MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus equi subsp. zooepidemicus ATCC 35246 chromosome

Total Repeats: 45695

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13501	NC_017582	CT	3	6	637430	637435	0 %	50 %	0 %	50 %	414563581
13502	NC_017582	GCA	2	6	637503	637508	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414563581
13503	NC_017582	CAT	2	6	637565	637570	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414563581
13504	NC_017582	TAA	2	6	637577	637582	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414563581
13505	NC_017582	GGA	2	6	637631	637636	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	414563581
13506	NC_017582	TGC	2	6	637646	637651	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414563581
13507	NC_017582	ATT	2	6	637653	637658	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414563581
13508	NC_017582	GAA	2	6	637695	637700	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414563581
13509	NC_017582	GAG	2	6	637773	637778	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	414563581
13510	NC_017582	CAGA	2	8	637941	637948	50 %	0 %	25 %	25 %	414563581
13511	NC_017582	GCT	2	6	637965	637970	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414563581
13512	NC_017582	CA	3	6	638041	638046	50 %	0 %	0 %	50 %	414563581
13513	NC_017582	TGT	2	6	638114	638119	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414563581
13514	NC_017582	TTGA	2	8	638178	638185	25 %	50 %	25 %	0 %	414563581
13515	NC_017582	TGG	2	6	638201	638206	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	414563581
13516	NC_017582	TCA	2	6	638277	638282	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414563581
13517	NC_017582	ATG	2	6	638313	638318	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414563581
13518	NC_017582	A	6	6	638376	638381	100 %	0 %	0 %	0 %	414563581
13519	NC_017582	ATA	2	6	638470	638475	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414563581
13520	NC_017582	GGC	2	6	638562	638567	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	414563581
13521	NC_017582	TAAG	2	8	638635	638642	50 %	25 %	25 %	0 %	414563581
13522	NC_017582	GCT	2	6	638679	638684	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414563581
13523	NC_017582	ATT	2	6	638697	638702	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414563581
13524	NC_017582	GGT	2	6	638720	638725	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	414563581
13525	NC_017582	AGG	2	6	638765	638770	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	414563581
13526	NC_017582	TGT	2	6	638858	638863	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414563581
13527	NC_017582	TTGCTG	2	12	638893	638904	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	414563581
13528	NC_017582	CT	3	6	638927	638932	0 %	50 %	0 %	50 %	414563581
13529	NC_017582	AATT	2	8	639039	639046	50 %	50 %	0 %	0 %	414563582
13530	NC_017582	TGA	2	6	639121	639126	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414563582
13531	NC_017582	AGC	2	6	639157	639162	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414563582
13532	NC_017582	GAT	3	9	639206	639214	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414563582
13533	NC_017582	GTT	2	6	639263	639268	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414563582
13534	NC_017582	A	6	6	639297	639302	100 %	0 %	0 %	0 %	414563582
13535	NC_017582	TGC	2	6	639330	639335	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414563582
13536	NC_017582	TTG	2	6	639432	639437	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414563582
13537	NC_017582	CAG	2	6	639450	639455	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414563582
13538	NC_017582	CTG	2	6	639498	639503	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414563582
13539	NC_017582	TGA	2	6	639562	639567	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414563582
13540	NC_017582	ATT	2	6	639716	639721	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13541	NC_017582	AGC	2	6	639736	639741	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13542	NC_017582	CTTT	2	8	639824	639831	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
13543	NC_017582	TGT	2	6	639857	639862	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13544	NC_017582	AAGC	2	8	639888	639895	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
13545	NC_017582	GAT	2	6	639913	639918	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13546	NC_017582	AAAC	2	8	639953	639960	75 %	0 %	0 %	25 %	414563583
13547	NC_017582	TAT	2	6	639969	639974	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414563583
13548	NC_017582	TGA	2	6	640026	640031	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414563583
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13550	NC_017582	CCAG	2	8	640113	640120	25 %	0 %	25 %	50 %	414563583
13551	NC_017582	TGA	2	6	640140	640145	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414563583
13552	NC_017582	CAG	2	6	640169	640174	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414563583
13553	NC_017582	GAG	2	6	640196	640201	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	414563583
13554	NC_017582	TGT	2	6	640207	640212	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414563583
13555	NC_017582	TCA	2	6	640307	640312	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414563583
13556	NC_017582	CCA	2	6	640335	640340	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	414563583
13557	NC_017582	ATC	2	6	640477	640482	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414563583
13558	NC_017582	AGG	2	6	640509	640514	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	414563583
13559	NC_017582	TGCG	2	8	640518	640525	0 %	25 %	50 %	25 %	414563583
13560	NC_017582	AG	3	6	640586	640591	50 %	0 %	50 %	0 %	414563583
