MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus pneumoniae OXC141

Total Repeats: 41465

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017592	TAA	2	6	34	39	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017592	AAT	2	6	43	48	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017592	TTC	2	6	49	54	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_017592	ATT	2	6	96	101	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017592	CTAT	2	8	127	134	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
6	NC_017592	AGG	2	6	172	177	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017592	GAAA	2	8	188	195	75 %	0 %	25 %	0 %	387756561
8	NC_017592	AAGA	2	8	229	236	75 %	0 %	25 %	0 %	387756561
9	NC_017592	TCA	2	6	280	285	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387756561
10	NC_017592	GAAATG	2	12	327	338	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	387756561
11	NC_017592	AAC	2	6	349	354	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387756561
12	NC_017592	ATT	2	6	363	368	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387756561
13	NC_017592	GTA	2	6	369	374	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387756561
14	NC_017592	GAA	2	6	456	461	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387756561
15	NC_017592	AAAAG	2	10	530	539	80 %	0 %	20 %	0 %	387756561
16	NC_017592	GGA	2	6	648	653	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387756561
17	NC_017592	TTA	2	6	675	680	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387756561
18	NC_017592	GAAAT	2	10	691	700	60 %	20 %	20 %	0 %	387756561
19	NC_017592	A	6	6	704	709	100 %	0 %	0 %	0 %	387756561
20	NC_017592	AT	3	6	731	736	50 %	50 %	0 %	0 %	387756561
21	NC_017592	TTA	2	6	751	756	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387756561
22	NC_017592	GAT	2	6	837	842	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387756561
23	NC_017592	A	7	7	860	866	100 %	0 %	0 %	0 %	387756561
24	NC_017592	GAA	2	6	879	884	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387756561
25	NC_017592	GAG	2	6	972	977	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387756561
26	NC_017592	A	8	8	1184	1191	100 %	0 %	0 %	0 %	387756561
27	NC_017592	TGC	2	6	1214	1219	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387756561
28	NC_017592	ATA	2	6	1402	1407	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387756561
29	NC_017592	GGAA	2	8	1423	1430	50 %	0 %	50 %	0 %	387756561
30	NC_017592	TCAT	2	8	1456	1463	25 %	50 %	0 %	25 %	387756561
31	NC_017592	AAAAT	2	10	1473	1482	80 %	20 %	0 %	0 %	387756561
32	NC_017592	TGAT	2	8	1486	1493	25 %	50 %	25 %	0 %	387756561
33	NC_017592	AATC	2	8	1522	1529	50 %	25 %	0 %	25 %	387756561
34	NC_017592	AAT	2	6	1543	1548	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387756561
35	NC_017592	T	6	6	1566	1571	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017592	T	6	6	1575	1580	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017592	T	6	6	1588	1593	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017592	A	6	6	1603	1608	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017592	TAT	2	6	1657	1662	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017592	TAT	2	6	1666	1671	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017592	ATAA	2	8	1688	1695	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017592	TAA	2	6	1723	1728	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387756562
43	NC_017592	ATTT	2	8	1731	1738	25 %	75 %	0 %	0 %	387756562
44	NC_017592	TAC	2	6	1753	1758	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387756562
45	NC_017592	AG	3	6	1761	1766	50 %	0 %	50 %	0 %	387756562
46	NC_017592	A	7	7	1884	1890	100 %	0 %	0 %	0 %	387756562
47	NC_017592	CTT	2	6	1914	1919	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387756562
48	NC_017592	CTT	2	6	1931	1936	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387756562
49	NC_017592	CTT	2	6	1941	1946	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387756562
50	NC_017592	GTA	2	6	1958	1963	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387756562
51	NC_017592	AGCA	2	8	2095	2102	50 %	0 %	25 %	25 %	387756562
52	NC_017592	ATT	2	6	2138	2143	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387756562
53	NC_017592	TGC	2	6	2158	2163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387756562
54	NC_017592	AG	3	6	2173	2178	50 %	0 %	50 %	0 %	387756562
55	NC_017592	A	6	6	2267	2272	100 %	0 %	0 %	0 %	387756562
56	NC_017592	A	7	7	2283	2289	100 %	0 %	0 %	0 %	387756562
57	NC_017592	TGA	2	6	2293	2298	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387756562
58	NC_017592	GAT	2	6	2354	2359	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387756562
59	NC_017592	ACT	2	6	2489	2494	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387756562
60	NC_017592	GTT	2	6	2597	2602	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387756562
61	NC_017592	GTAAA	2	10	2631	2640	60 %	20 %	20 %	0 %	387756562
62	NC_017592	GAA	2	6	2642	2647	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387756562
63	NC_017592	ACTT	2	8	2699	2706	25 %	50 %	0 %	25 %	387756562
64	NC_017592	GATT	2	8	2707	2714	25 %	50 %	25 %	0 %	387756562
65	NC_017592	CAG	2	6	2787	2792	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387756562
66	NC_017592	AGT	2	6	2901	2906	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017592	TTG	2	6	2926	2931	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387756563
68	NC_017592	A	6	6	2937	2942	100 %	0 %	0 %	0 %	387756563
