MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus equi subsp. zooepidemicus ATCC 35246 chromosome

Total Repeats: 45695

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
30501	NC_017582	GTA	2	6	1442500	1442505	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30502	NC_017582	GGCT	2	8	1442635	1442642	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
30503	NC_017582	TCAT	2	8	1442649	1442656	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
30504	NC_017582	AG	3	6	1442677	1442682	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
30505	NC_017582	CTCA	2	8	1442693	1442700	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
30506	NC_017582	CAT	2	6	1442839	1442844	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30507	NC_017582	CCT	2	6	1442872	1442877	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
30508	NC_017582	TAA	2	6	1442904	1442909	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30509	NC_017582	CAA	2	6	1442910	1442915	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30510	NC_017582	TAT	2	6	1442939	1442944	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414564349
30511	NC_017582	A	6	6	1442948	1442953	100 %	0 %	0 %	0 %	414564349
30512	NC_017582	ATA	2	6	1442965	1442970	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414564349
30513	NC_017582	TAA	2	6	1443078	1443083	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414564349
30514	NC_017582	GCA	2	6	1443153	1443158	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414564350
30515	NC_017582	AGCT	2	8	1443199	1443206	25 %	25 %	25 %	25 %	414564350
30516	NC_017582	AAG	2	6	1443216	1443221	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414564350
30517	NC_017582	TAA	2	6	1443279	1443284	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30518	NC_017582	TCA	2	6	1443301	1443306	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30519	NC_017582	TCT	2	6	1443394	1443399	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30520	NC_017582	A	6	6	1443416	1443421	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
30521	NC_017582	GCTTT	2	10	1443526	1443535	0 %	60 %	20 %	20 %	414564351
30522	NC_017582	TGT	3	9	1443544	1443552	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414564351
30523	NC_017582	A	6	6	1443556	1443561	100 %	0 %	0 %	0 %	414564351
30524	NC_017582	AAG	2	6	1443648	1443653	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414564351
30525	NC_017582	CAT	2	6	1443659	1443664	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414564351
30526	NC_017582	ATGG	2	8	1443696	1443703	25 %	25 %	50 %	0 %	414564351
30527	NC_017582	TGA	2	6	1443729	1443734	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414564351
30528	NC_017582	AAT	2	6	1443866	1443871	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414564351
30529	NC_017582	GATA	2	8	1443900	1443907	50 %	25 %	25 %	0 %	414564351
30530	NC_017582	AGGTA	2	10	1443920	1443929	40 %	20 %	40 %	0 %	414564351
30531	NC_017582	AAG	2	6	1444027	1444032	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414564351
30532	NC_017582	ACG	2	6	1444046	1444051	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414564351
30533	NC_017582	TCA	2	6	1444078	1444083	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414564351
30534	NC_017582	T	6	6	1444094	1444099	0 %	100 %	0 %	0 %	414564351
30535	NC_017582	CGA	2	6	1444143	1444148	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414564351
30536	NC_017582	ATG	2	6	1444163	1444168	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414564351
30537	NC_017582	TCA	2	6	1444170	1444175	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414564351
30538	NC_017582	TCT	2	6	1444215	1444220	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	414564351
30539	NC_017582	CTTGA	2	10	1444232	1444241	20 %	40 %	20 %	20 %	414564351
30540	NC_017582	TAA	2	6	1444242	1444247	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414564351
30541	NC_017582	GAT	2	6	1444316	1444321	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414564352
30542	NC_017582	TC	3	6	1444364	1444369	0 %	50 %	0 %	50 %	414564352
30543	NC_017582	T	6	6	1444373	1444378	0 %	100 %	0 %	0 %	414564352
30544	NC_017582	TCT	2	6	1444452	1444457	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	414564352
30545	NC_017582	TGG	2	6	1444477	1444482	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	414564352
30546	NC_017582	CCTC	2	8	1444483	1444490	0 %	25 %	0 %	75 %	414564352
30547	NC_017582	ATCA	2	8	1444603	1444610	50 %	25 %	0 %	25 %	414564352
30548	NC_017582	TAT	2	6	1444621	1444626	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414564352
30549	NC_017582	AAT	2	6	1444647	1444652	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414564352
30550	NC_017582	C	6	6	1444830	1444835	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
30551	NC_017582	G	6	6	1444863	1444868	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
30552	NC_017582	TCAA	2	8	1444915	1444922	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
30553	NC_017582	CTAT	2	8	1444929	1444936	25 %	50 %	0 %	25 %	414564353
30554	NC_017582	GCA	2	6	1444952	1444957	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414564353
30555	NC_017582	TGC	2	6	1444966	1444971	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414564353
30556	NC_017582	AAC	2	6	1444992	1444997	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414564353
30557	NC_017582	CTG	2	6	1445033	1445038	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414564353
30558	NC_017582	CAT	2	6	1445040	1445045	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414564353
30559	NC_017582	GCA	2	6	1445069	1445074	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414564353
30560	NC_017582	TTG	2	6	1445110	1445115	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414564353
30561	NC_017582	GCT	2	6	1445153	1445158	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414564353
30562	NC_017582	CAT	2	6	1445177	1445182	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414564353
30563	NC_017582	GCCA	2	8	1445240	1445247	25 %	0 %	25 %	50 %	414564353
30564	NC_017582	CAT	2	6	1445267	1445272	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414564353
30565	NC_017582	GTT	2	6	1445299	1445304	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414564353
30566	NC_017582	CTGCT	2	10	1445322	1445331	0 %	40 %	20 %	40 %	414564353
30567	NC_017582	CTGA	2	8	1445376	1445383	25 %	25 %	25 %	25 %	414564353
