MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Staphylococcus pseudintermedius ED99 chromosome

Total Repeats: 55398

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017568	TG	3	6	31	36	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017568	GTG	2	6	42	47	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017568	AT	3	6	93	98	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017568	ATT	2	6	157	162	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017568	ACT	2	6	296	301	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386318030
6	NC_017568	ACA	2	6	329	334	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386318030
7	NC_017568	TGA	2	6	352	357	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386318030
8	NC_017568	GCA	2	6	371	376	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386318030
9	NC_017568	TAC	2	6	400	405	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386318030
10	NC_017568	CAA	2	6	449	454	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386318030
11	NC_017568	TCATC	2	10	515	524	20 %	40 %	0 %	40 %	386318030
12	NC_017568	ACAA	2	8	578	585	75 %	0 %	0 %	25 %	386318030
13	NC_017568	TGG	2	6	691	696	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386318030
14	NC_017568	AAT	2	6	752	757	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386318030
15	NC_017568	ACGA	2	8	797	804	50 %	0 %	25 %	25 %	386318030
16	NC_017568	ATTC	2	8	805	812	25 %	50 %	0 %	25 %	386318030
17	NC_017568	ATTG	2	8	874	881	25 %	50 %	25 %	0 %	386318030
18	NC_017568	AGAA	2	8	903	910	75 %	0 %	25 %	0 %	386318030
19	NC_017568	AAG	2	6	918	923	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386318030
20	NC_017568	AAG	2	6	959	964	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386318030
21	NC_017568	CGCC	2	8	986	993	0 %	0 %	25 %	75 %	386318030
22	NC_017568	AGA	2	6	1012	1017	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386318030
23	NC_017568	ACC	2	6	1063	1068	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386318030
24	NC_017568	A	7	7	1100	1106	100 %	0 %	0 %	0 %	386318030
25	NC_017568	GAA	3	9	1109	1117	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386318030
26	NC_017568	ATT	2	6	1274	1279	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386318030
27	NC_017568	ACTAAA	2	12	1286	1297	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	386318030
28	NC_017568	A	7	7	1295	1301	100 %	0 %	0 %	0 %	386318030
29	NC_017568	GCGT	2	8	1344	1351	0 %	25 %	50 %	25 %	386318030
30	NC_017568	AAGAA	2	10	1370	1379	80 %	0 %	20 %	0 %	386318030
31	NC_017568	GAA	2	6	1460	1465	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386318030
32	NC_017568	TGG	2	6	1468	1473	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386318030
33	NC_017568	ACA	2	6	1484	1489	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386318030
34	NC_017568	A	6	6	1514	1519	100 %	0 %	0 %	0 %	386318030
35	NC_017568	T	6	6	1661	1666	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017568	CTATGA	2	12	1692	1703	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_017568	TAA	2	6	1716	1721	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017568	TA	3	6	1729	1734	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017568	GAT	2	6	1756	1761	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386318031
40	NC_017568	ATT	2	6	1782	1787	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386318031
41	NC_017568	CGA	2	6	1869	1874	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386318031
42	NC_017568	ATT	2	6	1955	1960	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386318031
43	NC_017568	CTT	2	6	1999	2004	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386318031
44	NC_017568	ATT	2	6	2012	2017	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386318031
45	NC_017568	AAG	2	6	2034	2039	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386318031
46	NC_017568	CAA	2	6	2049	2054	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386318031
47	NC_017568	ATTA	2	8	2071	2078	50 %	50 %	0 %	0 %	386318031
48	NC_017568	TGA	2	6	2152	2157	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386318031
49	NC_017568	CAT	2	6	2191	2196	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386318031
50	NC_017568	ACA	2	6	2266	2271	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386318031
51	NC_017568	ATT	2	6	2278	2283	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386318031
52	NC_017568	GAA	2	6	2333	2338	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386318031
53	NC_017568	TCA	2	6	2358	2363	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386318031
54	NC_017568	TGAC	2	8	2400	2407	25 %	25 %	25 %	25 %	386318031
55	NC_017568	TTC	2	6	2429	2434	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386318031
56	NC_017568	TAT	2	6	2448	2453	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386318031
57	NC_017568	TTA	2	6	2486	2491	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386318031
58	NC_017568	CGT	2	6	2589	2594	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386318031
59	NC_017568	AAT	2	6	2615	2620	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386318031
60	NC_017568	TCA	2	6	2622	2627	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386318031
61	NC_017568	TCT	2	6	2660	2665	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386318031
62	NC_017568	AGA	2	6	2692	2697	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386318031
63	NC_017568	ATG	2	6	2709	2714	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386318031
64	NC_017568	GGC	2	6	2720	2725	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386318031
65	NC_017568	TTTC	2	8	2736	2743	0 %	75 %	0 %	25 %	386318031
66	NC_017568	AT	3	6	2752	2757	50 %	50 %	0 %	0 %	386318031
67	NC_017568	GATG	2	8	2758	2765	25 %	25 %	50 %	0 %	386318031
68	NC_017568	GAA	2	6	2786	2791	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386318031
