351851	1351856	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386578289
27554	NC_017617	AGA	2	6	1351857	1351862	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386578289
27555	NC_017617	CTG	2	6	1351928	1351933	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386578289
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27557	NC_017617	TTGG	2	8	1352017	1352024	0 %	50 %	50 %	0 %	386578289
27558	NC_017617	GCAC	2	8	1352065	1352072	25 %	0 %	25 %	50 %	386578289
27559	NC_017617	GGTCCA	2	12	1352074	1352085	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27560	NC_017617	GGA	2	6	1352135	1352140	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
27561	NC_017617	AAGT	2	8	1352228	1352235	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
27562	NC_017617	GAA	2	6	1352276	1352281	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27563	NC_017617	A	7	7	1352280	1352286	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
27564	NC_017617	CTT	2	6	1352300	1352305	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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27602	NC_017617	ATG	2	6	1353600	1353605	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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27604	NC_017617	T	7	7	1353626	1353632	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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27607	NC_017617	TACT	2	8	1353684	1353691	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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