MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Staphylococcus pseudintermedius ED99 chromosome

Total Repeats: 55398

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_017568	TA	3	6	22548	22553	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
502	NC_017568	TAA	2	6	22642	22647	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
503	NC_017568	T	6	6	22733	22738	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
504	NC_017568	ATG	2	6	22750	22755	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
505	NC_017568	TCA	2	6	22811	22816	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386318047
506	NC_017568	GTA	2	6	22820	22825	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386318047
507	NC_017568	AAGGTA	2	12	22848	22859	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	386318047
508	NC_017568	TGG	2	6	22909	22914	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386318047
509	NC_017568	TAA	2	6	22915	22920	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386318047
510	NC_017568	T	6	6	22983	22988	0 %	100 %	0 %	0 %	386318047
511	NC_017568	TGAT	2	8	23025	23032	25 %	50 %	25 %	0 %	386318047
512	NC_017568	CAA	2	6	23138	23143	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386318047
513	NC_017568	GAA	2	6	23153	23158	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386318047
514	NC_017568	CGT	2	6	23162	23167	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386318047
515	NC_017568	ACA	2	6	23172	23177	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386318047
516	NC_017568	ACG	2	6	23186	23191	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386318047
517	NC_017568	TTA	2	6	23255	23260	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386318047
518	NC_017568	AAG	2	6	23265	23270	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386318047
519	NC_017568	AAC	2	6	23277	23282	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386318047
520	NC_017568	CAT	2	6	23346	23351	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386318047
521	NC_017568	TAT	2	6	23457	23462	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386318047
522	NC_017568	CAA	2	6	23571	23576	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386318047
523	NC_017568	ATT	2	6	23647	23652	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386318047
524	NC_017568	TCA	2	6	23665	23670	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386318047
525	NC_017568	ACA	3	9	23699	23707	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386318047
526	NC_017568	GTC	2	6	23709	23714	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386318047
527	NC_017568	CGT	2	6	23717	23722	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386318047
528	NC_017568	GTG	2	6	23741	23746	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386318047
529	NC_017568	TCG	2	6	23758	23763	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386318047
530	NC_017568	AGA	2	6	23938	23943	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386318047
531	NC_017568	CGTA	2	8	23953	23960	25 %	25 %	25 %	25 %	386318047
532	NC_017568	GAA	2	6	23966	23971	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386318047
533	NC_017568	CGT	2	6	23987	23992	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386318047
534	NC_017568	TCT	2	6	24036	24041	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386318047
535	NC_017568	CAAA	2	8	24062	24069	75 %	0 %	0 %	25 %	386318047
536	NC_017568	TGT	2	6	24070	24075	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386318047
537	NC_017568	TAAAA	2	10	24140	24149	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
538	NC_017568	A	6	6	24146	24151	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
539	NC_017568	TGG	2	6	24168	24173	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
540	NC_017568	T	6	6	24176	24181	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
541	NC_017568	TGT	2	6	24208	24213	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
542	NC_017568	TG	3	6	24227	24232	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
543	NC_017568	ACA	3	9	24265	24273	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
544	NC_017568	TCG	2	6	24383	24388	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386318048
545	NC_017568	CTT	2	6	24417	24422	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386318048
546	NC_017568	TCT	2	6	24458	24463	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386318048
547	NC_017568	CAC	2	6	24498	24503	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386318048
548	NC_017568	CGAGA	2	10	24507	24516	40 %	0 %	40 %	20 %	386318048
549	NC_017568	ATTG	2	8	24517	24524	25 %	50 %	25 %	0 %	386318048
550	NC_017568	TAA	2	6	24552	24557	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386318048
551	NC_017568	TCA	2	6	24575	24580	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386318048
552	NC_017568	ATCA	2	8	24598	24605	50 %	25 %	0 %	25 %	386318048
553	NC_017568	CAA	2	6	24627	24632	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386318048
554	NC_017568	AAT	2	6	24638	24643	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386318048
555	NC_017568	GAA	2	6	24685	24690	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386318048
556	NC_017568	TAA	2	6	24693	24698	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386318048
557	NC_017568	CCA	2	6	24776	24781	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386318048
558	NC_017568	AGA	2	6	24960	24965	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386318048
559	NC_017568	TAA	2	6	25009	25014	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386318048
560	NC_017568	AAT	2	6	25024	25029	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386318048
561	NC_017568	TAA	2	6	25116	25121	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386318048
562	NC_017568	AAC	2	6	25217	25222	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
563	NC_017568	A	7	7	25242	25248	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
564	NC_017568	A	7	7	25253	25259	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