69	NC_017568	ATTT	2	8	2824	2831	25 %	75 %	0 %	0 %	386318031
70	NC_017568	GAC	2	6	2846	2851	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386318031
71	NC_017568	CGTA	2	8	2879	2886	25 %	25 %	25 %	25 %	386318031
72	NC_017568	T	6	6	2934	2939	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017568	CCA	2	6	3024	3029	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
74	NC_017568	A	7	7	3064	3070	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017568	ATT	2	6	3111	3116	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017568	TAAT	2	8	3138	3145	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017568	GAAT	2	8	3151	3158	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017568	GGA	2	6	3159	3164	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017568	AAAT	2	8	3184	3191	75 %	25 %	0 %	0 %	386318032
80	NC_017568	TTG	2	6	3207	3212	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386318032
81	NC_017568	T	6	6	3233	3238	0 %	100 %	0 %	0 %	386318032
82	NC_017568	GAA	2	6	3262	3267	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386318032
83	NC_017568	GCA	2	6	3296	3301	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386318032
84	NC_017568	A	6	6	3329	3334	100 %	0 %	0 %	0 %	386318032
85	NC_017568	AT	3	6	3427	3432	50 %	50 %	0 %	0 %	386318032
86	NC_017568	GGA	2	6	3481	3486	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386318032
87	NC_017568	AGC	2	6	3505	3510	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386318032
88	NC_017568	TCA	2	6	3553	3558	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386318032
89	NC_017568	AAC	3	9	3570	3578	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386318032
90	NC_017568	GAT	2	6	3590	3595	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386318032
91	NC_017568	TGAG	2	8	3657	3664	25 %	25 %	50 %	0 %	386318032
92	NC_017568	GC	4	8	3721	3728	0 %	0 %	50 %	50 %	386318032
93	NC_017568	AAG	2	6	3729	3734	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386318032
94	NC_017568	A	6	6	3749	3754	100 %	0 %	0 %	0 %	386318032
95	NC_017568	TAA	2	6	3949	3954	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017568	AT	3	6	3964	3969	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017568	TGA	2	6	3992	3997	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017568	ATT	2	6	4063	4068	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386318033
99	NC_017568	GGC	2	6	4075	4080	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386318033
100	NC_017568	TCT	2	6	4112	4117	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386318033
101	NC_017568	CGT	2	6	4138	4143	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386318033
102	NC_017568	A	6	6	4147	4152	100 %	0 %	0 %	0 %	386318033
103	NC_017568	CAT	2	6	4197	4202	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386318033
104	NC_017568	TTA	2	6	4332	4337	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386318034
105	NC_017568	ACG	2	6	4377	4382	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386318034
106	NC_017568	ATG	2	6	4455	4460	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386318034
107	NC_017568	A	6	6	4482	4487	100 %	0 %	0 %	0 %	386318034
108	NC_017568	A	6	6	4491	4496	100 %	0 %	0 %	0 %	386318034
109	NC_017568	GTC	2	6	4554	4559	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386318034
110	NC_017568	CAC	2	6	4597	4602	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386318034
111	NC_017568	AAC	2	6	4690	4695	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386318034
112	NC_017568	ATT	2	6	4702	4707	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386318034
113	NC_017568	ACG	2	6	4740	4745	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386318034
114	NC_017568	ATC	2	6	4762	4767	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386318034
115	NC_017568	GCA	2	6	4805	4810	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386318034
116	NC_017568	TTGC	2	8	4830	4837	0 %	50 %	25 %	25 %	386318034
117	NC_017568	ATTC	2	8	4845	4852	25 %	50 %	0 %	25 %	386318034
118	NC_017568	AGA	2	6	4910	4915	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386318034
119	NC_017568	CAA	2	6	4944	4949	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386318034
120	NC_017568	AGA	2	6	4955	4960	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386318034
121	NC_017568	CAA	2	6	5079	5084	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386318034
122	NC_017568	TGA	2	6	5165	5170	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386318034
123	NC_017568	GAT	2	6	5187	5192	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386318034
124	NC_017568	AAC	2	6	5368	5373	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386318035
125	NC_017568	GTAT	2	8	5441	5448	25 %	50 %	25 %	0 %	386318035
126	NC_017568	CAT	2	6	5476	5481	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386318035
127	NC_017568	AGT	2	6	5547	5552	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386318035
128	NC_017568	A	6	6	5618	5623	100 %	0 %	0 %	0 %	386318035
129	NC_017568	TGG	2	6	5667	5672	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386318035
130	NC_017568	CGG	3	9	5679	5687	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386318035
131	NC_017568	GGT	2	6	5704	5709	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386318035
132	NC_017568	TCA	2	6	5725	5730	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386318035
133	NC_017568	GTA	2	6	5731	5736	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386318035
134	NC_017568	TCA	3	9	5787	5795	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386318035
135	NC_017568	ACA	2	6	5902	5907	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386318035
136	NC_017568	TAAA	2	8	5957	5964	75 %	25 %	0 %	0 %	386318035
137	NC_017568	GAA	2	6	5998	6003	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386318035
