MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus suis GZ1 chromosome

Total Repeats: 41209

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11001	NC_017617	CT	3	6	539264	539269	0 %	50 %	0 %	50 %	386577502
11002	NC_017617	TTTTTC	2	12	539618	539629	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	386577502
11003	NC_017617	CACTG	2	10	539693	539702	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
11004	NC_017617	CT	3	6	539732	539737	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11005	NC_017617	GTT	2	6	539787	539792	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11006	NC_017617	TTTC	2	8	540005	540012	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
11007	NC_017617	AAG	2	6	540027	540032	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11008	NC_017617	GCC	2	6	540038	540043	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11009	NC_017617	ATA	2	6	540045	540050	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11010	NC_017617	TCC	2	6	540101	540106	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386577503
11011	NC_017617	TTC	2	6	540107	540112	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386577503
11012	NC_017617	T	6	6	540113	540118	0 %	100 %	0 %	0 %	386577503
11013	NC_017617	CAA	2	6	540126	540131	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386577503
11014	NC_017617	GT	3	6	540213	540218	0 %	50 %	50 %	0 %	386577503
11015	NC_017617	GTA	2	6	540248	540253	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386577503
11016	NC_017617	AAG	2	6	540297	540302	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386577503
11017	NC_017617	ATT	2	6	540362	540367	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386577503
11018	NC_017617	AAG	2	6	540628	540633	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386577503
11019	NC_017617	TCG	2	6	540686	540691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386577503
11020	NC_017617	CGT	2	6	540693	540698	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386577503
11021	NC_017617	TTG	2	6	540755	540760	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386577503
11022	NC_017617	TCA	2	6	540773	540778	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386577503
11023	NC_017617	AAG	2	6	540867	540872	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386577503
11024	NC_017617	TCA	2	6	540875	540880	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386577503
11025	NC_017617	GCT	2	6	540897	540902	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386577503
11026	NC_017617	AAAAG	2	10	540943	540952	80 %	0 %	20 %	0 %	386577503
11027	NC_017617	TCA	2	6	540978	540983	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386577503
11028	NC_017617	TCA	2	6	541010	541015	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386577503
11029	NC_017617	CCG	2	6	541040	541045	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386577503
11030	NC_017617	TTC	2	6	541048	541053	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386577503
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11032	NC_017617	CGT	2	6	541119	541124	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386577503
11033	NC_017617	TAG	2	6	541232	541237	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386577503
11034	NC_017617	AAGG	2	8	541245	541252	50 %	0 %	50 %	0 %	386577503
11035	NC_017617	GCG	2	6	541352	541357	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386577503
11036	NC_017617	TTC	2	6	541376	541381	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386577503
11037	NC_017617	CTT	2	6	541533	541538	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386577503
11038	NC_017617	ACC	2	6	541574	541579	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386577503
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11040	NC_017617	TCT	2	6	541694	541699	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386577503
11041	NC_017617	GATA	2	8	541755	541762	50 %	25 %	25 %	0 %	386577503
11042	NC_017617	ACC	2	6	541879	541884	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386577503
11043	NC_017617	CAA	2	6	541965	541970	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386577503
11044	NC_017617	ACC	2	6	542162	542167	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386577503
11045	NC_017617	GTT	2	6	542191	542196	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386577503
11046	NC_017617	GTC	2	6	542245	542250	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386577503
11047	NC_017617	TGA	2	6	542282	542287	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386577503
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11049	NC_017617	TCA	2	6	542336	542341	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386577503
11050	NC_017617	CTG	2	6	542370	542375	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386577503
11051	NC_017617	AGAT	2	8	542399	542406	50 %	25 %	25 %	0 %	386577503
11052	NC_017617	TGA	2	6	542466	542471	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386577503
11053	NC_017617	CAT	2	6	542505	542510	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386577503
11054	NC_017617	GTTACG	2	12	542771	542782	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	386577503
11055	NC_017617	CTT	2	6	542823	542828	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386577503
11056	NC_017617	CAT	2	6	542925	542930	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386577503
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11058	NC_017617	TGA	2	6	543048	543053	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386577503
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11060	NC_017617	CAA	2	6	543111	543116	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386577503
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11063	NC_017617	CCT	2	6	543363	543368	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386577503
11064	NC_017617	TGG	2	6	543407	543412	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386577503
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11066	NC_017617	TGT	2	6	543711	543716	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386577503
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11077	NC_017617	TGT	2	6	544432	544437	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386577504
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11083	NC_017617	TGG	2	6	544796	544801	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386577504
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11085	NC_017617	CCG	2	6	544849	544854	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386577504
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11090	NC_017617	AAG	2	6	545002	545007	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386577504
11091	NC_017617	CTT	2	6	545035	545040	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386577504
11092	NC_017617	ATC	2	6	545073	545078	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386577504
11093	NC_017617	AGGC	2	8	545079	545086	25 %	0 %	50 %	25 %	386577504
11094	NC_017617	A	6	6	545156	545161	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11095	NC_017617	TTTTGC	2	12	545204	545215	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
11096	NC_017617	TTA	2	6	545252	545257	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11097	NC_017617	GATA	2	8	545260	545267	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
11098	NC_017617	CAG	2	6	545295	545300	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11099	NC_017617	TA	4	8	545313	545320	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11100	NC_017617	TTG	2	6	545386	545391	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386577505
11101	NC_017617	CA	3	6	545410	545415	50 %	0 %	0 %	50 %	386577505
11102	NC_017617	TCC	2	6	545419	545424	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386577505
11103	NC_017617	TTC	2	6	545443	545448	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386577505
11104	NC_017617	TTTGG	2	10	545495	545504	0 %	60 %	40 %	0 %	386577505
11105	NC_017617	TCC	2	6	545509	545514	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386577505
11106	NC_017617	GTT	2	6	545539	545544	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386577505
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11109	NC_017617	TCA	2	6	545620	545625	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386577505
11110	NC_017617	CCG	2	6	545669	545674	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386577505
11111	NC_017617	AT	3	6	545740	545745	50 %	50 %	0 %	0 %	386577505
11112	NC_017617	AAC	2	6	545785	545790	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386577505
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11115	NC_017617	TCA	2	6	546139	546144	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386577505
11116	NC_017617	GGT	2	6	546158	546163	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386577505
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11118	NC_017617	TTC	2	6	546281	546286	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386577505
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