MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus equi subsp. zooepidemicus ATCC 35246 chromosome

Total Repeats: 45695

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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34002	NC_017582	AAC	2	6	1607656	1607661	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414564507
34003	NC_017582	ATTT	2	8	1607725	1607732	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
34004	NC_017582	CAC	2	6	1607736	1607741	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
34005	NC_017582	T	7	7	1607764	1607770	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
34006	NC_017582	A	6	6	1607781	1607786	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
34007	NC_017582	TAT	2	6	1607791	1607796	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34008	NC_017582	T	6	6	1607796	1607801	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
34009	NC_017582	ATT	3	9	1607818	1607826	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34010	NC_017582	GAA	2	6	1607832	1607837	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34011	NC_017582	TGAAA	2	10	1607847	1607856	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
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34013	NC_017582	TAT	2	6	1607969	1607974	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414564508
34014	NC_017582	GAA	2	6	1607988	1607993	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414564508
34015	NC_017582	A	6	6	1608018	1608023	100 %	0 %	0 %	0 %	414564508
34016	NC_017582	GCAA	2	8	1608055	1608062	50 %	0 %	25 %	25 %	414564508
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34018	NC_017582	TCC	2	6	1608164	1608169	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	414564508
34019	NC_017582	T	6	6	1608187	1608192	0 %	100 %	0 %	0 %	414564508
34020	NC_017582	ATT	2	6	1608210	1608215	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414564508
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34033	NC_017582	A	6	6	1608974	1608979	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
34034	NC_017582	A	6	6	1609022	1609027	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
34035	NC_017582	ATA	2	6	1609039	1609044	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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34037	NC_017582	CT	3	6	1609065	1609070	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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34039	NC_017582	ATTT	2	8	1609111	1609118	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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34043	NC_017582	CTTTT	2	10	1609301	1609310	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
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34054	NC_017582	AAGC	2	8	1609769	1609776	50 %	0 %	25 %	25 %	414564509
34055	NC_017582	T	6	6	1610018	1610023	0 %	100 %	0 %	0 %	414564509
34056	NC_017582	ATTA	2	8	1610153	1610160	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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34059	NC_017582	ATC	2	6	1610198	1610203	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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34063	NC_017582	ACC	2	6	1610437	1610442	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
34064	NC_017582	TTC	2	6	1610540	1610545	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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34067	NC_017582	TC	3	6	1610621	1610626	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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34075	NC_017582	GTCA	2	8	1611254	1611261	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
34076	NC_017582	TGG	2	6	1611272	1611277	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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34101	NC_017582	T	6	6	1612298	1612303	0 %	100 %	0 %	0 %	414564511
34102	NC_017582	CATGA	2	10	1612308	1612317	40 %	20 %	20 %	20 %	414564511
34103	NC_017582	CAA	2	6	1612361	1612366	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414564511
34104	NC_017582	CAAGG	2	10	1612411	1612420	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
34105	NC_017582	AGC	2	6	1612425	1612430	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34106	NC_017582	T	7	7	1612514	1612520	0 %	100 %	0 %	0 %	414564512
34107	NC_017582	A	7	7	1612712	1612718	100 %	0 %	0 %	0 %	414564512
34108	NC_017582	CTT	2	6	1612805	1612810	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	414564512
34109	NC_017582	CTC	2	6	1612819	1612824	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	414564512
34110	NC_017582	TAT	2	6	1612899	1612904	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414564512
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34113	NC_017582	CTGC	2	8	1613059	1613066	0 %	25 %	25 %	50 %	414564513
34114	NC_017582	GCA	2	6	1613316	1613321	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414564513
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34117	NC_017582	ATC	2	6	1613382	1613387	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414564513
34118	NC_017582	TA	3	6	1613390	1613395	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34119	NC_017582	CAT	2	6	1613396	1613401	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34120	NC_017582	CAAA	2	8	1613431	1613438	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
34121	NC_017582	CAT	2	6	1613485	1613490	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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34123	NC_017582	A	6	6	1613521	1613526	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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34242	NC_017582	GTA	2	6	1619775	1619780	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34243	NC_017582	AAT	2	6	1619785	1619790	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34244	NC_017582	A	6	6	1619804	1619809	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
34245	NC_017582	ATTT	2	8	1619839	1619846	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
34246	NC_017582	CAT	2	6	1619900	1619905	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34247	NC_017582	AGGA	2	8	1619937	1619944	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
34248	NC_017582	CCT	2	6	1619951	1619956	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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34251	NC_017582	CAA	2	6	1620028	1620033	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34252	NC_017582	A	6	6	1620065	1620070	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
