MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus equi subsp. zooepidemicus ATCC 35246 chromosome

Total Repeats: 45695

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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30002	NC_017582	GAA	2	6	1417388	1417393	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414564327
30003	NC_017582	AGCA	2	8	1417398	1417405	50 %	0 %	25 %	25 %	414564327
30004	NC_017582	TGAT	2	8	1417416	1417423	25 %	50 %	25 %	0 %	414564327
30005	NC_017582	CAA	2	6	1417454	1417459	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414564327
30006	NC_017582	T	7	7	1417507	1417513	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
30007	NC_017582	TCT	2	6	1417515	1417520	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30008	NC_017582	A	6	6	1417528	1417533	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
30009	NC_017582	TAA	2	6	1417544	1417549	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30010	NC_017582	ACA	2	6	1417560	1417565	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30011	NC_017582	A	6	6	1417596	1417601	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
30012	NC_017582	ATCA	2	8	1417605	1417612	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
30013	NC_017582	TGA	2	6	1417629	1417634	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30014	NC_017582	GAG	2	6	1417676	1417681	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
30015	NC_017582	A	6	6	1417756	1417761	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
30016	NC_017582	GTC	2	6	1417765	1417770	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30017	NC_017582	CTT	2	6	1417795	1417800	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30018	NC_017582	ACT	2	6	1417802	1417807	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30019	NC_017582	CAT	2	6	1417837	1417842	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30020	NC_017582	AAT	2	6	1417864	1417869	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30021	NC_017582	GCAA	2	8	1417871	1417878	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
30022	NC_017582	T	6	6	1417881	1417886	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
30023	NC_017582	CTA	2	6	1417949	1417954	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30024	NC_017582	GAAT	2	8	1417961	1417968	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
30025	NC_017582	A	7	7	1417973	1417979	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
30026	NC_017582	CTA	2	6	1418024	1418029	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30027	NC_017582	GACA	2	8	1418044	1418051	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
30028	NC_017582	GCT	2	6	1418106	1418111	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414564328
30029	NC_017582	CTG	2	6	1418113	1418118	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414564328
30030	NC_017582	TAG	2	6	1418131	1418136	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414564328
30031	NC_017582	CTG	2	6	1418232	1418237	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414564328
30032	NC_017582	CAA	2	6	1418332	1418337	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414564328
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30034	NC_017582	GAA	2	6	1418372	1418377	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414564329
30035	NC_017582	GGA	2	6	1418425	1418430	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	414564329
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30037	NC_017582	CT	3	6	1418495	1418500	0 %	50 %	0 %	50 %	414564329
30038	NC_017582	TGA	2	6	1418605	1418610	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414564329
30039	NC_017582	CGT	2	6	1418648	1418653	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414564329
30040	NC_017582	AG	3	6	1418659	1418664	50 %	0 %	50 %	0 %	414564329
30041	NC_017582	GCA	2	6	1418722	1418727	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414564330
30042	NC_017582	ACAA	2	8	1418755	1418762	75 %	0 %	0 %	25 %	414564330
30043	NC_017582	AGC	2	6	1418850	1418855	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414564330
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30045	NC_017582	ATC	2	6	1418887	1418892	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414564330
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30050	NC_017582	TCAG	2	8	1419293	1419300	25 %	25 %	25 %	25 %	414564330
30051	NC_017582	AGC	2	6	1419457	1419462	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414564330
30052	NC_017582	TGA	2	6	1419543	1419548	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414564330
30053	NC_017582	ATG	2	6	1419572	1419577	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414564330
30054	NC_017582	AAGG	2	8	1419595	1419602	50 %	0 %	50 %	0 %	414564330
30055	NC_017582	TCG	2	6	1419649	1419654	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414564330
30056	NC_017582	CAA	2	6	1419678	1419683	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414564330
30057	NC_017582	GAT	2	6	1419691	1419696	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414564330
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30060	NC_017582	TCTG	2	8	1419850	1419857	0 %	50 %	25 %	25 %	414564330
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30063	NC_017582	T	6	6	1420149	1420154	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
30064	NC_017582	TAT	2	6	1420162	1420167	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30065	NC_017582	TAT	2	6	1420188	1420193	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30066	NC_017582	ATT	3	9	1420207	1420215	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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30069	NC_017582	ATT	2	6	1420398	1420403	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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30088	NC_017582	CAT	2	6	1421135	1421140	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414564333
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30092	NC_017582	T	6	6	1421453	1421458	0 %	100 %	0 %	0 %	414564333
30093	NC_017582	CTT	2	6	1421483	1421488	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	414564333
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30103	NC_017582	CAT	2	6	1422015	1422020	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414564333
