MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shewanella putrefaciens 200 chromosome

Total Repeats: 85921

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
17001	NC_017566	TCC	2	6	955827	955832	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17002	NC_017566	T	6	6	955860	955865	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17003	NC_017566	TAA	2	6	955952	955957	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17004	NC_017566	TAC	2	6	956011	956016	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17005	NC_017566	AAT	2	6	956049	956054	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386312642
17006	NC_017566	A	6	6	956089	956094	100 %	0 %	0 %	0 %	386312642
17007	NC_017566	T	6	6	956122	956127	0 %	100 %	0 %	0 %	386312642
17008	NC_017566	AAG	2	6	956216	956221	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386312642
17009	NC_017566	GGT	2	6	956235	956240	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386312642
17010	NC_017566	T	6	6	956281	956286	0 %	100 %	0 %	0 %	386312642
17011	NC_017566	GTG	2	6	956306	956311	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386312642
17012	NC_017566	T	6	6	956467	956472	0 %	100 %	0 %	0 %	386312642
17013	NC_017566	GTG	2	6	956540	956545	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386312642
17014	NC_017566	TAATA	2	10	956550	956559	60 %	40 %	0 %	0 %	386312642
17015	NC_017566	TTG	2	6	956584	956589	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386312642
17016	NC_017566	CTT	2	6	956611	956616	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386312642
17017	NC_017566	ATA	2	6	956640	956645	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386312642
17018	NC_017566	GAG	2	6	956652	956657	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17019	NC_017566	TTA	2	6	956659	956664	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17020	NC_017566	ATCC	2	8	956693	956700	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
17021	NC_017566	TGG	2	6	956752	956757	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17022	NC_017566	ATT	2	6	956776	956781	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17023	NC_017566	TGA	2	6	956795	956800	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17024	NC_017566	ACGT	2	8	956884	956891	25 %	25 %	25 %	25 %	386312643
17025	NC_017566	ACA	2	6	956981	956986	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386312643
17026	NC_017566	CCA	2	6	957016	957021	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386312643
17027	NC_017566	T	6	6	957035	957040	0 %	100 %	0 %	0 %	386312643
17028	NC_017566	TCT	2	6	957097	957102	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386312643
17029	NC_017566	CCT	2	6	957114	957119	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386312643
17030	NC_017566	GGA	2	6	957131	957136	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386312643
17031	NC_017566	GCA	2	6	957158	957163	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386312643
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17033	NC_017566	TTC	2	6	957217	957222	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386312643
17034	NC_017566	TG	3	6	957233	957238	0 %	50 %	50 %	0 %	386312643
17035	NC_017566	AATGA	2	10	957276	957285	60 %	20 %	20 %	0 %	386312643
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17038	NC_017566	ATG	2	6	957369	957374	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386312643
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17040	NC_017566	TGCGC	2	10	957424	957433	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
17041	NC_017566	ATG	2	6	957508	957513	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17042	NC_017566	T	6	6	957528	957533	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17043	NC_017566	TAA	2	6	957703	957708	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17044	NC_017566	ACA	2	6	957735	957740	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17045	NC_017566	A	7	7	957803	957809	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17046	NC_017566	TTC	2	6	957907	957912	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386312644
17047	NC_017566	AGT	2	6	957972	957977	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386312644
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17049	NC_017566	CGT	2	6	957994	957999	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386312644
17050	NC_017566	GCAT	2	8	958098	958105	25 %	25 %	25 %	25 %	386312644
17051	NC_017566	TAC	2	6	958112	958117	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386312644
17052	NC_017566	AC	3	6	958158	958163	50 %	0 %	0 %	50 %	386312644
17053	NC_017566	A	6	6	958196	958201	100 %	0 %	0 %	0 %	386312644
17054	NC_017566	TAA	2	6	958316	958321	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386312644
