MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus equi subsp. zooepidemicus ATCC 35246 chromosome

Total Repeats: 45695

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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31502	NC_017582	AGA	2	6	1488772	1488777	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414564398
31503	NC_017582	A	6	6	1488784	1488789	100 %	0 %	0 %	0 %	414564398
31504	NC_017582	CCT	2	6	1488829	1488834	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	414564398
31505	NC_017582	CT	3	6	1488909	1488914	0 %	50 %	0 %	50 %	414564398
31506	NC_017582	AAT	2	6	1488987	1488992	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414564398
31507	NC_017582	AGG	2	6	1489048	1489053	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	414564398
31508	NC_017582	ATC	2	6	1489107	1489112	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414564398
31509	NC_017582	CAG	2	6	1489137	1489142	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414564398
31510	NC_017582	TCA	2	6	1489157	1489162	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414564398
31511	NC_017582	TAT	2	6	1489201	1489206	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31512	NC_017582	ATT	2	6	1489253	1489258	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31513	NC_017582	GCT	3	9	1489283	1489291	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414564399
31514	NC_017582	CAG	2	6	1489316	1489321	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414564399
31515	NC_017582	A	6	6	1489362	1489367	100 %	0 %	0 %	0 %	414564399
31516	NC_017582	AGC	2	6	1489386	1489391	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414564399
31517	NC_017582	A	6	6	1489411	1489416	100 %	0 %	0 %	0 %	414564399
31518	NC_017582	GCT	2	6	1489445	1489450	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414564400
31519	NC_017582	GCT	2	6	1489457	1489462	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414564400
31520	NC_017582	CTG	2	6	1489569	1489574	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414564400
31521	NC_017582	CTC	2	6	1489575	1489580	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	414564400
31522	NC_017582	AAG	2	6	1489685	1489690	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414564400
31523	NC_017582	CT	3	6	1489733	1489738	0 %	50 %	0 %	50 %	414564400
31524	NC_017582	GAT	2	6	1489749	1489754	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414564400
31525	NC_017582	GGC	2	6	1489765	1489770	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	414564400
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31530	NC_017582	A	6	6	1489987	1489992	100 %	0 %	0 %	0 %	414564400
31531	NC_017582	GAC	2	6	1490018	1490023	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414564400
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31533	NC_017582	TCT	3	9	1490068	1490076	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	414564400
31534	NC_017582	AAT	2	6	1490114	1490119	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414564400
31535	NC_017582	AAGAA	2	10	1490124	1490133	80 %	0 %	20 %	0 %	414564400
31536	NC_017582	TAGCA	2	10	1490219	1490228	40 %	20 %	20 %	20 %	414564400
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31539	NC_017582	AAT	2	6	1490409	1490414	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414564400
31540	NC_017582	ATC	2	6	1490517	1490522	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414564400
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31542	NC_017582	GAT	2	6	1490570	1490575	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414564400
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31544	NC_017582	GAT	2	6	1490677	1490682	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414564400
31545	NC_017582	TTA	2	6	1490713	1490718	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414564400
31546	NC_017582	CAA	2	6	1490900	1490905	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414564400
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31548	NC_017582	TTA	2	6	1490948	1490953	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31549	NC_017582	A	8	8	1491002	1491009	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31550	NC_017582	A	6	6	1491015	1491020	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31551	NC_017582	ATC	2	6	1491043	1491048	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31552	NC_017582	ATAA	2	8	1491057	1491064	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
31553	NC_017582	A	6	6	1491063	1491068	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31554	NC_017582	ATA	2	6	1491138	1491143	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31555	NC_017582	T	6	6	1491160	1491165	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31556	NC_017582	TTAA	2	8	1491217	1491224	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31557	NC_017582	A	7	7	1491229	1491235	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31558	NC_017582	AAAT	2	8	1491239	1491246	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
31559	NC_017582	TAC	2	6	1491277	1491282	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31560	NC_017582	ATT	2	6	1491329	1491334	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414564401
