MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus equi subsp. zooepidemicus ATCC 35246 chromosome

Total Repeats: 45695

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
43501	NC_017582	T	6	6	2061974	2061979	0 %	100 %	0 %	0 %	414564940
43502	NC_017582	TCC	2	6	2061987	2061992	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
43503	NC_017582	TGCT	2	8	2062113	2062120	0 %	50 %	25 %	25 %	414564941
43504	NC_017582	CTG	2	6	2062150	2062155	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414564941
43505	NC_017582	AGC	2	6	2062219	2062224	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414564941
43506	NC_017582	CCT	2	6	2062251	2062256	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	414564941
43507	NC_017582	TAG	3	9	2062272	2062280	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414564941
43508	NC_017582	TAT	2	6	2062296	2062301	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414564941
43509	NC_017582	CTG	2	6	2062351	2062356	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414564941
43510	NC_017582	CAT	2	6	2062359	2062364	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414564941
43511	NC_017582	TAG	2	6	2062365	2062370	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414564941
43512	NC_017582	T	6	6	2062402	2062407	0 %	100 %	0 %	0 %	414564941
43513	NC_017582	CTT	2	6	2062426	2062431	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	414564941
43514	NC_017582	CAA	2	6	2062507	2062512	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414564941
43515	NC_017582	CCA	2	6	2062562	2062567	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	414564941
43516	NC_017582	CTG	2	6	2062593	2062598	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414564941
43517	NC_017582	GCT	2	6	2062710	2062715	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414564941
43518	NC_017582	T	6	6	2062754	2062759	0 %	100 %	0 %	0 %	414564941
43519	NC_017582	TTC	2	6	2062775	2062780	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	414564941
43520	NC_017582	CTT	2	6	2062782	2062787	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	414564941
43521	NC_017582	GCC	2	6	2062792	2062797	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	414564941
43522	NC_017582	CG	3	6	2062824	2062829	0 %	0 %	50 %	50 %	414564941
43523	NC_017582	AAT	2	6	2062861	2062866	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414564941
43524	NC_017582	AGC	2	6	2062876	2062881	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414564941
43525	NC_017582	TGGT	2	8	2062892	2062899	0 %	50 %	50 %	0 %	414564941
43526	NC_017582	TAG	2	6	2062918	2062923	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414564941
43527	NC_017582	AGA	2	6	2063079	2063084	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43528	NC_017582	ATC	2	6	2063088	2063093	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43529	NC_017582	ACAA	2	8	2063101	2063108	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
43530	NC_017582	GT	3	6	2063151	2063156	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
43531	NC_017582	AAG	2	6	2063193	2063198	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43532	NC_017582	TAA	2	6	2063205	2063210	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43533	NC_017582	TACCA	2	10	2063243	2063252	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
43534	NC_017582	CCT	2	6	2063256	2063261	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
43535	NC_017582	TTTC	2	8	2063264	2063271	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
43536	NC_017582	T	8	8	2063320	2063327	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
43537	NC_017582	AACT	2	8	2063446	2063453	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
43538	NC_017582	TCA	2	6	2063479	2063484	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43539	NC_017582	A	6	6	2063502	2063507	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
43540	NC_017582	GA	3	6	2063578	2063583	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
43541	NC_017582	TGT	2	6	2063702	2063707	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43542	NC_017582	ACT	2	6	2063720	2063725	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43543	NC_017582	GAA	3	9	2063730	2063738	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43544	NC_017582	ACT	2	6	2063771	2063776	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43545	NC_017582	AAG	2	6	2063836	2063841	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43546	NC_017582	CAAA	2	8	2063843	2063850	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
43547	NC_017582	A	6	6	2063866	2063871	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
43548	NC_017582	CTT	2	6	2063900	2063905	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43549	NC_017582	GAA	2	6	2063907	2063912	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43550	NC_017582	AAGA	2	8	2063939	2063946	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
43551	NC_017582	ACA	2	6	2063999	2064004	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43552	NC_017582	TAT	2	6	2064089	2064094	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43553	NC_017582	CAGT	2	8	2064178	2064185	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
43554	NC_017582	TCT	2	6	2064260	2064265	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43555	NC_017582	TC	3	6	2064357	2064362	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
