MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Staphylococcus pseudintermedius ED99 chromosome

Total Repeats: 55398

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_017568	AT	3	6	254099	254104	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5502	NC_017568	ACT	2	6	254201	254206	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386318240
5503	NC_017568	CGA	2	6	254215	254220	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386318240
5504	NC_017568	GCA	2	6	254232	254237	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386318240
5505	NC_017568	CAT	2	6	254248	254253	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386318240
5506	NC_017568	GTT	2	6	254345	254350	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386318240
5507	NC_017568	ATC	2	6	254427	254432	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386318240
5508	NC_017568	CAA	2	6	254485	254490	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386318240
5509	NC_017568	TAA	2	6	254495	254500	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386318240
5510	NC_017568	AC	3	6	254798	254803	50 %	0 %	0 %	50 %	386318240
5511	NC_017568	ATG	2	6	254808	254813	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386318240
5512	NC_017568	TA	3	6	254878	254883	50 %	50 %	0 %	0 %	386318240
5513	NC_017568	ATAA	2	8	254889	254896	75 %	25 %	0 %	0 %	386318240
5514	NC_017568	TA	3	6	254929	254934	50 %	50 %	0 %	0 %	386318240
5515	NC_017568	ACG	2	6	254954	254959	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386318240
5516	NC_017568	CAATA	2	10	254978	254987	60 %	20 %	0 %	20 %	386318240
5517	NC_017568	CAC	2	6	255010	255015	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386318240
5518	NC_017568	TAA	2	6	255029	255034	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386318240
5519	NC_017568	TAA	2	6	255098	255103	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386318240
5520	NC_017568	A	6	6	255145	255150	100 %	0 %	0 %	0 %	386318240
5521	NC_017568	TCCAG	2	10	255219	255228	20 %	20 %	20 %	40 %	386318240
5522	NC_017568	ATC	2	6	255300	255305	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386318240
5523	NC_017568	TC	3	6	255351	255356	0 %	50 %	0 %	50 %	386318240
5524	NC_017568	TCC	2	6	255365	255370	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5525	NC_017568	TAT	2	6	255390	255395	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5526	NC_017568	TA	3	6	255428	255433	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5527	NC_017568	AATT	2	8	255441	255448	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5528	NC_017568	ATA	2	6	255449	255454	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5529	NC_017568	A	6	6	255477	255482	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5530	NC_017568	TGTT	2	8	255499	255506	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
5531	NC_017568	TTA	2	6	255532	255537	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5532	NC_017568	GTA	2	6	255561	255566	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5533	NC_017568	A	6	6	255598	255603	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5534	NC_017568	TGT	2	6	255671	255676	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5535	NC_017568	GAT	2	6	255698	255703	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5536	NC_017568	TAA	2	6	255756	255761	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5537	NC_017568	A	7	7	255851	255857	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5538	NC_017568	AAG	2	6	255861	255866	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5539	NC_017568	CAA	2	6	255883	255888	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386318241
5540	NC_017568	TTTGGC	2	12	255913	255924	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	386318241
5541	NC_017568	TAGT	2	8	255953	255960	25 %	50 %	25 %	0 %	386318241
5542	NC_017568	T	6	6	256024	256029	0 %	100 %	0 %	0 %	386318241
5543	NC_017568	ACA	2	6	256082	256087	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386318241
5544	NC_017568	CA	3	6	256086	256091	50 %	0 %	0 %	50 %	386318241
5545	NC_017568	TTA	2	6	256136	256141	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386318241
5546	NC_017568	CGT	2	6	256146	256151	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386318241
5547	NC_017568	TAT	2	6	256160	256165	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386318241
5548	NC_017568	GAT	2	6	256245	256250	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386318241
5549	NC_017568	T	7	7	256329	256335	0 %	100 %	0 %	0 %	386318241
5550	NC_017568	TGTAG	2	10	256438	256447	20 %	40 %	40 %	0 %	386318241
5551	NC_017568	AGA	2	6	256488	256493	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386318241
5552	NC_017568	AAG	2	6	256511	256516	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386318241
5553	NC_017568	ATG	2	6	256579	256584	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386318241
5554	NC_017568	ATTTA	2	10	256599	256608	40 %	60 %	0 %	0 %	386318241
5555	NC_017568	ATC	2	6	256633	256638	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386318241
5556	NC_017568	T	7	7	256672	256678	0 %	100 %	0 %	0 %	386318241
5557	NC_017568	ATT	2	6	256716	256721	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386318241
5558	NC_017568	GTCG	2	8	256747	256754	0 %	25 %	50 %	25 %	386318241
5559	NC_017568	GGTT	2	8	256819	256826	0 %	50 %	50 %	0 %	386318241
5560	NC_017568	ATC	2	6	256852	256857	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386318241
5561	NC_017568	GAT	2	6	256863	256868	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386318241
5562	NC_017568	CGATTG	2	12	256907	256918	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	386318241
5563	NC_017568	TGAT	2	8	256925	256932	25 %	50 %	25 %	0 %	386318241
5564	NC_017568	GTGAA	2	10	256937	256946	40 %	20 %	40 %	0 %	386318241
5565	NC_017568	ATT	2	6	256969	256974	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386318241