69	NC_017592	AAAAT	2	10	3018	3027	80 %	20 %	0 %	0 %	387756563
70	NC_017592	TGT	2	6	3044	3049	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387756563
71	NC_017592	ATG	2	6	3051	3056	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387756563
72	NC_017592	ATT	2	6	3090	3095	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387756563
73	NC_017592	TTAG	2	8	3108	3115	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017592	TGAAA	2	10	3159	3168	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017592	CAG	2	6	3195	3200	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387756564
76	NC_017592	GCA	2	6	3269	3274	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387756564
77	NC_017592	TGG	2	6	3312	3317	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387756564
78	NC_017592	AACT	2	8	3342	3349	50 %	25 %	0 %	25 %	387756564
79	NC_017592	TGA	3	9	3505	3513	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387756564
80	NC_017592	AATT	2	8	3588	3595	50 %	50 %	0 %	0 %	387756564
81	NC_017592	TTC	2	6	3690	3695	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387756564
82	NC_017592	AGA	2	6	3715	3720	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387756564
83	NC_017592	GAC	2	6	3790	3795	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387756564
84	NC_017592	CAAA	2	8	3865	3872	75 %	0 %	0 %	25 %	387756564
85	NC_017592	AGT	2	6	3904	3909	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387756564
86	NC_017592	GAA	2	6	3932	3937	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387756564
87	NC_017592	GAT	2	6	3950	3955	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387756564
88	NC_017592	A	6	6	3962	3967	100 %	0 %	0 %	0 %	387756564
89	NC_017592	CTTG	2	8	4033	4040	0 %	50 %	25 %	25 %	387756564
90	NC_017592	ACTT	2	8	4049	4056	25 %	50 %	0 %	25 %	387756564
91	NC_017592	AAG	2	6	4071	4076	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387756564
92	NC_017592	CTC	2	6	4110	4115	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	387756564
93	NC_017592	AGC	2	6	4117	4122	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387756564
94	NC_017592	TAT	2	6	4126	4131	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387756564
95	NC_017592	AAG	2	6	4218	4223	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387756564
96	NC_017592	GAA	2	6	4238	4243	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387756564
97	NC_017592	AT	3	6	4252	4257	50 %	50 %	0 %	0 %	387756564
98	NC_017592	TAA	2	6	4305	4310	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017592	A	7	7	4330	4336	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017592	AAAT	2	8	4365	4372	75 %	25 %	0 %	0 %	387756565
101	NC_017592	AAACA	2	10	4420	4429	80 %	0 %	0 %	20 %	387756565
102	NC_017592	TTGA	2	8	4446	4453	25 %	50 %	25 %	0 %	387756565
103	NC_017592	GAA	2	6	4463	4468	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387756565
104	NC_017592	AC	3	6	4485	4490	50 %	0 %	0 %	50 %	387756565
105	NC_017592	A	6	6	4537	4542	100 %	0 %	0 %	0 %	387756565
106	NC_017592	ATGA	2	8	4569	4576	50 %	25 %	25 %	0 %	387756565
107	NC_017592	TTA	2	6	4599	4604	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387756565
108	NC_017592	GAT	2	6	4647	4652	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387756565
109	NC_017592	CAG	2	6	4696	4701	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387756565
110	NC_017592	TAT	2	6	4724	4729	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387756565
111	NC_017592	ATTGGA	2	12	4767	4778	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387756565
112	NC_017592	GTT	2	6	4800	4805	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387756565
113	NC_017592	CAT	2	6	4806	4811	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387756565
114	NC_017592	GAT	2	6	4833	4838	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387756565
115	NC_017592	ACT	2	6	4885	4890	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387756565
116	NC_017592	TTA	2	6	4950	4955	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387756566
117	NC_017592	A	6	6	4983	4988	100 %	0 %	0 %	0 %	387756566
118	NC_017592	CTA	2	6	5044	5049	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387756566
119	NC_017592	TTGCAA	2	12	5056	5067	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	387756566
120	NC_017592	AGA	2	6	5081	5086	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387756566
121	NC_017592	TATC	2	8	5146	5153	25 %	50 %	0 %	25 %	387756566
122	NC_017592	GAT	2	6	5187	5192	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387756566
123	NC_017592	TGG	2	6	5200	5205	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387756566
124	NC_017592	A	6	6	5227	5232	100 %	0 %	0 %	0 %	387756566
125	NC_017592	T	6	6	5258	5263	0 %	100 %	0 %	0 %	387756566
126	NC_017592	GCA	2	6	5304	5309	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387756566
127	NC_017592	GATT	2	8	5314	5321	25 %	50 %	25 %	0 %	387756566
128	NC_017592	GAA	2	6	5373	5378	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387756566
129	NC_017592	GAG	2	6	5467	5472	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387756566
130	NC_017592	T	6	6	5523	5528	0 %	100 %	0 %	0 %	387756566
131	NC_017592	TGA	2	6	5531	5536	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387756566
132	NC_017592	GAAA	2	8	5579	5586	75 %	0 %	25 %	0 %	387756566
133	NC_017592	GA	3	6	5630	5635	50 %	0 %	50 %	0 %	387756566
134	NC_017592	AGA	2	6	5714	5719	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387756566