565	NC_017568	CGG	2	6	25347	25352	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
566	NC_017568	GCCT	2	8	25417	25424	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
567	NC_017568	T	6	6	25494	25499	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
568	NC_017568	TGA	2	6	25528	25533	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
569	NC_017568	GTT	2	6	25543	25548	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
570	NC_017568	GT	3	6	25622	25627	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
571	NC_017568	AGG	2	6	25630	25635	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
572	NC_017568	TAT	2	6	25655	25660	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
573	NC_017568	ATT	2	6	25673	25678	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
574	NC_017568	TGG	2	6	25697	25702	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
575	NC_017568	T	6	6	25759	25764	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
576	NC_017568	GAAT	2	8	25777	25784	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
577	NC_017568	GC	3	6	25820	25825	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
578	NC_017568	T	6	6	25833	25838	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
579	NC_017568	AGTG	2	8	25842	25849	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
580	NC_017568	GTTT	2	8	25855	25862	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
581	NC_017568	GTT	2	6	25919	25924	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386318049
582	NC_017568	TTCTTA	2	12	25927	25938	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	386318049
583	NC_017568	TAT	2	6	26102	26107	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386318049
584	NC_017568	TTG	2	6	26197	26202	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386318049
585	NC_017568	ATAG	2	8	26291	26298	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
586	NC_017568	TTA	2	6	26368	26373	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
587	NC_017568	AGT	2	6	26403	26408	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386318050
588	NC_017568	GAT	2	6	26416	26421	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386318050
589	NC_017568	AT	3	6	26438	26443	50 %	50 %	0 %	0 %	386318050
590	NC_017568	AATTT	2	10	26447	26456	40 %	60 %	0 %	0 %	386318050
591	NC_017568	A	6	6	26458	26463	100 %	0 %	0 %	0 %	386318050
592	NC_017568	ATG	2	6	26489	26494	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386318050
593	NC_017568	A	6	6	26599	26604	100 %	0 %	0 %	0 %	386318050
594	NC_017568	ATT	2	6	26617	26622	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386318050
595	NC_017568	AATT	2	8	26714	26721	50 %	50 %	0 %	0 %	386318050
596	NC_017568	CGC	2	6	26743	26748	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386318050
597	NC_017568	A	6	6	26839	26844	100 %	0 %	0 %	0 %	386318050
598	NC_017568	GTT	2	6	26883	26888	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386318050
599	NC_017568	ATT	2	6	26891	26896	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386318050
600	NC_017568	TGA	2	6	26918	26923	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386318050
601	NC_017568	ATT	2	6	26960	26965	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386318050
602	NC_017568	A	6	6	27011	27016	100 %	0 %	0 %	0 %	386318050
603	NC_017568	GAT	2	6	27022	27027	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386318050
604	NC_017568	CGT	2	6	27055	27060	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386318050
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606	NC_017568	ATT	3	9	27169	27177	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386318051
607	NC_017568	ATT	2	6	27187	27192	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386318051
608	NC_017568	A	6	6	27287	27292	100 %	0 %	0 %	0 %	386318051
609	NC_017568	AATGA	2	10	27367	27376	60 %	20 %	20 %	0 %	386318051
610	NC_017568	ATT	2	6	27409	27414	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386318051
611	NC_017568	ATT	2	6	27442	27447	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386318051
612	NC_017568	AGC	2	6	27539	27544	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386318051
613	NC_017568	ATT	2	6	27685	27690	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386318051
614	NC_017568	AAC	2	6	27841	27846	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386318051
615	NC_017568	AAG	2	6	27863	27868	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386318051
616	NC_017568	GCG	2	6	27894	27899	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386318051
617	NC_017568	TAT	2	6	27966	27971	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386318051
618	NC_017568	GAA	2	6	28069	28074	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386318051
619	NC_017568	AAT	2	6	28084	28089	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386318051
620	NC_017568	TAT	2	6	28125	28130	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386318051
621	NC_017568	TAC	2	6	28193	28198	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386318051
622	NC_017568	ATG	2	6	28199	28204	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386318051
623	NC_017568	CAA	3	9	28213	28221	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386318051
624	NC_017568	TGA	2	6	28329	28334	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386318051
625	NC_017568	CTC	2	6	28343	28348	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386318051
626	NC_017568	GAT	2	6	28383	28388	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386318051
627	NC_017568	TCGTC	2	10	28389	28398	0 %	40 %	20 %	40 %	386318051
628	NC_017568	GAAACG	2	12	28432	28443	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	386318051
629	NC_017568	TTG	2	6	28457	28462	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386318051
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631	NC_017568	ATT	2	6	28486	28491	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386318051
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633	NC_017568	GA	4	8	28542	28549	50 %	0 %	50 %	0 %	386318051
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