MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus equi subsp. zooepidemicus ATCC 35246 chromosome

Total Repeats: 45695

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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43002	NC_017582	GAT	2	6	2037916	2037921	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414564915
43003	NC_017582	ATC	2	6	2037962	2037967	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414564915
43004	NC_017582	GAC	2	6	2038026	2038031	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414564915
43005	NC_017582	AAT	2	6	2038069	2038074	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414564915
43006	NC_017582	ACC	2	6	2038096	2038101	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	414564915
43007	NC_017582	CTT	2	6	2038140	2038145	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	414564915
43008	NC_017582	AAG	2	6	2038175	2038180	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414564915
43009	NC_017582	CTG	2	6	2038200	2038205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414564915
43010	NC_017582	ATA	2	6	2038271	2038276	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414564915
43011	NC_017582	T	6	6	2038485	2038490	0 %	100 %	0 %	0 %	414564915
43012	NC_017582	CAG	2	6	2038753	2038758	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414564916
43013	NC_017582	TGT	2	6	2038768	2038773	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414564916
43014	NC_017582	CTG	2	6	2038798	2038803	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414564916
43015	NC_017582	TCC	2	6	2038833	2038838	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
43016	NC_017582	TCA	2	6	2038921	2038926	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414564917
43017	NC_017582	CCT	2	6	2038981	2038986	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	414564917
43018	NC_017582	TAA	2	6	2039021	2039026	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414564917
43019	NC_017582	CAT	2	6	2039029	2039034	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414564917
43020	NC_017582	TTAGCC	2	12	2039073	2039084	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	414564917
43021	NC_017582	GATA	2	8	2039098	2039105	50 %	25 %	25 %	0 %	414564917
43022	NC_017582	TGC	2	6	2039106	2039111	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414564917
43023	NC_017582	ATG	2	6	2039142	2039147	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414564917
43024	NC_017582	AATT	2	8	2039162	2039169	50 %	50 %	0 %	0 %	414564917
43025	NC_017582	T	6	6	2039217	2039222	0 %	100 %	0 %	0 %	414564918
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43029	NC_017582	TG	3	6	2039307	2039312	0 %	50 %	50 %	0 %	414564918
43030	NC_017582	TATT	2	8	2039316	2039323	25 %	75 %	0 %	0 %	414564918
43031	NC_017582	T	6	6	2039322	2039327	0 %	100 %	0 %	0 %	414564918
43032	NC_017582	A	7	7	2039372	2039378	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
43033	NC_017582	TCT	2	6	2039393	2039398	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43034	NC_017582	GA	3	6	2039416	2039421	50 %	0 %	50 %	0 %	414564919
43035	NC_017582	CTGATC	2	12	2039436	2039447	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	414564919
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43082	NC_017582	A	6	6	2041420	2041425	100 %	0 %	0 %	0 %	414564921
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43087	NC_017582	GCTGA	2	10	2041665	2041674	20 %	20 %	40 %	20 %	414564921
43088	NC_017582	TTTA	2	8	2041689	2041696	25 %	75 %	0 %	0 %	414564921
43089	NC_017582	GTC	2	6	2041803	2041808	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414564921
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43097	NC_017582	CCTT	2	8	2042099	2042106	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
43098	NC_017582	ACCA	2	8	2042244	2042251	50 %	0 %	0 %	50 %	414564922
43099	NC_017582	ACG	2	6	2042262	2042267	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414564922
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43101	NC_017582	AC	3	6	2042498	2042503	50 %	0 %	0 %	50 %	414564922
43102	NC_017582	GTT	2	6	2042563	2042568	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414564922
43103	NC_017582	CAA	2	6	2042672	2042677	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414564922
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43108	NC_017582	TGC	2	6	2043036	2043041	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414564922
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43112	NC_017582	GAA	2	6	2043276	2043281	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414564922
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43115	NC_017582	ACT	4	12	2043439	2043450	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414564922
43116	NC_017582	AAAACG	2	12	2043482	2043493	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
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43237	NC_017582	ATC	2	6	2048957	2048962	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414564928
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43295	NC_017582	AAC	2	6	2051610	2051615	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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43342	NC_017582	T	6	6	2053564	2053569	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
43343	NC_017582	AAC	2	6	2053573	2053578	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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43348	NC_017582	T	6	6	2053648	2053653	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
43349	NC_017582	ATT	2	6	2053656	2053661	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43350	NC_017582	ATA	2	6	2053734	2053739	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43351	NC_017582	TAA	2	6	2053744	2053749	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43352	NC_017582	TTG	2	6	2053753	2053758	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43353	NC_017582	GTTTC	2	10	2053865	2053874	0 %	60 %	20 %	20 %	414564932
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43355	NC_017582	GAG	2	6	2053967	2053972	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	414564932
43356	NC_017582	CTA	2	6	2053984	2053989	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414564932
43357	NC_017582	AATT	2	8	2053992	2053999	50 %	50 %	0 %	0 %	414564932
43358	NC_017582	CT	3	6	2054062	2054067	0 %	50 %	0 %	50 %	414564932
43359	NC_017582	CTTT	2	8	2054118	2054125	0 %	75 %	0 %	25 %	414564932
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43364	NC_017582	GGA	2	6	2054323	2054328	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	414564932
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43368	NC_017582	A	7	7	2054467	2054473	100 %	0 %	0 %	0 %	414564932
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43371	NC_017582	TTTAT	2	10	2054553	2054562	20 %	80 %	0 %	0 %	414564932
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43382	NC_017582	ATGA	2	8	2055172	2055179	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
43383	NC_017582	CTAT	2	8	2055196	2055203	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
43384	NC_017582	GCT	2	6	2055223	2055228	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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43386	NC_017582	AGC	2	6	2055261	2055266	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43387	NC_017582	GCT	2	6	2055398	2055403	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414564933