135	NC_017592	TGA	2	6	5840	5845	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387756566
136	NC_017592	TGA	2	6	5857	5862	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387756566
137	NC_017592	AGA	2	6	5906	5911	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387756566
138	NC_017592	A	6	6	5973	5978	100 %	0 %	0 %	0 %	387756566
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268	NC_017592	A	6	6	11899	11904	100 %	0 %	0 %	0 %	387756572
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403	NC_017592	GGA	2	6	17568	17573	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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406	NC_017592	ATG	2	6	17753	17758	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
407	NC_017592	GGA	2	6	17886	17891	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
408	NC_017592	TC	3	6	17972	17977	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
409	NC_017592	ACC	2	6	18152	18157	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
410	NC_017592	AAT	2	6	18172	18177	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
411	NC_017592	AGC	2	6	18232	18237	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
412	NC_017592	ATTC	2	8	18239	18246	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
413	NC_017592	TG	3	6	18361	18366	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
414	NC_017592	GAG	2	6	18382	18387	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
415	NC_017592	GA	3	6	18512	18517	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
416	NC_017592	ACA	2	6	18538	18543	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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419	NC_017592	TAG	2	6	18695	18700	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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421	NC_017592	CT	3	6	18924	18929	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
422	NC_017592	GAT	2	6	18942	18947	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
423	NC_017592	CGG	2	6	19033	19038	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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425	NC_017592	TAGG	2	8	19249	19256	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
426	NC_017592	TAC	2	6	19303	19308	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
427	NC_017592	CCT	2	6	19391	19396	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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429	NC_017592	TCG	2	6	19642	19647	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
430	NC_017592	CGT	2	6	19722	19727	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
431	NC_017592	AGGGA	2	10	19860	19869	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
432	NC_017592	TA	3	6	19926	19931	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
433	NC_017592	GA	3	6	19946	19951	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
434	NC_017592	GAAGTG	2	12	19971	19982	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
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438	NC_017592	GTA	2	6	20247	20252	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
439	NC_017592	ATG	2	6	20270	20275	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
440	NC_017592	T	6	6	20329	20334	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
441	NC_017592	TAA	3	9	20341	20349	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
442	NC_017592	CTA	2	6	20461	20466	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
443	NC_017592	TAT	2	6	20467	20472	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
444	NC_017592	TG	3	6	20514	20519	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
445	NC_017592	TCC	2	6	20548	20553	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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449	NC_017592	T	6	6	20769	20774	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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451	NC_017592	ATT	2	6	20829	20834	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
452	NC_017592	GTG	2	6	20963	20968	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
453	NC_017592	TTA	2	6	21012	21017	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
454	NC_017592	TTG	2	6	21077	21082	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
455	NC_017592	GAT	2	6	21130	21135	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
456	NC_017592	CATCTC	2	12	21202	21213	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
457	NC_017592	AGTTGA	2	12	21321	21332	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
458	NC_017592	TGA	2	6	21343	21348	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
459	NC_017592	TGA	2	6	21401	21406	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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464	NC_017592	ATA	2	6	21541	21546	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
465	NC_017592	TA	3	6	21549	21554	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
466	NC_017592	TTG	2	6	21677	21682	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
467	NC_017592	T	6	6	21729	21734	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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474	NC_017592	T	6	6	22092	22097	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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476	NC_017592	T	6	6	22150	22155	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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