MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus equi subsp. zooepidemicus ATCC 35246 chromosome

Total Repeats: 45695

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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36002	NC_017582	CTT	2	6	1706342	1706347	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36003	NC_017582	CTCCC	2	10	1706377	1706386	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
36004	NC_017582	TCC	2	6	1706462	1706467	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
36005	NC_017582	CGA	2	6	1706475	1706480	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36006	NC_017582	CT	3	6	1706550	1706555	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
36007	NC_017582	CTT	2	6	1706576	1706581	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36008	NC_017582	GTC	2	6	1706592	1706597	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36009	NC_017582	CACAG	2	10	1706599	1706608	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
36010	NC_017582	CCT	2	6	1706644	1706649	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
36011	NC_017582	TCGC	2	8	1706656	1706663	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
36012	NC_017582	CTTC	2	8	1706730	1706737	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
36013	NC_017582	CTTA	2	8	1706811	1706818	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
36014	NC_017582	TCG	2	6	1706836	1706841	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36015	NC_017582	CTT	2	6	1706853	1706858	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36016	NC_017582	TTA	2	6	1706893	1706898	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36017	NC_017582	T	6	6	1706910	1706915	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
36018	NC_017582	TTG	2	6	1707041	1707046	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36019	NC_017582	CGA	2	6	1707073	1707078	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36020	NC_017582	TG	3	6	1707079	1707084	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
36021	NC_017582	AC	3	6	1707089	1707094	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
36022	NC_017582	GAG	2	6	1707095	1707100	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
36023	NC_017582	T	6	6	1707108	1707113	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
36024	NC_017582	A	6	6	1707117	1707122	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
36025	NC_017582	TA	3	6	1707155	1707160	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36026	NC_017582	CCT	2	6	1707241	1707246	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
36027	NC_017582	TGTATA	2	12	1707305	1707316	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
36028	NC_017582	AGG	2	6	1707511	1707516	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
36029	NC_017582	ATC	2	6	1707567	1707572	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36030	NC_017582	GGC	2	6	1707585	1707590	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
36031	NC_017582	GTG	2	6	1707638	1707643	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
36032	NC_017582	GT	3	6	1707653	1707658	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
36033	NC_017582	ACCA	2	8	1707805	1707812	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
36034	NC_017582	GT	3	6	1707822	1707827	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
36035	NC_017582	ATG	2	6	1707847	1707852	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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36037	NC_017582	TTA	2	6	1707882	1707887	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36038	NC_017582	ATG	2	6	1707917	1707922	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36039	NC_017582	CACGA	2	10	1707972	1707981	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
36040	NC_017582	GAC	2	6	1707985	1707990	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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36042	NC_017582	CTT	2	6	1708027	1708032	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36043	NC_017582	TTC	2	6	1708073	1708078	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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36045	NC_017582	TCC	2	6	1708337	1708342	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
36046	NC_017582	AT	3	6	1708343	1708348	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36047	NC_017582	GCT	2	6	1708526	1708531	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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36049	NC_017582	ATG	2	6	1708573	1708578	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36050	NC_017582	TTC	2	6	1708600	1708605	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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36052	NC_017582	CTT	2	6	1708636	1708641	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36053	NC_017582	C	6	6	1708671	1708676	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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36055	NC_017582	TCG	2	6	1708770	1708775	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36056	NC_017582	ATC	2	6	1708985	1708990	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36057	NC_017582	CGC	2	6	1709019	1709024	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
36058	NC_017582	CT	3	6	1709052	1709057	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
36059	NC_017582	GTC	2	6	1709145	1709150	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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36062	NC_017582	T	6	6	1709237	1709242	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
36063	NC_017582	A	7	7	1709313	1709319	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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36103	NC_017582	AG	3	6	1711024	1711029	50 %	0 %	50 %	0 %	414564608
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36238	NC_017582	TCATCT	2	12	1716528	1716539	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	414564615
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36241	NC_017582	AACC	2	8	1716682	1716689	50 %	0 %	0 %	50 %	414564615
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36357	NC_017582	TTG	2	6	1722340	1722345	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414564618
36358	NC_017582	TCC	2	6	1722430	1722435	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
36359	NC_017582	TAC	2	6	1722440	1722445	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414564619
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36361	NC_017582	TCA	2	6	1722611	1722616	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414564619
36362	NC_017582	TTA	2	6	1722639	1722644	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414564619
36363	NC_017582	ACC	2	6	1722646	1722651	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	414564619
36364	NC_017582	TTG	2	6	1722728	1722733	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414564619
36365	NC_017582	TGA	2	6	1722756	1722761	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414564619
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36367	NC_017582	CT	3	6	1722832	1722837	0 %	50 %	0 %	50 %	414564619
36368	NC_017582	TTCA	2	8	1722892	1722899	25 %	50 %	0 %	25 %	414564619
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36372	NC_017582	GCA	2	6	1723100	1723105	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414564619
36373	NC_017582	CT	3	6	1723116	1723121	0 %	50 %	0 %	50 %	414564619
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36377	NC_017582	T	6	6	1723331	1723336	0 %	100 %	0 %	0 %	414564619
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36399	NC_017582	TCTT	2	8	1724705	1724712	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
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36478	NC_017582	ATA	2	6	1729220	1729225	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414564624
36479	NC_017582	ATC	2	6	1729240	1729245	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414564624
36480	NC_017582	GCCA	2	8	1729288	1729295	25 %	0 %	25 %	50 %	414564624
36481	NC_017582	TGTC	2	8	1729335	1729342	0 %	50 %	25 %	25 %	414564624
36482	NC_017582	AGC	2	6	1729450	1729455	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414564624
36483	NC_017582	T	7	7	1729475	1729481	0 %	100 %	0 %	0 %	414564624
36484	NC_017582	TCA	2	6	1729514	1729519	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414564624
36485	NC_017582	TTC	2	6	1729681	1729686	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	414564624
36486	NC_017582	CTTC	2	8	1729848	1729855	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
36487	NC_017582	ATTA	2	8	1729933	1729940	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36488	NC_017582	AAT	2	6	1729956	1729961	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36489	NC_017582	AGTTT	2	10	1729962	1729971	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
36490	NC_017582	TTATG	2	10	1730062	1730071	20 %	60 %	20 %	0 %	414564625
36491	NC_017582	ATAAAA	2	12	1730078	1730089	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	414564625
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