MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus equi subsp. zooepidemicus ATCC 35246 chromosome

Total Repeats: 45695

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
34501	NC_017582	TCA	2	6	1632107	1632112	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414564533
34502	NC_017582	GCA	2	6	1632299	1632304	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414564533
34503	NC_017582	TCG	2	6	1632315	1632320	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414564533
34504	NC_017582	CTC	2	6	1632373	1632378	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	414564533
34505	NC_017582	GCG	2	6	1632390	1632395	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	414564533
34506	NC_017582	CTC	2	6	1632445	1632450	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	414564533
34507	NC_017582	TCA	2	6	1632473	1632478	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414564533
34508	NC_017582	A	6	6	1632517	1632522	100 %	0 %	0 %	0 %	414564533
34509	NC_017582	CTC	2	6	1632532	1632537	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	414564533
34510	NC_017582	CTC	2	6	1632628	1632633	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	414564533
34511	NC_017582	CT	3	6	1632640	1632645	0 %	50 %	0 %	50 %	414564533
34512	NC_017582	CTC	2	6	1632655	1632660	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	414564533
34513	NC_017582	CAGC	2	8	1632663	1632670	25 %	0 %	25 %	50 %	414564533
34514	NC_017582	GCT	2	6	1632675	1632680	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414564533
34515	NC_017582	CAA	2	6	1632690	1632695	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414564533
34516	NC_017582	TGAC	2	8	1632758	1632765	25 %	25 %	25 %	25 %	414564533
34517	NC_017582	CAG	2	6	1632802	1632807	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414564533
34518	NC_017582	A	6	6	1632815	1632820	100 %	0 %	0 %	0 %	414564533
34519	NC_017582	AATAA	2	10	1632823	1632832	80 %	20 %	0 %	0 %	414564533
34520	NC_017582	AAG	2	6	1632851	1632856	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414564533
34521	NC_017582	ACC	3	9	1632889	1632897	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	414564533
34522	NC_017582	CAA	2	6	1632957	1632962	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414564533
34523	NC_017582	TGA	2	6	1632968	1632973	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414564533
34524	NC_017582	GAT	2	6	1633033	1633038	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414564533
34525	NC_017582	GAA	3	9	1633078	1633086	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414564533
34526	NC_017582	A	6	6	1633092	1633097	100 %	0 %	0 %	0 %	414564533
34527	NC_017582	TA	3	6	1633152	1633157	50 %	50 %	0 %	0 %	414564533
34528	NC_017582	AAG	2	6	1633218	1633223	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414564533
34529	NC_017582	T	9	9	1633289	1633297	0 %	100 %	0 %	0 %	414564533
34530	NC_017582	TTC	2	6	1633305	1633310	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	414564533
34531	NC_017582	TTA	2	6	1633322	1633327	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34532	NC_017582	T	6	6	1633333	1633338	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
34533	NC_017582	AATA	2	8	1633370	1633377	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
34534	NC_017582	GCT	2	6	1633384	1633389	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34535	NC_017582	AGG	2	6	1633579	1633584	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	414564534
34536	NC_017582	A	6	6	1633609	1633614	100 %	0 %	0 %	0 %	414564534
34537	NC_017582	ATAAA	2	10	1633664	1633673	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
34538	NC_017582	A	6	6	1633700	1633705	100 %	0 %	0 %	0 %	414564535
34539	NC_017582	CTA	2	6	1633706	1633711	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414564535
34540	NC_017582	TTGCT	2	10	1633731	1633740	0 %	60 %	20 %	20 %	414564535
34541	NC_017582	TGA	2	6	1633783	1633788	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414564535
34542	NC_017582	CGA	2	6	1633795	1633800	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414564535
34543	NC_017582	A	6	6	1633800	1633805	100 %	0 %	0 %	0 %	414564535
34544	NC_017582	AG	3	6	1633811	1633816	50 %	0 %	50 %	0 %	414564535
34545	NC_017582	GCA	3	9	1633826	1633834	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414564535
34546	NC_017582	A	6	6	1633856	1633861	100 %	0 %	0 %	0 %	414564535
34547	NC_017582	TAAA	2	8	1633896	1633903	75 %	25 %	0 %	0 %	414564535
34548	NC_017582	AC	3	6	1634009	1634014	50 %	0 %	0 %	50 %	414564535
34549	NC_017582	AAGG	2	8	1634018	1634025	50 %	0 %	50 %	0 %	414564535
34550	NC_017582	TAA	2	6	1634059	1634064	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414564535
34551	NC_017582	A	6	6	1634138	1634143	100 %	0 %	0 %	0 %	414564535
34552	NC_017582	TA	3	6	1634184	1634189	50 %	50 %	0 %	0 %	414564535
34553	NC_017582	TTC	2	6	1634246	1634251	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	414564535
34554	NC_017582	ATCA	2	8	1634252	1634259	50 %	25 %	0 %	25 %	414564535
34555	NC_017582	AAGC	2	8	1634260	1634267	50 %	0 %	25 %	25 %	414564535
34556	NC_017582	CCAAG	2	10	1634272	1634281	40 %	0 %	20 %	40 %	414564535
34557	NC_017582	GAA	2	6	1634327	1634332	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414564535
34558	NC_017582	CCTAG	2	10	1634342	1634351	20 %	20 %	20 %	40 %	414564535
34559	NC_017582	GGC	2	6	1634354	1634359	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	414564535
34560	NC_017582	A	6	6	1634495	1634500	100 %	0 %	0 %	0 %	414564535
34561	NC_017582	ACA	3	9	1634514	1634522	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34562	NC_017582	T	6	6	1634577	1634582	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
