MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Spirochaeta thermophila DSM 6578 chromosome

Total Repeats: 65008

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017583	ATGTG	2	10	8	17	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017583	GGAA	2	8	83	90	50 %	0 %	50 %	0 %	386345756
3	NC_017583	ACT	2	6	155	160	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386345756
4	NC_017583	ACG	2	6	161	166	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386345756
5	NC_017583	GGA	2	6	171	176	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386345756
6	NC_017583	GATCA	2	10	214	223	40 %	20 %	20 %	20 %	386345756
7	NC_017583	AGC	2	6	224	229	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386345756
8	NC_017583	AGA	2	6	246	251	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386345756
9	NC_017583	CTC	2	6	265	270	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386345756
10	NC_017583	GAA	2	6	272	277	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386345756
11	NC_017583	GTG	2	6	295	300	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386345756
12	NC_017583	TCC	2	6	340	345	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386345756
13	NC_017583	C	6	6	344	349	0 %	0 %	0 %	100 %	386345756
14	NC_017583	GA	3	6	367	372	50 %	0 %	50 %	0 %	386345756
15	NC_017583	GCA	2	6	451	456	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386345756
16	NC_017583	AC	3	6	529	534	50 %	0 %	0 %	50 %	386345756
17	NC_017583	CTC	2	6	535	540	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386345756
18	NC_017583	GTG	2	6	586	591	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386345756
19	NC_017583	GGA	2	6	603	608	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386345756
20	NC_017583	CTC	2	6	688	693	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386345756
21	NC_017583	CGA	2	6	696	701	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386345756
22	NC_017583	CTT	2	6	708	713	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386345756
23	NC_017583	GAA	2	6	736	741	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386345756
24	NC_017583	CAA	2	6	774	779	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386345756
25	NC_017583	GAA	2	6	819	824	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386345756
26	NC_017583	CCT	2	6	880	885	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386345756
27	NC_017583	A	8	8	913	920	100 %	0 %	0 %	0 %	386345756
28	NC_017583	CGA	2	6	948	953	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386345756
29	NC_017583	TCA	2	6	956	961	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386345756
30	NC_017583	CAC	2	6	981	986	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386345756
31	NC_017583	GGT	2	6	1140	1145	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386345756
32	NC_017583	ACT	2	6	1151	1156	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386345756
33	NC_017583	AAG	2	6	1186	1191	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386345756
34	NC_017583	GGT	2	6	1203	1208	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386345756
35	NC_017583	CGG	2	6	1284	1289	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386345756
36	NC_017583	CAC	2	6	1299	1304	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386345756
37	NC_017583	AGA	2	6	1322	1327	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386345756
38	NC_017583	CAT	2	6	1365	1370	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386345756
39	NC_017583	TCA	2	6	1379	1384	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386345756
40	NC_017583	AGG	2	6	1394	1399	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386345756
41	NC_017583	GGT	2	6	1413	1418	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017583	TA	3	6	1437	1442	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017583	A	7	7	1491	1497	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017583	T	6	6	1504	1509	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017583	CTA	2	6	1555	1560	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_017583	ACT	2	6	1566	1571	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_017583	CAT	2	6	1659	1664	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386345757
48	NC_017583	TCC	2	6	1700	1705	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386345757
49	NC_017583	TGG	2	6	1706	1711	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386345757
50	NC_017583	AGC	2	6	1768	1773	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386345757
51	NC_017583	CCA	2	6	1799	1804	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386345757
52	NC_017583	TCT	2	6	1808	1813	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386345757
53	NC_017583	ACT	2	6	1821	1826	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386345757
54	NC_017583	CTCC	2	8	1884	1891	0 %	25 %	0 %	75 %	386345757
55	NC_017583	TC	3	6	1937	1942	0 %	50 %	0 %	50 %	386345757
56	NC_017583	GAT	2	6	2044	2049	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386345757
57	NC_017583	TCG	2	6	2078	2083	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386345757
58	NC_017583	GA	3	6	2090	2095	50 %	0 %	50 %	0 %	386345757