13561	NC_017582	GCT	2	6	640603	640608	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414563583
13562	NC_017582	GGT	2	6	640645	640650	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	414563583
13563	NC_017582	AT	3	6	640684	640689	50 %	50 %	0 %	0 %	414563583
13564	NC_017582	CGG	2	6	640716	640721	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	414563583
13565	NC_017582	TTC	2	6	640811	640816	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	414563583
13566	NC_017582	GAG	2	6	640934	640939	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	414563583
13567	NC_017582	CTAT	2	8	641116	641123	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
13568	NC_017582	AGAA	2	8	641155	641162	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
13569	NC_017582	TATAA	2	10	641182	641191	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
13570	NC_017582	GTT	2	6	641262	641267	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414563584
13571	NC_017582	GAC	2	6	641295	641300	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414563584
13572	NC_017582	T	7	7	641353	641359	0 %	100 %	0 %	0 %	414563584
13573	NC_017582	TA	3	6	641460	641465	50 %	50 %	0 %	0 %	414563584
13574	NC_017582	TAT	2	6	641508	641513	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414563584
13575	NC_017582	TAA	2	6	641636	641641	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414563584
13576	NC_017582	GCT	2	6	641735	641740	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414563584
13577	NC_017582	CT	3	6	641739	641744	0 %	50 %	0 %	50 %	414563584
13578	NC_017582	AGA	2	6	641818	641823	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414563584
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13580	NC_017582	ATCCT	2	10	641890	641899	20 %	40 %	0 %	40 %	414563584
13581	NC_017582	ATC	2	6	641944	641949	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414563584
13582	NC_017582	TGG	2	6	641956	641961	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	414563584
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13585	NC_017582	ACCGA	2	10	642151	642160	40 %	0 %	20 %	40 %	414563584
13586	NC_017582	GGC	2	6	642170	642175	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	414563584
13587	NC_017582	TGC	2	6	642248	642253	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414563584
13588	NC_017582	A	7	7	642276	642282	100 %	0 %	0 %	0 %	414563584
13589	NC_017582	GAT	2	6	642341	642346	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414563584
13590	NC_017582	TGA	2	6	642392	642397	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414563584
13591	NC_017582	AGCT	2	8	642415	642422	25 %	25 %	25 %	25 %	414563584
13592	NC_017582	CTT	2	6	642452	642457	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	414563584
13593	NC_017582	AAT	2	6	642465	642470	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414563584
13594	NC_017582	TGC	2	6	642535	642540	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414563584
13595	NC_017582	TGC	2	6	642559	642564	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414563584
13596	NC_017582	CTC	2	6	642592	642597	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	414563584
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13598	NC_017582	A	6	6	642629	642634	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13599	NC_017582	ATTAAG	2	12	642658	642669	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
13600	NC_017582	A	6	6	642678	642683	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13601	NC_017582	T	7	7	642706	642712	0 %	100 %	0 %	0 %	414563585
13602	NC_017582	TAT	2	6	642759	642764	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414563585
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13604	NC_017582	AGC	2	6	642981	642986	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414563585
13605	NC_017582	TGG	2	6	643006	643011	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	414563585
13606	NC_017582	CTT	2	6	643015	643020	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	414563585
13607	NC_017582	CTG	2	6	643124	643129	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414563585
13608	NC_017582	CAA	2	6	643218	643223	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414563585
13609	NC_017582	ATT	2	6	643256	643261	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414563585
13610	NC_017582	GACT	2	8	643305	643312	25 %	25 %	25 %	25 %	414563585
13611	NC_017582	TTAA	2	8	643316	643323	50 %	50 %	0 %	0 %	414563585
13612	NC_017582	TAGAGC	2	12	643368	643379	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	414563585
13613	NC_017582	AAAG	2	8	643385	643392	75 %	0 %	25 %	0 %	414563585
13614	NC_017582	TAA	2	6	643426	643431	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13615	NC_017582	GCT	2	6	643436	643441	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13616	NC_017582	AGC	2	6	643444	643449	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13617	NC_017582	TATCA	2	10	643456	643465	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
13618	NC_017582	A	6	6	643556	643561	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13619	NC_017582	AGA	2	6	643575	643580	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414563586
13620	NC_017582	AAC	2	6	643632	643637	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414563586
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13990	NC_017582	GTCATG	2	12	661546	661557	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
13991	NC_017582	GAT	2	6	661570	661575	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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13995	NC_017582	TA	3	6	661656	661661	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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