MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus equi subsp. zooepidemicus ATCC 35246 chromosome

Total Repeats: 45695

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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31002	NC_017582	CTC	2	6	1466199	1466204	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	414564379
31003	NC_017582	TAA	2	6	1466259	1466264	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414564379
31004	NC_017582	ATC	2	6	1466295	1466300	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414564379
31005	NC_017582	TCA	2	6	1466335	1466340	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414564379
31006	NC_017582	CAT	2	6	1466355	1466360	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414564379
31007	NC_017582	GCA	2	6	1466423	1466428	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414564379
31008	NC_017582	CCT	2	6	1466516	1466521	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	414564379
31009	NC_017582	CTC	2	6	1466556	1466561	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	414564379
31010	NC_017582	ATC	2	6	1466562	1466567	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414564379
31011	NC_017582	TAA	2	6	1466571	1466576	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414564379
31012	NC_017582	GTCA	2	8	1466627	1466634	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
31013	NC_017582	AC	3	6	1466643	1466648	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
31014	NC_017582	AATC	2	8	1466671	1466678	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
31015	NC_017582	ATTG	2	8	1466739	1466746	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
31016	NC_017582	AAG	2	6	1466748	1466753	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31017	NC_017582	GAT	2	6	1466800	1466805	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414564380
31018	NC_017582	CGT	2	6	1466928	1466933	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31019	NC_017582	T	6	6	1466965	1466970	0 %	100 %	0 %	0 %	414564381
31020	NC_017582	CCTC	2	8	1467110	1467117	0 %	25 %	0 %	75 %	414564381
31021	NC_017582	TCCT	2	8	1467167	1467174	0 %	50 %	0 %	50 %	414564381
31022	NC_017582	TAT	2	6	1467194	1467199	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414564381
31023	NC_017582	T	6	6	1467206	1467211	0 %	100 %	0 %	0 %	414564381
31024	NC_017582	AAG	2	6	1467216	1467221	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414564381
31025	NC_017582	CTG	2	6	1467235	1467240	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414564381
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31028	NC_017582	CAT	2	6	1467371	1467376	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414564381
31029	NC_017582	TTG	2	6	1467388	1467393	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414564381
31030	NC_017582	CAGCC	2	10	1467415	1467424	20 %	0 %	20 %	60 %	414564381
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31032	NC_017582	CAA	2	6	1467568	1467573	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414564381
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31034	NC_017582	ATG	3	9	1467759	1467767	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414564381
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31036	NC_017582	TGA	2	6	1467858	1467863	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414564381
31037	NC_017582	AT	3	6	1467934	1467939	50 %	50 %	0 %	0 %	414564382
31038	NC_017582	AAGGT	2	10	1468050	1468059	40 %	20 %	40 %	0 %	414564382
31039	NC_017582	TTGG	2	8	1468100	1468107	0 %	50 %	50 %	0 %	414564382
31040	NC_017582	CGA	2	6	1468137	1468142	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414564382
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31045	NC_017582	AGC	3	9	1468593	1468601	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414564382
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31047	NC_017582	CA	3	6	1468626	1468631	50 %	0 %	0 %	50 %	414564382
31048	NC_017582	GTTC	2	8	1468754	1468761	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
31049	NC_017582	AAATG	2	10	1468767	1468776	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
31050	NC_017582	TTG	2	6	1468833	1468838	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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31052	NC_017582	T	6	6	1468924	1468929	0 %	100 %	0 %	0 %	414564383
31053	NC_017582	CAT	3	9	1468956	1468964	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414564383
31054	NC_017582	GTCG	2	8	1468965	1468972	0 %	25 %	50 %	25 %	414564383
31055	NC_017582	ATAA	2	8	1468975	1468982	75 %	25 %	0 %	0 %	414564383
31056	NC_017582	CTTA	2	8	1468993	1469000	25 %	50 %	0 %	25 %	414564383
31057	NC_017582	CAAT	2	8	1469024	1469031	50 %	25 %	0 %	25 %	414564383
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31061	NC_017582	AG	3	6	1469202	1469207	50 %	0 %	50 %	0 %	414564383
31062	NC_017582	CCCTC	2	10	1469324	1469333	0 %	20 %	0 %	80 %	414564383
31063	NC_017582	TGA	2	6	1469351	1469356	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414564383
31064	NC_017582	TGC	2	6	1469405	1469410	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414564383
31065	NC_017582	TGC	2	6	1469453	1469458	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414564383
