MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus equi subsp. zooepidemicus ATCC 35246 chromosome

Total Repeats: 45695

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_017582	TGCT	2	8	235997	236004	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5002	NC_017582	GCT	2	6	236033	236038	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5003	NC_017582	GGCT	2	8	236059	236066	0 %	25 %	50 %	25 %	414563175
5004	NC_017582	ACCT	2	8	236068	236075	25 %	25 %	0 %	50 %	414563175
5005	NC_017582	AGAC	2	8	236159	236166	50 %	0 %	25 %	25 %	414563175
5006	NC_017582	GGA	2	6	236201	236206	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5007	NC_017582	TGG	2	6	236394	236399	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	414563176
5008	NC_017582	CAG	3	9	236440	236448	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414563176
5009	NC_017582	GTT	2	6	236467	236472	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414563176
5010	NC_017582	TCA	2	6	236475	236480	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414563176
5011	NC_017582	CAG	2	6	236524	236529	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414563176
5012	NC_017582	GCA	2	6	236622	236627	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414563176
5013	NC_017582	GTG	2	6	236660	236665	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	414563176
5014	NC_017582	ATG	2	6	236672	236677	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414563176
5015	NC_017582	TGC	2	6	236790	236795	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414563177
5016	NC_017582	A	6	6	236797	236802	100 %	0 %	0 %	0 %	414563177
5017	NC_017582	GTG	2	6	236841	236846	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	414563177
5018	NC_017582	CAG	2	6	236881	236886	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414563177
5019	NC_017582	TTG	2	6	236901	236906	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414563177
5020	NC_017582	GTCT	2	8	236929	236936	0 %	50 %	25 %	25 %	414563177
5021	NC_017582	CA	3	6	236963	236968	50 %	0 %	0 %	50 %	414563177
5022	NC_017582	GTCA	2	8	236971	236978	25 %	25 %	25 %	25 %	414563177
5023	NC_017582	TGGT	2	8	237024	237031	0 %	50 %	50 %	0 %	414563177
5024	NC_017582	CA	3	6	237073	237078	50 %	0 %	0 %	50 %	414563177
5025	NC_017582	ATG	2	6	237090	237095	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414563177
5026	NC_017582	AGCT	2	8	237105	237112	25 %	25 %	25 %	25 %	414563177
5027	NC_017582	CTT	2	6	237187	237192	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	414563177
5028	NC_017582	GCTCA	2	10	237204	237213	20 %	20 %	20 %	40 %	414563177
5029	NC_017582	T	6	6	237269	237274	0 %	100 %	0 %	0 %	414563177
5030	NC_017582	CTG	2	6	237302	237307	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414563177
5031	NC_017582	A	7	7	237329	237335	100 %	0 %	0 %	0 %	414563177
5032	NC_017582	ATA	2	6	237366	237371	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414563177
5033	NC_017582	TGG	2	6	237378	237383	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	414563177
5034	NC_017582	TTG	2	6	237639	237644	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5035	NC_017582	CT	3	6	237645	237650	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5036	NC_017582	TCTGC	2	10	237678	237687	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
5037	NC_017582	TGC	2	6	237710	237715	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5038	NC_017582	GCA	2	6	237824	237829	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5039	NC_017582	GCT	2	6	237844	237849	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5040	NC_017582	TCA	2	6	237919	237924	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5041	NC_017582	TGA	2	6	237981	237986	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5042	NC_017582	CTT	2	6	238227	238232	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5043	NC_017582	TCA	2	6	238356	238361	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414563178
5044	NC_017582	TAT	2	6	238374	238379	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414563178
5045	NC_017582	GTCA	2	8	238499	238506	25 %	25 %	25 %	25 %	414563178
5046	NC_017582	CAA	2	6	238525	238530	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414563178
5047	NC_017582	ATT	2	6	238542	238547	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414563178
5048	NC_017582	AAGGC	2	10	238553	238562	40 %	0 %	40 %	20 %	414563178
5049	NC_017582	GAG	3	9	238582	238590	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	414563178
5050	NC_017582	GCA	2	6	238594	238599	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414563178
5051	NC_017582	GAGCGT	2	12	238600	238611	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	414563178
5052	NC_017582	CAG	2	6	238664	238669	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414563178
5053	NC_017582	GGC	2	6	238677	238682	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	414563178
5054	NC_017582	GACA	2	8	238761	238768	50 %	0 %	25 %	25 %	414563178
5055	NC_017582	GGT	2	6	238807	238812	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	414563178
5056	NC_017582	A	6	6	238828	238833	100 %	0 %	0 %	0 %	414563178
5057	NC_017582	TGT	2	6	238860	238865	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414563178
5058	NC_017582	TGA	2	6	238869	238874	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414563178
5059	NC_017582	A	6	6	239071	239076	100 %	0 %	0 %	0 %	414563178
5060	NC_017582	ATTG	2	8	239163	239170	25 %	50 %	25 %	0 %	414563178
5061	NC_017582	TGA	2	6	239178	239183	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414563178
5062	NC_017582	GTC	2	6	239186	239191	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414563178
5063	NC_017582	CAG	2	6	239204	239209	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414563178
5064	NC_017582	A	7	7	239221	239227	100 %	0 %	0 %	0 %	414563178
5065	NC_017582	AGC	2	6	239304	239309	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414563178
5066	NC_017582	CTG	2	6	239369	239374	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414563178
5067	NC_017582	ATTT	2	8	239396	239403	25 %	75 %	0 %	0 %	414563178
5068	NC_017582	AAAAGA	2	12	239430	239441	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	414563178
5069	NC_017582	CCT	2	6	239655	239660	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	414563178