30568	NC_017582	CCTT	2	8	1445432	1445439	0 %	50 %	0 %	50 %	414564353
30569	NC_017582	T	6	6	1445485	1445490	0 %	100 %	0 %	0 %	414564353
30570	NC_017582	TCA	2	6	1445521	1445526	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414564353
30571	NC_017582	TGC	2	6	1445539	1445544	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414564353
30572	NC_017582	GCTCAT	2	12	1445546	1445557	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	414564353
30573	NC_017582	GTC	2	6	1445653	1445658	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414564353
30574	NC_017582	AAT	2	6	1445696	1445701	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414564353
30575	NC_017582	TTGA	2	8	1445721	1445728	25 %	50 %	25 %	0 %	414564353
30576	NC_017582	CTG	2	6	1445784	1445789	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414564353
30577	NC_017582	ATC	2	6	1445802	1445807	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414564353
30578	NC_017582	TCTTT	2	10	1445840	1445849	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
30579	NC_017582	ATT	2	6	1445986	1445991	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30580	NC_017582	CAT	2	6	1445996	1446001	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30581	NC_017582	T	6	6	1446085	1446090	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
30582	NC_017582	CAA	2	6	1446184	1446189	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414564354
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30584	NC_017582	GCT	2	6	1446262	1446267	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414564354
30585	NC_017582	GGC	2	6	1446306	1446311	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	414564354
30586	NC_017582	TGC	2	6	1446316	1446321	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414564354
30587	NC_017582	ACA	2	6	1446357	1446362	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414564354
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30589	NC_017582	TAT	2	6	1446388	1446393	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414564354
30590	NC_017582	CGC	2	6	1446554	1446559	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	414564354
30591	NC_017582	TAA	2	6	1446578	1446583	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414564354
30592	NC_017582	GCA	2	6	1446721	1446726	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414564354
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30598	NC_017582	AGAT	2	8	1446964	1446971	50 %	25 %	25 %	0 %	414564354
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30601	NC_017582	TAAA	2	8	1447097	1447104	75 %	25 %	0 %	0 %	414564354
30602	NC_017582	ACC	2	6	1447176	1447181	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	414564354
30603	NC_017582	TGC	2	6	1447199	1447204	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414564354
30604	NC_017582	GCT	2	6	1447210	1447215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414564354
30605	NC_017582	ATC	2	6	1447233	1447238	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414564354
30606	NC_017582	ACC	2	6	1447239	1447244	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	414564354
30607	NC_017582	TACC	2	8	1447264	1447271	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
30608	NC_017582	GCT	2	6	1447293	1447298	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30609	NC_017582	A	8	8	1447299	1447306	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
30610	NC_017582	CAG	3	9	1447338	1447346	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30611	NC_017582	GCC	2	6	1447347	1447352	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
30612	NC_017582	TGG	2	6	1447388	1447393	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
30613	NC_017582	ATA	2	6	1447429	1447434	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30614	NC_017582	AGCA	2	8	1447440	1447447	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
30615	NC_017582	CTG	2	6	1447464	1447469	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30616	NC_017582	GTT	2	6	1447471	1447476	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30617	NC_017582	CCA	2	6	1447559	1447564	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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30619	NC_017582	GAT	2	6	1447589	1447594	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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30621	NC_017582	T	7	7	1447698	1447704	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
30622	NC_017582	T	6	6	1447714	1447719	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
30623	NC_017582	T	6	6	1447731	1447736	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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30858	NC_017582	CAA	2	6	1458316	1458321	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414564372
30859	NC_017582	GAA	2	6	1458406	1458411	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414564372
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30953	NC_017582	A	7	7	1463427	1463433	100 %	0 %	0 %	0 %	414564376
30954	NC_017582	TCC	2	6	1463434	1463439	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	414564376
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30964	NC_017582	T	6	6	1463717	1463722	0 %	100 %	0 %	0 %	414564377
30965	NC_017582	CGG	2	6	1463729	1463734	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	414564377
30966	NC_017582	CTG	2	6	1463741	1463746	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414564377
30967	NC_017582	TCTT	2	8	1463788	1463795	0 %	75 %	0 %	25 %	414564377
30968	NC_017582	ATA	2	6	1464178	1464183	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414564377
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30970	NC_017582	CTG	2	6	1464302	1464307	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414564377
30971	NC_017582	T	7	7	1464386	1464392	0 %	100 %	0 %	0 %	414564377
30972	NC_017582	TGT	2	6	1464431	1464436	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30973	NC_017582	AGC	2	6	1464541	1464546	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30974	NC_017582	TTG	2	6	1464564	1464569	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414564378
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30978	NC_017582	CTG	2	6	1464699	1464704	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414564378
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