31066	NC_017582	A	6	6	1469464	1469469	100 %	0 %	0 %	0 %	414564383
31067	NC_017582	AATC	2	8	1469629	1469636	50 %	25 %	0 %	25 %	414564383
31068	NC_017582	CTA	2	6	1469664	1469669	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414564383
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31078	NC_017582	TCC	2	6	1470289	1470294	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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31090	NC_017582	A	6	6	1470837	1470842	100 %	0 %	0 %	0 %	414564384
31091	NC_017582	CAC	2	6	1470954	1470959	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	414564384
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31102	NC_017582	TAA	2	6	1471376	1471381	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414564384
31103	NC_017582	AAC	2	6	1471398	1471403	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414564384
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31107	NC_017582	GTA	2	6	1471622	1471627	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414564384
31108	NC_017582	TGC	2	6	1471644	1471649	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414564384
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31110	NC_017582	AGC	2	6	1471716	1471721	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414564384
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31112	NC_017582	TAA	2	6	1471736	1471741	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414564384
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31118	NC_017582	TAA	2	6	1471954	1471959	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414564384
31119	NC_017582	CAT	2	6	1471967	1471972	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414564384
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31231	NC_017582	T	7	7	1477330	1477336	0 %	100 %	0 %	0 %	414564389
31232	NC_017582	TAA	2	6	1477378	1477383	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31233	NC_017582	CTTT	2	8	1477401	1477408	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
31234	NC_017582	TTA	2	6	1477456	1477461	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414564390
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31349	NC_017582	TAA	3	9	1482046	1482054	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414564393
31350	NC_017582	ATT	2	6	1482062	1482067	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414564393
31351	NC_017582	ACT	2	6	1482122	1482127	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414564393
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31474	NC_017582	GCA	2	6	1487300	1487305	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414564397
31475	NC_017582	AGC	2	6	1487335	1487340	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414564397
31476	NC_017582	GAC	2	6	1487435	1487440	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414564397
31477	NC_017582	AGCA	2	8	1487466	1487473	50 %	0 %	25 %	25 %	414564397
31478	NC_017582	CTG	2	6	1487487	1487492	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414564397
31479	NC_017582	TTTTC	2	10	1487513	1487522	0 %	80 %	0 %	20 %	414564397
31480	NC_017582	TGA	2	6	1487546	1487551	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414564397
31481	NC_017582	CAG	2	6	1487624	1487629	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414564397
31482	NC_017582	AG	3	6	1487628	1487633	50 %	0 %	50 %	0 %	414564397
31483	NC_017582	CTA	2	6	1487720	1487725	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414564397
31484	NC_017582	CCT	2	6	1487741	1487746	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	414564397
31485	NC_017582	CAGCTG	2	12	1487787	1487798	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	414564397
31486	NC_017582	ATA	2	6	1487884	1487889	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414564397
31487	NC_017582	CTT	2	6	1487943	1487948	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	414564397
31488	NC_017582	ATA	2	6	1488046	1488051	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414564397
31489	NC_017582	ATCA	2	8	1488123	1488130	50 %	25 %	0 %	25 %	414564397
31490	NC_017582	GATA	2	8	1488152	1488159	50 %	25 %	25 %	0 %	414564397
31491	NC_017582	TAA	2	6	1488194	1488199	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414564397
31492	NC_017582	ACA	2	6	1488220	1488225	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414564397
31493	NC_017582	ACC	2	6	1488291	1488296	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	414564397
31494	NC_017582	ACA	2	6	1488379	1488384	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414564397
31495	NC_017582	AGC	2	6	1488501	1488506	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414564398
31496	NC_017582	T	6	6	1488522	1488527	0 %	100 %	0 %	0 %	414564398
31497	NC_017582	ACCA	2	8	1488561	1488568	50 %	0 %	0 %	50 %	414564398
31498	NC_017582	AATC	2	8	1488626	1488633	50 %	25 %	0 %	25 %	414564398
31499	NC_017582	ACA	2	6	1488634	1488639	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414564398
31500	NC_017582	AAC	2	6	1488655	1488660	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414564398

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