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242	NC_017568	CCT	2	6	11026	11031	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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248	NC_017568	T	7	7	11181	11187	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
249	NC_017568	GAAA	2	8	11314	11321	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
250	NC_017568	TG	3	6	11331	11336	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
251	NC_017568	TGA	2	6	11342	11347	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
252	NC_017568	GGA	2	6	11356	11361	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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257	NC_017568	GTTT	2	8	11545	11552	0 %	75 %	25 %	0 %	386318038
258	NC_017568	TGAT	2	8	11563	11570	25 %	50 %	25 %	0 %	386318038
259	NC_017568	TGA	3	9	11659	11667	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386318038
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263	NC_017568	AAG	2	6	11929	11934	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386318038
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268	NC_017568	GTG	2	6	12505	12510	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386318038
269	NC_017568	GAT	2	6	12512	12517	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386318038
270	NC_017568	GATTC	2	10	12582	12591	20 %	40 %	20 %	20 %	386318038
271	NC_017568	ACG	2	6	12671	12676	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386318038
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273	NC_017568	GAA	2	6	12765	12770	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386318038
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275	NC_017568	TCA	2	6	12812	12817	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386318038
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277	NC_017568	TTGT	2	8	12924	12931	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
278	NC_017568	AGT	2	6	12938	12943	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
279	NC_017568	AG	3	6	12958	12963	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
280	NC_017568	TCTG	2	8	13067	13074	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
281	NC_017568	TG	3	6	13110	13115	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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314	NC_017568	ATT	2	6	14622	14627	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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373	NC_017568	ATA	2	6	17093	17098	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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397	NC_017568	T	6	6	18203	18208	0 %	100 %	0 %	0 %	386318044
398	NC_017568	ATC	2	6	18228	18233	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386318044
399	NC_017568	GCT	2	6	18279	18284	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386318044
400	NC_017568	GAT	2	6	18360	18365	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386318044
401	NC_017568	AAATGA	2	12	18434	18445	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	386318044
402	NC_017568	CAAT	2	8	18508	18515	50 %	25 %	0 %	25 %	386318044
403	NC_017568	GAAA	2	8	18554	18561	75 %	0 %	25 %	0 %	386318044
404	NC_017568	GAA	2	6	18642	18647	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386318044
405	NC_017568	CCA	2	6	18649	18654	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386318044
406	NC_017568	CAA	2	6	18657	18662	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386318044
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410	NC_017568	TCG	2	6	18854	18859	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386318044
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420	NC_017568	GAT	2	6	19368	19373	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386318044
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437	NC_017568	GAA	2	6	19941	19946	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386318044
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439	NC_017568	GCAAC	2	10	20040	20049	40 %	0 %	20 %	40 %	386318044
440	NC_017568	ACA	2	6	20087	20092	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386318044
441	NC_017568	TAAAGG	2	12	20155	20166	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	386318045
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443	NC_017568	A	7	7	20274	20280	100 %	0 %	0 %	0 %	386318045
444	NC_017568	ACAA	2	8	20298	20305	75 %	0 %	0 %	25 %	386318045
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449	NC_017568	T	6	6	20616	20621	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
450	NC_017568	CAT	2	6	20626	20631	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
451	NC_017568	AT	3	6	20684	20689	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
452	NC_017568	TG	3	6	20709	20714	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
453	NC_017568	ATC	2	6	20722	20727	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
454	NC_017568	AAT	2	6	20784	20789	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
455	NC_017568	TCT	2	6	20815	20820	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
456	NC_017568	ATG	2	6	20886	20891	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
457	NC_017568	TTA	2	6	20985	20990	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
458	NC_017568	GAG	2	6	21021	21026	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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497	NC_017568	ATCA	2	8	22466	22473	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
498	NC_017568	AAC	2	6	22503	22508	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
499	NC_017568	GAAAA	2	10	22510	22519	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
500	NC_017568	AAT	2	6	22520	22525	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding

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