MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus equi subsp. zooepidemicus ATCC 35246 chromosome

Total Repeats: 45695

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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32502	NC_017582	ATA	2	6	1536173	1536178	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414564445
32503	NC_017582	TGT	2	6	1536353	1536358	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414564445
32504	NC_017582	TTA	2	6	1536396	1536401	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414564445
32505	NC_017582	CAT	3	9	1536415	1536423	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414564445
32506	NC_017582	ACA	2	6	1536435	1536440	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414564445
32507	NC_017582	CTT	2	6	1536470	1536475	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	414564445
32508	NC_017582	CTG	2	6	1536484	1536489	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414564445
32509	NC_017582	ACA	2	6	1536519	1536524	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414564445
32510	NC_017582	TCA	2	6	1536552	1536557	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414564445
32511	NC_017582	ATCA	2	8	1536650	1536657	50 %	25 %	0 %	25 %	414564445
32512	NC_017582	CAT	2	6	1536706	1536711	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414564445
32513	NC_017582	CAG	3	9	1536745	1536753	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414564445
32514	NC_017582	TAT	2	6	1536946	1536951	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414564445
32515	NC_017582	AAAG	2	8	1536965	1536972	75 %	0 %	25 %	0 %	414564445
32516	NC_017582	CAG	2	6	1537048	1537053	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414564445
32517	NC_017582	TCA	2	6	1537096	1537101	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414564445
32518	NC_017582	CAT	2	6	1537102	1537107	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414564445
32519	NC_017582	GCT	2	6	1537140	1537145	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414564445
32520	NC_017582	GCTT	2	8	1537229	1537236	0 %	50 %	25 %	25 %	414564445
32521	NC_017582	TGGC	2	8	1537336	1537343	0 %	25 %	50 %	25 %	414564445
32522	NC_017582	CCTT	2	8	1537386	1537393	0 %	50 %	0 %	50 %	414564445
32523	NC_017582	AGC	2	6	1537463	1537468	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414564445
32524	NC_017582	GCT	2	6	1537524	1537529	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414564445
32525	NC_017582	ATA	2	6	1537721	1537726	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414564445
32526	NC_017582	AGC	2	6	1537736	1537741	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414564445
32527	NC_017582	TAA	2	6	1537761	1537766	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414564445
32528	NC_017582	AATC	2	8	1537774	1537781	50 %	25 %	0 %	25 %	414564445
32529	NC_017582	TAG	2	6	1537809	1537814	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414564445
32530	NC_017582	TTA	2	6	1537872	1537877	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414564445
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32532	NC_017582	TCA	2	6	1537905	1537910	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414564445
32533	NC_017582	TCA	2	6	1537998	1538003	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414564445
32534	NC_017582	TCA	2	6	1538010	1538015	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414564445
32535	NC_017582	GTA	2	6	1538084	1538089	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414564445
32536	NC_017582	GAG	2	6	1538095	1538100	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	414564445
32537	NC_017582	TTG	2	6	1538115	1538120	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414564445
32538	NC_017582	TGC	2	6	1538151	1538156	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414564445
32539	NC_017582	GCCA	2	8	1538206	1538213	25 %	0 %	25 %	50 %	414564445
32540	NC_017582	CTTG	2	8	1538338	1538345	0 %	50 %	25 %	25 %	414564445
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32543	NC_017582	CTGT	2	8	1538487	1538494	0 %	50 %	25 %	25 %	414564445
32544	NC_017582	TGC	2	6	1538499	1538504	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414564445
32545	NC_017582	TCC	2	6	1538577	1538582	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	414564445
32546	NC_017582	CAA	2	6	1538686	1538691	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414564445
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32548	NC_017582	GGA	2	6	1538902	1538907	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	414564445
32549	NC_017582	TAT	3	9	1538947	1538955	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414564445
32550	NC_017582	TGT	2	6	1538960	1538965	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414564445
32551	NC_017582	CCTC	2	8	1538979	1538986	0 %	25 %	0 %	75 %	414564445
32552	NC_017582	ACC	2	6	1539032	1539037	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	414564445
32553	NC_017582	TTG	2	6	1539048	1539053	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414564445
32554	NC_017582	CTG	2	6	1539085	1539090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414564445
32555	NC_017582	CAG	2	6	1539097	1539102	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414564445
32556	NC_017582	CTA	2	6	1539124	1539129	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414564445
32557	NC_017582	GTC	2	6	1539144	1539149	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414564445
32558	NC_017582	ACT	2	6	1539159	1539164	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414564445
32559	NC_017582	TATCTG	2	12	1539175	1539186	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	414564445