34253	NC_017582	TGA	2	6	1620075	1620080	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34254	NC_017582	TC	3	6	1620109	1620114	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
34255	NC_017582	CAG	2	6	1620200	1620205	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34256	NC_017582	CAA	2	6	1620235	1620240	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34257	NC_017582	A	7	7	1620239	1620245	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
34258	NC_017582	GA	3	6	1620296	1620301	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
34259	NC_017582	ATTT	2	8	1620304	1620311	25 %	75 %	0 %	0 %	414564522
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34321	NC_017582	TCAC	2	8	1623537	1623544	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
34322	NC_017582	CTC	2	6	1623551	1623556	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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34333	NC_017582	CCAG	2	8	1624128	1624135	25 %	0 %	25 %	50 %	414564526
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34347	NC_017582	CT	3	6	1624948	1624953	0 %	50 %	0 %	50 %	414564526
34348	NC_017582	CAG	2	6	1625136	1625141	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414564526
34349	NC_017582	AT	3	6	1625206	1625211	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34350	NC_017582	ATCT	2	8	1625214	1625221	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
34351	NC_017582	TTAAT	2	10	1625258	1625267	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
34352	NC_017582	A	6	6	1625291	1625296	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
34353	NC_017582	GCTA	2	8	1625391	1625398	25 %	25 %	25 %	25 %	414564527
34354	NC_017582	AAT	2	6	1625404	1625409	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414564527
34355	NC_017582	TTG	2	6	1625416	1625421	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414564527
34356	NC_017582	ATT	2	6	1625457	1625462	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414564527
34357	NC_017582	CCT	2	6	1625507	1625512	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	414564527
34358	NC_017582	A	13	13	1625572	1625584	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
34359	NC_017582	CGT	2	6	1625632	1625637	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34360	NC_017582	AAAG	2	8	1625657	1625664	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
34361	NC_017582	GA	3	6	1625695	1625700	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
34362	NC_017582	GAA	2	6	1625719	1625724	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414564528
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34364	NC_017582	ATC	2	6	1625750	1625755	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414564528
34365	NC_017582	TCA	2	6	1625769	1625774	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414564528
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34391	NC_017582	AAAG	2	8	1627563	1627570	75 %	0 %	25 %	0 %	414564528
34392	NC_017582	T	6	6	1627659	1627664	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
34393	NC_017582	GTA	2	6	1627677	1627682	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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34395	NC_017582	AT	3	6	1627821	1627826	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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34398	NC_017582	GACA	2	8	1627881	1627888	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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34469	NC_017582	T	7	7	1630787	1630793	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
34470	NC_017582	AGCTT	2	10	1630865	1630874	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
34471	NC_017582	GTTT	2	8	1630882	1630889	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
34472	NC_017582	ATG	2	6	1630891	1630896	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34473	NC_017582	GCT	2	6	1631119	1631124	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414564533
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34476	NC_017582	CAT	3	9	1631217	1631225	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414564533
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34478	NC_017582	AGC	2	6	1631300	1631305	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414564533
34479	NC_017582	TCA	2	6	1631321	1631326	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414564533
34480	NC_017582	TGA	2	6	1631350	1631355	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414564533
34481	NC_017582	CTG	2	6	1631451	1631456	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414564533
34482	NC_017582	AAT	2	6	1631479	1631484	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414564533
34483	NC_017582	CCT	2	6	1631496	1631501	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	414564533
34484	NC_017582	CCA	2	6	1631508	1631513	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	414564533
34485	NC_017582	TCA	2	6	1631514	1631519	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414564533
34486	NC_017582	AGCT	2	8	1631524	1631531	25 %	25 %	25 %	25 %	414564533
34487	NC_017582	CAA	2	6	1631535	1631540	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414564533
34488	NC_017582	ATC	2	6	1631549	1631554	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414564533
34489	NC_017582	TTTGCT	2	12	1631565	1631576	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	414564533
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34491	NC_017582	TCA	2	6	1631669	1631674	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414564533
34492	NC_017582	TGCT	2	8	1631694	1631701	0 %	50 %	25 %	25 %	414564533
34493	NC_017582	ACC	2	6	1631717	1631722	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	414564533
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34496	NC_017582	AGCC	2	8	1631871	1631878	25 %	0 %	25 %	50 %	414564533
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34498	NC_017582	ATC	2	6	1631962	1631967	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414564533
34499	NC_017582	GAAA	2	8	1631998	1632005	75 %	0 %	25 %	0 %	414564533
34500	NC_017582	GCCAAG	3	18	1632089	1632106	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414564533

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