MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus equi subsp. zooepidemicus ATCC 35246 chromosome

Total Repeats: 45695

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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42119	NC_017582	GCTG	2	8	1996083	1996090	0 %	25 %	50 %	25 %	414564880
42120	NC_017582	AGC	2	6	1996105	1996110	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414564880
42121	NC_017582	TGC	2	6	1996242	1996247	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414564880
42122	NC_017582	CAA	2	6	1996302	1996307	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414564880
42123	NC_017582	GCA	3	9	1996308	1996316	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414564880
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42125	NC_017582	CAA	2	6	1996463	1996468	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414564881
42126	NC_017582	CAG	2	6	1996469	1996474	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414564881
42127	NC_017582	TGG	2	6	1996568	1996573	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	414564881
42128	NC_017582	CAT	2	6	1996595	1996600	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414564881
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42130	NC_017582	GCA	2	6	1996803	1996808	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414564881
42131	NC_017582	CTC	2	6	1996920	1996925	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	414564881
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42133	NC_017582	TTA	2	6	1996981	1996986	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414564881
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42135	NC_017582	CTC	2	6	1997037	1997042	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	414564881
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42142	NC_017582	GCT	2	6	1997608	1997613	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414564881
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42149	NC_017582	TCC	2	6	1998064	1998069	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	414564881
42150	NC_017582	GA	3	6	1998137	1998142	50 %	0 %	50 %	0 %	414564881
42151	NC_017582	TCGG	2	8	1998195	1998202	0 %	25 %	50 %	25 %	414564881
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42157	NC_017582	TGC	2	6	1998453	1998458	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414564881
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42162	NC_017582	GTT	2	6	1998648	1998653	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42163	NC_017582	AAG	2	6	1998687	1998692	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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42166	NC_017582	TAT	2	6	1998811	1998816	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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42200	NC_017582	CAT	2	6	2000198	2000203	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414564882
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42202	NC_017582	TCCAGT	2	12	2000478	2000489	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	414564882
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42215	NC_017582	T	6	6	2000760	2000765	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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42220	NC_017582	AGT	2	6	2000981	2000986	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414564883
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42222	NC_017582	T	7	7	2001049	2001055	0 %	100 %	0 %	0 %	414564883
42223	NC_017582	T	6	6	2001123	2001128	0 %	100 %	0 %	0 %	414564883
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42226	NC_017582	CCT	2	6	2001285	2001290	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	414564883
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42228	NC_017582	ATC	2	6	2001444	2001449	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414564883
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42230	NC_017582	A	7	7	2001505	2001511	100 %	0 %	0 %	0 %	414564883
42231	NC_017582	GA	3	6	2001605	2001610	50 %	0 %	50 %	0 %	414564883
42232	NC_017582	GTGA	2	8	2001684	2001691	25 %	25 %	50 %	0 %	414564883
42233	NC_017582	TC	3	6	2001718	2001723	0 %	50 %	0 %	50 %	414564883
42234	NC_017582	AT	3	6	2001746	2001751	50 %	50 %	0 %	0 %	414564883
42235	NC_017582	TGC	2	6	2001904	2001909	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414564883
42236	NC_017582	A	6	6	2001984	2001989	100 %	0 %	0 %	0 %	414564883
42237	NC_017582	AGC	2	6	2002033	2002038	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414564883
42238	NC_017582	CT	3	6	2002075	2002080	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
42239	NC_017582	TGA	2	6	2002094	2002099	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42240	NC_017582	T	7	7	2002129	2002135	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
42241	NC_017582	ATGTG	2	10	2002136	2002145	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
42242	NC_017582	TCT	2	6	2002225	2002230	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42243	NC_017582	TTA	2	6	2002266	2002271	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414564884
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42251	NC_017582	GACTT	2	10	2002724	2002733	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
42252	NC_017582	GCA	2	6	2002774	2002779	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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42257	NC_017582	CAC	2	6	2003056	2003061	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	414564885
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42325	NC_017582	ATG	2	6	2006070	2006075	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42326	NC_017582	T	6	6	2006094	2006099	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
42327	NC_017582	CAGAC	2	10	2006128	2006137	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