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30106	NC_017582	TC	3	6	1422101	1422106	0 %	50 %	0 %	50 %	414564333
30107	NC_017582	TTC	2	6	1422111	1422116	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	414564333
30108	NC_017582	CAA	2	6	1422135	1422140	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414564333
30109	NC_017582	GCTT	2	8	1422184	1422191	0 %	50 %	25 %	25 %	414564333
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30114	NC_017582	TGA	2	6	1422411	1422416	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414564333
30115	NC_017582	GAT	2	6	1422495	1422500	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414564333
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30117	NC_017582	ATA	2	6	1422541	1422546	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414564333
30118	NC_017582	GCA	2	6	1422622	1422627	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414564333
30119	NC_017582	TCA	2	6	1422647	1422652	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414564333
30120	NC_017582	TAGA	2	8	1422740	1422747	50 %	25 %	25 %	0 %	414564333
30121	NC_017582	GT	3	6	1422770	1422775	0 %	50 %	50 %	0 %	414564333
30122	NC_017582	TCA	2	6	1422781	1422786	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414564333
30123	NC_017582	CT	3	6	1422930	1422935	0 %	50 %	0 %	50 %	414564333
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30131	NC_017582	AGAA	2	8	1423263	1423270	75 %	0 %	25 %	0 %	414564333
30132	NC_017582	ATA	2	6	1423288	1423293	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414564333
30133	NC_017582	ATC	2	6	1423294	1423299	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414564333
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30136	NC_017582	TTC	2	6	1423446	1423451	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	414564333
30137	NC_017582	TCCC	2	8	1423499	1423506	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
30138	NC_017582	GAC	2	6	1423605	1423610	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30139	NC_017582	TAT	2	6	1423653	1423658	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30140	NC_017582	ATG	2	6	1423665	1423670	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30141	NC_017582	A	6	6	1423674	1423679	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
30142	NC_017582	A	7	7	1423684	1423690	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
30143	NC_017582	T	6	6	1423701	1423706	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
30144	NC_017582	ATC	2	6	1423718	1423723	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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30146	NC_017582	TGA	2	6	1423749	1423754	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30147	NC_017582	ACAG	2	8	1423782	1423789	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
30148	NC_017582	CTG	2	6	1423833	1423838	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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30150	NC_017582	CTG	2	6	1423926	1423931	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414564334
30151	NC_017582	T	6	6	1424010	1424015	0 %	100 %	0 %	0 %	414564334
30152	NC_017582	TCA	2	6	1424030	1424035	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414564334
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30159	NC_017582	ATGA	2	8	1424309	1424316	50 %	25 %	25 %	0 %	414564335
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30182	NC_017582	ACAAGC	2	12	1425695	1425706	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
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30189	NC_017582	GCAATT	2	12	1425999	1426010	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	414564336
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30203	NC_017582	GCT	4	12	1426800	1426811	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414564337
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30211	NC_017582	TAT	2	6	1427298	1427303	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414564337
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30220	NC_017582	TTCA	2	8	1427924	1427931	25 %	50 %	0 %	25 %	414564338
30221	NC_017582	GCT	2	6	1427950	1427955	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414564338
30222	NC_017582	CGG	2	6	1428046	1428051	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	414564338
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30225	NC_017582	GAT	2	6	1428215	1428220	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414564338
30226	NC_017582	TCA	2	6	1428351	1428356	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414564338
30227	NC_017582	A	7	7	1428388	1428394	100 %	0 %	0 %	0 %	414564338
30228	NC_017582	TGA	2	6	1428433	1428438	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414564338
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30231	NC_017582	TGA	2	6	1428574	1428579	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414564338
30232	NC_017582	AGC	2	6	1428618	1428623	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414564338
30233	NC_017582	A	8	8	1428669	1428676	100 %	0 %	0 %	0 %	414564338
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30235	NC_017582	GAAAA	2	10	1428905	1428914	80 %	0 %	20 %	0 %	414564338
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30339	NC_017582	A	6	6	1433882	1433887	100 %	0 %	0 %	0 %	414564341
30340	NC_017582	AAGG	2	8	1433957	1433964	50 %	0 %	50 %	0 %	414564341
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30350	NC_017582	AAG	2	6	1434551	1434556	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414564341
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30352	NC_017582	ATTG	2	8	1434581	1434588	25 %	50 %	25 %	0 %	414564341
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30354	NC_017582	GCAAT	2	10	1434608	1434617	40 %	20 %	20 %	20 %	414564341
30355	NC_017582	GCA	2	6	1434647	1434652	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414564341
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30370	NC_017582	GA	3	6	1435712	1435717	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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30479	NC_017582	TCT	2	6	1441619	1441624	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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