32560	NC_017582	CTG	2	6	1539223	1539228	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414564445
32561	NC_017582	GCT	2	6	1539238	1539243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414564445
32562	NC_017582	TCA	2	6	1539264	1539269	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414564445
32563	NC_017582	CAG	2	6	1539292	1539297	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414564445
32564	NC_017582	CA	4	8	1539311	1539318	50 %	0 %	0 %	50 %	414564445
32565	NC_017582	TA	4	8	1539410	1539417	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32566	NC_017582	CAT	2	6	1539418	1539423	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32567	NC_017582	CAA	2	6	1539507	1539512	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32568	NC_017582	AGA	2	6	1539523	1539528	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32569	NC_017582	AT	3	6	1539546	1539551	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32570	NC_017582	GGC	2	6	1539703	1539708	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	414564446
32571	NC_017582	CAG	2	6	1539785	1539790	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414564446
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32574	NC_017582	CAAT	2	8	1539938	1539945	50 %	25 %	0 %	25 %	414564446
32575	NC_017582	CATAC	2	10	1539959	1539968	40 %	20 %	0 %	40 %	414564446
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32585	NC_017582	TGA	2	6	1540599	1540604	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414564446
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32587	NC_017582	TTA	2	6	1540699	1540704	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414564446
32588	NC_017582	CAC	2	6	1540714	1540719	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	414564446
32589	NC_017582	A	6	6	1540771	1540776	100 %	0 %	0 %	0 %	414564446
32590	NC_017582	CATT	2	8	1540778	1540785	25 %	50 %	0 %	25 %	414564446
32591	NC_017582	TCA	2	6	1540805	1540810	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414564446
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32595	NC_017582	ATTC	2	8	1540920	1540927	25 %	50 %	0 %	25 %	414564446
32596	NC_017582	CT	3	6	1540962	1540967	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
32597	NC_017582	GCTC	2	8	1540996	1541003	0 %	25 %	25 %	50 %	414564447
32598	NC_017582	TCT	2	6	1541012	1541017	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	414564447
32599	NC_017582	TAA	3	9	1541026	1541034	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414564447
32600	NC_017582	AGA	2	6	1541046	1541051	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414564447
32601	NC_017582	AAT	2	6	1541060	1541065	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414564447
32602	NC_017582	GGC	2	6	1541127	1541132	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	414564447
32603	NC_017582	ACAA	2	8	1541196	1541203	75 %	0 %	0 %	25 %	414564447
32604	NC_017582	AAC	2	6	1541252	1541257	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414564447
32605	NC_017582	CTG	2	6	1541333	1541338	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414564447
32606	NC_017582	CGA	2	6	1541349	1541354	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414564447
32607	NC_017582	AGAC	2	8	1541431	1541438	50 %	0 %	25 %	25 %	414564447
32608	NC_017582	ATA	2	6	1541517	1541522	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414564447
32609	NC_017582	CCA	2	6	1541541	1541546	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	414564447
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32611	NC_017582	AAG	2	6	1541576	1541581	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414564447
32612	NC_017582	AAC	2	6	1541582	1541587	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414564447
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32614	NC_017582	AAT	2	6	1541732	1541737	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414564447
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32975	NC_017582	T	6	6	1558294	1558299	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
32976	NC_017582	TCT	2	6	1558311	1558316	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32977	NC_017582	AGC	2	6	1558329	1558334	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32978	NC_017582	TCA	2	6	1558363	1558368	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414564464
32979	NC_017582	TCA	2	6	1558414	1558419	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414564464
32980	NC_017582	TCT	2	6	1558445	1558450	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	414564464
32981	NC_017582	ATT	2	6	1558470	1558475	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414564464
32982	NC_017582	CATCA	2	10	1558482	1558491	40 %	20 %	0 %	40 %	414564464
32983	NC_017582	GAG	2	6	1558525	1558530	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	414564464
32984	NC_017582	TCT	2	6	1558537	1558542	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	414564464
32985	NC_017582	TGT	2	6	1558597	1558602	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414564464
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32989	NC_017582	ATC	2	6	1558713	1558718	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414564464
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32992	NC_017582	CCT	2	6	1558990	1558995	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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32999	NC_017582	A	6	6	1559361	1559366	100 %	0 %	0 %	0 %	414564466
33000	NC_017582	GCT	2	6	1559388	1559393	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414564466

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