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31562	NC_017582	CTA	2	6	1491378	1491383	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414564401
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31564	NC_017582	CAG	2	6	1491425	1491430	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414564401
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31566	NC_017582	TC	3	6	1491469	1491474	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
31567	NC_017582	AT	3	6	1491549	1491554	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31568	NC_017582	TTAG	2	8	1491579	1491586	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
31569	NC_017582	AAG	2	6	1491613	1491618	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414564402
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31573	NC_017582	CA	3	6	1491695	1491700	50 %	0 %	0 %	50 %	414564402
31574	NC_017582	TGTC	2	8	1491839	1491846	0 %	50 %	25 %	25 %	414564403
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31580	NC_017582	TCA	2	6	1492366	1492371	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414564403
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31594	NC_017582	TCA	2	6	1492894	1492899	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414564404
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31598	NC_017582	TG	3	6	1493088	1493093	0 %	50 %	50 %	0 %	414564404
31599	NC_017582	ACAG	2	8	1493161	1493168	50 %	0 %	25 %	25 %	414564404
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31602	NC_017582	GC	3	6	1493285	1493290	0 %	0 %	50 %	50 %	414564404
31603	NC_017582	CTC	2	6	1493382	1493387	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	414564404
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31606	NC_017582	CGCAGC	2	12	1493467	1493478	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	414564404
31607	NC_017582	AAAC	2	8	1493480	1493487	75 %	0 %	0 %	25 %	414564404
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31610	NC_017582	T	7	7	1493587	1493593	0 %	100 %	0 %	0 %	414564404
31611	NC_017582	GCT	2	6	1493621	1493626	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414564404
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31613	NC_017582	TCAAT	2	10	1493795	1493804	40 %	40 %	0 %	20 %	414564404
31614	NC_017582	TCTTA	2	10	1493853	1493862	20 %	60 %	0 %	20 %	414564404
31615	NC_017582	TCA	2	6	1493867	1493872	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414564404
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31619	NC_017582	GTA	2	6	1494010	1494015	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414564405
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31972	NC_017582	TCAAC	2	10	1511257	1511266	40 %	20 %	0 %	40 %	414564422
31973	NC_017582	CTT	2	6	1511302	1511307	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	414564422
31974	NC_017582	T	7	7	1511350	1511356	0 %	100 %	0 %	0 %	414564422
31975	NC_017582	ATA	2	6	1511420	1511425	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414564422
31976	NC_017582	GCA	2	6	1511518	1511523	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414564422
31977	NC_017582	CAG	2	6	1511545	1511550	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414564422
31978	NC_017582	TAC	2	6	1511563	1511568	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414564422
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31980	NC_017582	AATT	2	8	1511597	1511604	50 %	50 %	0 %	0 %	414564422
31981	NC_017582	CAG	2	6	1511668	1511673	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414564422
31982	NC_017582	ATC	2	6	1511727	1511732	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414564422
31983	NC_017582	CTG	2	6	1511802	1511807	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31984	NC_017582	ACTG	2	8	1511824	1511831	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
31985	NC_017582	TTTA	2	8	1511865	1511872	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
31986	NC_017582	TCCTG	2	10	1511888	1511897	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
31987	NC_017582	ACC	2	6	1511921	1511926	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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31989	NC_017582	ACCA	2	8	1511987	1511994	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
31990	NC_017582	TCT	2	6	1512030	1512035	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31991	NC_017582	ATT	2	6	1512038	1512043	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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31993	NC_017582	A	6	6	1512081	1512086	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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31997	NC_017582	ACA	2	6	1512218	1512223	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31998	NC_017582	CT	3	6	1512267	1512272	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
31999	NC_017582	CTT	2	6	1512302	1512307	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32000	NC_017582	TTTA	2	8	1512310	1512317	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding

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