MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus equi subsp. zooepidemicus ATCC 35246 chromosome

Total Repeats: 45695

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
42501	NC_017582	TCTGAC	2	12	2014721	2014732	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	414564893
42502	NC_017582	GAC	2	6	2014736	2014741	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414564893
42503	NC_017582	TTG	2	6	2014764	2014769	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414564893
42504	NC_017582	AGCC	2	8	2014791	2014798	25 %	0 %	25 %	50 %	414564893
42505	NC_017582	T	6	6	2014804	2014809	0 %	100 %	0 %	0 %	414564893
42506	NC_017582	CAG	2	6	2014845	2014850	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414564893
42507	NC_017582	TGAT	2	8	2014878	2014885	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
42508	NC_017582	ACT	2	6	2014893	2014898	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42509	NC_017582	TAG	2	6	2015016	2015021	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42510	NC_017582	AAT	2	6	2015073	2015078	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414564894
42511	NC_017582	TCA	2	6	2015129	2015134	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414564894
42512	NC_017582	TCA	2	6	2015162	2015167	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414564894
42513	NC_017582	CCA	2	6	2015208	2015213	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	414564894
42514	NC_017582	CTC	2	6	2015299	2015304	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	414564894
42515	NC_017582	CCT	2	6	2015357	2015362	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	414564894
42516	NC_017582	ATC	3	9	2015506	2015514	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414564895
42517	NC_017582	GTA	2	6	2015564	2015569	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414564895
42518	NC_017582	CTT	2	6	2015605	2015610	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	414564895
42519	NC_017582	ATC	2	6	2015660	2015665	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414564895
42520	NC_017582	AAT	2	6	2015668	2015673	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414564895
42521	NC_017582	AATCC	2	10	2015732	2015741	40 %	20 %	0 %	40 %	414564895
42522	NC_017582	GCCT	2	8	2015754	2015761	0 %	25 %	25 %	50 %	414564895
42523	NC_017582	TCA	2	6	2015766	2015771	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414564895
42524	NC_017582	CAT	2	6	2015834	2015839	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414564895
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42526	NC_017582	ATC	2	6	2015952	2015957	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414564896
42527	NC_017582	CAT	2	6	2015999	2016004	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414564896
42528	NC_017582	CCA	2	6	2016071	2016076	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	414564896
42529	NC_017582	CTG	2	6	2016083	2016088	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414564896
42530	NC_017582	TCA	2	6	2016169	2016174	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414564896
42531	NC_017582	CTG	2	6	2016185	2016190	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414564896
42532	NC_017582	CATAG	2	10	2016252	2016261	40 %	20 %	20 %	20 %	414564896
42533	NC_017582	TCT	3	9	2016286	2016294	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	414564896
42534	NC_017582	ATA	2	6	2016344	2016349	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42535	NC_017582	CTA	2	6	2016354	2016359	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42536	NC_017582	AAG	2	6	2016374	2016379	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42537	NC_017582	CT	4	8	2016385	2016392	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
42538	NC_017582	TTG	2	6	2016397	2016402	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42539	NC_017582	CTT	2	6	2016418	2016423	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42540	NC_017582	CCT	2	6	2016430	2016435	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
42541	NC_017582	ATT	2	6	2016489	2016494	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414564897
42542	NC_017582	TA	3	6	2016519	2016524	50 %	50 %	0 %	0 %	414564897
42543	NC_017582	TAG	2	6	2016547	2016552	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414564897
42544	NC_017582	CTA	2	6	2016614	2016619	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414564897
42545	NC_017582	TGT	2	6	2016620	2016625	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414564897
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42549	NC_017582	TCA	2	6	2016836	2016841	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414564897
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42551	NC_017582	TCAGC	2	10	2016884	2016893	20 %	20 %	20 %	40 %	414564897
42552	NC_017582	ATC	2	6	2016928	2016933	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414564897
42553	NC_017582	CAAG	2	8	2017022	2017029	50 %	0 %	25 %	25 %	414564897
42554	NC_017582	CAC	2	6	2017043	2017048	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	414564897
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42557	NC_017582	TTA	2	6	2017164	2017169	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414564897
42558	NC_017582	GTCACA	2	12	2017206	2017217	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	414564897
42559	NC_017582	GTC	2	6	2017294	2017299	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414564897
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42563	NC_017582	TCAGC	2	10	2017475	2017484	20 %	20 %	20 %	40 %	414564897
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42566	NC_017582	ATCT	2	8	2017641	2017648	25 %	50 %	0 %	25 %	414564897
42567	NC_017582	CAG	2	6	2017754	2017759	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414564897
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42569	NC_017582	TGG	2	6	2018147	2018152	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	414564897
42570	NC_017582	ACT	2	6	2018231	2018236	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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42574	NC_017582	GCAA	2	8	2018549	2018556	50 %	0 %	25 %	25 %	414564898
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42581	NC_017582	GGGGA	2	10	2018924	2018933	20 %	0 %	80 %	0 %	414564899
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42585	NC_017582	TGA	2	6	2019142	2019147	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414564899
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42588	NC_017582	T	6	6	2019241	2019246	0 %	100 %	0 %	0 %	414564899
42589	NC_017582	GAA	2	6	2019308	2019313	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414564899
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42591	NC_017582	GCT	2	6	2019386	2019391	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414564899
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42595	NC_017582	AATC	2	8	2019594	2019601	50 %	25 %	0 %	25 %	414564899
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42602	NC_017582	GCA	2	6	2019936	2019941	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414564899
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42604	NC_017582	AGC	2	6	2020115	2020120	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414564899
42605	NC_017582	A	6	6	2020131	2020136	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
42606	NC_017582	T	7	7	2020151	2020157	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
42607	NC_017582	T	7	7	2020254	2020260	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
42608	NC_017582	CCT	2	6	2020405	2020410	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
42609	NC_017582	GTATA	2	10	2020474	2020483	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
42610	NC_017582	TTA	2	6	2020501	2020506	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42611	NC_017582	T	6	6	2020513	2020518	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
42612	NC_017582	AAG	2	6	2020529	2020534	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42613	NC_017582	CCA	2	6	2020542	2020547	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
42614	NC_017582	T	6	6	2020564	2020569	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
42615	NC_017582	ATGAT	2	10	2020570	2020579	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
42616	NC_017582	TTA	2	6	2020594	2020599	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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42980	NC_017582	TTCT	2	8	2036879	2036886	0 %	75 %	0 %	25 %	414564914
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42983	NC_017582	A	7	7	2037080	2037086	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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