59	NC_017583	TGG	2	6	2108	2113	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386345757
60	NC_017583	TGG	2	6	2157	2162	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386345757
61	NC_017583	ATC	2	6	2185	2190	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386345757
62	NC_017583	CCG	2	6	2191	2196	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386345757
63	NC_017583	TCC	2	6	2201	2206	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386345757
64	NC_017583	ACT	2	6	2220	2225	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386345757
65	NC_017583	CAG	2	6	2353	2358	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386345757
66	NC_017583	CATT	2	8	2362	2369	25 %	50 %	0 %	25 %	386345757
67	NC_017583	AG	4	8	2378	2385	50 %	0 %	50 %	0 %	386345757
68	NC_017583	CTC	2	6	2416	2421	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386345757
69	NC_017583	GTG	2	6	2473	2478	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386345757
70	NC_017583	GAG	2	6	2485	2490	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386345757
71	NC_017583	AAG	2	6	2510	2515	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386345757
72	NC_017583	CGA	2	6	2535	2540	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386345757
73	NC_017583	CTACCT	2	12	2562	2573	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	386345757
74	NC_017583	CCGAG	2	10	2624	2633	20 %	0 %	40 %	40 %	386345757
75	NC_017583	CCGG	2	8	2649	2656	0 %	0 %	50 %	50 %	386345757
76	NC_017583	TTC	2	6	2671	2676	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386345757
77	NC_017583	AGGA	2	8	2937	2944	50 %	0 %	50 %	0 %	386345758
78	NC_017583	GAA	2	6	3004	3009	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386345758
79	NC_017583	AGGA	2	8	3020	3027	50 %	0 %	50 %	0 %	386345758
80	NC_017583	ACG	2	6	3063	3068	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386345758
81	NC_017583	CGC	2	6	3090	3095	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386345758
82	NC_017583	TCC	2	6	3096	3101	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386345758
83	NC_017583	TGG	2	6	3132	3137	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386345758
84	NC_017583	CT	3	6	3141	3146	0 %	50 %	0 %	50 %	386345758
85	NC_017583	CT	3	6	3154	3159	0 %	50 %	0 %	50 %	386345758
86	NC_017583	ACA	2	6	3168	3173	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386345758
87	NC_017583	GGA	2	6	3214	3219	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386345758
88	NC_017583	ACG	2	6	3234	3239	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386345758
89	NC_017583	TCA	2	6	3259	3264	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386345758
90	NC_017583	ATG	2	6	3287	3292	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386345758
91	NC_017583	TTC	2	6	3301	3306	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386345758
92	NC_017583	GAG	2	6	3326	3331	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386345758
93	NC_017583	TGG	2	6	3441	3446	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386345758
94	NC_017583	CGCGG	2	10	3453	3462	0 %	0 %	60 %	40 %	386345758
95	NC_017583	GA	3	6	3528	3533	50 %	0 %	50 %	0 %	386345758
96	NC_017583	GAT	2	6	3617	3622	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386345758
97	NC_017583	CTC	2	6	3626	3631	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386345758
98	NC_017583	TTC	2	6	3692	3697	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386345758
99	NC_017583	TTCC	2	8	3701	3708	0 %	50 %	0 %	50 %	386345758
100	NC_017583	TCC	2	6	3720	3725	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386345758
101	NC_017583	GGA	3	9	3734	3742	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386345758
102	NC_017583	GC	3	6	3809	3814	0 %	0 %	50 %	50 %	386345759
103	NC_017583	TCT	2	6	3815	3820	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386345759
104	NC_017583	TTTC	2	8	3860	3867	0 %	75 %	0 %	25 %	386345759
105	NC_017583	GTC	3	9	3945	3953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386345759
106	NC_017583	AAAG	2	8	3987	3994	75 %	0 %	25 %	0 %	386345759
107	NC_017583	TA	3	6	3996	4001	50 %	50 %	0 %	0 %	386345759
108	NC_017583	CT	3	6	4002	4007	0 %	50 %	0 %	50 %	386345759
109	NC_017583	AG	3	6	4015	4020	50 %	0 %	50 %	0 %	386345759
110	NC_017583	CGC	2	6	4041	4046	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386345759
111	NC_017583	TCC	2	6	4110	4115	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386345759
112	NC_017583	GGAAC	2	10	4119	4128	40 %	0 %	40 %	20 %	386345759
113	NC_017583	GAG	2	6	4140	4145	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386345759
114	NC_017583	GAGG	2	8	4187	4194	25 %	0 %	75 %	0 %	386345759
115	NC_017583	CGC	2	6	4224	4229	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386345759
116	NC_017583	TGGAG	2	10	4292	4301	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017583	CAG	2	6	4333	4338	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386345760
118	NC_017583	AG	3	6	4344	4349	50 %	0 %	50 %	0 %	386345760
119	NC_017583	GAA	2	6	4425	4430	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386345760
120	NC_017583	AAG	2	6	4454	4459	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386345760