5566	NC_017568	GGATTA	2	12	257032	257043	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386318241
5567	NC_017568	TAT	2	6	257124	257129	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386318241
5568	NC_017568	TCA	2	6	257138	257143	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386318241
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5570	NC_017568	ATT	2	6	257183	257188	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386318241
5571	NC_017568	AAC	2	6	257231	257236	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386318241
5572	NC_017568	GAG	2	6	257269	257274	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5573	NC_017568	T	6	6	257279	257284	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5574	NC_017568	AATTT	2	10	257289	257298	40 %	60 %	0 %	0 %	386318242
5575	NC_017568	ACA	2	6	257317	257322	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386318242
5576	NC_017568	CAC	2	6	257399	257404	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386318242
5577	NC_017568	TCA	2	6	257480	257485	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386318242
5578	NC_017568	ATC	2	6	257501	257506	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386318242
5579	NC_017568	TTA	2	6	257617	257622	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386318242
5580	NC_017568	GTG	2	6	257691	257696	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386318242
5581	NC_017568	CGCA	2	8	257745	257752	25 %	0 %	25 %	50 %	386318242
5582	NC_017568	TTG	2	6	257892	257897	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386318242
5583	NC_017568	GAA	2	6	257987	257992	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386318242
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5585	NC_017568	CCAC	2	8	258256	258263	25 %	0 %	0 %	75 %	386318242
5586	NC_017568	GAA	2	6	258284	258289	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386318242
5587	NC_017568	TCA	2	6	258294	258299	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386318242
5588	NC_017568	A	6	6	258317	258322	100 %	0 %	0 %	0 %	386318242
5589	NC_017568	TGA	2	6	258405	258410	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386318242
5590	NC_017568	TGGTG	2	10	258433	258442	0 %	40 %	60 %	0 %	386318242
5591	NC_017568	GAT	2	6	258488	258493	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386318242
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5594	NC_017568	GAAT	2	8	258583	258590	50 %	25 %	25 %	0 %	386318242
5595	NC_017568	CAT	2	6	258689	258694	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386318242
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5597	NC_017568	GTTT	2	8	258787	258794	0 %	75 %	25 %	0 %	386318242
5598	NC_017568	TTA	2	6	259039	259044	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386318242
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5601	NC_017568	AT	3	6	259297	259302	50 %	50 %	0 %	0 %	386318242
5602	NC_017568	GTC	2	6	259358	259363	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386318242
5603	NC_017568	TA	3	6	259469	259474	50 %	50 %	0 %	0 %	386318242
5604	NC_017568	ACA	2	6	259498	259503	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386318242
5605	NC_017568	TCA	2	6	259510	259515	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386318242
5606	NC_017568	GACA	2	8	259567	259574	50 %	0 %	25 %	25 %	386318242
5607	NC_017568	ATTCAA	2	12	259580	259591	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	386318242
5608	NC_017568	CAA	3	9	259652	259660	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386318242
5609	NC_017568	TGG	2	6	259695	259700	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386318242
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5611	NC_017568	AAG	2	6	259902	259907	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386318242
5612	NC_017568	TTAT	2	8	259912	259919	25 %	75 %	0 %	0 %	386318242
5613	NC_017568	GC	3	6	259980	259985	0 %	0 %	50 %	50 %	386318242
5614	NC_017568	ATG	2	6	260013	260018	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386318242
5615	NC_017568	CGATG	2	10	260080	260089	20 %	20 %	40 %	20 %	386318242
5616	NC_017568	ATG	3	9	260106	260114	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386318242
5617	NC_017568	AGA	2	6	260119	260124	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386318242
5618	NC_017568	TAC	2	6	260214	260219	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386318242
5619	NC_017568	A	6	6	260280	260285	100 %	0 %	0 %	0 %	386318242
5620	NC_017568	CTCC	2	8	260311	260318	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
5621	NC_017568	A	6	6	260332	260337	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5622	NC_017568	GGAG	2	8	260348	260355	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
5623	NC_017568	TTA	2	6	260381	260386	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5624	NC_017568	T	6	6	260413	260418	0 %	100 %	0 %	0 %	386318243
5625	NC_017568	TCA	2	6	260447	260452	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386318243
5626	NC_017568	TCA	2	6	260495	260500	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386318243
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5628	NC_017568	GTC	2	6	260591	260596	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386318243
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5646	NC_017568	A	6	6	261458	261463	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5668	NC_017568	AT	3	6	262489	262494	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5997	NC_017568	TAAA	2	8	278163	278170	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5998	NC_017568	GTT	2	6	278220	278225	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5999	NC_017568	TA	4	8	278233	278240	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6000	NC_017568	AATTT	2	10	278284	278293	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding

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