42328	NC_017582	T	7	7	2006213	2006219	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
42329	NC_017582	CTC	2	6	2006276	2006281	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
42330	NC_017582	TAAA	2	8	2006313	2006320	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
42331	NC_017582	A	6	6	2006318	2006323	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
42332	NC_017582	CTTA	2	8	2006351	2006358	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
42333	NC_017582	TC	3	6	2006400	2006405	0 %	50 %	0 %	50 %	414564887
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42339	NC_017582	TGA	2	6	2006598	2006603	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414564887
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42344	NC_017582	TTG	3	9	2006882	2006890	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414564887
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42346	NC_017582	ATC	2	6	2006980	2006985	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414564887
42347	NC_017582	T	6	6	2007047	2007052	0 %	100 %	0 %	0 %	414564887
42348	NC_017582	CAG	2	6	2007114	2007119	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414564887
42349	NC_017582	A	6	6	2007143	2007148	100 %	0 %	0 %	0 %	414564887
42350	NC_017582	AAT	2	6	2007237	2007242	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414564887
42351	NC_017582	T	6	6	2007271	2007276	0 %	100 %	0 %	0 %	414564887
42352	NC_017582	CTC	2	6	2007391	2007396	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	414564887
42353	NC_017582	TCA	2	6	2007437	2007442	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42354	NC_017582	TCA	2	6	2007449	2007454	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42355	NC_017582	A	6	6	2007460	2007465	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
42356	NC_017582	AGC	2	6	2007479	2007484	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42357	NC_017582	CTT	2	6	2007546	2007551	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	414564888
42358	NC_017582	ATC	2	6	2007589	2007594	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414564888
42359	NC_017582	CAA	2	6	2007714	2007719	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414564888
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42361	NC_017582	TC	3	6	2007783	2007788	0 %	50 %	0 %	50 %	414564888
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42365	NC_017582	CTT	2	6	2008135	2008140	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	414564888
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42367	NC_017582	TAC	2	6	2008326	2008331	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414564888
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42374	NC_017582	TATAG	2	10	2008580	2008589	40 %	40 %	20 %	0 %	414564889
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42382	NC_017582	CTG	2	6	2008990	2008995	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414564889
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42398	NC_017582	TTTAT	2	10	2009850	2009859	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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42400	NC_017582	TTAA	2	8	2009889	2009896	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42401	NC_017582	TTG	2	6	2009912	2009917	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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42452	NC_017582	AACC	2	8	2011897	2011904	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
42453	NC_017582	A	6	6	2012081	2012086	100 %	0 %	0 %	0 %	414564892
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42456	NC_017582	A	6	6	2012215	2012220	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
42457	NC_017582	TAA	2	6	2012270	2012275	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42458	NC_017582	GTTAA	2	10	2012285	2012294	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
42459	NC_017582	TTG	2	6	2012295	2012300	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42460	NC_017582	TAAC	2	8	2012312	2012319	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
42461	NC_017582	ACA	2	6	2012326	2012331	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414564893
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42465	NC_017582	A	6	6	2012463	2012468	100 %	0 %	0 %	0 %	414564893
42466	NC_017582	A	7	7	2012483	2012489	100 %	0 %	0 %	0 %	414564893
42467	NC_017582	TGA	2	6	2012527	2012532	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414564893
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42469	NC_017582	GCT	2	6	2012702	2012707	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414564893
42470	NC_017582	AGCT	2	8	2012710	2012717	25 %	25 %	25 %	25 %	414564893
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42472	NC_017582	ACC	2	6	2012899	2012904	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	414564893
42473	NC_017582	TCA	2	6	2012911	2012916	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414564893
42474	NC_017582	AGG	2	6	2012919	2012924	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	414564893
42475	NC_017582	CTT	2	6	2012959	2012964	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	414564893
42476	NC_017582	CACG	2	8	2013238	2013245	25 %	0 %	25 %	50 %	414564893
42477	NC_017582	AGA	2	6	2013292	2013297	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414564893
42478	NC_017582	AAAG	2	8	2013341	2013348	75 %	0 %	25 %	0 %	414564893
42479	NC_017582	TCA	2	6	2013351	2013356	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414564893
42480	NC_017582	TCG	2	6	2013382	2013387	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414564893
42481	NC_017582	GAT	2	6	2013473	2013478	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414564893
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42499	NC_017582	GCA	2	6	2014680	2014685	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414564893
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