121	NC_017583	AAGA	2	8	4467	4474	75 %	0 %	25 %	0 %	386345760
122	NC_017583	ACT	2	6	4573	4578	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386345761
123	NC_017583	TGG	2	6	4780	4785	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386345761
124	NC_017583	TCA	2	6	4826	4831	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386345762
125	NC_017583	TTCC	2	8	4862	4869	0 %	50 %	0 %	50 %	386345762
126	NC_017583	TGG	2	6	4989	4994	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386345762
127	NC_017583	AG	3	6	5013	5018	50 %	0 %	50 %	0 %	386345762
128	NC_017583	GTG	2	6	5071	5076	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386345763
129	NC_017583	ATCA	2	8	5095	5102	50 %	25 %	0 %	25 %	386345763
130	NC_017583	CCT	2	6	5186	5191	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386345763
131	NC_017583	TC	3	6	5206	5211	0 %	50 %	0 %	50 %	386345763
132	NC_017583	CTTC	2	8	5224	5231	0 %	50 %	0 %	50 %	386345763
133	NC_017583	CTC	2	6	5251	5256	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386345763
134	NC_017583	GGA	2	6	5262	5267	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386345763
135	NC_017583	GGT	2	6	5274	5279	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386345763
136	NC_017583	GGT	2	6	5301	5306	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386345763
137	NC_017583	TCC	2	6	5311	5316	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386345763
138	NC_017583	G	6	6	5320	5325	0 %	0 %	100 %	0 %	386345763
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141	NC_017583	G	6	6	5398	5403	0 %	0 %	100 %	0 %	386345763
142	NC_017583	TCC	3	9	5441	5449	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386345763
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145	NC_017583	T	6	6	5494	5499	0 %	100 %	0 %	0 %	386345763
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152	NC_017583	CT	3	6	5843	5848	0 %	50 %	0 %	50 %	386345763
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234	NC_017583	GAGG	2	8	8726	8733	25 %	0 %	75 %	0 %	386345766
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248	NC_017583	G	7	7	9590	9596	0 %	0 %	100 %	0 %	386345767
249	NC_017583	GGA	2	6	9631	9636	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386345767
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255	NC_017583	GAC	2	6	9772	9777	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386345767
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258	NC_017583	TG	3	6	9957	9962	0 %	50 %	50 %	0 %	386345767
259	NC_017583	GCG	2	6	10058	10063	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386345767
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263	NC_017583	CGG	3	9	10433	10441	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386345767
264	NC_017583	GAA	2	6	10481	10486	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386345767
265	NC_017583	GGCTC	2	10	10489	10498	0 %	20 %	40 %	40 %	386345767
266	NC_017583	GGC	2	6	10546	10551	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386345767
267	NC_017583	CGA	2	6	10607	10612	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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269	NC_017583	CAC	3	9	10772	10780	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386345768
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271	NC_017583	GC	3	6	10818	10823	0 %	0 %	50 %	50 %	386345768
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273	NC_017583	GTG	2	6	10851	10856	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386345768
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281	NC_017583	CTC	2	6	11076	11081	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386345768
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361	NC_017583	TTG	2	6	14052	14057	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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385	NC_017583	CCT	3	9	14935	14943	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386345771
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388	NC_017583	GGA	2	6	15065	15070	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
389	NC_017583	ACG	2	6	15152	15157	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386345772
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391	NC_017583	T	6	6	15229	15234	0 %	100 %	0 %	0 %	386345772
392	NC_017583	TA	3	6	15259	15264	50 %	50 %	0 %	0 %	386345772
393	NC_017583	AGG	3	9	15278	15286	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386345772
394	NC_017583	GAG	2	6	15352	15357	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386345772
395	NC_017583	CGA	2	6	15432	15437	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386345772
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398	NC_017583	CAT	2	6	15531	15536	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386345772
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400	NC_017583	TGG	2	6	15641	15646	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386345772
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403	NC_017583	AGG	3	9	15719	15727	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386345772
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