43556	NC_017582	TGG	2	6	2064412	2064417	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
43557	NC_017582	CCAGC	2	10	2064455	2064464	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
43558	NC_017582	CAT	2	6	2064512	2064517	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43559	NC_017582	AAC	2	6	2064530	2064535	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43560	NC_017582	CTAAAA	2	12	2064705	2064716	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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43562	NC_017582	CCA	2	6	2064737	2064742	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
43563	NC_017582	GAA	2	6	2064806	2064811	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43564	NC_017582	GAA	2	6	2064823	2064828	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43565	NC_017582	TTC	2	6	2064829	2064834	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43566	NC_017582	T	6	6	2064875	2064880	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
43567	NC_017582	T	10	10	2064910	2064919	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
43568	NC_017582	T	6	6	2064933	2064938	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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43571	NC_017582	ATCA	2	8	2065047	2065054	50 %	25 %	0 %	25 %	414564942
43572	NC_017582	AGC	2	6	2065062	2065067	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414564942
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43575	NC_017582	CGA	2	6	2065303	2065308	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414564942
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43577	NC_017582	TTA	2	6	2065426	2065431	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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43579	NC_017582	AAAG	2	8	2065501	2065508	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
43580	NC_017582	TATG	2	8	2065577	2065584	25 %	50 %	25 %	0 %	414564943
43581	NC_017582	CAG	2	6	2065657	2065662	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414564943
43582	NC_017582	TAT	2	6	2065714	2065719	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414564943
43583	NC_017582	ATAAA	2	10	2065744	2065753	80 %	20 %	0 %	0 %	414564943
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43587	NC_017582	GAT	2	6	2066153	2066158	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414564943
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43589	NC_017582	A	7	7	2066233	2066239	100 %	0 %	0 %	0 %	414564943
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43591	NC_017582	AAG	2	6	2066497	2066502	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43592	NC_017582	GCA	2	6	2066583	2066588	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414564945
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43594	NC_017582	CAT	2	6	2066654	2066659	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414564945
43595	NC_017582	TTCC	2	8	2066669	2066676	0 %	50 %	0 %	50 %	414564945
43596	NC_017582	CAT	2	6	2066714	2066719	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414564945
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43601	NC_017582	CAAG	2	8	2067021	2067028	50 %	0 %	25 %	25 %	414564945
43602	NC_017582	TCT	2	6	2067042	2067047	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	414564945
43603	NC_017582	T	6	6	2067098	2067103	0 %	100 %	0 %	0 %	414564945
43604	NC_017582	TAT	2	6	2067145	2067150	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414564945
43605	NC_017582	ATC	2	6	2067159	2067164	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414564945
43606	NC_017582	GCT	2	6	2067188	2067193	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414564946
43607	NC_017582	ATC	2	6	2067322	2067327	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414564946
43608	NC_017582	GATA	2	8	2067387	2067394	50 %	25 %	25 %	0 %	414564946
43609	NC_017582	CTG	2	6	2067417	2067422	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414564946
43610	NC_017582	A	6	6	2067424	2067429	100 %	0 %	0 %	0 %	414564946
43611	NC_017582	TTC	2	6	2067469	2067474	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	414564946
43612	NC_017582	AAT	2	6	2067487	2067492	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414564946
43613	NC_017582	TGGTAA	2	12	2067529	2067540	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414564947
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43615	NC_017582	CAT	2	6	2067581	2067586	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414564947
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43617	NC_017582	GC	3	6	2067649	2067654	0 %	0 %	50 %	50 %	414564947
43618	NC_017582	CT	3	6	2067678	2067683	0 %	50 %	0 %	50 %	414564947
43619	NC_017582	AGCCC	2	10	2067728	2067737	20 %	0 %	20 %	60 %	414564947
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43982	NC_017582	A	7	7	2084590	2084596	100 %	0 %	0 %	0 %	414564968
43983	NC_017582	CCTG	2	8	2084612	2084619	0 %	25 %	25 %	50 %	414564968
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43997	NC_017582	ATAA	2	8	2085386	2085393	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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43999	NC_017582	GCA	2	6	2085432	2085437	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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