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43400	NC_017582	CT	3	6	2055954	2055959	0 %	50 %	0 %	50 %	414564933
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43403	NC_017582	GA	3	6	2056090	2056095	50 %	0 %	50 %	0 %	414564933
43404	NC_017582	TTG	2	6	2056306	2056311	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414564934
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43421	NC_017582	TGC	3	9	2057225	2057233	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414564935
43422	NC_017582	A	6	6	2057316	2057321	100 %	0 %	0 %	0 %	414564935
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43427	NC_017582	CTG	2	6	2057550	2057555	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414564935
43428	NC_017582	GAC	2	6	2057628	2057633	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414564935
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43431	NC_017582	ACA	2	6	2057848	2057853	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43432	NC_017582	TTG	2	6	2057892	2057897	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414564936
43433	NC_017582	AGCT	2	8	2057978	2057985	25 %	25 %	25 %	25 %	414564936
43434	NC_017582	CT	3	6	2057984	2057989	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
43435	NC_017582	ATTA	2	8	2058010	2058017	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43436	NC_017582	ACC	2	6	2058025	2058030	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
43437	NC_017582	TGACAT	2	12	2058036	2058047	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
43438	NC_017582	GTC	2	6	2058113	2058118	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414564937
43439	NC_017582	CTG	2	6	2058151	2058156	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414564937
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43442	NC_017582	CAA	2	6	2058366	2058371	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414564937
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43445	NC_017582	TAG	2	6	2058486	2058491	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414564937
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43450	NC_017582	GAT	2	6	2058720	2058725	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414564937
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43452	NC_017582	TGA	2	6	2058942	2058947	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414564937
43453	NC_017582	TTA	2	6	2058948	2058953	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414564937
43454	NC_017582	CAG	2	6	2058994	2058999	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414564937
43455	NC_017582	GCAATT	2	12	2059009	2059020	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	414564937
43456	NC_017582	TCA	2	6	2059074	2059079	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414564937
43457	NC_017582	GCT	2	6	2059173	2059178	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43458	NC_017582	CAT	2	6	2059226	2059231	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414564938
43459	NC_017582	TCT	2	6	2059300	2059305	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	414564938
43460	NC_017582	CCA	2	6	2059316	2059321	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	414564938
43461	NC_017582	ATC	2	6	2059390	2059395	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414564938
43462	NC_017582	CAA	2	6	2059418	2059423	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414564938
43463	NC_017582	TCA	2	6	2059439	2059444	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414564938
43464	NC_017582	AGC	2	6	2059489	2059494	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414564938
43465	NC_017582	CCT	2	6	2059549	2059554	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	414564938
43466	NC_017582	TCTT	2	8	2059638	2059645	0 %	75 %	0 %	25 %	414564938
43467	NC_017582	GCT	2	6	2059777	2059782	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414564938
43468	NC_017582	TTGA	2	8	2059792	2059799	25 %	50 %	25 %	0 %	414564938
43469	NC_017582	CTC	2	6	2059911	2059916	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	414564938
43470	NC_017582	ATA	2	6	2059997	2060002	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414564938
43471	NC_017582	ATG	2	6	2060011	2060016	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414564938
43472	NC_017582	TCCTA	2	10	2060019	2060028	20 %	40 %	0 %	40 %	414564939
43473	NC_017582	AAT	2	6	2060153	2060158	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414564939
43474	NC_017582	GCCA	2	8	2060200	2060207	25 %	0 %	25 %	50 %	414564939
43475	NC_017582	ATC	2	6	2060223	2060228	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414564939
43476	NC_017582	AGCC	2	8	2060249	2060256	25 %	0 %	25 %	50 %	414564939
43477	NC_017582	ATT	2	6	2060300	2060305	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414564939
43478	NC_017582	ATCTG	2	10	2060370	2060379	20 %	40 %	20 %	20 %	414564939
43479	NC_017582	TCA	2	6	2060452	2060457	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414564939
43480	NC_017582	TAA	2	6	2060465	2060470	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414564939
43481	NC_017582	TAA	2	6	2060570	2060575	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414564939
43482	NC_017582	CAA	2	6	2060710	2060715	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414564939
43483	NC_017582	ATA	2	6	2060856	2060861	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414564939
43484	NC_017582	T	6	6	2060915	2060920	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
43485	NC_017582	TAAGC	2	10	2060941	2060950	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
43486	NC_017582	TTGA	2	8	2061071	2061078	25 %	50 %	25 %	0 %	414564940
43487	NC_017582	CCA	2	6	2061234	2061239	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	414564940
43488	NC_017582	TTA	2	6	2061252	2061257	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414564940
43489	NC_017582	TAT	2	6	2061301	2061306	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414564940
43490	NC_017582	TCA	2	6	2061337	2061342	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414564940
43491	NC_017582	GCA	3	9	2061348	2061356	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414564940
43492	NC_017582	CAT	2	6	2061364	2061369	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414564940
43493	NC_017582	TAA	2	6	2061391	2061396	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414564940
43494	NC_017582	TTTGC	2	10	2061523	2061532	0 %	60 %	20 %	20 %	414564940
43495	NC_017582	CTG	2	6	2061598	2061603	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414564940
43496	NC_017582	CTG	2	6	2061619	2061624	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414564940
43497	NC_017582	TGA	2	6	2061644	2061649	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414564940
43498	NC_017582	GCT	2	6	2061715	2061720	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414564940
43499	NC_017582	CGA	2	6	2061828	2061833	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414564940
43500	NC_017582	CCA	2	6	2061928	2061933	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	414564940

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