17055	NC_017566	TGC	2	6	958370	958375	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17056	NC_017566	ATT	2	6	958403	958408	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17057	NC_017566	CAT	2	6	958418	958423	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17058	NC_017566	A	7	7	958428	958434	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17059	NC_017566	T	6	6	958449	958454	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17060	NC_017566	GC	3	6	958489	958494	0 %	0 %	50 %	50 %	386312645
17061	NC_017566	TCAG	2	8	958597	958604	25 %	25 %	25 %	25 %	386312645
17062	NC_017566	TGAT	2	8	958691	958698	25 %	50 %	25 %	0 %	386312645
17063	NC_017566	GCA	2	6	958759	958764	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386312645
17064	NC_017566	T	6	6	958771	958776	0 %	100 %	0 %	0 %	386312645
17065	NC_017566	CAC	2	6	958841	958846	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386312645
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17069	NC_017566	GCAG	2	8	958984	958991	25 %	0 %	50 %	25 %	386312645
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17072	NC_017566	AGT	2	6	959448	959453	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386312645
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17074	NC_017566	ACGCG	2	10	959501	959510	20 %	0 %	40 %	40 %	386312645
17075	NC_017566	ATCTG	2	10	959557	959566	20 %	40 %	20 %	20 %	386312645
17076	NC_017566	TAG	2	6	959624	959629	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386312645
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17079	NC_017566	TAT	2	6	959683	959688	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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17081	NC_017566	TTAA	2	8	959787	959794	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17082	NC_017566	AT	3	6	959817	959822	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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17085	NC_017566	TGA	2	6	960013	960018	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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17094	NC_017566	TTTAGG	2	12	960620	960631	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	386312646
17095	NC_017566	GCGAT	2	10	960766	960775	20 %	20 %	40 %	20 %	386312646
17096	NC_017566	GCG	2	6	960792	960797	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386312646
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17101	NC_017566	CGC	2	6	960914	960919	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386312646
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17104	NC_017566	CTG	2	6	961108	961113	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386312646
17105	NC_017566	TGG	2	6	961235	961240	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386312646
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17107	NC_017566	TGG	2	6	961379	961384	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386312646
17108	NC_017566	ATG	2	6	961410	961415	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386312646
17109	NC_017566	CG	3	6	961427	961432	0 %	0 %	50 %	50 %	386312646
17110	NC_017566	GGC	2	6	961619	961624	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386312646
17111	NC_017566	CGT	2	6	961632	961637	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386312646
17112	NC_017566	CGTA	2	8	961726	961733	25 %	25 %	25 %	25 %	386312646
17113	NC_017566	CTGATC	2	12	961761	961772	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	386312646
17114	NC_017566	AGCGGC	2	12	961805	961816	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	386312646
17115	NC_017566	CTGA	2	8	961818	961825	25 %	25 %	25 %	25 %	386312646
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17119	NC_017566	GATTA	2	10	962110	962119	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
17120	NC_017566	ATT	2	6	962342	962347	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386312647
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17123	NC_017566	CGA	2	6	962425	962430	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386312647
17124	NC_017566	TCC	2	6	962442	962447	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386312647
17125	NC_017566	CATC	2	8	962582	962589	25 %	25 %	0 %	50 %	386312647
17126	NC_017566	GC	3	6	962641	962646	0 %	0 %	50 %	50 %	386312647
17127	NC_017566	TGAT	2	8	962700	962707	25 %	50 %	25 %	0 %	386312647
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17140	NC_017566	TGA	2	6	963314	963319	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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17142	NC_017566	T	6	6	963331	963336	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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17239	NC_017566	TGGTG	2	10	968018	968027	0 %	40 %	60 %	0 %	386312651
17240	NC_017566	TG	3	6	968031	968036	0 %	50 %	50 %	0 %	386312651
17241	NC_017566	GGC	2	6	968037	968042	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386312651
17242	NC_017566	ATC	2	6	968132	968137	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386312651
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