34563	NC_017582	TAAA	2	8	1634592	1634599	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
34564	NC_017582	ATCAT	2	10	1634615	1634624	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
34565	NC_017582	AGC	2	6	1634626	1634631	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34566	NC_017582	CAGC	2	8	1634642	1634649	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
34567	NC_017582	AAG	2	6	1634699	1634704	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414564536
34568	NC_017582	GCT	2	6	1634864	1634869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414564536
34569	NC_017582	CAA	2	6	1634938	1634943	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414564536
34570	NC_017582	ATC	2	6	1634945	1634950	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414564536
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34572	NC_017582	AGA	2	6	1635033	1635038	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414564536
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34574	NC_017582	CAAAA	2	10	1635052	1635061	80 %	0 %	0 %	20 %	414564536
34575	NC_017582	AAT	2	6	1635070	1635075	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414564536
34576	NC_017582	TGA	2	6	1635249	1635254	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414564536
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34578	NC_017582	AGC	2	6	1635390	1635395	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414564536
34579	NC_017582	AAC	2	6	1635421	1635426	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414564536
34580	NC_017582	TAA	2	6	1635432	1635437	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414564536
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34585	NC_017582	TGA	2	6	1635644	1635649	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414564537
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34587	NC_017582	ATG	2	6	1635698	1635703	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414564537
34588	NC_017582	T	6	6	1635705	1635710	0 %	100 %	0 %	0 %	414564537
34589	NC_017582	AATC	2	8	1635720	1635727	50 %	25 %	0 %	25 %	414564537
34590	NC_017582	CAA	2	6	1635729	1635734	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414564537
34591	NC_017582	TCA	2	6	1635740	1635745	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414564537
34592	NC_017582	CTA	2	6	1635783	1635788	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414564537
34593	NC_017582	CCA	2	6	1635806	1635811	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	414564537
34594	NC_017582	TAG	2	6	1635862	1635867	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414564537
34595	NC_017582	T	7	7	1635889	1635895	0 %	100 %	0 %	0 %	414564537
34596	NC_017582	ACG	2	6	1635901	1635906	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414564537
34597	NC_017582	CTAGT	2	10	1635915	1635924	20 %	40 %	20 %	20 %	414564537
34598	NC_017582	AC	3	6	1635941	1635946	50 %	0 %	0 %	50 %	414564537
34599	NC_017582	TGC	2	6	1635981	1635986	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414564537
34600	NC_017582	GCT	2	6	1635987	1635992	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414564537
34601	NC_017582	CGTC	2	8	1636022	1636029	0 %	25 %	25 %	50 %	414564537
34602	NC_017582	TCA	2	6	1636083	1636088	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414564537
34603	NC_017582	T	6	6	1636218	1636223	0 %	100 %	0 %	0 %	414564537
34604	NC_017582	ACAA	2	8	1636233	1636240	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
34605	NC_017582	GCT	2	6	1636256	1636261	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34606	NC_017582	TAT	2	6	1636276	1636281	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414564538
34607	NC_017582	TCA	2	6	1636319	1636324	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414564538
34608	NC_017582	TAG	2	6	1636330	1636335	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414564538
34609	NC_017582	T	6	6	1636353	1636358	0 %	100 %	0 %	0 %	414564538
34610	NC_017582	CAA	2	6	1636448	1636453	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414564538
34611	NC_017582	TCAA	2	8	1636486	1636493	50 %	25 %	0 %	25 %	414564538
34612	NC_017582	TGA	2	6	1636494	1636499	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414564538
34613	NC_017582	CTT	3	9	1636517	1636525	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	414564538
34614	NC_017582	ATTTTG	2	12	1636637	1636648	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	414564538
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34616	NC_017582	T	6	6	1636750	1636755	0 %	100 %	0 %	0 %	414564538
34617	NC_017582	TTTCAC	2	12	1636811	1636822	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	414564538
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34619	NC_017582	TCT	2	6	1636880	1636885	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	414564538
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34621	NC_017582	CCG	2	6	1636921	1636926	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	414564538
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34730	NC_017582	TAG	2	6	1642338	1642343	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414564546
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34980	NC_017582	TTG	2	6	1654166	1654171	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414564561
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34982	NC_017582	GAA	2	6	1654190	1654195	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414564561
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