5070	NC_017582	TAG	2	6	239717	239722	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5071	NC_017582	GAT	2	6	239739	239744	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5072	NC_017582	ATAA	2	8	239746	239753	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5073	NC_017582	CAT	2	6	239754	239759	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5074	NC_017582	T	6	6	239800	239805	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5075	NC_017582	ACG	2	6	239825	239830	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5076	NC_017582	TAG	2	6	239833	239838	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5077	NC_017582	CAG	2	6	239861	239866	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5078	NC_017582	TGA	2	6	239885	239890	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5079	NC_017582	AT	3	6	239898	239903	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5080	NC_017582	AAAT	2	8	239909	239916	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5081	NC_017582	ATT	2	6	239942	239947	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5082	NC_017582	TAAGG	2	10	239972	239981	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
5083	NC_017582	TA	3	6	240075	240080	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5084	NC_017582	A	6	6	240080	240085	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5085	NC_017582	ATA	2	6	240091	240096	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5086	NC_017582	GT	3	6	240111	240116	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5087	NC_017582	ATA	2	6	240121	240126	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5088	NC_017582	AGG	2	6	240136	240141	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5089	NC_017582	TAT	2	6	240158	240163	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414563179
5090	NC_017582	TTA	2	6	240170	240175	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414563179
5091	NC_017582	TGA	2	6	240183	240188	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414563179
5092	NC_017582	TAT	2	6	240191	240196	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414563179
5093	NC_017582	T	6	6	240213	240218	0 %	100 %	0 %	0 %	414563179
5094	NC_017582	GCA	2	6	240269	240274	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414563179
5095	NC_017582	CT	3	6	240276	240281	0 %	50 %	0 %	50 %	414563179
5096	NC_017582	GCC	2	6	240304	240309	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	414563179
5097	NC_017582	TGC	2	6	240330	240335	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414563179
5098	NC_017582	TTG	2	6	240411	240416	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414563179
5099	NC_017582	T	6	6	240459	240464	0 %	100 %	0 %	0 %	414563179
5100	NC_017582	TGA	2	6	240516	240521	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414563179
5101	NC_017582	ATTA	2	8	240542	240549	50 %	50 %	0 %	0 %	414563179
5102	NC_017582	CAG	2	6	240604	240609	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414563179
5103	NC_017582	CTA	2	6	240643	240648	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414563179
5104	NC_017582	ATTT	2	8	240654	240661	25 %	75 %	0 %	0 %	414563179
5105	NC_017582	GAT	3	9	240706	240714	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414563179
5106	NC_017582	CTTTA	2	10	240745	240754	20 %	60 %	0 %	20 %	414563179
5107	NC_017582	TTG	2	6	240755	240760	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414563179
5108	NC_017582	ATTT	2	8	240761	240768	25 %	75 %	0 %	0 %	414563179
5109	NC_017582	ATC	2	6	240783	240788	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414563179
5110	NC_017582	AGC	2	6	240825	240830	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414563179
5111	NC_017582	ATT	2	6	241008	241013	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414563179
5112	NC_017582	ATC	2	6	241081	241086	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414563179
5113	NC_017582	TGC	2	6	241179	241184	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414563179
5114	NC_017582	T	6	6	241194	241199	0 %	100 %	0 %	0 %	414563179
5115	NC_017582	GCT	2	6	241217	241222	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414563179
5116	NC_017582	CAG	2	6	241239	241244	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414563179
5117	NC_017582	CAG	2	6	241274	241279	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414563179
5118	NC_017582	TAA	2	6	241324	241329	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414563179
5119	NC_017582	AGAGT	2	10	241486	241495	40 %	20 %	40 %	0 %	414563179
5120	NC_017582	AGCT	2	8	241580	241587	25 %	25 %	25 %	25 %	414563180
5121	NC_017582	TGGT	2	8	241604	241611	0 %	50 %	50 %	0 %	414563180
5122	NC_017582	TGT	2	6	241620	241625	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414563180
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5124	NC_017582	TTG	2	6	241673	241678	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414563180
5125	NC_017582	TTG	2	6	241751	241756	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414563180
5126	NC_017582	GCT	2	6	241758	241763	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414563180
5127	NC_017582	TAT	2	6	241770	241775	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414563180
5128	NC_017582	TCA	2	6	241815	241820	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414563180
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5130	NC_017582	TGA	2	6	241844	241849	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414563180
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5152	NC_017582	TGCAAC	2	12	243291	243302	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	414563181
5153	NC_017582	TGT	2	6	243432	243437	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414563181
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5163	NC_017582	T	6	6	243914	243919	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5164	NC_017582	TTA	2	6	243952	243957	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5165	NC_017582	TAA	2	6	244008	244013	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5250	NC_017582	GAA	2	6	248063	248068	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414563187
5251	NC_017582	CAG	2	6	248078	248083	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414563187
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5254	NC_017582	GATA	2	8	248361	248368	50 %	25 %	25 %	0 %	414563187
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5262	NC_017582	ATC	2	6	248731	248736	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414563188
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5369	NC_017582	ACAT	2	8	253043	253050	50 %	25 %	0 %	25 %	414563193
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